microbio 2 Flashcards
quel est la hiérarchie taxonomique?
Domaine → Règne → Embranchement → Classe → Ordre → Famille → Genre → Espèce–> souche
différencier procaryote, eucaryote et archéobactéries (domaine)
- bacteria: cellule simple sans membrane nucléaire (noyau)
- eucarya: complexe avec noyaux
- archaea: sans noyaux conditions spéciales, extremes et ribosomes différents, membrane sans peptidoglycane, ex: bactérie méthanogène
lesquelles des 3 domaines sont divisés en règnes?
les eucaryotes seulement
protiste-eucaryote unicellulaire, mycète, plante et animaux)
qu,est ce qu’une souche?
un ensemble de cellules filles descendant toutes d’une même cellule mère (même genre et espèce)
quelle est la différence entre critère génétypique et phénotypique?
- géno: constituants génétiques des microbes
- phéno: attributs en découlant, caractères observables
les tests de labo peuvent utilisés quels type d’outils de classification et d’identification?
morphologiques, biochimiques, sérologiques, génétiques…
en pratique, utilise t on plus la classification ou l’identification?
identification
le terme microbe désigne quoi?
bactéries, virus, mycètes et protozoaires
qu’on en commun les microbes/micro organsimes?
Organismes de très petite taille (besoin d’un microscope)
Omniprésence et abondance dans la nature
Unicellulaires (les mycètes incluent des unicellulaires et des pluricellulaires, ex: levure)
Niveau d’organisation relativement simple
Inclut des procaryotes et des eucaryotes ex: fungi, mycète, protozoaire
Disposent d’un potentiel métabolique (sauf les virus)
Capables de se reproduire de façon autonome (sauf les virus).
dans quels domaines sont les virus?
aucun! ils sont acellulaires
qu’est ce qu’un virus?
agent infectieux acellulaire, non vivant qui a besoin d’une cellule hote pour se répliquer
qu’est ce qu’un prion?
protéines anormales qui affectent le système nerveux lorsquil entre en contact avec une protéine saine
donner des exemples de maladie lié à des prions?
maladie de la vache folle, creuzfeld jacob etc
par quoi se différencient les m-o des autres êtres vivants?
microorganismes se différencient des autres êtres vivants par un certain nombre de propriétés structurales et fonctionnelles, incluant le type d’organisation cellulaire, l’unicellularité, la taille, le potentiel métabolique, l’omniprésence (ubiquité) et l’abondance
vrai ou faux, les procaryotes sont tous unicellulaires
vrai! contrairement aux eucaryotes!
comment se distingue les virus des eu/pro-caryotes?
absence d’organisation cellulaire et incapacité de reproduction autonome, acellulaire et non vivant
vrai ou faux, les m-o disposent de plusieurs moyens pour se procurer de l’énergie
vrai! que ce soit par respiration ou par fermentation, par photosynthèse ou en dégradant des produits organiques comme substrat énergétique et source de carbone, en présence ou absence d’oxygène.
vrai ou faux, tous les micro-organismes sont dangereux
faux, la plupart ne le sont pas et certains sont mêmes essentiels à la vie
où est le matériel génétique des bactéries?
libre dans le cytoplasme
v ou f les vactéries possèdent de l’ARN et de l,’ ADN
VRAI
quel type de microscope faut il pour voir les bactéries?
optique (400x-1000x)
v ou f les vbactéries ne vivent qu’à l’intérieur des cellules hotes infectés
faux, extérieurs et intérieurs
certaines sont intracellulaire obligatoires car manque de métabolite pour se reproduire
quel microscope doit on utilisé pour voir les virus?
électronique
v ou f les virus peuvent être composé d’ADN
VRAI, ADN OU ARN pas les deux en meme temps
quel est le nom de la structure qui entoure le matériel génétique des virus?
capside
comment se reproduisent les virus lors d’infection?
Lors d’une infection, l’ADN ou l’ARN est injecté à la cellule infectée, et les gènes viraux donnent des ordres pour la construction de nouvelles particules virales en détournant à leurs fins le matériel de la cellule-hôte (acides aminés, nucléotides, etc.). Les composantes virales sont assemblées puis les virions sont libérés, souvent au coût de la mort de la cellule parasitée.
les mycètes sont ils eucaryotes ou procaryoyes?
eucaryotes, plus complexes
chez qui les mycètes causent le plus souvent des infections?
les personnes en déficit immunitaire
quelles sont les deux catégories de mycètes?
levure (unicellulaires)et moisissure (pluricellulaires)
comment se reproduisent les levures?
par bourgeonnement
donner une exemple de levure qui peut causer des infections chez l’être humain
candida albicans (vaginite)
exemple de pour quoi sont utilisés les moisissures
péniciline, fromage
comment se reproduisent les moisissures généraleent?
spores asexués volatiles
nommer 3 embranchements de mycètes d’intérêt médical
zygomycète, ascomycète, basidiomycètes
quels sont les protozoaires?
