Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biyokimya > Proteinler > Flashcards

Proteinler Flashcards

1
Q

… hariç tüm aa’ler transaminasyona girer

A

Lys ve Thr

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Enzimlerin sınıflandırılması

A

Oksidoredüktazlar- Yükseltgenme indirgenme reaksiyonları katalize ederler
Transferazlar- Metil, glikozil gibi grupları donörden akseptöre taşırlar
Hidrolazlar- bağları hidrolitik kırılmaya uğratırlar
Liyazlar-
İzomerazlar - molekülde geometrik ve yapısal değişiklikler yaparlar
Ligaz- ATP enerjisi ile moleküllerin birbirine bağlanmasını sağlar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Peptid bağı ___ bağ

A

Peptid bağı=Kovalent Bağ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Non-polar AA’ler

A

Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Polar, Yüksüz yan zincirli AA’ler

A

Ser, Thr, Gln, Asn

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Ser/Thr

A

-OH grubu içerir, proteinlerin yüzeylerinde bulunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Asn/Gln

A

polar -N grubu içerir, protein yapısında H bağı yapar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Polar, + Yüklü/ Bazik yan zincirli AA’ler

A

His, Arg, Lys

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Polar, “-“ Yüklü/ Asidik yan zincirli AA’ler

A

Asp, Glu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

AA asidik karakterli yerden (-COOH) H+ verirse AA ____ (neutral)

A

Zwitterion forma gelir- net yük sıfır “izoelektronik nokta” (pI)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Esansiyel AA’ler

A

PVT TIM HALL

Phe, Val, Thr_Trp, Ile, Met_His, Arg, Lys, Leu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Transaminasyon

A

AminoAsit1 + Alfa-keto Asit2 ——PLP (piridoksalfosfat)——> AminoAsit2 + Alfa-keto Asit1

(aminosunu aktaran aa’in adı gelir= AA1 Aminotransferaz)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

KC sitozolünde amino grupları _____’a aktarılır ve ______ oluşur

A

Karaciğer sitozolünde amino grupları (NH3) “Alfa-Ketoglutarat”a (amonyak’ın zırhlı aracı) aktarılır ve Glutamat oluşur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Transaminaz enzimleri _____’ı kofaktör olarak kullanırlar

A

Piridoksalfosfatı (PLP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

___ ve ___ hariç tüm AA’ler transaminasyona katılır

Transaminasyon’a KATILMAYAN enzimler?

A

Lys ve Thr transaminasyona katılmaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Oksidatif Deaminasyon ile Glutamat üzerindeki NH3 ______ enzimi ile NH4 olarak uzaklaştırılır ve KC’de üreye çevrilip böbreklerle atılır

A

Glutamat dehidrogenaz (GDH) enzimi ile

Glutamat——GDH——> Alfa-keto glutarat
|
|—>NH4—>üre—>böbreklerle atılım

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Periferal dokulardaki amino grupları ____ formunda
Kaslardaki amino grupları ______ formunda KC’e ulaşır

A

Periferal dokulardaki Glutamin formunda
Kaslardaki Cori siklusu ile Alanin formunda

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Enzim aktivitesinin regülasyonu

kaba (coarse) kontrol
-___,___

ince (fine) kontrol
-___, ___

A

kaba (coarse) kontrol
-indüksiyon, represyon (adaptif kontroldür uzun süreli regülasyon sağlar)

ince (fine) kontrol
-substrata bağlı, enzime bağlı kontrol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Allosterik regülasyon

Hücre içi/dışı
Enzim etkisi?
substratı ve modlatörü aynıysa=___
___ satürasyon eğrisi vardır
-____ örn
Allosterik feedback inhibition=___

A

Hücre içi değişen koşullara yanıt
Enzim etkisine gerek duymaz
Modülatör enzime Reversible ve non-kovalent bağlanır
substratı ve modülatörü aynıysa homotropik, farklıysa heterotropik
Sigmoidal satürasyon eğrisi vardır
-Fosfofruktokinaz-1
Allosterik feedback inhibition=aa ve nükleotit sentezi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Enzim aktivitesi regülasyonu

Reversible Kovalent Modifikasyon

A

2 enzim gerektirir (biri kovalent bağlı modifiye ediciyi bağlarken diğeri uzaklaştırır)
[Hücre dışı sinyallere yanıt genellikle]- Fosforilasyon= kinaz fosfat bağlarken fosfataz uzaklaştırır
Kovalent Modifikasyona örn= Kas Glikojen Fosforilazı
Glikojen Fosforilaz —> Glikojen Fosforilaz- P (aktif) [fosforilasyonla aktif]
Epinefrin, kas ve adipoz dokuda cAMP-bağımlı kinazlar üzerinden fosforilasyonla enzimleri aktive/inaktive

