Microbiologie M1S2 Flashcards
Quels sont les deux objectifs majeurs de tout être vivant ?
Se nourrir et se reproduire
Quels sont les besoins des bactéries ?
Énergie
Eau
Carbone
Azote
Minéraux
Facteurs de croissance
Quelles sont les deux sources d’énergie possibles pour les bactéries ?
La lumière
Les matières chimiques
Comment sont appelées les bactéries qui utilisent la lumière comme source d’énergie ?
Phototrophe
Que sont les bactéries phototrophes ?
Les bactéries qui ont la lumière comme source d’énergie.
Comment sont appelées les bactéries qui utilisent des éléments chimiques comme source d’énergie ?
Chimiotrophe
Qu’est ce qu’une bactérie chimiotrophe ?
Une bactérie qui utilise des éléments chimiques comme source d’énergie.
Quels sont les deux substrats pouvant être utilisés par les bactéries pour leur métabolisme énergétique ?
Matières organiques
Matières inorganiques
Comment sont appelées les bactéries qui utilisent un substrat minéral pour leur métabolisme énergétique ?
Lithotrophe
Qu’est ce qu’une bactérie lithotrophe ?
Une bactérie qui utilisent de la matière minérale (inorganique) comme substrat pour son métabolisme énergétique.
Comment sont appelées les bactéries qui utilisent un substrat organique pour leur métabolisme énergétique ?
Organotrophe
Qu’est ce qu’une bactérie organotrophe ?
Une bactérie qui utilise de la matière organique comme substrat pour son métabolisme énergétique.
Quelles sont les bactéries les plus souvent rencontrées quant à leur source et leur substrat énergétique ?
Les bactéries chimio-organotrophe
Quelles substances organiques peuvent être utilisées par les bactéries pour leur métabolisme énergétique ?
Lipides
Protéines
Glucides
Qu’est ce qu’une bactérie autotrophe?
Une bactérie qui puise son carbone dans de la matière inorganique.
Qu’est ce qu’une bactérie hétérotrophe ?
Une bactérie qui puise son carbone dans de la matière organique.
Comment appelle-t-on les bactéries qui puisent leur carbone dans de la matière inorganique ?
Autotrophe
Comment appelle-t-on les bactéries qui puisent leur carbone dans la matière organique ?
Hétérotrophe
Dans quelles molécules les bactéries autotrophes puisent-t-elles leur carbone ?
Le CO2.
Quelles sont les 3 étapes de la digestion extracellulaire pour extraire le carbone de la matière organique ?
- Sécrétion d’enzymes.
- Dégradation du substrat
- Ingestion des molécules dégradées.
Quelles sont les 3 sources d’azote pour les bactéries ?
Les molécules atmosphériques
Les molécules inorganiques
Les molécules organiques
Quelles sont les sources d’azote organiques des bactéries ?
Les acides aminés
Quelles sont les sources d’azote inorganiques des bactéries ?
Nitrates et nitrites
Ammoniac et sels ammonium
Quelle enzyme la bactérie sécrète-t-elle pour récupérer l’azote des molécules élémentaires atmosphériques ?
Nitrogenase
Quelles enzymes la bactérie sécrète-t-elle pour récupérer l’azote de l’ammoniac et des sels d’ammonium ?
Glutamate déshydrogénase
Glutamate synthase
Quelle enzyme la bactérie sécrète-t-elle pour récupérer l’azote des nitrites et nitrates ?
Nitrate réductase
Quelles enzymes la bactérie sécrète-t-elle pour récupérer l’azote des acides aminés ?
Protéases
Peptidases
Qu’est ce que l’Aw ?
Water activity : quantité d’eau libre dans une solution, non liée à d’autres molécules.
Quelle Aw est nécessaire pour la survie des bactéries ?
0,90
A quoi peut servir l’azote extraite des nitrates et des nitrites par les bacteries ?
Source d’azote
Accepteur final d’électrons dans fermentation.
Quels sont les deux minéraux nécessaires à la bactérie ?
