Polimeraza RNA i inne

Question 1

Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 1

Answer 1

28S, 5,8S, 18S rRNA

Question 2

Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 2

Answer 2

mRNA, snRNA, snoRNA, microRNA, piRNA, lncRNA

Question 3

Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 3

Answer 3

tRNA, 5S rRNA, niektóre snRNA

Question 4

z jakich segmentów składa się promotor polimerazy RNA 2?

Answer 4

Blok -25 TATA (sekwencja największej zgodności 5I TATAWAAR3I, gdzie W oznacza A lub T,
a R-A lub G)
Sekwencja Inicjatorowa Inr -(sekwencja największej zgodności u ssaków 5I YCANTYY 3I,
gdzie Y oznacza C lubT a N-dowolny nukleotyd) obejmuje nukleotyd +1

Question 5

Jakie związkiprzeciwdziałają „pauzowaniu” polimerazy 2
w czasie transkrypcji rejonów gdzie
powstają struktury typu spinki do włosów

Answer 5

TFIIF, CSB, ELL, elongina

Question 6

Jaki związek zapobiega zaprzestaniu elongacji

Answer 6

TFIIS

Question 7

Bakteryjna polimeraza RNA ma silne lub słabe powinowactwo do
promotora

Answer 7

Silne

Question 8

Czym jest operon?

Answer 8

zespół genów, które sąsiadują ze sobą w genomie bakterii, są
transkrybowane z jednego promotora i podlegają tym samym
mechanizmom regulacyjnym.

Question 9

Jak nazywa się najmniejsza jednostka ekspresji genetycznej

Answer 9

cistron

Question 10

Czy zachodzi transkrypcja jeżeli poziom glukozy jest wysoki a cAMP niski

Answer 10

nie zachodzi

Question 11

Czy zachodzi transkrypcja jeżeli poziom glukozy jest niski a cAMP wysoki

Answer 11

zachodzi.
białko CAP w połączeniu z cAMP przyłącza się do miejsca CAP.

Question 12

Moduły promotorowe polimerazy RNA II

Answer 12

'’Moduł promotora podstawowego
(TATA box i sekwencja Inr. YYANWYY. (C/T C/T A N A/T C/T C/T))
▪Moduły konstytutywne (np. blok CAAT)
▪Moduły odpowiedzi (np. moduł odpowiedzi na cAMP)
▪Moduły komórkowo specyficzne
▪Moduły wiążące regulatory rozwoju

Question 13

Heterochromatyna konstytutywna

Answer 13

występuje we wszystkich
komórkach, a w jej skład wchodzi DNA niezawierający żadnych
genów, przez co może zachować zwartą strukturę (centromery,
telomery, część chromosomu Y)

Question 14

Heterochromatyna fakultatywna

Answer 14

obserwowana okresowo w
pewnych komórkach. (zawiera geny nieaktywne w pewnych
komórkach lub na pewnych etapach cyklu komórkowego)

Question 15

Co robią sekwencje izolatorów

Answer 15

oddzielają od siebie domeny funkcjonalne

Question 16

Za co odpowiadaja regiony LCR

Answer 16

utrzymują chromatynę w stanie otwartym, aktywnym transkrypcyjnie

Question 17

Co decyduje o tym, które z genów ulegają w danym momencie
ekspresji? na poziomie transkrypcji

Answer 17

wiązanie specyficznych czynników
transkrypcyjnych do sekwencji regulatorowych aktywuje lub hamuje
powstanie kompleksu transkrypcyjnego.

Question 18

Co decyduje o tym, które z genów ulegają w danym momencie
ekspresji? na poziomie transkrypcji na poziomie DNA

Answer 18

acetylacja
histonów, metylacja DNA – modyfikacje zmieniające dostępność DNA
dla procesu transkrypcji.

Question 19

microRNA

Answer 19

sekwencje 21-23 nukleotydów niekodujacego RNA(regulacja posttranskrypcyjna)
Geny kodujace miRNA są w intronach i w
eksonach oraz w odcinkach międzygenowych

Question 20

Nadekspresja miRNA regulującego
ekspresje genu supresorowego
Co powoduje

Answer 20

Spadek ekspresji
genu supresorowego

Question 21

Obniżona ekspresja miRNA
regulującego ekspresje
protonkogenu co powoduje

Answer 21

Nadekspresja
protoonkogenu
(protoonkogen-onkogen)

Question 22

Potranskrypcyjna Modyfikacja
Eukariotycznego pre-mRNA

Answer 22

TWORZENIE „CZAPECZKI” (5’-capping) na końcu 5’ pierwotnego
transkryptu (hnRNA)
* POLIADENYLACJA (polyA-tail) na końcu 3’ pierwotnego
transkryptu (hnRNA)
* USUWANIE intronów (splicing, splajsing) z pierwotnego
transkryptu (pre-mRNA)

Question 23

Zaznacz starter Forward:
5’AAAG CGCGTGCGT GACGTACGCGCACGTAGTACAGTGAC3

Answer 23

Starter forward 5CGCGTGCG3

Question 24

Zaznacz starter reverse:
Starter forward:
5’AAAGCGCGTGCGTGACGTACGCGCA CGTAGTACA GTGAC3

Answer 24

Starter reverse 5TGTACTACG3

Question 25

Czy w komórkach hodowanych w hipoksji
zmienia się ilość mRNA dla genu kodującego
anhydrazę węglanową CAIX?

Answer 25

Komórki hodowane w hipoksji zwiększają ekspresję
anhydrazy węglanowej CAIX

Question 26

Metoda sekwencjonowania za sprawą terminacji łańcucha, zwana również?

Answer 26

metoda Sangera
Matryca- jednoniciowy DNA
Pierwszy etap
reakcji : przyłączenie
startera dla polimerazy DNA.
Mieszanina reakcyjne
wymaga dodania trójfosforanów
deoksynukleotydów (dNTP)