Microbiologie Flashcards
Caractéristique microscopique des gram positif
couche épaisse de peptidoglycans dans la paroi cellulaire, permet de garder le violet de crystal, on l’air mauve quand on les colore au gram
Caractéristiques microscopique des gram négatif
fine couche de peptidoglycane
membrane externe plus complexe on l’air rouge/rose quand on les colore au gram
Quel avantage donne la paroi cellulaire épaisse des bactéries gram positif?
la parois cellulaire épaisse des gram positifs leurs confère de la résistante et une survie plus facile dans l’environnement
Nommer des coccis gram positif
Staphylococcus
Streptococcus
Enterococcus
Nommer des coccis grams négatif
Neisseria:
- meningitidis
- gonorrhoeae
Moraxella catarrhalis
Nommer des bâtonnets gram positif
Sporulés:
- Bacillus (souvent un contaminant de la peau)
- CLOSTRIDIUM
Lettres chinoises:
- Corynebacterium (souvent un contaminant de la peau)
Longs et minces:
- LISTERIA MONOCYTOGENES (toujours y penser, c’est insidieux, parfois juste de la fièvre, surtout chez la femme enceinte!)
- Lactobacillus
- Erysipelothrix
Embranchés:
- Nocardia
- Actinomyces
Nommer des bâtonnets gram négatif
Entérobactéries:
- escherichia coli (le plus fréquent)
- klebsiella pneumoniae
- proteus mirabilis
- salmonella spp.
- shigella spp.
- yersinia enterocolitica
- enterobacter spp.
Autres:
- haemophilus influenzae
- pseudomonas aeruginosa
- stenotrophomonas altophilia
- acinetobacter baumanii
- pasteurella multocida
- bacteroides fragilis
Cocci gram + diplocoques (en paires) on pense à quoi?
Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)
Cocci gram + en chaines
Streptococcus
Enterococcus (ne pas l’oublier!)
Cocci gram + en amas
Staphylococcus
Nommer des bactéries anaérobes strictes
Bacteroides fragilis
Clostridium spp.
Streptococcus anaerobius
Femme enceinte qui fait de la fièvre, hémocultures le gram montre des bâtonnets gram positif, à quoi faut-il penser?
Listeria monocytogenes!
Très dangereux en grossesse pour la patiente et le foetus
ça peut se présenter par une méningite
ou seulement de la fièvre
Comment détruire les spores?
Stérilisation
eau de javel
peroxyde d’hydrogène
donc procédure de désinfection différente quand on pense que le patient a un clostridium
Quels sont les 4 principaux mécanismes d’actions des antibiotiques?
Interférence avec la synthèse de la paroi cellulaire (on aime ce mécanisme car l’humain n’a pas de paroi cellulaire, donc moins d’effet indésirable)
Interférence avec la synthèse de protéines
Interférence avec la synthèse d’ADN
Inhibition de la synthèse de métabolites essentiels
Nommer les 2 grandes familles d’antibiotiques qui s’attaquent à la paroi cellulaire de la bactérie?
B-lactamines:
- pénicillines
- céphalosporines
- monobactams
- carbapénems
- +/- combinaison avec un inhibiteur des beta-lactamases
Glycopeptides:
- vancomycine
- daptomycine
Mécanisme d’action des B-lactamines
Inhibe la synthèse de la paroi cellulaire:
- le noyau beta-lactame se lie de façon covalente avec les PBP (protein binding proteins) –> empêchent les chaînes de peptigoglycans de se faire entre-elles –> bactéricide –> ultimemement cause la lyse de la cellule
Les B-lactames sont tous pareilles, la différence ce sont les chaines latérales sur leur noyau beta-lactame qui modifie leur liaison aux PBP
Mécanisme d’action des glycopeptides
Inhibe la synthèse de la paroi cellulaire par un mécanisme différent que les B-lactamines
ça s’attaque à la paroi cellulaire
Nommer les familles d’antibiotiques qui ont comme cible d’attaque les ribosomes (empêchent la synthèse des protéines)
Aminoglycosides:
- amikacine
- gentamicine
- tobramycine
Macrolides:
- érythromycine
- azithromycine
- clarithromycine
Tétracyclines
- tétracycline
- monocycline
- doxycycline
Clindamycine
Linezolid
Mécanisme d’action des antibiotiques qui inhibent la synthèse des protéines
empêchent la traduction et/ou la transcription de l’ARN messager à divers endroits
peu d’interférence avec ribosomes eucaryotes (humains)
souvent bactériostatiques (ralentie la croissance des bactéries), parfois bactéricides (tuer la bactérie) mais en pratique ça change pas grand chose
Mécanisme d’action des antibiotiques qui cible l’ADN
Empêcher la synthèse des acides nucléiques
ou
Empêcher la réplication de l’ADN
ou
Génération de radicaux libres
Mécanisme d’action des Quinolones?