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Enzim Aktivitesi Regülasyonu

Proteolitik Klivaj

A

Irreversibl
“___jen -> ___ “ & “Pro___ > ___”
İnaktif form zimojen/proenzim- Km daha yüksek (affinite düşük)
Proteazlar parsiyel proteolizle enzimleri aktifleştirir- vücutta pankreas enzimler ve pıhtılaşma kaskadında

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Enzim Aktivitesinin Regülasyonu

Feedback Regülasyon

A

Son ürün yeni enzimlerin gen düzeyinde sentezini inhibe eder

HMG-KoA redüktaz enziminin diyetsel kolestrol tarafından baskılanması

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

ATP’den fosforil grup transferi adımları (kinaz- fosforilasyon)

A

1-Hidroliz
2-Rezonans Stabilizasyonu
3-İyonizasyon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Oksidoredüktazlar
Transferazlar
Hidrolazlar
Liyazlar
İzomerazlar
Liyazlar

A

Oksidoredüktazlar= oksidasyon/redüksiyon reaksiyonu katalizler
Transferazlar= fonksiyonel grup transferi
Hidrolazlar= bağ hidrolizi
Liyazlar= non-hidrolitik non-enzymatic bağ yıkımı
İzomerazlar= molekülün kendi içinde izomerizasyon değişimini katalizler
Ligazlar= kovalent bağ ile iki molekülün birleşimi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Glukojenik AA’ler - Glukoneogenez’de kullanılır

A

Lys ve Leu hariç hepsi

26
Q

AA’lerin peptit bağıyla uç uca eklenmesiyle oluşan kısa polimer zincirler “__”, uzun
polimer zincirler “__” veya “__”

A

AA’lerin peptit bağıyla uç uca eklenmesiyle oluşan kısa polimer zincirler “peptid”, uzun polimer zincirler “polipeptid” veya “protein”

Proteinler bir ya da daha fazla polipeptid içeren makromoleküllerdir

27
Q

Tüm hücrelerde ve hücrelerin tüm bölümlerinde en çok bulunan biyomolekül

A

Protein

28
Q

bir zincirde karboksil grubu varsa onun bağlandığı karbon __ ondan sonraki ___…

A

bir zincirde karboksil grubu varsa onun bağlandığı karbon alfa ondan sonraki beta…

29
Q

Proteinlerin birbirinden farklı olmasını sağlayan temel özellik _____ ve bu da ____ yapıyı oluşturur

A

AA dizilimi primer (birincil) yapıyı oluşturur

30
Q

Bilinen en uzun polipeptit=
Polipeptit zincirine katılan aa’lere=
Oligopeptit=
Polipeptit=

A

Bilinen en uzun polipeptit kas dokusundaki ‘titin’
Polipeptit zincirine katılan aa’lere= kalıntı (residue)
Oligopeptit= Birkaç AA (<12)
Polipeptit (AA sayısı > 12)

31
Q

Glisilalanin

A

Dipeptid

32
Q

Adlandırma

A

N-terminal (amino terminal)’den C-terminal’s doğru (Karboksi terminal)

33
Q

Polipeptit zincirindeki peptit bağlarının yıkılması:
ile olur

Proteinlerin hidrolizinde ___ yıkılır, denaturasyonunda _____ yapılar yıkılır

A

Hidroliz
Kaynatma
Midede asit etkisi
Vücutta enzimler etkisi (proteazlar)

Proteinlerin hidrolizinde birincil yapı yıkılır, denaturasyonda birincil dışındaki yapılar
yıkılır

34
Q

Daha çok üçüncül yapıda gözlenen Kimyasal bağ/çekmeler:

A

Kovalent olmayan bağlar

İyonik bağ, H bağ
Hidrofob (apolar bağlar), Van der Waals - London kuvvetleri

35
Q

şaperon

A

proteinin doğru katlanmasını sağlar

36
Q

Yapının değişik düzeyleri düşünüldüğünde proteinler iki grupta toplanabilir:

A

Fibröz proteinler- uzun iplikçik veya tabaka halinde düzenlenmiş destek şekil ve dış koruma sağlar
Küresel proteinler- küresel/globüler şekilde katlanmış enzim ve regülatuvar proteinleri oluşturur

37
Q

İkincil yapı proteinlerde

H bağları ile aa’in CO grubu ve kendinden sonraki ___ aa’in NH grubu ile H bağı sonucu

düzensiz katlamalar:

A

İkincil yapı proteinlerde

H bağları ile aa’in CO grubu ve kendinden sonraki dördüncü aa’in NH grubu ile H bağı sonucu

düzensiz katlamalar: Beta büklüm, ilmek (loop)

