Les glycoprotéines Flashcards
Comment se nomme la modification post-traductionnelle formant les glycoprotéines ? Elle se fait entre quoi et quoi ?
Glycosylation, Ser-O et Asp-N
Définir la glycosylation
Modification post-traductionnelle; ajout covalent de sucres sur certains a.a
Comment sont les sucres lors de la glycosylation ? Où sont-ils élaborés ? Ils sont ajoutés à quoi et où ?
Souvent des polysaccharides, élaborés dans le Golgi puis ajoutés aux protéines dans le réticulum endoplasmique
Le % en glucide des glycoprotéines est-il variable ?
Très variable (1 à 95%)
Où pouvons-nous trouver des glycoprotéines ?
À toutes les localisations sub-cellulaires
Quelles protéines sont glycosylées ?
Presque toutes les protéines sécrétées ou associées aux membranes
Nommer des conséquences de la glycolysation sur les fonctions de la protéines (4)
Peut modifier ses fonctions de repliement, oligomérisation, stabilité, activité spécifique, etc…
Quelle est la fonction précise de l’ajout glucidique ?
Reste souvent inconnue
Quelles sont les trois façons par lesquelles les polysaccharides peuvent se lier aux protéines ?
- Par liaison O-glycosidique à chaînes latérales d’acides aminés hydroxylées
- Par liaison N-Glycosidique
- Par liaison au C-terminal d’une protéine
Quels sont les acides aminés des chaînes latérales hydroxylées lors d’une liaison O-Glycosidique ?
Sérine, thréonine et hydroxylysine
Le lien O-glycosidique peut être alpha ou beta. Vrai ou Faux ?
Vrai
Comment se nomme le lien pointé ?
Lien O-Glycosidique
Quel est le sucre qui est généralement lié à l’acide aminé dans une liaison O-glycosidique ?
Un N-acétylgalactosamine
Comment se nomme ça ?
α-N-acétylgalactosyl-sérine
Si le sucre lié à l’acide aminé n’est pas un N-acétylgalactosamine, que peut-il être ?
Un mannose, galactose ou xylose
Comment se nomme ça ?
α-Xylosyl-threonine
Comment se nomme ça ?
α-Mannosyl-serine
Où se fait la liaison N-Glycosidique ?
Sur résidu asparagine dans séquences Asn-X-Ser ou Asn-X-Thr
Quel sucre fait la liaison N-Glycosidique ? Lié à quoi ? Par quoi ?
Toujours une N-acétylglucosamine liée à l’azote de l’amide de l’Asn par une liaison β
Comment se nomme la liaison violette ?
La liaison N-glycosidique
Via quoi se fait la liaison au C-terminal d’une protéine ?
Via une ancre glycosylphosphatidylinositol (ancre GPI)
Que sont les protéoglycanes ?
Composantes essentielles de la matrice extracellulaire (ex : cartilage)
Qu’est-ce qui se lient pour faire les protéoglycanes ?
Ce sont les longues chaines linéaires de polysaccharides liées de façon covalente à une protéine centrale
Que sont les éléments de base des protéoglycanes ?
Les glycoaminoglycanes (GAG) (ou mucopolysaccharides) => unités de disaccharides répétées
Quels sont les disaccharides des GAG ?
Sucre aminé (N-acétylglucosamine ou N-acétylgalactosamine) et, le plus souvent, acide uronique
Comment se nomment ces disaccharides ?
Comment se nomme ce disaccharide?
Comment se nomme ce disaccharide ?
Il n’y a pas la présence de charges multiples dans les disaccharides des GAG. Vrai ou Faux ?
Faux, présence de multiples charges négatives
Plusieurs GAG de natures différentes peuvent se lier à une même protéine. Vrai ou Faux ?
Vrai
À quelle protéine peuvent se lier plusieurs GAG de natures différentes ?
Protéoglycane
Y-a-t-il plusieurs protéines servant de noyau central aux protéoglycanes ? Qu’est-ce que cela entraîne ?
Il existe plusieurs protéines servant de noyau central aux protéoglycanes => très grande variété de protéoglycanes
Qu’est-ce que peuvent former les protéoglycanes ?
D’énormes complexes
Comment se nomment ces complexes ? Par quoi sont-ils formés ?
Par les protéoglycanes
Décrire la structure des protéoglycanes
Structures rigides et encombrantes : occupent un très grand volume dans la matrice extracellulaire
Les protéoglycanes sont-ils hydrophobes ou hydrophiles ? Qu’est-ce que cela implique ?