Cible l’ADN en inhibant 2 enzymes:
- DNAgyrase qui permet la structure hélicoïdale de l’ADN (nécessaire à la réplication)
- Topoisomérase IV qui s’assure de la ségrégation de l’ADN
Nommer les antibiotiques de la classe des Quinolones
Ciprofloxacine (une fluoroquinolone)
Levofloxacine
Moxifloxacine
Nommer les antibiotiques de la classe des Aminoglycosides et leur cible d’action
- amikacine
- gentamicine
- tobramycine
ciblent la synthèse des protéines
Nommer les antibiotiques de la classe des Macrolides et leur cible d’action
- érythromycine
- azithromycine
- clarithromycine
ciblent la synthèse des protéines
Nommer les antibiotiques de la classe des Tétracyclines et leur cible d’action
Tétracycline
Monocycline
Doxycycline
ciblent la synthèse des protéines
Mécanisme d’action du Septra (Sulfonamides + triméthoprime)
Inhibition de la synthèse des folates
Cible l’ADN en empêchant la synthèse des acides nucléiques en empêchant de former les purines
Vrai ou faux: les SARM sont résistants à presque toutes les B-lactamines
Oui
Ex: patient sous meropenem et l’hémoculture sort SARM, le patient est pas couvert
SARM = staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (oxaciline)
Nommer des antibiotiques de type pénicilline
Péni benzathine (se donne IM)
Péni G (se donne IV)
Péni V ( se donne per os)
Cloxacilline
Méthicilline
Ampicilline
Amoxicilline
Pipéracilline
Spectre de la pénicilline
Strep beta-hemolytique groupe A, B, C, G (100% sensibilité)
Pneumocoque
Neisseria meningitidis
Anaérobies (ORL) (dentistes)
Treponema palidum (syphilis)
Vrai ou faux: quand on trouve on strep beta hémolytique dans la gorge on ne fait pas d’antibiogramme?
vrai car on a jamais trouvé de souche résistante
Spectre de la Cloxacilline
On l’utilise seulement pour le SASO
En pratique surtout pour les cas de bactériémie SASO quand on a un doute qu’il y a une infection du CNS (ça pénètre la barrière hémato-encéphalique)
Spectre ampicilline/amoxicilline
Idem à pénicilline +
Entérocoques
Haemophilus Influenzae (70%)
Quelques E.Coli et P. Mirabilis (mais pas assez pour que ça fasse partie du traitement empirique)
Salmonella spp./Shigella spp.
listeria monocytogenes
PAS STAPH AUREUS
Est-ce que l’ampi/amox couvre le staph aureus?
NON
Traitement antibiotique du chancre syphilitique?
Pénicilline benzathine intramusculaire
Pharyngite à SgA patient allergique à la pénicilline c’est quoi notre traitement de choix
La clindamycine
Abcès cutané/carboncles à staph aureus (non SARM), traitement de choix
Cloxacilline
OMA traitement de choix
Amoxicilline haute dose
Spectre de l’amoxicilline-acide clavulanique (Clavulin)
L’acide clavulanique est un inhibiteur de beta lactamase, ça empêche la formation d’enzyme qui mange l’antibiotique
Idem pénicilline/cloxacilline/amoxicilline
mais on ajoute
- staph aureus
- moraxella catarrhalis
- haemophilus influenzae (>95%)
PAS DE COUVERTURE DE PSEUDOMONAS
Est-ce que le Clavulin couvre le Pseudomonas?
