Microbiologie 3 : Bâtonnets Gram - Flashcards
Paroi d’un bâtonnet Gram -
- Pas d’acides teichoïques et lipo-teichoïques
- Espace périplasmique (enzymes, facteurs de virulence)
- Membrane externe
- LPS : endotoxine
- Porines
Membrane externe de la paroi
- Maintient la structure de la bactérie
- Rôle de protection
- Structure asymétrique avec couche phospholipidique interne et couche externe de lipolysaccharides
LPS dans la paroi
- Extoxine
- Stimulation de la réponse immunitaire
- Cause de la fièvre et choc septique
Porines dans la paroi
- Diffusion passive de petites molécules
- Contrôle transport molécules plus groses
- Contrôle export antimicrobiens
Composition des lipopolysaccharides
- Antigène O :
-Chaîne polysaccharidique
-Reconnaissance spécifique par anticorps et détermination sérotype - Polysaccharide central (identique pour toutes les entérobactéries)
- Lipide A :
-Ancrage LPS dans membrane externe
-Responsable de l’activité endotoxine
-Conservation chez bactéries même espèce
Mécanisme d’action d’une endotoxine
- Réponse inflammatoire démesurée après liaison au TLR4
- Activation du complément, relâche cytokines
- Fièvre, diarrhée, choc septique, mort
- Leucocytose, thrombocytopénie, coagulation intravasculaire disséminée, circulation périphérique diminuée
Particularité des lipopolysaccharides de la paroi d’un bâtonnet Gram -
Résistants à la chaleur
Quelle est la famille la plus large des bâtonnets Gram -?
Entérobactéries
Quel sont les caractéristiques d’identification des entéropathogènes?
- Bâtonnets Gram -
- Non-sporulant
- Anaérobie facultatif
Quelles sont les caractéristiques générales des entéropathogènes?
- Antigène commun entérobactérien
- Fermentation glucose
- Catalase +
- Oxydase - (pas de cytochrome oxydase)
Les entéropathogènes sont-ils mobiles?
Oui, sauf Shigella, Yersinia, Klebsiella
Quel est le réservoir des entéropathogènes?
Ubiquitaire: Terre, eau, végétation, flore intestinale normale des humains et animaux
Quelles infections les entéropathogènes causent-ils souvent?
- Bactériémies
- UTI
- Infections intestinales
Quels entéropathogènes sont des pathogènes uniquement chez l’humain et quels maladies causent-ils?
- Salmonella Typhi
- Shigella
- Yersinia pestis
- gastroentérites exogènes, méningites néonatales, UTI
Quels entéropathogènes font partie de la flore normale de l’intestin?
- E. coli
- Klebsiella pneumonia
- Proteus mirabilis
Quels entéropathogènes sont acquis via un réservoir animal?
- Salmonella
- Yersinia
Quel est le rôle de la capsule des entéropathogènes?
- Antiphagocytose
- Antigènes hydrophiles repoussent surface hydrophobe des cellules phagocytaires
- Empêche liaison anticorps, mauvais immunogène/activateur du complément,
- Protège contre attaque du sérum
Quels sont les facteurs de virulence des entéropathogènes? (7)
- Endotoxines (lipide A)
- Capsule
- Variation antigénique
- Système de sécrétion type III
- Séquestration facteurs de croissance
- Résistance à l’attaque du sérum (complément)
- Résistance aux antibiotiques
Quel est le rôle de la variation antigénique des entéropathogènes?
- Protection contre anticorps
- utile pour classification sérologique
Quelles composantes des entéropathogènes sont impliquées dans la variation antigénique ?
- Polysaccharide somatique O
- Antigène capsulaire K
- Antigène flagellaire H
Quel est le rôle du système de sécrétion des entéropathogènes?
Transférer les facteurs de virulence sur les cellules hôtes ciblées
Quel est le rôle de la séquestration des facteurs de croissance des entéropathogènes?
Production de sidérophores ou agents chélateurs pour le fer = compétition du fer fixé aux protéines d’hème ou protéines chélateurs de fer
Quel est le rôle de la résistance à l’attaque du sérum des entéropathogènes?
Prévention attachement du complément
Comment la résistance aux antibiotiques est elle acquise par les entéropathogènes?
Encodé sur plasmide et transfert d’une espèce à l’autre
Quels sont les principaux critères d’identification d’Escherichia coli?
- Bâtonnets Gram -
- Anaérobie facultatif
- Fermentation
- Oxydase -
Quels sont les principaux critères d’identification de Klebsiella pneumoniae?
Apparence mucoïde à cause de capsule
Quels sont les principaux critères d’identification de Salmonella?
- Bâtonnets Gram -
- Anaérobie facultatif
- Fermentation
- Oxydase -
Quels sont les principaux critères d’identification de Pseudomonas aeruginosa?
- Bâtonnets Gram -
- Aérobie stricte
- Pas de fermentation
- Glucose oxydase +
- Motile
Quels sont les principaux critères d’identification de Bacteriodes fragilis?
- Bâtonnets Gram -
- Anaérobie
Quelles sont les principales infections liées à Bacteriodes fragilis?