Très hydrophiles : absorbent une grande quantité d’eau et de cations (hydratés) => neutralisent leurs charges négatives => forment un gel
Que se passe-t-il lorsqu’il y a de la pression dans les protéoglycanes ? Qu’est-ce que cela explique entre autre ?
L’eau (et cations) est en partie expulsée du gel : augmente la densité de charges du polymère => forces de répulsion électrostatique empêchent une compression supplémentaire. Explique entre autre la forte résistance aux forces de compression des cartilages des articulations des genoux
Quel est le % en poids des sucres des protéoglycanes ?
Environ 95%
Les glycoprotéines plus simples ont-elles des GAG ?
Non
Quelle est la longueur des sucres des glycoprotéines plus simples ?
Oligosaccharides généralement de 3 à 7 résidus
Quel est le % en poids des sucres des glycoprotéines plus simples ?
1% à 60%
Les protéines glycosylées sont-elles homogènes ou hétérogènes ?
Très hétérogènes
Existe-t-il qu’une seule glycoforme d’une protéine dans une cellule ?
Différentes glycoformes d’une protéine dans une cellule
Quelles sont les variations entre les différentes glycoformes d’une protéine dans une cellule ?
Variation des séquences, des sites de liaison et du nombre d’oligosaccharides liés (1 à 30)
Une protéine ne peut être à la fois que O-glycosylée ou N-Glycosylée. Vrai ou Faux ?
Faux, une protéine peut être à la fois O- et N-glycosylée
Les oligosaccharides participent-ils à la structure des protéines qui les portent ?
Non, ils n’y participent pas
Les oligosaccharides des glycoprotéines plus simples sont-ils hydrophiles ou hydrophobes ?
Caractère hydrophile donc sont situés à la surface de la protéine repliée
Quelle est la principale classe de glycoprotéines ?
Les glycoprotéines N-glycosylées (ex : protéines plasmatiques)
Quels sont les trois grands types de glycoprotéines N-glycosylées ?
Complexes, riches en mannose et hybrides
Qu’est-ce qui caractérise les glycoprotéines N-glycosylées de type complexes et riches en mannose ?
Le coeur de l’oligosaccharide est un pentasaccharide Man3GlcNAc2
Qu’est-ce qui caractérise les glycoprotéines N-glycosylées de type riches en mannose ?
Ont 2 à 6 résidus mannose supplémentaire
Qu’est-ce qui caractérise les glycoprotéines N-glycosylées de type complexe ?
Ont d’autres sucres + 2 à 5 ramifications
Qu’est-ce qui caractérise les glycoprotéines N-glycosylées de type hybride ?
Ont des caractéristiques communes aux deux autres types
Quel est ce type de glycoprotéine N-glycosylée ?
Type riche en mannose
Quel est ce type de glycoprotéine N-glycosylée ?
Type complexe ?
Y-a-t-il qu’une seule sous classe de liaison O-Glycosidiques ?
Non, plusieurs sous-classes
Quelles sont les liaisons prédominantes des glycoprotéines O-glycosylées ?
GalNac-Ser(Thr) et GlcNac-Ser(Thr) sont les liaisons prédominantes
Par quoi sont régulées plusieurs protéines nucléaires et cytoplasmiques ?
Par O-GlcNAcylation
Qu’est-ce que sont des mucines ?
Des protéines formant le mucus des sécrétions gastro-intestinales et de la salive
De quoi est composée la salive ?
5% de mucines et 94% d’eau
Quel est le contenu en glucides des mucines ?
Le contenu en glucides dépasse 50% => la majorité sont O-liés à la mucine
De quoi sont composées les parois cellulaires des bactéries gram-positives et gram négatives ?
De peptidoglycanes
Nommer ces composés ainsi que ce qui est pointé par les flèches
De quoi sont composés les peptidoglycanes ?
Disaccharide NAG-NAM qui forme un lien amide avec un tetrapeptide
De quoi sont composées les Gram-positives ?
Pont de 5 glycines (peut contenir résidu Ala ou Ser)
De quoi sont composées les Gram-négatives ?
Les chaînes peptidiques sont directement reliées par des liens peptidiques
Comment sont placés les peptidoglycanes sur une bactérie ?
Sont enroulés autour de la membrane plasmique de la bactérie comme un câble composé de plusieurs brins
Qu’est-ce qui interfère avec le métabolisme des peptidoglycanes de la paroi cellulaire ?
Les antibiotiques de la famille de la pénicilline
Qui a découvert la pénicilline ? En quelle année ?
Alexander Fleming en 1928