Non
Relais per os du piptazo quand on veut garder la même couverture?
Le clavulin
Un des antibiotiques oraux avec le plus large spectre
Mais ça ne couvrira pas le pseudomonas alors il faut se demander si on a pas de cultures si le patient avait une grande chance d’avoir un pseudomonas!
Spectre du piptazo
Idem au clavulin
Mais on gagne:
- la plupart des entérobactéries
- beaucoup d’autres BGN tel que pseudomonas (dose contre pseudo est plus élevée i.e 4.5g q6h au lieu de 3.375g q6h)
- beaucoup de bactéries anaérobies
mais on perd le listeria
Pourquoi piptazo + flagyl c’est une drôle de combinaison?
parce que le piptazo couvre déjà les anaérobes! et même mieux que le flagyl
donc la majorité du temps pas d’intérêt d’une double couverture si on pense que le patient a un anaérobe
Nommer les céphalosporines de 1ière génération
Céfazoline (Ancef)
Céphalexin
Céfadroxil (Duricef)
Nommer les céphalosporines de 2e génération
Céfuroxime, Céfaclor, Cefprozil (bon au goût)
- infections respiratoires
Céfoxitine (Infections digestives/gynéco)
Nommer les céphalosporines de 3e génération
Ceftriaxone, cefotaxime, céfixime (pas d’activité anti-pseudomonas)
Ceftazidime (bon pour le pseudomonas)
Nommer les céphalosporines de 4e génération
Céfépime
Nommer les céphalosporines de 5e génération
Ceftobiprole
Pas mal la seule B-lactamines qui couvre le SARM
Spectre des céphalosporines de 1ière génération
Strep B-hémolytiques
SASO
Quelques E.coli, K pneumoniae, P mirabilis (mais pas assez pour couverture empirique)
Pourquoi on utilise l’ancef en prophylaxie chirurgicale à l’induction?
Pour prévenir les infections de cicatrices (majoritairement causées par des SASO et des streptocoques)
Dans quel contexte on donne des céphalosporines de 1ière génération
Prophylaxie chirurgicale
Infections de la peau et des tissus mous
Cystites si on a l’identification et l’antibiogramme car il y a trop de résistance
Dans quel contexte on prescrit des céphalosporines de 2e génération
Bcp utilisés dans les années 90 pour les infections respiratoires (pneumonies, otites, sinusites)
mais remplacés par les céphalosporines de 3e génération
cefprozil souvent utilisé par les pédiatres car ça goute bon!
Spectre des céphalosporines de 3e génération
Couverture large qui inclut plusieurs cocci Gram + et plusieurs entérobactéries
couverture aussi de l’H Influenzae et N. Meningitidis et gonorrhea
Ceftazidime a une excellente activité contre le Pseudomonas (mais pas les autres)
Dans quel contexte on prescrit des céphalosporines de 3e génération?
Méningites (ça pénètre bien le SNC)
Pneumonies acquises en communauté (hospitalisé)
Quel est la céphalosporine de 3e génération qu’on utilise chez le nouveau-né?
La céfotaxime (car ça a un métabolisme rénal, versus la ceftriaxone a un métabolisme hépatique et les nouveau-né on un métabolisme hépatique immature donc on en donne pas au enfants <1mois)
Avantage de la ceftriaxone en adulte?
Métabolisme hépatique donc pas ajustement en insuffisance rénale
mais attention en insuffisance hépatique! on pourrait privilégier alors la Céfotaxime
Nommer des antibiotiques qui couvrent le Pseudomonas
Piptazo (à dose de 4.5g q6h)
Ciprofloxacine (seul ATB qui se donne per os pour le pseudo)
Ceftazidime (céphalosporine de 3e génération)
Imipénème/Méropénème (mais pas toutes les souches)
aminoglycosides (genta/tobra/amikacin)
Nommer des antibiotiques qui couvrent le SARM
Septra
Vanco
Ceftobiprole (seule B-lactamines avec activité anti-SARM)
Doxycycline
Clindamycine
Linezolid
Dans quel contexte on utilise les céphalosporines de 4e génération?
