Microbiologie - Génétique bactérienne Flashcards

1
Q

Les infections représentent quelle proportion (%) des décès mondiaux?

A

16%

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2
Q

Nommer 3 mécanismes de résistance aux antibiotiques.

A
  1. Altération de la perméabilité/séquestration
  2. Modification ou destruction de l’antibiotique
  3. Modification ou remplacement de la cible
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3
Q

Nommer quelques exemples de cibles des antibiotiques.

A
  • Membrane
  • Synthèse d’ATP
  • Biosynthèse de l’acide folique
  • Paroi
  • Synthèse des protéines
  • Polymérase à ARN
  • Gyrases à ADN
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4
Q

Pourquoi les antibiotiques qui ciblent la paroi sont-ils souvent peu toxiques?

A

Car la paroi est unique aux bactéries (les cellules humaines n’en ont pas)

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5
Q

Vrai ou faux. Les plasmides codent pour des fonctions essentielles à la cellule.

A

Faux.

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6
Q

Quelle structure bactérienne permet l’empaquetage compact du matériel génétique?

A

Le nucléoïde

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7
Q

Nommer 3 facteurs qui donnent un avantage à la bactérie conférés par le pasmide.

A
  • Résistance aux antibiotiques
  • Capacité métabolique supplémentaire
  • Facteur favorisant l’infection
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8
Q

Chez les bactéries, un gène de longueur moyenne occupe combien de paires de bases?

A

1000 environ

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9
Q

Quels sont les 3 types de gènes pouvant être retrouvés dans le chromosome bactérien?

A
  • Résistance
  • Virulence
  • Essentiel
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10
Q

Vrai ou faux. En général, les bactéries ont un seul chromosome qui est circulaire.

A

Vrai

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11
Q

Qu’est-ce que le pangénome?

A

Ensemble des gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne

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12
Q

Qu’est-ce que le génome de base?

A

Gènes communs à toutes les souches d’une même espèce

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13
Q

Qu’est-ce que le génome accessoire?

A

Gènes retrouvés dans certaines souches mais absents chez d’autres souches

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14
Q

Compléter la phrase.

Génome de base + génome accessoire = …

A

Pangénome

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15
Q

Quel est le mode de division des bactéries?

A

La fission binaire

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16
Q

Vrai ou faux. Dans la fission binaire, il y a répartition égale des copies du chromosome entre les cellules filles.

A

Vrai

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17
Q

Vrai ou faux. Dans la fission binaire, il y a répartition égale des copies du plasmide entre les cellules filles.

A

Faux, pas toujours

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18
Q

Combien de temps prend en moyenne la production d’une génération bactérienne par fission binaire?

A

20 minutes

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19
Q

Quels sont les 3 types de régulation de l’expression des gènes?

A
  1. Changement dans la séquence d’ADN
  2. Changement dans le nombre de transcrits
  3. Changement dans la quantité de produit de gène actif

En gras = plus important chez les bactéries

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20
Q

Qu’est-ce qu’un répresseur?

A

Protéine inhibant la transcription d’un gène en se liant à une séquence spécifique de nucléotides

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21
Q

Qu’est-ce qu’un activateur?

A

Protéine qui stimule la transcription d’un gène

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22
Q

Compléter la phrase.

Le contrôle négatif s’effectue par un …

A

Répresseur

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23
Q

Compléter la phrase.

Le contrôle positif s’effectue par …

A

Un activateur

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24
Q

Compléter la phrase.