38
Q

Örnek.
İkincil yapı-
Üçüncül yapı-
Dördüncül yapı-

A

Örnek.
İkincil yapı- alfa/beta keratin
Üçüncül yapı- kolajen
Dördüncül yapı- Hemoglobin (homotetramer)

39
Q

Proteinlerin

ozmotik basıncı

molekül ağırlığı

A

Kolloid ozmotik basınç (onkotik basınç)

Dalton (Da) ya da kilodalton (kDa)

40
Q

Anormal biçimde katlanmış proteinlere örnek ___ ve ___ gösterilebilir

A

Anormal biçimde katlanmış proteinlere örnek prion ve amiloid madde gösterilebilir

41
Q

Denatürasyon (Yapısal değişim)
Reversibl-
Irreversibl-

A

Reversibl= ikincil & birincil yapı korunur

Geri dönüşümsüz= birincil yapı korunur

42
Q

Proteinler amfoter maddelerdir, bu özellikleri sayesinde

A
  • Proteinlerin hem baz hem asit bağlama özellikleri vardır.
    • Proteinlerin hem negatif iyon hem pozitif iyon bağlama özellikleri vardır .
    • Proteinlerin su bağlama ve bağlı suyu verme yetenekleri vardır.
    • Proteinler, elektriksel alanda farklı hızlarda göç ederler.
43
Q

Enzimler reaksiyonların istenen ____, ____, ____’de gerçekleşmesini sağlar

A

istenen
Hız
Özgüllük
Düzenleme de (metabolik yolaklar değişen şartlara adaptasyon için enzimler tarafından düzenlenir)

44
Q

Enzimin aktif bölgesi __ ve __ olmak üzere iki bölümden oluşur

A

Enzimin aktif bölgesi bağlanma bölgesi ve katalitik bölge olmak üzere iki bölümden oluşur

45
Q

İzoenzimler

protein olmayan enzimler

A

Katalizlediği reaksiyon aynı ama yapıları farklı, >2 subunitten oluşur

katalitik rna & katalitik antikor

46
Q

Metabolit =

Metabolik yolakların Özellikleri:

A

Metabolit = Metabolizma sonucu oluşan ara ürün ve ürünlerdir.
Metabolik yolakların Özellikleri:
1. Metabolik yollar geri döndürülemez
2. Katabolik ve anabolik yollar farklı olmalıdır
3. Her metabolik yolun bir ilk hız kısıtlayıcı adımı vardır
4. Tüm metabolik yollar düzenlenir
5. Spesifik lokalizasyonlarda (kompartmanlarda) gerçekleşirler.

47
Q

Enzim spesifitesi

A
  • Mutlak
  • Grup
  • Bağ
  • Stereokimyasal spesifite
48
Q

Enzim işlevini etkileyen faktörler

Reaksiyon Çevre şartları:
Reaksiyona İç Etki (Bileşenlerin Etkisi):
Reaksiyona Dış Etki:

A

Reaksiyon Çevre şartları:
Sıcaklık, pH, iyonik içerik (optimum olacak)

Reaksiyona İç Etki (Bileşenlerin Etkisi): [E], [S], [Ü]
Reaksiyona Dış Etki: [Aktivatör], [İnhibitör]

49
Q

Hemoprotein, metalloprotein

A

Hem içeren proteinler

miyoglobin [1 hem] - tersiyer yapı
hemoglobin (dimerik) [4 hem] - kuaterner yapı

Hemoglobin 4. yapısı disulfid bağ ve kovalent bağ içermez- hidrofobik,hidrojen,tuz köprüsü içerir (nonkovalent bağlar)

50
Q

Hemoglobin’e reversibl oksijen bağlanmasını (affinitesini) etkileyen faktörler

A

Oksijen düzeyi- Hemoglobin subunitelerine Oksijen bağlandıkça diğer su üniteleri de oksijene karşı afinitelerini arttirir=kooperatif yardımlaşma etkisi
Hidrojen düzeyi- Hemoglobin subunitelerine H bağlanması oksijen affinitesini azaltır
Bifosfogliserat düzeyi-BPG oksijen seviyesi düşünce artar, oksijene affinite duser serbestleşmesi

51
Q

Yaygın prostetik grup metalleri

A

Piridoksalfosfat, FMN, FAD, TPP, biotin

52
Q

Bir metal iyonuna kofaktör olarak gereksinim duyan enzimler _________

___________ ise metal iyonu prostetik grup olarak
bulunur

A

Bir metal iyonuna kofaktör olarak gereksinim duyan enzimlere
metaller ile aktive olan enzimler denir.
 Metalloenzimlerde ise metal iyonu prostetik grup olarak
bulunur.

53
Q

İnsülin ile glükozinaz’ın regülasyonu

A

Adaptif kontrol - indüksiyon

54
Q

Cystic Fibrozis

ve hangi sistemleri etkiler

A

otozomal resesif

F508 mutasyonu-Phe AA delesyonu
CFTR proteininin doğru katlanmamasına, membrana yerleşememesine neden olur.