Céfépime est peu/pas utilisée
parfois chez les greffés de moelle, enjeux digestifs mais rarement
Spectre des Carbapénèmes?
Couverture idem que piptazo
avec ajout:
- certaines entérobactéries résistantes
- certains Pseudomonas
Honnêtement on gagne pas grand chose quand on switch le patient de piptazo à meropenem
l’enjeux c’est qu’on perd la couverture de certains pseudomonas
Particularité:
- Imipénème: enterococcus faecalis
- Méropénème: pas de couverture E. faecalis
- Ertapénème: pas de couverture E. faecalis/Pseudomonas
Vrai ou faux: l’Ertapénème ne couvre pas le pseudomonas?
Vrai
Effets secondaires des B-Lactamines
GI: diarrhée (surtout acide clavulanique)
Néphrite interstitielle (très rare)
Neutropénie (piptazo) (rare, mais ça arrive! et ça peut aller vite)
Allergie
- anaphylaxie (0.05%)
- toujours questionner le type de réaction
Clostridium difficile !!
Est-ce qu’on peut donner des céphalosporines a un patient allergique aux pénicillines?
Oui
<3% d’allergie croisée
mais ne pas en donner si l’allergie est de type anaphylactique (angioedème)
Spectre de l’azithro (macrolide)
Streptocoque (mais résistance)
Pneumocoque (mais résistance)
Atypiques (mycoplasma, legionella, chlamoydophila pneumoniae)
Haemophilus influenzae
Campylobacter (cause #1 de diarrhée bactérienne au Qc)
Chlamydia trachomatis
Bon pour les trucs respiratoires
Patient allergique à la pénicilline et on fait une culture de gorge, pourquoi inscrire sur la requête l’allergie?
Car là le labo va faire un antibiogramme car il y a de la résistance à l’azithromycin dans ces bactéries
versus normalement pas d’antibiogramme par tous sensibles à aux pénicllines
Effets indésirables des macrolides?
GI: N/V, diarrhée
Allongement du QTc
Clostridium difficile
Spectre des aminoglycosides (genta/tobra/amikacine)
Surtout les gram négatif aérobes
- entérobactéries
- pseudomonas
PAS DE COUVERTURE DE GRAM POSITIF ET DES ANAÉROBES
Vrai ou faux: les aminoglycosides n’ont aucune couverture contre les anaérobes et les gram positifs
Vrai
Précautions avec les aminoglycosides
Élimination rénale
ajustement de la dose en fonction de la clairance
dosage pré-dose (parfois post-dose)
Effets secondaires des aminoglycosides
Néphrotoxicité (réversible)
Ototoxicité (irréversible)
- surdité
- troubles d’équilibre
Problème de jonction neuro-musculaire
Avantage des quinolones (cipro/levo/moxi)
Excellente biodisponibilité (IV=PO)
Spectre de la ciprofloxacine (fluoroquinolone)
Plusieurs entérobactéries
Pseudomonas (seul ATB PO pour cette bactérie)
Quel est le seul antibiotique per os qui couver le pseudo?
La ciprofloxacine
Spectre levofloxacine/moxifloxacine
Plus de couverture gram positif (que la cirpo) S. pneumoniae, SBH, Staph aureus
Moxifloxacine a une meilleure couverture des anaérobes, mais ne couvre pas le pseudomonas et ne va pas dans l’urine
Nommer 2 cas où on ne devrait pas donner de moxifloxacine
Infection urinaire (pas d’excrétion dans l’urine)
Pseudomonas (pas de couverture)
Effets indésirables des quinolones
Effets SNC (délirium?)
