Moja bch Flashcards
Jaka jest aktywność bakteryjnej polimerazy 1 DNA i jej funkcja
Aktywnósć egzonukleazy 5-3 i 3-5
replikacja i naprawa DNA_!usuwa primery!
Jaka jest aktywność bakteryjnej polimerazy 2 DNA i jej funkcja
aktywnosc 3-5
naprawa dna
Jaka jest aktywność bakteryjnej polimerazy 3 DNA i jej funkcja
Aktywnosc 3-5
główny enzym replikacyjny
w widełkach replikacyjnych występuje w postaci dimeru
Jaka jest aktywność eukariotycznej polimerazy alfa DNA i jej funkcja
nie ma aktywności
synteza starterów
Jaka jest aktywność eukariotycznej polimerazy beta DNA i jej funkcja
nie ma aktywności
naprawa DNA
Jaka jest aktywność eukariotycznej polimerazy gamma DNA i jej funkcja
aktywnosc 3-5
replikacja mitochondrialnego DNA
Jaka jest aktywność eukariotycznej polimerazy delta DNA i jej funkcja
aktywnosć egzonukleazy 3-5
główny enzym replikacyjny
Jaka jest aktywność eukariotycznej polimerazy theta DNA i jej funkcja
aktywnosc 3-5
replikacja DNA ale dokładna nie znana
Za co odpowiadaja wszystkie polimerazy
Za syntezę DNA
Egzonukleaza 3’-5’ za co odpowiada
Egzonukleaza 3’-5’ – korekcja błędów
Egzonukleaza 5’-3’ – za co odpowiada
Egzonukleaza 5’-3’ – naprawa
uszkodzeń, usuwanie starterów.
Niektóre polimerazy bakteryjne
(Polimeraza DNA I, u Eukariota jest to
osobny enzym Polimerazy
eukariotyczne nie mają
aktywności Exo 5’-3’, startery RNA
usuwają np. nukleazy Flap 1
kodowanej przez gen FEN1
Która polimeraza bakteryjna ma dodatkową aktywność exo 5-3
Polimeraza 1
Polimerazy DNA
Zawsze potrzebują matrycy
* Mogą tylko dodawać nukleotydy do końca 3’ nici DNA
* Nie mogą zacząć tworzyć łańcucha DNA od zera, a wymagają wcześniej istniejącego
łańcucha lub krótkiego odcinka nukleotydów nazywanego starterem
* Dokonują korekty, czyli sprawdzają swoje własne działanie, usuwając znaczną większość
“złych” nukleotydów, które są przypadkowo dodawane do łańcucha
* Dodawanie nukleotydów wymaga energii.
Czym się charakteryzuje nić opóźniona
jest syntetyzowana w kawałkach (matryca odczytywana
porcjami), zwanych fragmentami Okazaki, o długości 1000 - 2000 nukleotydów. Fragmenty Okazaki
syntetyzowane są przez drugą cząsteczkę dimeru Pol DNA III.
Ile występuje polimeraz DNA u eukariota
9
Co robi kompleks polimerazy alfa
U Eukaryota kompleks polimerazy α ma aktywność prymazy i polimerazy DNA - tworzy
starter RNA i zapoczątkowuje syntezę DNA, po nim syntezę przejmują inne polimerazy
(np. pol δ
Mechanizm działania primazy
Prymaza syntetyzuje krótki primer RNA (~10 nukl.),
który wydłużany jest o ~20 nukleotydów przez DNA Pol alfa. Z powodu niskiej procesywności
oddysocjowuje - syntezę nici potomnej przejmuje DNA Pol alfa o wysokiej procesywności.
.
endonukleaza FLAP 1 co to jest
to enzym który odpowiada za wyciecie primera
sekwencja telomerowa to
5’-TTAGGG‐3’
telomery znajdują się na końcach ramion chromosomów i chronią je
Funkcja telomerów
ochronę chromosomów przed degradacją, czyli zniszczeniem,
* umożliwianie systemom naprawczym rozpoznania zarówno prawidłowych, jak
i uszkodzonych zakończeń chromosomów,
* regulację transkrypcji genów, które zlokalizowane są w pobliżu telomerów,
* zapobieganie mutacjom chromosomowym strukturalnym, w tym translokacjom,
duplikacjom i delecjom,
* zapobieganie powstawaniu chromosomów dicentrycznych, zapewnienie prawidłowego
przebiegu procesu rekombinacji,
* umożliwienie przestrzennej organizacji jądra komórkowego
Gdzie jest aktywna telomeraza
komórki macierzyste gamet,
* keratynocytach warstwy podstawnej naskórka,
* w komórkach ponad 90% nowotworów złośliwych
Czym jest telomeraza
Odwrotną transkryptazą
Mechanizm selekcji nukleotydów polimerazy;
3 etapy:
wiązanie nukleotydu z polimerazą
* przenoszenie do centrum aktywnego
* dołączanie do 3’ końca syntetyzowanego
łańcucha
Mechanizm korekcji błędów:
Aktywność egzonukleazy 3’-5’
* Usuwanie niewłaściwie wstawionego
nukleotydu
* Zasada konkurencji między aktywnością
polimerazy a egzonukleazy
* Naprawa poreplikacyjna (Mismatch repair).
