13 wykład Flashcards
Co regulują mi RNA
endogenne regulatory ekspresji wielu genów
Co powoduje przyłączenia nici antysensownej mi RNA do mRNA
inhibicja translacji
Funkcje nukleotydów
- wchodzą w skład koenzymów
- stanowią efektory allosteryczne reakcji enzymatycznych
3.Aktywują metabolity(UPDG)
4.stanowią podstawowa formę magazynowania ENERGII chemicznej
5.Pośredniczą w procesach przekazywania sygnałów pomiędzy komórkami
cechy zasad azotowych
tworzą formy tautomeryczne
hydrofobowe planarne
Absorbancja przy 260( w UV)
jaka konformacja dominuje w nukleozydach naturalnych
anty
synteza łańcucha polideoksyrybonukleotydowego jakie jest kierunek wydłużania iw jakim kierunku biegnie wiązanie fosfodiestrowe
jaki enzym katalizuje
Synteza 5-3
wiązanie 3-5
polimeraza DNA
wiązanie fosfodiestrowe DNA trwałość
i w kwaśnym i w alkalicznym jest trwałe
wiązanie fosfodiestrowe RNA trwałość
jest trwałe w srodowisku kwaśnym
nie trwałe w środowisku alkalicznym
wynika do hydroksylacji wiązania 2oh co powoduje hydrolizę wiązania fosfodiestrowego:)
w jakim środowisku są stosunkowo trwałe polideoksyrybonuleotydy
w obojętnym
co robią egzonukleazy
hydrolizuja zewnętrzne wiązania .odłączaja pojedynczyczych nukleotydów
co robią endonukeazy
hydrolizują wiązania wewnętrzne
nie wymagają wolnego końca
wiązanie typu p
powstaja fragmenty nici polinuklotydowej
DNA
nini antyrównoległe
na zewnątrz są reszty fosforanowe i deoksyrybozy-hydrofilne
wewnątrz zasady azotowe-hydrofobowe
skok 3,4 nm 10 nukleotydów
średnica na całej długości jednakowa
jakie wiązania stabilizują łańcuch dna
wodorowe i warstwowe (hydrofobowe+ wan der WAALSA)
elektrostatyczne odpychania od ujemno naładowanymi cząsteczkami
średnica rowka małego i dużego dna
mały 1,2 nm
duży 2,2
jaki typ DNA występuje głównie w naturze
B DNA
ALE Z DNA też jest
jakie środowisko sprzyja A-DNA
bogate w NA+ i K+
i mniej uwodnione
czym się różnią od B DNA:Z DNA I A RNA
A:
tez prawoskętna
skok 11 par zd i 2.8
Z:
lewoskrętna
sekwencje naprzeminne C i G
12 par zasad i 3,5-4,7 nm
ma konformację syn
rośnie czy spada absorbancja kiedy organizyjemy wolne nukleotydy w dwuniciową strukturę
spada
możemy wykorzystać to dla badania renaturacji i denaturacji białka
efekt hiperchromowy
wzrost absorbancji przy przejściu dwuniciowej w jednoniciową strukturę
Tm to
to jest tempratura przy której cząsteczka DNA jest zdenaturowana na 50 procent
ile zawiera haploidalny genom pn
3 razy 10*6
jakie geny maja kopie wielokrotne
dla rRNA
histony
tRNA
histony to
małe zasodowe białka bogate w Lys i Arg
H1 bardziej bogaty w lizynę
co robi histon H1
stabilizuje strukturę nukleosomu
jak osłabić wiązanie z histonami
kowalencyjna modyfikacja N-końcowych ogonów:
acetylacja histonów
HDAC uczęstniczy w
transkrypcji
ekspresji genów
splising
różnicowania i regulacji cyklu komórkowego
inhibitor deacetylaz histonowych jest
kwas walproinowy(lek w przypadku padaczki)
ekwencje rozproszone
krótkie i długi
sekwencje tandemowe
mikrosatelity i ministelity
