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BCM1501 > Acides nucléiques > Flashcards

Acides nucléiques Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que Mendel a postulé comme hypothèse ?

A

Il postule l’existence de gènes

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Q

Quels sont les trois concepts qu’a établit Mendel ?

A

Dominant/récessif
Homozygote/hétérozygote
Génotype/phénotype

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3
Q

Quelle est la règle de Chargaff ?

A

Il y a autant de C que de G et autant de T que d’A dans l’ADN

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4
Q

Quelle est la structure de l’ADN ?

A

Une double hélice

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5
Q

En quoi consiste la double hélice ? Donner son sens

A

Deux brins antiparallèles (sens 5’-3’ en direction inverses) de synthèse inverse

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6
Q

La double hélice s’enroule vers la droite ou vers la gauche ?

A

Vers la droite

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7
Q

Que signifie “antiparallèle”

A

Orientés parallèlement l’un à l’autre, mais en sens opposé

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8
Q

S’il y a trois cadres de lecture possibles sur un brin, combien il y en aura pour l’ADN double brin ?

A

6

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9
Q

Quel est le sens de lecture ?

A

5’-3’

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10
Q

Quel est le sens de lecture reverse ?

A

3’-5’

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11
Q

Quel est le sens de lecture complémentaire ?

A

3’-5’

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12
Q

Quel est le sens de lecture reverse complémentaire ?

A

5’-3’

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13
Q

Quelle forme de l’ADN est biologiquement pertinente?

A

La “forme B”

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14
Q

Combien y a-t-il de formes de l’ADN qui ne sont pas biologiquement pertinentes ? Les nommer

A

2 formes : “forme A” et “forme Z”

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15
Q

Où sont situés les sucres et phosphates sur l’ADN ? Sont-ils hydrophiles ou hydrophobes ?

A

En périphérie. Hydrophiles, les phosphates sont chargés négativement au pH physiologique

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16
Q

Où sont situées les bases sur l’ADN ? Sont-elles hydrophiles ou hydrophobes ? Comment sont-elles disposées

A

À l’intérieur, hydrophobes. Disposées pratiquement perpendiculaires à l’axe de l’hélice

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17
Q

Quel est le diamètre d’une double hélice

A

Environ 20A (1A = 1 Angstöm = 0,1nm)

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18
Q

Combien y a-t’il de phosphates et de sucres par tour d’hélice

A

10 phosphates et 10 sucres par tour d’hélice

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19
Q

L’ADN possède un ou plusieurs sillon(s) ? Le(s) nommer. Dû à quoi ?

A

Deux : sillon majeur et sillon mineur. Dû à l’asymétrie de structure des nucléotides

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20
Q

Les bases sont principalement accessibles aux protéines dans quel sillon ?

A

Sillon majeur

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21
Q

Comment sont liés les deux brins de l’ADN double brin ?

A

Uniquement par des liens hydrogènes entre bases

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22
Q

Quelles sont les deux paires possibles dans l’ADN double brin (comment sont-ils liés). Laquelle est la plus stable ?

A

Paire A-T (2 liens hydrogènes)
Paire G-C (trois liens hydrogènes) => la plus stable

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23
Q

Quels liens requiert davantage d’énergie pour les briser ?

A

G-C plutôt que A-T

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24
Q

Faut-il beaucoup d’énergie pour séparer les bases ? Pourquoi ?

A

Non parce que elles sont liées par des liens hydrogènes

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25
Q

Comment les bases sont-elles séparées ?

A

Peut se faire par la température sinon des enzymes s’en chargent

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26
Q

Qu’est-ce qui est requis pour la réplication et pour la lecture/transcription ?

A

Défaire de l’ADN double brin en simple brins

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27
Q

Que permet la structure en double hélice ?

A

Permet une conservation et réplication exacte de l’information

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28
Q

Quel est le plus stable chimiquement entre l’ADN et l’ARN

A

L’ADN est extraordinairement stable chimiquement

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29
Q

Que protège la stabilité de l’ADN ?

A

Protège surtout les bases des nucléotides, qui sont à l’intérieur de la double hélice. Donc le sens!

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30
Q

Quels sont les mutagènes ?

A

Des agents chimiques, et des rayons (UV, X, radioactifs)

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31
Q

Existe-t-il des mécanismes de réparation ?

A

Oui

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32
Q

Nommer les étapes

A
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33
Q

Où est-ce que les mutations s’accumulent ?

A

Dans des cellules somatiques

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34
Q

Que sont les cellules somatiques?

A

Cellules non germinales, qui ne sont pas transmises

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35
Q

À quoi participent les mutations ?

A

Participent au vieillissement, ainsi qu’à la cancérogenèse

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36
Q

L’ADN contenue dans une cellule est-elle courte ou longue ?

A

Longue

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37
Q

Quelle est la taille d’ADN dans un génome haploide ?

A

1m d’ADN

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38
Q

Que permet la compaction de l’ADN ?

