Notes Mathilde Chamula Microbio et Myco Flashcards
Énumérer les 5 grandes catégories de microorganismes d’importance médicale
Bactéries Champignons Parasites Virus Prions
Structure des bactéries
Unicellulaire
Structure des champignons
Unicellulaire et pluricellulaire
Structure des parasites
Unicellulaire et pluricellulaire
Structure des virus
Acellulaire
Structure des prions
Protéine (pas de matériel génétique)
Mode de reproduction des virus et prions
Réplication via machinerie génétique de l’hôte
Mode de reproduction des bactéries, champignons unicellulaires, et parasites unicellulaires
Fission binaire
Mode de reproduction des champignons pluricellulaires et des parasites pluricellulaires
Reproduction sexuée
Paroi des bactéries
Paroi de peptidoglycans
Paroi des champignons
Paroi de chitine
Paroi des parasites
Complexité variable jusqu’à petits animaux
Paroi virus
Capside +/- enveloppé
Paroi des prions
Aucune
Relation avec l’hôte pour:
Bactéries
Champignons
Parasite
Free living (Intracellulaire facultatif ou obligatoire) Free living (intracellulaire facultatif) Free living
Relation avec l’hôte pour virus et prions
Intracellulaire obligatoire
Deux types de paroi des bactéries
Gram+ (+ de peptidoglycan) et Gram- (membrane externe en plus)
Organites des bactéries (8)
Ribosomes ADN Paroi cellulaire Membrane plasmique Capsule Flagelle Pili Cytoplasme
Champignon unicellulaire
Levure
Champignon pluricellulaire
Champignon filamenteux
Organites de la levure (6)
Noyau (chromosomes) Cytoplasme Membrane plasmique Mitochondries Appareil de Golgi Membrane nucléaire
Organites des champignons filamenteux (dans les hyphes)
Mitochondries Noyau Septum (cloison) Cytoplasme Bulles d'air
Caractéristiques générales des amibes (parasites)
Classe des protozoaires Demeure unicellulaire (mais est plus gros qu'un globule blanc)
Structure (organises) de l’amibe (parasite)
Pseudopode Noyau Vacuole digestive Vacuole de stockage Vacuole contractile Membrane cellulaire Ectoplasme (cytoplasme périphérique) Endoplasme (cytoplasme central)
Parasites comme nématodes peuvent contenir des ______ complexes
systèmes
Taille des virus
Plus petits que bactéries (seulement visible en microscope électronique (noir et blanc)
Structure d’un virus (parties)
Capside (enveloppe de protéine) Glycoprotéines (en périphérie) Dans la capside: Brin d'ARN identique Enveloppe virale Parfois présence de lipoprotéines
Types d’interaction hôte et agent infectieux
- Commensal
- Saprophyte
- Parasite
- Symbiose
interaction 0/0
commensal
interaction +agent infectieux/0 hôte
saprophyte
interaction +agent infectieux/- hôte
Parasite
Interaction +/+
Symbiose
Microorganisme vivant sur une surface interne ou externe du corps
Colonisant
Ordre des types d’interaction en fonction du plus colonisant au moins colonisant
Commensal, saprophyte, symbiose
2 types de pathogènes
Pathogène obligatoire
Pathogène opportuniste
Infection de tous les hôtes = ?
pathogène obligatoire
Infection seulement si hôte immunodéprimé = ?
Pathogène opportuniste
Dommage pour l’hôte fait par ?
Parasite
Exemple de bactéries colonisant
Bactéries de l’intestin
Exemple de bactérie pathogène opportuniste
C difficile dans l’intestin
Utilités des bactéries
Carnivores: essentielles à la désintégration des tissus morts
Utilité industrielle (décontamination fuite toxique, yogourt, etc.)
Utilité des champignons
Végétariens: dégradation des matières végétales
Rôle dans l’alimentation humaine: bière, pain, fromages, etc.)