Le soufre
Le phosphore
Quels sont les minéraux hors soufre et phosphore importants pour la bactérie ?
Cuivre, zinc, fer,
Quels minéraux servent pour les transports transmembranaires des bactéries ?
Na
Cl
K
Quels minéraux servent de cofacteur enzymatique aux bactéries ?
Mg
Fe
Zn
Se
Qu’est ce qu’un facteur de croissance ?
Une substance non synthétisée par la bactérie mais qui est nécessaire à son développement.
Qu’est ce qu’une bactérie prototrophe ?
Une bactérie qui ne nécessite aucun facteur de croissance.
Qu’est ce qu’une bactérie auxotrophe ?
Une bactérie qui nécessite un ou plusieurs facteurs de croissance pour son développement.
Comment appelle-t-on une bactérie qui nécessite un ou des facteurs de croissance pour son développement ?
Auxotrophe
Comment appelle-t-on une bactérie capable de se développer sans facteur de croissance ?
Prototrophe
Quelles molécules peuvent être des facteurs de croissance ? (4)
AA
AG
Vitamines
Mineraux
Qu’est ce que la syntrophie ?
Le développement de bactéries satellites autour de bactéries qui sécrètent les facteurs de croissance leur étant nécessaires.
Comment appelle-t-on le fait que certaines bactéries se développent en satellite autour d’autres bactéries productrices de facteurs de croissance ?
Syntrophie
Qu’est ce qu’un anti- métabolite ?
Une molécule analogue à un facteur de croissance qui peut entrer en compétition avec ce dernier et inhiber la croissance bactérienne.
Quelles sont les 3 étapes du métabolisme énergétique en partant du glucose ?
- Dégradation du glucose par glycolyse en pyruvate ou production de 6-phosphogluconate.
2.1 Dégradation du pyruvate par cycle de Krebs (respiration) ou fermentation.
2.2 Dégradation du 6-phosphogluconate par voie de pentose-phosphate (respiration) ou fermentation.
- Reoxydation des coenzymes réduits.
Quelles sont les deux voies du métabolisme énergétique ?
Respiration
Fermentation
Quels sont les 5 types respiratoires des bactéries ?
Anaérobies aerotolerantes
Aéro anaérobies facultatives
Aérobies strictes
Anaérobies strictes
Microaerophiles
Quels types respiratoires de bactéries ont la respiration pour voie métabolique énergétique ?
Aérobies strictes
Quel type respiratoires de bactéries ont la fermentation pour voie métabolique énergétique ?
Anaerobie strictes
Anaérobies aerotolerantes
Quel type respiratoire de bactéries ont aussi bien la respiration que la fermentation comme voie métabolique énergétique ?
Aero anaérobie facultative
Microaerophiles
Quel problème pose la respiration aérobie?
Formation et accumulation de produits toxiques.
Quels types respiratoires de bactéries produisent des enzymes detoxifiantes pour dégrader les produits toxiques de la respiration aérobie ?
Aérobies facultatives
Anaérobies facultatives
Microaerophiles (en petite quantité)
Aérobies strictes
Quels sont les (5) différents types de fermentations ?
Fermentation lactique
Fermentation alcoolique
Fermentation acétique
Fermentation propionique
Fermentation butyrique
Quels sont les produits des différents types de fermentation et dans quels domaines sont ils utilisés ?
Fermentation lactique : acide lactique (yaourts, fromages frais)
Fermentation alcoolique : alcool éthylique (éthanol) (vinification, boissons alcoolisées)
Fermentation acétique : acide acétique (vinaigre)
Fermentation propionique : acide propionique ( affinage des fromages à trous)
Fermentation butyrique : acide butanoïque (affinage de certains fromages)
Quelles sont les 3 différents types relations entre la bactérie et son hôte ?
Nutritionnelle
Temporelle
Spatiale
Quelles sont les différents types de relations entre la bactérie et son hôte sur le plan nutritionnel ?
Saprophytisme
Symbiose
Parasitisme
Commensalisme
Qu’est ce que le saprophytisme ?
