Genomika i proteomika Flashcards

1
Q

kad su watson i crick otkrili sktrukturu DNA

A

1953.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

kad je izoliran i sekvenciran ljudski genom

A

2003.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

koliko parova baza sadrži ljudski genom

A

3⋅10^9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

koliko gena imaju ljudi

A

20 000-25 000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

koji kromosom ima najviše, a koji najmanje gena

A

najviše - I kromosom

najmanje - Y kromosom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

genomika se dijeli u

A

strukturalnu i funkcionalnu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

koje tehnike se često koriste u funkcionalnoj genomici

A

northern blotting

DNA microarray

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

kak funkcionira DNA microarray

A

napravi se cDNA iz zdravog i bolesnog uzorka
svaka se oboji nekom bojom
stavlja se na provu su oligonukleotidima
ovisno o obojanosti možemo vidjeti koji geni su gdje eksprimirani

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kaj je fizička mapa genoma

A

daje informaciju o fizičkoj udaljenosti određenih parova baza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

čime se izrađuje fizička mapa genoma

A

shotgun metodom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

kaj je shotgun metoda

A

segmenti gena se nasumišno režu
preklapanjem određenim regija se otkriva kojem dijelu su pripadali
rekontruira se cijela DNA sekvenca pomoću fregmenata

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

genetička mapa daje

A

točan položaj gena i njihove udaljenosti u centimorganima

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

kaj predstavlja centimorgan

A

jedan centimorgan predstavlja jedan posto šanse da će se jedan marker na kromosomu odvojiti od drugog na istom kromosomu tijekom crossing-overa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

čime se traže geni koji kodiraju za protein

A

ORF (open reading frame)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

ORF traži sekvencu koja

A

počinje start kodonom

dovoljno dugo ne sadrži stop kodon da može kodirati za protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

farmakogenomika uključuje

A

pravi lijek, pravu dozu i pravo vrijeme doziranja za svakog pacijenta

17
Q

pseudogeni su

A

funkcionalni geni koji više nemaju sposobnost transkripcije

18
Q

kak mogu nastati pseudogeni

A
  1. podupla se sekvenca, jedna kopija ima mutaciju

2. insercija cDNA u genom

19
Q

transpozoni su

A

odsječci DNA koji se sami mogu kopirati, izrezivati i premještati unutar genoma

20
Q

tipovi transpozona

A

DNA transpozoni

retrotranspozoni

21
Q

DNA transpozoni kodiraju za

A

transpozazu koja može izrezivati taj transpozon i premjestiti ga na drugo mjesto

22
Q

kak se dijele retrotranspozoni

A
endogeni retrovirusi (ERV)
neviralni transpozoni
23
Q

kak nastaju endogeni retrovirusi

A

dok se retrovirus ugradi u genom spolnih stanica –> prenašanje na potomke

24
Q

koje ponavljajuće sekvence sadrže endogeni retrovirusi (ERV)

A

LTR (retriviral-like long terminal repeats)

25
koji su neviralni transpozoni
LINE i SINE
26
SINE je u biti
RNA sekvenca koju je reverzna transkriptaza prepisala u cDNA i ugradila u genom
27
koja je najčešća SINE (kratka DNA sekvenca)
Alu sekvenca
28
kak stanica kontrolira transpozone
metilacijom | nekodirajućom DNA (miRNA, siRNA)
29
haplotip je
obrazac razmještaja SNP-a na jednom kromosomu
30
kaj su politeni
gorostasni (debeli) kromosomi
31
gdje su prisutni gorostasni kromosomi
u žlijezdama slinovnicama drosophile melanogaster
32
ima li gorostasnih kromosoma kod sisavaca
ne
33
kak nastaju gorostasni kromosomi
centomere se ne odvoje tijekom diobe, nego se kromatide podijele 10 puta
34
koliko kromatida nastaje kod gorostasnih kromosoma
1024 (2^10)
35
bojanje kromatina (kak je obojan heterokromatin, kak eukromatin)
heterokromatin - tamno | eukromatin - svijetlo
36
transkripcija u politenim kromosomima se odvija u
puffovima
37
razlika između siRNA i miRNA
siRNA mora biti potpuno komplementarna s mRNA kako bi se vezala miRNA može biti parcijalno komplementarna