- Bactériémie
- Infections pleuro-pulmonaire, Intra-abdominale, Génitale, Peau et tissus mous caractérisées par formation d’abcès
- Gastroentérite: Diarrhée
Quelles sont les principales infections liées à Escherichia coli?
- Gastroentérite
- Infections extra-intestinales (bactériémie, méningite néonatale, UTI, infections intra-abdominales)
Quelles sont les principales infections liées à Klebsiella pneumoniae?
Pneumonie, infections des tissus mous et plaies, UTI
Quelles sont les principales infections liées à Salmonella?
S. Typhi/paratiphy :
* Fièvre entérique (fièvre typhoïde/paratyphoïde, myalgie, maux têtes, anorexie) –> réinfection intestins
* Bactériémie : infections suppuratives os, coeur, articulations
* Colonisation asymptomatique : vésicule biliaire = réservoir
Autres:
* Gastroentérite (fièvre, nausée & vomissements, diarrhée +/- sang, crampes abdominales)
Quelles sont les principales infections liées à Yersinia enterocolitica?
2/3 =
* Entérocolite/gastroentérite
* Gastroentérite
* Pseudo-appendicite (surtout enfant, iléon terminal)
Adulte: septicémie, arthrite, abcès intra-abdominal, hépatite, ostéomyélite, choc endotoxique
Quelles sont les principales infections liées à Shigella?
Gastroentérite (shigellose) :
* Diarrhée liquide sanglante
* Pus : neutrophiles, globules rouges et mucus (à cause d’entérotoxine)
* Crampes abdominales
PAS DE BACTÉRIÉMIE
Quelles sont les principales infections liées à Pseudomonas aeruginosa?
- Peau et tissus mous
- SNC
- Endocardite
- UTI: opportuniste quand présence d’un cathéter et prise d’antibiotiques
- Ostéochondrite
- Système musculosquelettique
- Otite externe
- Bactériémie
- Voies respiratoires : de trachéobronchite à nécrose du parenchyme pulmonaire
- Yeux: ulcère cornée
- Infection tractus GI
Quel est le réservoir de Pseudomonas aeruginosa?
Ubiquitaire: Partout, nature, environnement humide hospitalier (fleurs, lavabos, toilettes, équipement de lavage)
Quand Pseudomonas aeruginosa est-il plus fréquent?
- Pas d’incidence saisonnière
- Infections nosocomiales
Quel endroit du corps Pseudomonas aeruginosa colonise-t-il?
Tractus respiratoire ou GI
Quels sont les facteurs de risques pour le Pseudomonas aeruginosa?
Opportuniste donc :
* Prise d’antibiotiques
* Équipement respiratoire
* Neutropénie
* Immunosupprimés
* Fibrose kystique
* Grands brûlés
* Lésions cutanées
Infections nosocomiales
Quels sont les mécanismes de virulence du Pseudomonas aeruginosa?
- Capsule polysaccharide,
- Adhésines (flagelle, pili, LPS, alginate),
- Toxines (exotoxine A, pyocyanine, pyoverdine),
- Enzymes (Élastase, alkaline protéase, phospholipase C, exoenzymes S et T),
- Système de sécrétion type III et résistance antimicrobienne (intrinsèque, acquis et adaptatif)
Quel est le rôle de l‘exotoxine A du Pseudomonas aeruginosa?
- Inhiber synthèse protéique
- Entraîne dommages tissus (brûlures et poumons) et yeux
Quel est le rôle de la pyocyanine du Pseudomonas aeruginosa?
- Catalyse production de superoxide et H2O2
- Stimule relargage de IL-8
- Attire neutrophiles
Quel est le rôle de la pyoverdine du Pseudomonas aeruginosa?
Sidérophore qui lie le fer et régulation de sécrétion autres facteurs virulence dont exotoxine A
Quel est le rôle de l’élastase du Pseudomonas aeruginosa?
LasA et LasB dégradent l’élastine :
* Détruit parenchyme pulmonaire et lésions hémorragiques
* Dégradation de complément
* Inhibition chimiotaxie neutrophiles = diffusion bactérie
Quel est le rôle de l’alkaline protéase du Pseudomonas aeruginosa?
Destruction tissulaire :
* Diffusion bactérie,
* Interfère réaction immunitaire hôte
Quel est le rôle de la phospholipase C du Pseudomonas aeruginosa?
Hémolysine thermolabile (inactivée par chaleur) facilitant destruction tissulaire
Quel est le rôle des exoenzymes S et T du Pseudomonas aeruginosa?
- Toxines extracellulaires
- Destruction tissulaire (nécrose)
- Diffusion bactérie
Quel est le rôle du système de sécrétion de type III du Pseudomonas aeruginosa?
Sécrétion de protéine (dont exotoxines S et T) :
- Destruction tissulaire
- Diffusion bactérie
Quel est le réservoir du Bacteroides fragilis?
- Tractus GI humain et animaux
- Rare ou absent dans oropharynx ou tractus génital des individus sains
Quel est le mode de transmission du Bacteroides fragilis?