A

Permet de garder certaines régions de l’ADN accessibles aux enzymes de la réplication, de la transcription et de la réparation et d’autres régions non-accessibles à celles-ci

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39
Q

Nommer ces étapes de compaction de l’ADN

A
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40
Q

Combien y a-t-il de nucléosomes dans l’ADN ?

A

6x

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41
Q

Combien y a-t-il de fibres dans l’ADN ?

A

40x

42
Q

Combien y a-t-il de chromosomes dans l’ADN ?

A

23 x2

43
Q

Combien y a-t-il d’histones dans les nucléosomes ? Les nommer

A

4 : H2A, H2B, H3 et H4

44
Q

Combien y a-t-il d’histones dans les fibres ? Les nommer

A

5 : H2A, H2B, H3, H4 et H1

45
Q

Comment sont organisées les fibres de 30nm

A

En boucles de 700nm

46
Q

Quelle est la compaction maximale des chromosomes mitotoques?

A

Environ 10000-50000x

47
Q

L’ADN s’assemble en quoi ? Combien

A

En 46 chromosomes chez l’humain

48
Q

Qu’est-ce qu’une hétérochromatine ?

A

ADN plus compacté, transcriptionellement inactif, (hauts degrés de méthylation dans certaines régions de l’hétérochromatine)

49
Q

Qu’est-ce qu’une euchromatine ?

A

chromatine moins condensée (en interphase), une partie est active dans la transcription

50
Q

Le nombre de chromosomes est le même entre espèces. Vrai ou Faux ?

A

Faux, le nombre de chromosomes est disparate entre espèces

51
Q

Dans une cellule en interphase, les chromosomes occupent différents territoires. Vrai ou Faux?

A

Vrai

52
Q

Le rôle et les propriétés de l’ADN sont beaucoup plus flexibles que l’ARN. Vrai ou Faux?

A

Faux, le rôle et les propriétés de l’ARN sont beaucoup plus flexibles

53
Q

L’ARN existe sous forme de double brin ou de simple brin?

A

Simple brin

54
Q

Est-ce que l’ARN peut contenir de l’information?

A

Oui, tout comme l’ADN

55
Q

L’ARN forme des bouts d’hélice se formant entre quoi?

A

Entre bases du même simple brin

56
Q

L’ARN peut conférer une structure beaucoup plus complexe (et irrégulière) que l’ADN. Vrai ou Faux?

A

Vrai

57
Q

Comment peuvent être des ARN correctement repliées

A

Des “machines globulaires”, similaires aux protéines

58
Q

Quelle est la différence de base azotée entre l’ADN et l’ARN ?

A

L’ADN contient de la thymine tandis que l’ARN contient de l’uracil

59
Q

Quelle est la différence de pentose entre l’ADN et l’ARN ? Quelle en est la conséquence?

A

L’ADN contient du 2’-désoxyribose et l’ARN du ribose (avec OH en position C2’). Cela rend l’ARN beaucoup plus vulnérable à l’hydrolyse

60
Q

Comment est-ce qu’il pourrait y avoir hydrolyse de l’ARN ?

A

La fonction hydroxyl en C2’ peut attaquer le phosphate du lien diester, menant au bris de la chaine et à la formation d’un diester cyclique de phosphate (ouvert par hydrolyse)

61
Q

Est-ce que les règles de Chargaff s’appliquent à l’ARN ? Pourquoi ?

A

Non car l’ARN existe majoritairement sous forme de simple brin

62
Q

Le pourcentage de G, A, U et C varie-t-il dans l’ARN et si oui de quoi en quoi ?

A

Oui, il varie d’un tissu à l’autre, et d’une condition physiologique à l’autre dans une même espèce

63
Q

Qui a des plus grandes contraintes structurales entre l’ADN et l’ARN ?

A

L’ADN a des contraintes structurales plus grandes que l’ARN

64
Q

Qu’est-ce qu’il peut se former lors du repliement de l’ARN ?

A

Des paires de bases et des interactions à trois bases

65
Q

Comment se passent les intéractions à trois bases?

A

Par des liaisons hydrogène supplémentaires, qui compensent la distorsion dans des régions double brin hélicoïdal lorsque l’ARN se replie

66
Q

À quoi servent les interactions à trois bases ?

A

À stabiliser la structure tertiaire

67
Q

Combien existe-t-il de classes d’ARN ?

A

Trois

68
Q

Quelles sont les différentes classes d’ARN?

A

L’ARN messager (ARNm)
L’ARN ribosomique (ARNr)
L’ARN de transfert

69
Q

Définir l’ARN messager (ARNm)

A

Produite par transcription à partir de la matrice de l’ADN. Elle sert comme information à la traduction d’un gène

70
Q

Définir l’ARN ribosomique (ARNr) et définir le ribosome

A

Composant structural du ribosome. Le ribosome est la grande machine qui fait de la traduction, et donc la production des protéines

71
Q

Définir l’ARN de transfert (ARNt)

A

Intervient lors de la traduction en protéine : c’est elle qui reconnait la séquence de l’ARNm, et apporte l’acide aminé voulu

72
Q

Qu’est-ce qu’est central pour l’ARNm ?

