Polimeraza RNA i inne Flashcards
Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 1
28S, 5,8S, 18S rRNA
Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 2
mRNA, snRNA, snoRNA, microRNA, piRNA, lncRNA
Jakie geny transkrybuje polimeraza RNA 3
tRNA, 5S rRNA, niektóre snRNA
z jakich segmentów składa się promotor polimerazy RNA 2?
Blok -25 TATA (sekwencja największej zgodności 5I TATAWAAR3I, gdzie W oznacza A lub T,
a R-A lub G)
Sekwencja Inicjatorowa Inr -(sekwencja największej zgodności u ssaków 5I YCANTYY 3I,
gdzie Y oznacza C lubT a N-dowolny nukleotyd) obejmuje nukleotyd +1
Jakie związkiprzeciwdziałają „pauzowaniu” polimerazy 2
w czasie transkrypcji rejonów gdzie
powstają struktury typu spinki do włosów
TFIIF, CSB, ELL, elongina
Jaki związek zapobiega zaprzestaniu elongacji
TFIIS
Bakteryjna polimeraza RNA ma silne lub słabe powinowactwo do
promotora
Silne
Czym jest operon?
zespół genów, które sąsiadują ze sobą w genomie bakterii, są
transkrybowane z jednego promotora i podlegają tym samym
mechanizmom regulacyjnym.
Jak nazywa się najmniejsza jednostka ekspresji genetycznej
cistron
Czy zachodzi transkrypcja jeżeli poziom glukozy jest wysoki a cAMP niski
nie zachodzi
Czy zachodzi transkrypcja jeżeli poziom glukozy jest niski a cAMP wysoki
zachodzi.
białko CAP w połączeniu z cAMP przyłącza się do miejsca CAP.
Moduły promotorowe polimerazy RNA II
'’Moduł promotora podstawowego
(TATA box i sekwencja Inr. YYANWYY. (C/T C/T A N A/T C/T C/T))
▪Moduły konstytutywne (np. blok CAAT)
▪Moduły odpowiedzi (np. moduł odpowiedzi na cAMP)
▪Moduły komórkowo specyficzne
▪Moduły wiążące regulatory rozwoju
Heterochromatyna konstytutywna
występuje we wszystkich
komórkach, a w jej skład wchodzi DNA niezawierający żadnych
genów, przez co może zachować zwartą strukturę (centromery,
telomery, część chromosomu Y)
Heterochromatyna fakultatywna
obserwowana okresowo w
pewnych komórkach. (zawiera geny nieaktywne w pewnych
komórkach lub na pewnych etapach cyklu komórkowego)
Co robią sekwencje izolatorów
oddzielają od siebie domeny funkcjonalne
Za co odpowiadaja regiony LCR
utrzymują chromatynę w stanie otwartym, aktywnym transkrypcyjnie
Co decyduje o tym, które z genów ulegają w danym momencie
ekspresji? na poziomie transkrypcji
wiązanie specyficznych czynników
transkrypcyjnych do sekwencji regulatorowych aktywuje lub hamuje
powstanie kompleksu transkrypcyjnego.
Co decyduje o tym, które z genów ulegają w danym momencie
ekspresji? na poziomie transkrypcji na poziomie DNA
acetylacja
histonów, metylacja DNA – modyfikacje zmieniające dostępność DNA
dla procesu transkrypcji.
microRNA
sekwencje 21-23 nukleotydów niekodujacego RNA(regulacja posttranskrypcyjna)
Geny kodujace miRNA są w intronach i w
eksonach oraz w odcinkach międzygenowych
Nadekspresja miRNA regulującego
ekspresje genu supresorowego
Co powoduje
Spadek ekspresji
genu supresorowego
Obniżona ekspresja miRNA
regulującego ekspresje
protonkogenu co powoduje
Nadekspresja
protoonkogenu
(protoonkogen-onkogen)
Potranskrypcyjna Modyfikacja
Eukariotycznego pre-mRNA
TWORZENIE „CZAPECZKI” (5’-capping) na końcu 5’ pierwotnego
transkryptu (hnRNA)
* POLIADENYLACJA (polyA-tail) na końcu 3’ pierwotnego
transkryptu (hnRNA)
* USUWANIE intronów (splicing, splajsing) z pierwotnego
transkryptu (pre-mRNA)
Zaznacz starter Forward:
5’AAAG CGCGTGCGT GACGTACGCGCACGTAGTACAGTGAC3
Starter forward 5CGCGTGCG3
Zaznacz starter reverse:
Starter forward:
5’AAAGCGCGTGCGTGACGTACGCGCA CGTAGTACA GTGAC3
Starter reverse 5TGTACTACG3
Czy w komórkach hodowanych w hipoksji
zmienia się ilość mRNA dla genu kodującego
anhydrazę węglanową CAIX?
Komórki hodowane w hipoksji zwiększają ekspresję
anhydrazy węglanowej CAIX
Metoda sekwencjonowania za sprawą terminacji łańcucha, zwana również?
metoda Sangera
Matryca- jednoniciowy DNA
Pierwszy etap
reakcji : przyłączenie
startera dla polimerazy DNA.
Mieszanina reakcyjne
wymaga dodania trójfosforanów
deoksynukleotydów (dNTP)