Endogène
Quels sont les mécanismes de virulence du Bacteroides fragilis?
- Capsule polysaccharide
- LPS sans activité endotoxique
- B. Fragilis toxin : Toxine métalloprotéase thermolabile responsable de diarrhée
- Fimbriae: adhésion aux cellules épithéliales et extracellulaires (fibrinogène, fibronectine et lactoferrine)
Quelles sont les principales manifestations extra-intestinales du Escherichia coli?
- UTI
- Méningite néonatale (cause majoritaire infection SNC <1 an)
- Septicémie (suite à infection intra-abdominale)
Quelle est la pathogénèse des UTI associées au Escherichia coli?
Origine côlon –> contamine urètre–> monte vers vessie–> migre vers rein ou prostate
Qu’est-ce qu’une bactériurie asymptomatique?
- Présence significative de bactéries de l’urine en l’absence de symptômes de UTI
- Courant pour patients avec cathéter urinaire et femme postménopause
- Pas traitement ni dépistage (sauf femmes enceintes) car complications rares
Qu’est-ce qu’une infection urinaire non compliquée?
- Infection urinaire qui peut être aigue, sporadique ou récidivante
- Chez la femme en bonne santé, indépendamment de son âge
Qu’est-ce qu’une infection urinaire compliquée?
- Toute autre infection urinaire
- Chez la femme enceinte, l’homme, patient avec anomalie anatomique/fonctionnelle de l’appareil urinaire, porteuse d’un cathéter urinaire, ayant subi une manipulation urologique, atteinte d’immunosuppression
Quel est la fréquence requise pour qu’une infection urinaire soit considérée comme récidivante?
- Survenance de l’infection urinaire : 2 fois/6 mois et au moins 3-4 fois/an
- Réinfection par même bactérie ou nouvelle infection par autres bactéries
- Souvent causée par : résistance bactérienne, traitement inadéquat ou anomalie anatomique
- Récidive habituellement très rapidement, 2-4 semaines max après le traitement initial
Quels sont les 4 agents étiologiques les plus fréquents responsables d’infection urinaire?
- Gram - : E. coli, Klebsiella pneumoniae,
- Gram + : Staph. saprophyticus, Enterococcus
Quels sont les symptômes évocateurs d’une cystite?
Infection urinaire basse :
- Dysurie (difficulté et douleur/brûlure uriner)
- Pollakiurie (envies fréquentes mais pas bcp d’urine)
- Hématurie
- Douleur suspubienne
Quels sont les symptômes évocateurs d’une pyélonéphrite?
Infection urinaire haute :
- Forme plus sérieuse, arrive surtout chez les femmes
- Forte fièvre subite : urgence
- Frissons
- Nausées & vomissements
- Douleur dorso-lombaire au test de percussion («punch rénal» positif)
- Symptômes de cystite (souvent)
Quels sont les éléments principaux du diagnostic clinique et microbiologique d’infection urinaire?
- Observation des symptômes et signes cliniques
- Bandelette urinaire
- Culture d’urine
- Observations microscopiques
Quels sont des exemples de symptômes cliniques pouvant orienter le diagnostic d’infection urinaire?
- Femmes : écoulements vaginaux ou pertes vaginales, prurit vulvaire, symptômes de grossesse
- Hommes : douleur à l’examen prostatique ou testiculaire
Quels sont les avantages associés à l’utilisation de bandelettes urinaires pour le diagnostic d’infection urinaire?
Simple, peu coûteux, fiable, recommandé pour tous les UTIs
Quels sont les éléments qui permettent de conclure si un test de bandelettes urinaires est positif ou négatif pour le diagnostic d’infection urinaire?
- Présence d’estérases leucocytaires, de nitrites et de symptômes urinaires de novo –> Bonne valeur prédictive positive (VPP) = 90%
- Absence d’estérase leucocytaire et/ou de symptôme urinaire de novo–> Bonne valeur prédictive négative (VPN) = 90%
Dans quels cas la culture d’urine est-elle factultative pour le diagnostic d’infection urinaire?
Cystite non compliquée ou récidivante déjà documentée, SAUF :
* Récidive moins de 1 mois
* Symptômes persistants ou échec du traitement antibiotique
* Combinaison de symptômes et signes cliniques, mais résultats bandelettes urinaires négatifs
* Voyage récent dans zone à risque de bactéries multirésistantes et symptômes urinaires
Dans quels cas la culture d’urine n’est pas recommandée pour le diagnostic d’infection urinaire?
Patient porteur d’une sonde urinaire sans symptôme ou signe clinique sauf pour cas particuliers (urosepsie)
Quelles observations microscopiques sont utiles pour le diagnostic d’infection urinaire?
Dénombrement du nb de globule rouges/mcL d’urine non-centrifugée et détecter bactéries
Quelles sont les deux indications de traitement de la bactériurie asymptomatique?
La bactériurie asymptomatique ne doit pas être traitée, sauf:
* Femmes enceintes (risque de transmission verticale)
* Patient avec problème obstructif non traitable (calculi)
