Prokaryoter - Replikation Flashcards
Vad är ett operon?
Unikt för bakterier.
Krävs endast en enda promotor för flera gener. Flera gener kommer ha gemensam startpunkt för transkription. Vid translationen kommer flera olika protein ut.
Vad menas med replikon?
Den DNA-sekvens som replikeras från OriC. Eftersom bakteriekromosomen endast har en enda OriC, är hela kromosomen ett enda replikon.
Hur är bakteriekromosomen packat?
Den har ingen cellkärna vilket gör att kromosomen har proteiner som gör att det bildar en struktur. Denna struktur kallas för nukleoid.
Vad är transposoner?
Hoppande gen som fogas in på nya ställen i kromosomer. Transposoner kodar för ett enzym som heter transposas som klyver DNA. Klyvda DNA:t kan sedan hoppa in i en annan funktionell gen.
Ex. resistensplasmider bär på transposoner som bär på resistensgener –> antibiotikaresistens
Vad är transposas?
Transposas är ett enzym som klyver DNA.
Vad är genomöar? Vad kan de ha för betydande roll?
Stora delar av DNA som följer med ex. en profag vid specialiserad transduktion. Ursprunget till dessa genomöar kan inte hittas (alltså tagna från omgivningen), och de hittas i DNA:t i form av att de har upprepade sekvenser av C-G-förhållanden som gör att de utmärker sig. Finns ofta integrerade i tRNA-molekylens DNA.
Genomöarna har olika egenskaper, och kan ge värdcellen en ny egenskap som ex. antibiotikaresistens.
Vad är OriC?
DNA-sekvens där replikationen börjar.
Varför behövs Topoisomeraser II vid DNA-replikation? Ge ett exempel på en Topoisomeras II.
Skapar negativa supercoils så replikation kan vara möjlig. Hjälper även till att klyva bort de nya strängarna i TerC.
Exempel: DNA-gyras
Vad är DnaA och varför behövs den?
DnaA är ett protein som kopplar replikering till celldelning. Proteinet kommer att relaxera och denaturera DNA vid OriC. M.h.a. ATP kommer det aktiveras och påbörja replikeringen m.h.a. replikas.
Vad är replikationsgaffeln?
De ställen på kromosomen där själva replikationen sker.
Vad måste DNA-strängarna vara för att en replikation ska kunna uppstå?
Båda strängarna måste vara metylerade och negativt supercoilade.
Hur ser DnaA-processen ut?
- DnaA kommer med hjälp av ATP att bli aktivt.
- Kommer bildas ADP-DnaA
- Replikationen upphör
- ADP släpps av och nytt ATP släpps in så en ny replikation kan ske.
Vad står RIDA för och vad betyder det?
Replication inactivation of DnaA. Enzymet hydroliserar ATP och bildar ADP-DnaA som är inaktivt.
Vad är replisomen och vad innehåller den?
Replisomen är den maskin som sköter replikeringen.
Innehåller DNA-polymeras III, helikaser, gyras, primas, DNA-polymeras I (för proof-reading), topoisomeras och DNA-ligas
Vad är DnaG?
Ett primas som tillverkar RNA-primers.