• Gastrointestinal sistem: safra kanalı, ince barsak
• Ter Bezleri
• Solunum sistemi,
• Genito-üriner sistem

55
Q

Ökaryotik hücrelerde ;
• Salgılanan,
• Golgi kompleksinde fonksiyon gören,
• Lizozomlarda fonksiyon gören,
• Plazma membranında yer alan
tüm proteinlerin ana kavşak noktası _______

A

endoplazmik retikulumdur

56
Q

ER’DA GERÇEKLEŞEN
MODİFİKASYONLARIN AMACI

A
  1. Proteinlerin 3B yapılarını kazanmaları: (alfa heliks , beta kırmalı tabaka )
  2. Degradasyona uğrayacak proteinlerin işaretlenmesi,
  3. Proteinin intrasellüler/ekstrasellüler lokalizasyonunun belirlenmesi
  4. İnaktif (apo) haldeki enzimin/proteinin, aktif (holo) formuna
    dönüşmesi
57
Q

ENDOPLAZMİK RETİKULUMDA OLUŞAN protein MODİFİKASYONLARI

A
  1. Proteinlerin üç boyutlu yapılarını kazanmaları
  2. Multi-subunitli proteinlerin biraraya getirilmesi
  3. Disülfid bağlarının oluşması (Disülfid izomeraz)(İnsulin)
  4. Glikozilasyon (Oligosakkarid transferaz)
  5. Glikolipid takılarının eklenmesi (GPI takıları)
58
Q

Proteinlerin Plazma Membranın İç Yüzeyine Tutunması ________ (_______) ile Olur

A

Proteinlerin Plazma Membranın İç Yüzeyine Tutunması Lipid Çapaları (Miristoillenme, 14C) ile Olur

59
Q

Proteinlerin Fonk. olduğu organale yönelmesi

örn:

Lizozom enzimleri

Pürtüklü ER’de sentezlenen glikoproteinler N-terminallerinde bulunan sinyal peptidi sayesinde lümene transloke olurlar ve N-glikozilasyon başlar.

Enzimler vezikulle golgiye ulaşır.
Golgide post-translasyonel mod.
Golgide ilgili lizozom reseptorlerine bağlanırlar (Mannoz-6 Fosfat reseptörü)

Enzimler lizozoma ulaşınca reseptörler Golgiye geri döner

A
60
Q

PROTEİNİN GOLGİ KOMPLEKSİNDEN SONRA GİDECEĞİ
HEDEFİ BELİRLER (POSTA PULU GÖREVİ GÖRÜRLER)

hangi posttransyonel modifikasyonlar?

A

Sülfatlanma
KH eklenmesi
Lipid eklenmesi
Fosforillenme

61
Q

Mannoz-6 Fosfat oluşumu için

Mannoz rezidue’leri ______________ ile fosforillenir

Mannoz-6 Fosfat lizozoma gidecek enzimlerin golgiden aldığı posta pulu

A

Mannoz-6 Fosfat oluşumu için

Mannoz rezidue’leri N-asetilglukozamin Fosfotransferaz ile fosforillenir

62
Q

Yanlış kodlanan bir AA fonksiyonel olmayan proteinlerin sentezine neden olur,
örn hastalık:

  • _________
    !! ____ mutasyonu, ___ AA ‘nin delesyonuna neden olur
  • __________
    A-T ile; Glu-Val ile değişir

Sentezlenen protein enzim ise yer aldığı metabolik rx gerçekleşmez
örn:

  • __________
    Ser-14’ün fosforillenmesiyle aktifleşir, Ser14 yoksa çalışmaz
  • ______ Hastalığı
    N-asetilglukozamin Fosfotransferaz enzim defekti, Mannoz fosforillenemez. Lizozom enzimi üretilir ancak lizozoma giremez dolaşıma katılır.
A

Yanlış kodlanan bir AA fonksiyonel olmayan proteinlerin sentezine neden olur,
örn hastalık:

Cystic Fibrozis (CF)-
!! ∆F508 mutasyonu, Phe AA ‘nin delesyonuna neden olur

Orak hücreli Anemi
A-T ile; Glu-Val ile değişir

Sentezlenen protein enzim ise yer aldığı metabolik rx gerçekleşmez
örn:

Glikojen Fosforilaz
Ser-14’ün fosforillenmesiyle aktifleşir, Ser14 yoksa çalışmaz

  • I-Hücre Hastalığı
    N-asetilglukozamin Fosfotransferaz enzim defekti, Mannoz fosforillenemez. Lizozom enzimi üretilir ancak lizozoma giremez dolaşıma katılır.

Biyokimya (16 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions