Protein: oppbygning og struktur Flashcards
Proteiner: oppbygning
proteiner er bygget opp av lange aminosyre kjeder satt sammen av peptidbindinger - polypeptider.
Aminosyrer
aminosyrer er byggesteinene til proteiner. Det finnes mange forskjellige typer aminosyrer men de samme 20 er brukt for å danne proteiner. Det betyr at vi har 20 essensielle aminosyrer. 12 kan lages i kroppens mens resten må fås gjennom maten.
Aminosyrer: oppbygning
Aminosyrer er bygget opp av:
- Aminogruppe
- Hydrogenatom
- R-gruppe
- Karboksylsyre
Alle aminosyrene har et sentralt karbonatom (alpha karbon), og ut fra dette forgrener det seg 4 grupper
R-gruppen
R-gruppen i aminosyre representer en sidekjede. side kjedene varierer i kjemisk struktur og oppbygning. Formen av R-gruppen gir aminosyrene ulike kjemisk egenskaper.
Hvorfra kommer navet “aminosyre”
Amin = aminogrupper syre = karboksylsyre
Hva er funksjonen til sidekjedene i aminosyre?
Sidekjedene er ikke involvert i polypeptid bindingene -
De gir aminosyre unike egenskaper:
- upolar ➔ hydrofob (vann fryktende), i kontakt med lipider
- polar ➔ hydrofil (vann elskende), i kontakt med vann
- positiv ladd
- negativ ladd
- reaktiv - høy elektronegativitet
target for fosforlylation (????)
Aromatic R-groups
- Phenylalanine
- Tyrosine
- Tryptophan
Optisk isomer i aminosyre
speilbilde isomeri. To spelbildeisomere har like kjemisk formel og struktur men forskjellige egenskaper. karbon-a i aminosyrer er usymmetrisk og gir to isomerer:
L og D
Proteiner består kun av L-aminosyrer
Makromolekyler
Glykoproteiner - en proteindel og en karbohydrat del
lipoproteiner - en proteindel og en lipid del
Brukes som markør
Hva bestemmer funksjonen til en protein?
kjemisk struktur avgjør proteinets egenskaper. Funksjonen til en protein er bestemt av sin 3D form. Dersom proteiner blir kveilet feil, vil den ikke virke.
Proteinfunksjon: Struktur
Komponenter I celleveggene og inne I cellen.
Proteinfunksjon: Transport
Lakatse, helicase, katalase - katalyserer reaksjoner
Proteinfunksjon: Enzymer
flagella cilier og muskler
Proteinfunksjon: Motor for bevegelse
Hormonene som er proteiner, insulin
Proteinfunksjon: Transportmolekyler
Serumproteiner - hemoglobin og albumin
Proteinfunksjon: Regulering
Kanaler og pumper I cellemembran, GLUT4
Proteinfunksjon: Genuttrykk
Antistoffer og sakdelige/giftige proteiner
Proteinfunksjon: Forsvar/Angrep
Reseptorer/mottakermolekyler transcrpsjonfaktorer
I hvilke hovedområder har proteiner en funksjon?
- Struktur
- Transport
- Enzymer
- Motor for bevegelse
- Transportmolekyler
- Regulering
- Genuttrykk
- Forsvar/Angrep
Bindinger i aminosyre
Peptidbindinger:
- sterke bindinger - tillatter ingen rotasjon.
- stiv og gjør at aminosyrene ligger i en plan
- alltid transfigurasjon
-uladd men polar
Sidekjede bindingene: svake bindinger - tillater rotasjon
tegn figur
Partiell dobbelt binding mellom C-atomet og N-atomet
hvilke retning peker molekylene i hos peptidbindinger? Hvorfor må det være denne retningen?
Peptidbindinger har trans-konfigurasjon, de vil si at alpha karbon atomene peker i to ulike retninger. De kan ikke ha cis-konfigurasjon, altså peke i samme retning, fordi da er det ikke plass for begge karbonatomene.
konformasjon
er den 3 dimensjonelle figuren som proteiner er kveilet i. Protein må bestå av flere kjeder som er snodd, brettet, og nøstet sammen for å oppnå dette 3D figuren. Proteinen må være foldet i riktig 3D struktur for å virke. Formen er helt avgjørende fo funksjonen.
Hvorfor er konformasjonen til proteinene viktig for funksjonen.
Fordi proteinenes virkning er avhengig av at de kan gjenkjenne og binde seg til bestemte andre molekyler.
Primærstruktur
Det er rekkefølgen av aminosyrene som
bestemmer proteinenes form, ligger i en plan fra N til C terminal og sidekjeder på hver sin side.
Primærstrukturem kan finnes mens protein syntiseres. Proteines etter aa rekkefølge. foldingen skjer mens proteinen dannes.