Ce qui rend un agent pathogène
Virulence
La virulence d’une bactérie est définie par deux paramètres, quels sont-ils?
Son environnement (une bactérie de l'intestin peut faire des dommages lorsqu'elle entre dans la circulation sanguine) Ses facteurs de virulence
Facteurs de virulence d’un microorganisme
Destruction des tissus de l’hôte
Évasion des défenses de l’hôte
Séquestration dans site inaccessible pour le système immunitaire
Quel est le nom de la spécialité médicale de la microbiologie
Microbiologie-infectiologie
En quels types de milieu les spécialistes en microbiologie-infectiologie font leur diagnostics?
Clinique
Laboratoire
Que vise le travail des spécialistes en microbiologie-infectiologie? (2 objectifs)
Traitement des infections
Prévention des infections (vaccins par ex)
Nommer les 4 grandes modalités diagnostiques
- Microbiologique
- Immunodiagnostic
- Diagnostic moléculaire
- Autres méthodes (ex. MALDI-TOF)
Étapes de la modalité diagnostique microbiologique
Examen direct
Culture
Test biochimique
(antibiogramme)
Examen direct a pour but de connaître la forme et le _________ des bactéries
type de paroi (Gram+ et Gram -)
Donner les 4 étapes de la coloration de Gram
Application du crystal violet
Application de l’iode (mordant)
Lavage à l’alcool (enlever les lipides de la membrane externe des gram -)
Application de la safranine
Classification bactérienne chez les bactéries aérobie
Gram+: Cocci (amas+chaine) et bacille (non sporulé, sporulé, ramifiés)
Gram-: Cocci et bacille
Classification bactérienne Chez les bactéries anaérobies
Gram+: Cocci et bacilles (non sporulé, sporulé, ramifiés)
Gram-: Cocci et bacille
La culture se fait en _______ ou en _______
bouillon
gélose
L’identification biochimique se fait à l’aide d’équipement permettant d’identifier ce que la bactérie est capable de ______
métaboliser
(identification) Antibiogramme permet d’évaluer l’impact de différents _______ sur la ________ des bactéries
antibiotiques
croissance
(identification) À quoi sert l’immunodiagnostic
Détection d’antigènes ou d’anticorps
Nommer une méthode diagnostiques de l’immunodiagnostic
ELISA
Composante de surface du microorganisme
Antigène (sa signature se trouve dans notre sang lors de tests)
Réponse immune de l’hôte à l’antigène
Anticorps
La présence d’un anticorps contre une bactérie dans notre sang indique quoi?
Que la bactérie se trouve dans notre sang
Dans quelles circonstances utilise-t-on l’immunodiagnostic?
Quand une bactérie est difficile à faire pousser ou un autre microorganisme
Très utilisé pour les virus
Étapes du processus immunodiagnostique
- on a un bouillon avec l’antigène
- Liaison de l’anticorps spécifique à l’antigène (On rajoute le sérum du corps) (pour que les anticorps se lient à l’antigène)
- Liaison de l’anticorps conjuguée à l’anticorps spécifique (anticorps conjugué a un agent fluorescent qui brille s’il se lie à qqchose)
- Addition du substrat pour l’enzyme produisant une substance colorée
(identification) Que recherche-t-ton lors d’un diagnostic moléculaire?
Le matériel génétique (ADN et/ou ARN) d’un microorganisme
Dx moléculaire =?
Détection du matériel génétique (mm si la bactérie est morte)
Avantages du diagnostic moléculaire
- Plus sensible que la culture
- Rapide
- Détection des pathogènes qui ne peuvent être cultivés
Exemple de méthode de diagnostic moléculaire
PCR (Polymérase Chain Reaction)
Autre méthode d’identification de microorganismes
MALDI-TOF (bactérie vaporisée permet d’avoir un spectre de ses composantes)
Avantages du MALDI-TOF
Plus discriminant que les tests biochimiques
Rapide
