Pharmacogénomique Flashcards
Pourquoi est-il important d’évaluer la pharmacogénomique?
- Réponse variables démontrée par rapport à certains médicaments
- effets indésirable
- Caractère héréditaire démontré quant à la réponse de certains médicaments
Quelles sont les différentes mutations qu’on peut observer?
- Non-sens: codon STOP prématuré (protéine tronquée);
mutation non-synonyme - Faux-sens: différent a.a. codé aux propriétés physico-chimiques différentes; mutation non-synonyme
- Insertion/Délétion (indel): ajout/retrait de nucléotide(s)
<1kb avec conservation possible de la séquence d’a.a. - Translation du cadre de lecture (frameshift mutation): ajout/retrait de nucléotides causant un changement complet de séquence d’a.a., incluant un codon STOP possible
- Mutation synonyme/silencieuse: changement de nucléotide en 3ième position codant le même a.a. Séquence non-altérée, mais possibilité d’altération de la reconnaissance des sites d’épissage par le splicéosome
Les mutations peuvent engendrer quels types de variation structurelles?
Duplication / Délétion, Conversion exonique, hybridation génique, réarrangement en tandem
Quelle est la différence en un SNP et une mutation ?
Par convention, un SNP porte une fréquence génique ≥1%, alors qu’une mutation porte une fréquence <1%
Qu’est-ce qu’un allèle?
Un allèle est un variant ponctuel de séquence génétique donné à un seul gène. Les allèles d’un même gène occupent le même locus sur un même chromosome.
Qu’est-ce que le génotype?
Le génotype représente la constitution d’une paire d’allèles
-2 copies de chaque gène sur chaque chromatide sœur
-Homozygotes (AA, aa) et hétérozygotes (Aa)
Qu’est-ce que l’haplotype?
L’haplotype est un groupe groupe d’allèles hérités ensemble d’un seul parent
Qu’est-ce que le phénotype?
Le phénotype est le trait observable chez une personne résultant de l’expression des allèle (du génotype). Ex: réponse à un médicament
Quelle est la différence entre une maladie mendélienne et une maladie complexe?
- Maladie mendélienne : l’expression de la maladie est sous le contrôle d’un gène à forte pénétrance.
- Maladie complexe : Plusieurs facteurs génétiques et
environnementaux conférant un faible risque sont impliqués.
Quelles sont les caractéristiques de la pharmacogénomique monogénique ?
- variants dans un seul gène, peut avoir des effets majeures
- très peu de gène déterminent les phénotypes définis
- Réponse au médicament : Différences distinctes et parfois
extrêmes selon le génotype; chevauchement possible des
phénotypes - Distribution de la réponse : Mutlimodale, avec pics
correspondant à chaque phénotype inféré (PK et/ou PD).
Quelles sont les caractéristique de la pharmacogénomiques polygéniques?
- variant répartis sur plusieurs gènes d’intérêt, effet combiné
- Effet génétique diffus : De nombreux pharmacogènes
contribuent à la variabilité des profils PK et/ou de la réponse - Réponse au médicament : Répartition homogénéisée des
réponses observées - Distribution de la réponse : Continue, combinaison d’effets
mineurs de multiples gènes
Quelle sont les types d’interaction pharmacogénomiques?
- Interaction Rx-Rx classique
- Interaction Rx-Rx combinés avec perte de fonction
- Interaction PGx et Rx-Rx combinées
- Interactions PGx et Rx-Rx combinées via multiples voies métaboliques
- Interactions Rx-Rx combinées avec gain de fonction
Quel est l’effet indésirable le plus fréquent de la Warfarine?
Saignements
Les protéines membranaires HLA ont quel rôle physiologique?
la reconnaissance du « soi » et du « non-soi »
Qu’est-ce que l’Allopurinol?
L’allopurinol est une prodrogue analogue aux purines et est utilisée dans le traitement de la goutte (hyperuricémie).
Son métabolite oxypurinol inhibe l’enzyme hépatique xanthine oxydase et l’empêche de former l’acide