Lorsque la bactérie se nourrit des matières organiques en décomposition, recyclant ainsi les déchets de son hôte.
Qu’est ce que la symbiose ?
Cohabitation de deux organismes d’espèce différents (symbiote et hôte), chacun possédant une fonction qui manque à l’autre. Ils sont indispensables l’un pour l’autre.
Qu’est ce que le parasitisme ?
Relation dans laquelle le parasite tire profit en se nourrissant, s’abritant ou en se reproduisant au dépens de son hôte.
Qu’est ce que le commensalisme ?
Relation proche du parasitisme mais qui ne nuit pas à l’hôte. Le commensal vit aux dépens de son hôte sans lui causer de torts.
Quels sont les deux types de parasitismes ?
Parasitisme monoxene (direct)
Parasitisme heteroxene (passant par plusieurs hôtes intermédiaires)
Qu’est ce que la flore résidente ?
Microbiote constant pendant de longues périodes voire toute la vie.
Qu’est ce que la flore transitoire ?
Témoin d’une défaillance, d’un déséquilibre de la flore résidente.
Quelle est l’autre appellation de la flore transitoire ?
Flore de contamination.
Quelles sont les 4 flores que l’on trouve dans le corps humain ?
Flore digestive
Flore cutanée
Flore génitale
Flore respiratoire
Quel est le poids moyen du microbiote digestif ?
1,5kg
Quelles sont les 4 fonctions de la flore digestive ?
Production de fèces (près de 80%).
Barrière protectrice.
Dégradations de sels biliaires, de la bilirubine, de certains médicaments et additifs alimentaires.
Principale source de vitamine K.
Qu’est ce qu’un prébiotique?
Molécule ou assemblage de molécules alimentaires favorisant l’implantation, la survie et la multiplication d’un probiotique.
Qu’est ce qu’un probiotique ?
Micro-organisme vivant censé exercer un effet bénéfique sur son hôte lorsqu’il est ingéré de manière régulière et qu’il est résistant à l’acide chlorhydrique et à la bile.
Qu’est ce qu’un porteur sain ?
Individu portant une bactérie pathogène mais qui ne présente aucun symptôme clinique.
En quoi les porteurs sains présentent un problème en terme d’hygiène alimentaire ?
N’ayant pas de symptômes apparents, la présence de la bactérie pathogène passe inaperçue. Le porteur sain peut cependant contaminer les aliments.
Quelles sont les deux solutions pour prévenir les risques que présentent les porteurs sains ?
Respect des règles d’hygiène
Tests sur le personnels
Quelles sont les deux phases de la vie bactérienne ?
Végétative
Division
Quelles sont les étapes de la division cellulaire bactérienne ?
- Réplication de l’ADN
- Séparation des chromosomes
- Séparation du cytoplasme par l’apparition d’un septum
- Séparation des molécules de la paroi.
- Croissance des cellules filles
Quelle est la particularité génétique des cellules filles bactériennes ?
Elles sont des copies conformes de la cellule mère.
Que se passe-t-il lors de la division cellulaire pour les bactéries dont la paroi est riche en peptidoglycane (GRAM+) ?
Elles restent accrochées par la capsule formant des chaînettes.
Combien de molécules d’ATP donne une mole de glucose par la voie de la respiration ?
36 ATP
Combien de molécules d’ATP permet de former la fermentation ?
2 ATP
Qu’implique la croissance bactérienne quant aux cellules et au substrat ?
Une augmentation du volume des cellules et une diminution du substrat nutritionnel.
Quelles sont les 8 facteurs influençant la croissance bactérienne ?
Concentration du substrat nutritionnel
Pression osmotique
Oxygène
Facteurs de croissance
Aw
Température
pH
Accumulation des déchets métaboliques
Qu’est ce qu’un milieu renouvelé ?
Milieu où l’on ajoute régulièrement du substrat et dont on enlève constamment les déchets métaboliques.
