Nucléotides Flashcards
Quels sont les quatre rôles biologiques centraux des nucléotides?
- Ils sont composantes essentielles des acides nucléiques ADN et ARN
- Ils stockent et fournissent de l’énergie
- Ils régulent des processus cellulaires (signalisation intracellulaire : GTP, AMPcyclique/AMPc)
- Implication dans le transport d’électrons
Quels sont les trois ensembles distincts composants un nucléotide?
- Une base azotée
- Une pentose
- Un à trois groupements phosphates
De quoi est composée une base azotée ?
a) pyrimidine ou purine
b) avec groupements carbonyle-, méthyl- ou amine
Quel est ce groupement ?
Groupement carbonyle
Quel est ce groupement ?
Groupement méthyl
Quel est ce groupement ?
Groupement amine
Quelles sont les 5 bases azotées (dire si ce sont des pyrimidines ou des purines)
Adénine (purine), guanine (purine), cytosine (pyrimidine), uracile (pyrimidine), thymine (pyrimidine)
Quelle est cette base azotée ? Dire si présente dans l’ADN ou dans l’ARN ou les deux
Adénine, ARN et ADN
Quelle est cette base azotée ? Dire si présente dans l’ADN ou dans l’ARN ou les deux
Guanine, ADN et ARN
Quelle est cette base azotée ? Dire si présente dans l’ADN ou dans l’ARN ou les deux
Cytosine, ADN et ARN
Quelle est cette base azotée ? Dire si présente dans l’ADN ou dans l’ARN ou les deux
Uracile, juste ARN
Quelle est cette base azotée ? Dire si présente dans l’ADN ou dans l’ARN ou les deux
Thymine, juste ADN
Est-ce que les bases azotées peuvent se lier entre elles? Si oui, via quoi ?
Oui, via des ponts hydrogènes (charge partielle)
Entre quoi les liaisons hydrogènes sont-elles formées lorsque les bases azotées se lient?
- L’hydrogène attaché à un atome électronégatif
- Un atome électronégatif d’une molécule différente
Est-ce que toutes les bases azotées peuvent se lier entre elles?
Non
Quelles bases azotées forment des pairs de bases entre elles?
Adénine-Thymine (AT)
Guanine-Cytosine (GC)
Est-ce que l’ARN et l’ADN ont le même pentose?
Non
Quel est le pentose de l’ADN ?
β-D-2’-désoxyribose
Quel est le pentose de l’ARN ?
β-D-ribose
Quel est ce pentose ? Est-ce celui de l’ADN ou de l’ARN?
β-D-ribose
Quel est ce pentose ? Est-ce celui de l’ADN ou de l’ARN ?
β-D-2’-désoxyribose
Combien de phosphate minimum et maximum peuvent former le groupement phosphate?
De un à trois phosphates
Comment s’assemblent les nucléotides? Expliquer pour les purines et pour les pyirimidines
N9 des purines se lient avec le carbone C1 (1’) du ribose par un lien N-glycosidique
N1 des pyrimidines se relient avec le carbone C1 (1’) du ribose par un lien N-glycosidique
Que forme une base azotée liée à un pentose ?
Un nucléoside
Que doit-on ajouter à un nucléoside pour qu’il devienne un nucléotide? Ou doit-on l’ajouter?
Au moins un groupement phosphate. Sur le ribose. On peut avoir des nucléotides mono-, di- ou tri- phosphates
Nommer les trois groupes encerclés dans cet ordre : bleu, vert, magenta
Base azotée
Nucléoside
Nucléotide
Compléter ce tableau
Dans quel sens lit-on une séquence (de quelle extrémité à quelle extrémité)
De l’extrémité 5’ vers 3’
Comment se nomme ce di-nucléotide ?
A-C
Que désignent 5’ et 3’ ?
Les bouts “libres”, non-reliés
Quel est 5’ et 3’
Le sens de la lecture des nucléotides et également de la synthèse des polynucléotides
Comment se nomme ces structures ?
NAD+ et NADH : Nicotinamide adénine dinucléotide
Comment se nomme ça ?
NADP+ et NADPH : Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate
Que sont NADH, NADPH et FAD(H) ? Que permettent-ils ?
Ce sont des coenzymes. Ils permettent le transport d’électrons ordonnées, et sont ainsi impliqués dans des réactions redox
Comment se nomme cette coenzyme?
Flavine adénine dinucléotide (FAD(H))
Qu’est-ce que fournit l’ATP? Ceci implique quels domaines?
Elle fournit l’énergie nécessaire aux réactions chimiques physiologiques. Ceci implique presque tous les domaines, que ce soit métabolisme, cycle cellulaire ou mouvements
Que fait le GDP/GTP en tant que cofacteur?
Il lie des protéines cytosoliques, et coordonne leur activité dans le temps
Qu’est-ce qui lie des protéines cytosoliques et coordonne leur activité dans le temps? En tant que quoi?
Le GDP/GTP en tant que cofacteur
Par quoi est synthétisé l’AMPc ? En réponse à quoi?
Par une enzyme (adénylate cyclase) en réponse à des stimuli externes
Comment agit l’AMPc ?
Il agit comme “messager second” dans des cascades de signalisation intracellulaire
Est-ce que les nucléotides mono-, di-, et tri-nucléotides ont une vie à part de l’ADN et l’ARN?
Oui
Quels sont les éléments structuraux et actifs de la cellule?
Les protéines
Quel est le dogme central de la biologie moléculaire?
La transmission du “sens” (de l’information) ADN -> ARN
Comment une protéine est-elle synthétisée? Comment se nomme les étapes ?
ADN -transcription> ARN -traduction> Protéine
Les nucléotides (ADN et ARN) codent pour quoi? Combien?
Les 20 acides aminés
Qu’est-ce qui forment des codons ?
Des triplets de nucléotides
Combien y a t’il de codon(s) start? Le(s) nommer.
1 seul, la méthionine (AUG, ATG en langage ADN)
Quel est le codon start?
La méthionine (AUG, ATG en langage ADN)
Le code contient-il des redondances? Qu’est-ce que cela signifie?
Oui, plusieurs codons pour un seul acide aminé
Quels sont les seuls acides aminés qui sont encodés par un seul codon ?
Trp (tryptophane) et Met (méthionine)
Combien y a t’il de codon(s) stop ?
3
En théorie, la traduction ne peut pas commencer à n’importe quel méthionine (codon AUG, “ATG” en langage ADN). Vrai ou Faux?
Faux, en théorie elle peut commencer à n’importe quel méthionine (codon AUG, “ATG” en langage ADN)
Qu’indique un cadre de lecture “ouvert” (sans codon stop)?
La présence d’un gène traduit
Qu’est-ce qui indique la présence d’un gène traduit?
Un cadre de lecture “ouvert” (sans codon stop)
Quels sont les codons stop ou non-sens ?
UAA, UAG et UGA