Tendinopathies
Attention au calcium/magnésium/aluminium (suppléments, car vont se lier avec l’antibiotique)
Clostridium difficile
attention ne pas donner de cipro chez les enfants, ni chez la femme enceinte ou qui allaite
Vrai ou faux: on ne devrait pas donner de la cipro pour une bactéiurie asymptomatique?
Vrai
no good
Spectre de la vancomycine
PUREMENT DES GRAM +
Staph (incluant SARM)
Entérocoques (autres que ERV)
Pneumocoques
Streptocoques
Clostridium difficile (per os seulement)
Seule utilisation de la vancomycine orale
Le C Diff
Car la vancomycine n’a aucune absorption en forme orale, donc reste dans le tube GI
Dans quel contexte utiliser la vancomycine?
Germe résistant:
- SARM
- Staph coagulase négative
- entérocoque résistant à l’ampicilline
Patient avec allergie majeure à la pénicilline
Particularité de la vancomycine
pour les infections sévères ça prend une dose de charge (car sinon ça prend longtemps avant d’arriver à l’équilibre) à donner lentement
besoin de dosage
- pré 4e dose (pré 3e dose c’est trop tôt)
- visons entre 15-20mg/L pour les infections à SARM
Effets indésirables de la vancomycine
Éruption cutanée relative à la vitesse de perfusion (visage et bras, dégranulation de mastocytes, ce n’est pas une allergie IgE médiée, c’est pas dangereux)
Néphrotoxicité (rare de nos jours)
Spectre du Septra (TMP/SMX)
Staph aureus
Pneumocoque
Plusieurs entérobactéries
Stenotrophomonas maltophilia (le meilleur antibiotique pour ça)
certains parasites
certains champignons (P. jirovecii souvent donné en prophylaxie chez patientes VIH notamment)
Effets indésirables du Septra?
GI: N/V
Rash (vers 10e jours)
Atteinte moelle osseuse (GB, PLT)
- ça joue sur les folates. attention un patient sous MTX ne pas donner
Néphrotoxicité (hyperK+)
- attention à la fausse augmentation de la créatinine (on accepte ad 10%)
Nommer 3 antibiotiques qui sont inefficaces dans l’urine
Clindamycine
Macrolides (azithro/érythro)
Moxifloxacine
Agent causal dans la majorité des cellulites typiques ordinaires?
Streptocoques beta-hémolytiques (95%) –> aucune résistance aux B-lactamines donc Céfazolin fonctionne très bien
Traitement oral d’une cellulite
Cefadroxil 1g PO BID
ou
Cephalexine/Cloxacilline (mais c’est QID)
Clavulin c’est souvent overkill
Infection plus sévère qui a besoin d’un traitement IV on va y aller avec Cefazoline (Ancef )
Signaux d’alarme d’une fascite nécrosante
Fièvre persistante
Atteinte hémodynamique
Douleur disproportionnée par rapport aux signes cliniques (on effleure la peau et le patient hurle de douleur)
Progression rapide (important de délimiter la rougeur)
Présence de gaz dans les tissus (mais attention la majorité des fascite sont causées par des SgA et eux ne font pas de gaz!)
Aspect grisâtre de la peau
Aspect géographique de la rougeur de la peau
Oedème au delà de l’érythème
Bulles ou nécrose cutanée
Attention avec le dosage des CK, une cellulite ordinaire peut donner des CK et à l’inverse une fascite du feu de Dieu peut avoir des CK à zéro!
Agent causal de la majorité des fascite nécrosante
SgA
Traitement empirique lorsqu’on suspecte une fascite nécrosante
Piptazo + Vanco (pour couverture SARM) + Clinda (pour les toxines)
Cellulite au niveau de l’oeil quand devrait-on suspecter une atteinte orbitaire?
Fièvre
Douleur importante
Mouvements extra oculaires limités ou douloureux
Difficulté ou impossibilité d’ouvrir l’oeil
Chémosis
Proptose
Trouble de la vision
Histoire récente de traitement dentaire
Cellulite avec morsure chien/chat, quelle traitement antibiotique
Clavulin (couverture antibiotique plus large)
Chat: pasteurella multocida (très inflammatoire, fièvre, bcp d’érythème et d’enflure)
Chien: capnocytophaga canimorsus (attention si le patient est asplénique c’est mortel!)