Comment se développe une colonie bactérienne dans un milieu renouvelé ?
De manière continue et exponentielle
Qu’est ce qu’un milieu non renouvelé ?
Milieu naturel. Raréfaction du substrat et accumulation de déchets métaboliques.
Combien de temps dure la croissance en milieu non renouvelé ?
16 à 24h
Quelles sont les 6 phases d’une croissance bactérienne en milieu non renouvelé ?
Phase de latence
Phase d’accélération
Phase de croissance exponentielle
Phase de ralentissement
Phase stationnaire
Phase de decroissance
Quels sont les 3 types de bactéries selon leur température optimale de développement ?
Thermophiles : 25 à 90°C (opt 50-55°C)
Mesophiles : 10 à 45°C (opt 37°C)
Cryophiles : -10 à 25°C (opt 4°C)
Comment son classées les bactéries selon le pH optimal de croissance ?
Neutrophiles (la plupart des bactéries)
Basophiles
Acidophiles
Quelles caractéristiques de la bactéries lui donnent une capacité de résistance aux variations de pH ?
Capsule
Spore
Quelles sont les limites à l’ajout de substrat nutritionnel pour la croissance bactérienne ?
Au delà d’une certaine concentration il y a diminution de l’Aw et augmentation de la pression osmotique. Effet favorable à la croissance interrompu.
Qu’est ce qui protège les bactéries de la pression osmotique ?
La paroi
Comment s’appellent les bactéries qui résistent à une forte concentration en sel ?
Halophiles ou halotolérantes
Comment s’appellent les bactéries qui résistent à une forte concentration en sucre ?
Osmophiles
Quels sont les 4 caractéristiques permettant d’identifier des bactéries ?
Aspect
Couleur
Mobilité
Activité enzymatique
Quels sont les différentes techniques d’identification bactérienne ?
Systèmes automatisés 48h
Spectrométrie moins de 24h
Hybridation in situ moins de 2h
Quel procédé permet d’étudier la sensibilité des bactéries aux principaux antibiotiques ?
Antibiogramme
Qu’est ce que le dénombrement bactérien ?
Détermination de la concentration en bactéries d’un produit ou d’une surface.
Quel procédé permet le dénombrement bactérien ?
La dilution decimale
Quelle est la formule pour calculer le dénombrement bactérien ?
Nombre de germes visibles x 10 x nombre de dilutions
Qu’est ce que la turbidimétrie ?
Mesure du trouble produit par les bactéries en suspension dans un milieu liquide. Mesuré par spectrophotométrie.
Qu’est ce que le test de la contamination fécale ?
Recherche de bactéries spécifiques au microbiote intestinal dans un échantillon.
Quels sont les germes recherches lors d’un test de contamination fécale ?
Coliformes totaux : faciles à identifier mais peu spécifiques.
Coliformes thermo- tolérants : origine exclusivement fécale. Contamination récente.
Streptocoques fécaux : contamination ancienne.
Anaérobies sulfuto-reducteurs
Quelles sont les deux classes de détermination des infections bactériennes des denrées alimentaires dans le règlement européen ?
Plan à deux classes
Plan à trois classes
Qu’est ce qu’un plan à deux classes dans la sécurité des denrées alimentaires ?
Présence ou absence de la bactérie recherchée. 0 tolérance. Bactéries très pathogènes.
Qu’est ce qu’un plan à 3 classes dans la sécurité des denrées alimentaires ?
Classement des denrées en 3 groupes :
- Satisfaisante.
- Acceptable
- Non satisfaisante
Comment sont classées les denrées alimentaires dans un plan à trois classes ?
N : nombre de prélèvements
m et M : valeurs limites fixées en fonction du micro-organisme
C : nombre maximal de prélèvements.
C/N ←m : denrée satisfaisante
m - C/N - M maximum : denrée acceptable
M → C/N : denrée non satisfaisante
Quelles sont les 4 caractéristiques des bactéries propioniques ?
Gram +
Anaérobies aerotolerantes
Mesophiles
Non sporulees
