Krebssyklus Flashcards
Hva er hensikten med krebssyklusen?
aerobisk oksygenkrevende prosess som innebærer oksidativ katabolisme av aminosyre, fettsyrer, og karbohydrater for å produsere ATP (dannes også NADH og FADH). Omdannes til mellomprodukter som kan delta i krebssyklusen.
Hvor skjer krebssyklus?
mitokondria matriks
Gjør rede for hele krebssyklus?
figur (se i evernote)
Hva må skje for citrat blir dannet?
(figur)
Pyruvat fra glykolysen må transportes inn til mitokondrie. Det gjøres av en spesefikk transportør - pyruvat translokalse
Reaksjonen fra pyruvat til AcetylCoA katalyseres av enzym kompleks pyruvate dehydrogenase.
Hva er pyruvat dehydrogenase? Hvordan er det bygget opp?
Reaksjonen fra pyruvat til AcetylCoA katalyseres av enzym kompleks pyruvate dehydrogenase. Det er en multienzym kompleks med 36 subenheter og tre hoved enzym aktiviteter: E1, E2, og E3
- E1 = pyruvat dehydrogenase
Pyruvat dehydrogenase dekarboksylerer pyruvat (CO2 ut) og legger til en koenzym A for å genere Acetyl CoA
Regulering av pyruvat dehydrogenase
Inhibering (-)
- E1 er inaktivert av enzymet pyruvat dehydrogenase kinase (PDK). enzymet fosforylerer og inaktivere E1. PDK er aktivert (E1 blokkert) av Acetyl CoA og ATP. Dersom det er en overskudd av ATP (energi) vil man ikke lage mer. –> hemmer reaksjonsveien. Det kan være en signal for å lagre Acetyl CoA.
- Høye pyruvat nivåer kan inhibere PDK og hemme fosforylering og inaktivasjon –> E1 er aktiv
Aktivering (+)
- Pyruvat dehydrogenase fosfatase aktivere E! og stimuleres av Ca2+- Ca2+ kan virke som signaleringsmolekyl i cellen
Hva gjør et enzym som har dehydrogenase i navn?
dehydrogenase –> involvert i redoks reaksjon
- 1 molekyl redusert og den andre oksidert
- ofte NAD+ –> NADH (red) tas til elektron transport kjede og er oksidert der.
Oksiderte produkter
katalysert av enzym med dehydrogenase
Isocitrat - Isocitrat dehydrogenase (NADH)
a-ketogluterat - a-ketogluterat dehydrogenase (NADH)
Siccinyl - Siccinyl dehydrogenase (NADH)
Malate - malate dehydrogenase (FADH)
Hva skjer med karbon atomene under krebssyklus?
Oxaloacetat (4C) + Acetyl CoA (2C)
Citrat (6C)
Isocitrat (6C) –> CO2 ut
a-ketoglutrat (5C) –> CO2 ut
Succinyl (4C)
Succinyl CoA (4C)
Fumarate (4C)
Malate (4C)
Oxaloacetat (4C)
Hva skjer med succinyl CoA under krebssyklus?
- Ved succinyl CoA (substrat nivå fosforylering)
- dannes ATP (GTP)
- katalysert av succcinyl CoA syntetase
- høy energi binder fra CoA brukes for å genere GTP (ATP)
Hva er forskjellen mellom syntatase og syntase?
syntetase er involvert i substrat nivå fosforylering (GTP)
Regulering av krebssylus
Oxaloacetat + Acetyl CoA –> Citrat
citat syntese inhibert av produkt –> produkt feedback
- Når citrat akkumelates og citrat blir ikke omdannet videre vil prouktet bli rettet mot andre reaksjonsveier –> fettsyre syntese
- Citrat blokkerer også PFK-1 (i glykolyse). dette kan skje fordi citrat kan bevege seg på tvers av mitokondrie membraner.
Isocitrat –> a-ketoglutrat (oksidasjon)
- Allosterisk regulert
- Inhibert av: ATP og NADH
- Stimulert av: ADP og Ca2+
- for mye energi –> ATP inhiberer
- For mye energi –> ADP aktiverer
a-ketoglutrat –> Succinyl CoA
- produkt inhibert
- Succinyl CoA inhiberer enzym
Hvilke steg er regulert i krebssyklus?
Steg 1 Oxaloacetat + Acetyl CoA –> Citrat
Steg 3 Isocitrat –> a-ketoglutrat
Steg 4 a-ketoglutrat –> Succinyl CoA