A

Le contenu en information (la séquence)

73
Q

Que contient l’ARNm autre que le contenu en information (la séquence) ? Nommer 3 exemples

A

De nombreux éléments structuraux qui contiennent des “directives” quant à son emploi (ex: leur transport, leur durée de vie, la fréquence de leur traduction, etc…)

74
Q

Que signifie CDS ?

A

Coding sequence

75
Q

Que signifie UTR ?

A

Untranslated region

76
Q

Est-ce que chez les eucaryotes tout est utile pour être traduit dans l’ARN ? Quel est le terme pour ça ?

A

Chez les eucaryotes, l’ARN est “processée”, c’est-à-dire que pas tout est utile pour être traduit

77
Q

Qu’est-ce qui sont épissés dans l’ARNm ?

A

Différents bouts de séquence codants “exons”

78
Q

Que signifie épissé ?

A

“Splicing” (assembler)

79
Q

Qu’est-ce qui sont enlevés dans l’ARNm ?

A

Les “introns” non-codants

80
Q

L’épissage des exons et l’enlevage des introns se passent de façon variée ou non ? Donnant lieu à quoi ?

A

De façon variée, donnant lieu à des protéines différentes

81
Q

Donner les caractéristiques de l’ARNr

A

Longue, grande, a une structure tridimensionnelle complexe

82
Q

Qu’est-ce qui détermine la séquence de l’ARNr ?

A

Clairement l’aspect structural

83
Q

Donner les caractéristiques de l’ARNt

A

Petits, avec une forme caractéristique

84
Q

Que portent les ARNt et que reconnaissent-ils ?

A

Elles portent un acide aminé spécifique, et reconnaissent les codons sur l’ARNm

85
Q

Y-a-t-il davantage de codons ou d’ARNt

A

Il y a davantage d’ARNt que de codons (redondances)

86
Q

Qu’est-ce qu’un anticodon ?

A

3 nucléotides

87
Q

Qu’est-ce qu’est α sur cette image ?

A

Un anticodon (3 nucléotides)

88
Q

Qu’est-ce qu’est β sur cette image ?

A

Un site de fixation de l’acide aminé

89
Q

Y-a-t-il d’autres classes d’ARN que l’ARNm, l’ARNt et l’ARNr ?

A

Oui

90
Q

Quelles sont les autres classes d’ARN autre que l’ARNm, l’ARNr et l’ARNt ?

A

Les ARN catalyiques, les ARN guides, snRNAs (petits ARN nucléaires) et ncRNAs (ARNs noncodantes)

91
Q

Quelle classe d’ARN peut avoir des activités enzymatiques ? Quels en sont les substrats ?

A

Les ARN catalytiques peuvent avoir des activités enzymatiques (ribozymes), dont les substrats sont pour la plupart d’autres ARN

92
Q

Quel type d’activité peuvent avoir les ARN catalytiques ?

A

Peuvent avoir des activités enzymatiques dont les substrats sont pour la plupart d’autres ARN

93
Q

Y-a-t-il d’autres ARN impliqués dans des fonctions entourant l’expression génique (tout de la transcription à la traduction) ?

A

Oui

94
Q

Quelle est “L’hypothèse du monde à ARN” (RNA world) concernant l’ARN ?

A

Propose un monde (abiotique) dans lequel l’ARN se réplique, s’autogère, et forme des “machines” qui sont utiles à cette fin. Les protéines et l’ADN seraient survenus seulement plus tard

95
Q

“L’hypothèse du monde à ARN” (RNA world) a été avancée suite à quoi ? Est-elle favorisée par les chercheurs aujourd’hui ?

A

Dans les années 80, suite à la découverte des ARN catalytiques. Elle est aujourd’hui favorisée par beaucoup de chercheurs

96
Q

Y-a-t-il des “organismes” qui codent leur génome sous forme ARN ? Quels sont les plus connus ?

A

Oui. Les plus connus sont les virus à ARN, tel que le VIH ou COVID-19

97
Q

Quel est l’intru de l’ADN ?

A

La mitochondrie

98
Q

Les eukaryotes sont-ils aérobiques ? Grâce à quoi ? Pourquoi ?

A

Oui, grâce à la mitochondrie. Cette organelle a son propre génome (ou presque)

99
Q

La mitochondrie est le siège de quoi ? Expliquer

A

Le siège de la respiration : l’utilisation de l’O2 pour produire de l’énergie sous forme d’ATP

100
Q

La mitochondrie serait le résultat d’une symbiose entre quoi et quoi ?

A

Entre une bactérie (capable d’utiliser l’oxygène) et un eukaryote primitif (qui l’aurait ingéré)

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