La régulation de l’expression des gènes est un processus actif qui exige que la cellule soit …

A

Dans un état métabolique actif

25
Qu'est-ce que la régulation simple?
Un promoteur pour contrôler un gène
26
Qu'est-ce que la régulation dans un opéron?
Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents
27
Qu'est-ce que la régulation par un régulon?
Une seule protéine régulatrice pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome
28
Qu'est-ce que la régulation par un stimulon?
Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus
29
Qu'est-ce qu'une mutation?
Modification de la séquence des nucléotides de l'ADN
30
Qu'est-ce qu'un mutation mauvais sens?
Qui créé une protéine défectueuse
31
Qu'est-ce qu'une mutation non sens?
Qui créé une protéine incomplète (codon stop prématuré)
32
Qu'est-ce qu'une mutation silencieuse?
Qui créé la même protéine que prévu (mais peut quand même avoir un impact sur le fonctionnement optimal de la cellule mutée)
33
Quels sont les 5 groupes distincts de systèmes de réparation de l'ADN bactérien?
* Réparation directe de l'ADN * Réparation par excision * Réparation par recombinaison * Réponse SOS * Réponse sujette à erreur
34
Que peut entraîner une concentration suboptimale des antibiotiques?
La sélection de mutants résistants
35
Vrai ou faux. L'action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation de l'ADN chez les bactéries.
Vrai | Ex: aminoglycosides, B-lactamines et quinolones à faible concentration
36
Quelles sont les 3 méthodes d'échange de gènes chez les bactéries?
1. Transformation 2. Conjugaison 3. Transduction
37
Qu'est-ce que le mécanisme de transformation?
Capacité de la cellule d'être transformée (modifiée génétiquement) par de l'ADN externe libre. | Appelé compétence
38
Chez quelle bactérie particulière la compétence est naturelle?
Streptococcus pneumoniae (et autres espèces apparentées de streptocoques)
39
Comment fonctionne le mécanisme de compétence/transformation?
La bactérie entre en contact avec des fragments d'ADN provenant d'autres bactéries (mortes) et l'intègre à son génome
40
Comment les antibiotiques peuvent-ils favoriser la transformation?
1. En imposant une pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance 2. En agissant comme stimulus externe induisant ou augmentant la compétence 3. En favorisant la lyse des cellules, libérant l'ADN servant à la transformation
41
Quel est le principal mécanisme d'échange horizontal de gènes entre les bactéries?
La conjugaison
42
Comment le plasmide conjugatif peut-il être transmis à une autre cellule?
Avec un pili conjugatif (sexuel)
43
Qu'est-ce que la mobilisation?
Transfert de plasmides non-conjugatifs via la machinerie de plasmides conjugatifs
44
Qu'est-ce qu'un bactériophage?
Virus qui parasitent uniquement les bactéries
45
Qu'est-ce que la transduction?
Transfert de gènes médié par les bactériophages
46
Qu'est-ce que la capside?
Enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique (ADN ou ARN de phage)
47
Quelles sont les formes que les bactériophages peuvent prendre selon les cycles de vie?
* Lytiques * Lysogéniques * Chroniques
48
Vrai ou faux. Le cycle lysogénique précède le cycle lytique.
Vrai
49
Qu'est-ce que la transduction spécialisée?
Lorsqu'il y a empaquetage accidentel, et qu'il y a création d'un génome hybride phage-bactérie
50
Qu'est-ce que la transduction généralisée?
Empaquetage accidentel uniquement de fragments de l'ADN de l'hôte
51
Quel phénomène est le plus fréquent: transduction spécialisée ou généralisée?
Généralisée
52
Qu'est-ce que la transposition?
Mouvement de segments d'ADN à l'intérieur d'une même cellule (donc nécessite une proximité physique)
53
Quelles sont les 3 classes de transposons?
* Séquences d'insertion * Transposons complexes * Phages transposables
54
Pourquoi les transposons complexes ont une importance médicale considérable?
Car ils peuvent encoder à l'intérieur de leur région centrale, des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques
55
Que sont les intégrons?
Des éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l'expression de multiples gènes simultanément
56
Qu'est-ce que la pharmacoécologie?
Effet des interventions sur la composition et les fonctions du microbiome
57
Qu'est-ce que la pharmacomicrobiomique?
Effet des microbiomes sur la pharmacocinétique, pharmacodynamie, efficacité et toxicité des médicaments
58
Vrai ou faux. Les humains peuvent devenir résistants aux antibiotiques.
Faux, c'est la bactérie qui devient résistante et non l'humain