Cellulite avec blessure dans l’eau, traitement antibiotique
Ciprofloxacine
Eau douce: aeromonas hydrophila
Eau salée: vibrio vulnificus
Durée de traitement de la cellulite
5-7 jours
Agent causal des abcès cutanées
Staph aureus souvent (donc si on donne des antibiotiques il faut couvrir le SARM)
flores polymicrobiennes si péri-rectal ou vulvo-vaginal
Qui devrait recevoir des antibiotiques dans les abcès cutanés?
Maladie sévère ou extensive
Symptômes systémiques
Endroit difficile à drainer/nombreux abcès
Échec au tx de drainage
Considérer aux extrémités d’âges et en présence d’immunosuppression
Quels antibiotiques pour les abcès cutanés (si on décide d’en donner en plus du drainage)
Si modéré (PO): Septra > clinda ad culture (ou doxycycline)
Si sévère (IV): vanco ad culture
Vrai ou faux: la majorité des pharyngites sont d’origine virale?
Vrai
Caractéristiques de la Scarlatine?
Éruption érythémateuse généralisée, prédomine face antérieure tronc
papier sablé
pire dans les plis (signe de Pastia)
pâleur contour bouche/nez
Amygdales rouges et exsudatives, pétéchies au niveau du palais, langue saburrale puis rouge framboise
c’est une complication de la pharyngite à SgA, surtout chez l’enfant d’âge scolaire
pathogènes les plus fréquents en OMA
Pneumocoque
Haemophilus influenzae
Moraxella catarrhalis
Complications des OMA
Méningite
Paralysie faciale
Mastoïdite
Traitement antibiotique de l’OMA
Amoxicilline haute dose
ou Clavulin si antibiotiques dans les 30 derniers jours
Si on doit donner IV = Ceftriaxone
Antibiotique en sinusite
Amoxicilline 5-7 jours
Clavulin si patient immunosipprimé, suspicion de résistance élevée, sinusite frontale ou sphénoïdale
si échec de traitement: clavulin ou lévo ou moxi
Pathogènes le plus fréquents en sinusite
Pneumocoque
Haemophilus influenzae
Pathogènes en pneumonie acquise en communauté
Pneumocoque
Haemophilus influenzae
Moraxella catarrhalis
BGN si co-morbitdités (MPOC, abus ROH)
- klebsiella pneumoniae
- pseudomonas aeruginosa
Atypiques (20%):
- mycoplasma pneumoniae
- chlamydophila pneumoniae
- legionella pneumophila
antibiotiques pour pneumonie hospitalisé
ceftriaxone + macrolide pour couverture des atypiques (azithromycine)
antibiotique pour pneumonie qu’on traite en externe
amoxicilline + macrolide (azithro)
Causes bactériennes de diarrhée du voyageur
E coli (ETEC ou EAEC)
Campylobacter spp.
Salnonella/Shigella
Vibrio
Agents étiologiques méningite en fonction de l’âge
18-50 ans
- Pneumocoque #1
- Neisseria meningitidis (surtout en contexte d’éclosion)
> 50 ans:
- ajouter couverture listeria monocytogenes
Trauma crânien pénétrant ou post-chirurgie ou shunt de LCR:
- ajout couverture BGN (dont le pseudomonas) + staph aureus + SCN
enfants <6 ans hémophiles influenzae type B mais diminution de 90% des cas depuis la vaccination
sensibilité du gram sur le LCR
60-90%. donc on ne devrait jamais arrêter un traitement empirique d’une méningite basé sur un gram négatif
on doit attendre la culture
Quels antibiotiques passent la barrière hémato-encéphalique? (donc quand on suspecte une méningite)
CEFTRIAXONE 2g IV q12h (dose méningée) avec une dose de dexamethasone 12mg IV avant
+
Ampicilline 2g IV q4h (pour la listeria si >50ans)
+
Vancomycine
+
Acyclovir (si on pense à un HSV)
