Prokaryoter - plasmider och bakteriofager Flashcards
Vad är en plasmid? Vad har den för funktion?
Cirkulärt extra-DNA (dubbelsträngat). Replikerar oberoende av kromosomen. Kodar för funktioner som inte är livsnödvändiga för bakterien.
Plasmiden kan ge bakterien olika egenskaper: ex. virulensplasmider (ger bakterien vissa virulenta egenskaper) och resistensplasmider (gör bakterien resistent mot vissa antibiotika).
Vad menas med lytiska fager?
Enklaste typen av fager. Fagerna kommer att injicera sitt genom (DNA/RNA) och det kommer att integreras med värdkromosomen. Virusprotein kommer att syntetiseras, virus-DNA:t kommer att replikeras och fler bakteriofager bildas. Tillslut lyserar värdecellen och nya viruspartiklar kommer ut.
Vad är bakteriofager?
Det är virus som infekterar bakterier. Kan ha DNA/RNA som genom.
Vad är temperata fager?
Komplexa fager. Fagerna kommer att injicera DNA/RNA och cykeln kan gå två olika vägar: lytiska cykeln eller lysogeniska cykeln. Under lysogeniska cykeln kommer det bildas profager som kommer stänga av värdcellens gener och endast uttrycka sina egna. Celldelning uppstår. En spontan reaktion kommer uppstå där faggenomet klyvs från vanliga genomet, och kan sedan göra ett nytt val av de två vägarna.
Vad händer under lytiska cykeln?
Lytiska fagerna kommer att injicera sitt genom (DNA/RNA) och det kommer att integreras med värdkromosomen. Virusprotein kommer att syntetiseras, virus-DNA:t kommer att replikeras och fler bakteriofager bildas. Tillslut lyserar värdecellen och nya viruspartiklar kommer ut.
Vad menas med lysogenisk bakterie?
En värdbakterie som bär på en profag.
Vad är en profag?
Fagerns kromosom integrerar med bakteriens kromosom.
Vad händer under lysogeniska cykeln?
Om förhållandena inte är optimala för lytiska cykeln kommer bakterifagen gå in i lysogeniska cykeln.
Under lysogeniska cykeln kommer det bildas profager som kommer stänga av värdcellens gener och endast uttrycka sina egna. Celldelning uppstår. En spontan reaktion kommer uppstå där faggenomet klyvs från vanliga genomet, och kan sedan göra ett nytt val av de två vägarna.
Vad är en episom?
Episom är exempelvis en plasmid. Styrs av kromosomen men kan leva utanför den.
Vad menas med att en plasmid är icke-essentiell?
Generna den bär på är inte essentiella och livsnödvändiga för bakteriens överlevnad, men kan ha stora fördelar för överlevnad.
Vad menas med inkompatibla plasmider?
Två olika plasmider kan inte replikeras i en och samma cell. Dessa plasmider är då inkompatibla. Dessa plasmider har samma regulatoriska mekanism för replikation vilket gör att de är besläktade.
Hur skyddar bakterier sitt DNA?
Den vanligaste typen av modifiering är metylering av kvävebaserna. Detta gör att restrikrionsenzymerna inte klyver det egna DNA:t utan bara det främmande för bakterien.
Vad menas med transformation och hur går den till?
DNA:t tas upp från omgivningen (ex. från en död bakterie). Det fria DNA:t kommer tas upp enkelsträngat (ds binds och bryts ner på bakteriens yta för att sedan ta sig in). Det nya DNA:t måste bli en del av kromosomen, eller som en plasmid.
Hur går transformationen till i grampositiv respektive gramnegativ bakterie?
Grampositiv:
- Dubbelsträngat DNA binder till cellytan.
- Enzymer klyver DNA:t.
- Andra enzymer bryter ner den ena DNA-strängen.
- Ett protein binder DNA:t
- DNA:t ersätter en liten del av bakteriekromosomen.
Gramnegativ:
- Dubbelsträngat DNA binder till cellytan.
- DNA:t kommer att ta sig in genom det ytliga membranet.
- Enzymer klyver DNA:t
- Andra enzymer bryter ner den ena DNA-strängen.
- Ett protein binder DNA:t
- DNA:t ersätter en liten del av bakteriekromosomen.
Vad menas med transduktion och hur går den till?
En vektor (bakteriofag) kommer att förflytta DNA/RNA från en bakteriecell till en annan. Finns två typer av transduktion. Generell transduktion: Vilken gen som helst(med rätt storlek) från givarkromosomen kan överföras. I värdcellen kommer både fagens och det andra DNA:t följa med. Krävs att fagen är i den lytiska cykeln. Specialiserad transduktion: Gener som sitter i närheten av profagen vid delningen av lysogeniska cykeln. Det blir då en defekt i fagens genom och kommer överföras till andra bakterier.