Protistes eucaryotes unicellulaires ayant des cycles de vie complexes pouvant
affecter plusieurs espèces d’hôtes différents dans leur développement
donner des exemples de maladies causées par des parasites?
la toxoplasmose, la malaria ou la dysenterie. ou la giardase
quelles sont les différentes enveloppes possibles d’une bactérie?
capsule (glycoalyx): la plus externe
paroi
membrane cytoplasmique
v ou f la capsule est présente chez toutes le bactéries
faux!
qu’est ce qu’une capsuke procure à la bactérie?
un pouvoir pathogène supplémentaire (empeche la phagocytose)
de quoi est constitué la capsule et comment l’appelle t on aussi
polysacharrides: antigène K
quel terme utillise t on pour désigner les variantes capsulaires?
sérotype
quest ce que le glycoalyx
est un feutrage extracellulaire de fibres polysaccharidiques présentes à la surface de certaines bactéries dans leur milieu naturel. Elle est l’équivalent de la capsule mais elle établit des interconnections entre bactéries
que favorise le glycoalyx?
Favorise l’adhésion aux matériaux (ex. prothèses, tuyaux), biofilm agglutinants qui relie les bactéries entre elles
donner un exemple de bactérie très connu dont une certaine résistance est conféré par le glycoalyx
Streptococcus mutans mutans– > carie dentaire
qu’est ce que la paroi?
La paroi est une enveloppe semi-rigide donnant sa forme à la bactérie (sphère, bâtonnet, spirale).
quels sont les deux types de parois et leurs différences?
gram+: constitué de peptidoglycan épais
gram-: peptidoglycan mince recouverte d’une seconde couche appelée membrane externe qui contient des LPS (endotoxine) et des porines où les substances pénètrent
la péniciline cible quel structure des bactéries?
peptidoglycan de la paroi (donc gram+=plus efficace)
quel antigène est propre au gram -?
antigène O (LPS)
quest ce que la membrane cytoplasmique et ses rôles?
structure mince sous la paroi formée d’une Bicouche de phospholipides avec protéines transmembranaires
Barrière osmotique: contr
ôle les taux ioniques
Transport: régulation des échanges interne
/externe
Enzymes: métabolisme énergétique
quels sont les constituants internes des m-o?
Les constituants internes incluent le cytoplasme, les ribosomes et le matériel génétique, lui-même constitué d’ADN sous forme libre mais aussi de petits fragments d’ADN extra-chromosomiques appelés plasmides
v ou f les ribosomes bactériens sont identiques à ceux humains?
faux, unités 30s et 50s exploitable par antibio
quest ce que des plasmides?
ADN extra extra-chromosomique, circulaire, réplication autonome
Codent pour des propriétés facilitant la survie, incluant des gènes de résistance=problème!!!
quels sont les différents appendices externes des bactéries?
flagelles et pilis
les flagelles assurent quoi?
la mobilité de la bactérie
à quel Ag correspond les flagelles?
antigène H
donner le définition de mono/lopho/amphi/péri-triche
Monotriche : un seul flagelle à une extrémité de la cellule
Lophotriche : plusieurs flagelles à une extrémité de la cellule
Amphitriche : un ou plusieurs flagelles aux deux extrémités de la cellule
Péritriche : des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule
quels sont les différentes fonctions des pili? (souvent sur les gram-)
- fimbiae=fixer les bactéries
- pili sexuels =transfert de matériel génétique (plasmides)–> conjugaison
à quoi servent les spores des bactéries?
Survivre dans des
conditions défavorables, Sous cette forme, elles peuvent résister de longues années sans eau ni nourriture, aux températures extrêmes, et deviennent insensibles à l’action de composés chimiques tels les antibiotiques
v ou f les bactéries peuvent être contractés sous formes sporulés?
vrai! elle est alors non pathogène mais peut s’activer!
quelles bactéries ont la capacité à former des endospores?
bacilles à Gram + des genres Bacillus et Clostridium
les désinfectant alcoolisé suffise t il pour s’attaquer aux spores?
NON il faut se laver les mains!!
quelles sont les composantes obligatoires des bactéries?
Paroi cellulaire Membrane plasmique Cytoplasme Chromosome Ribosomes
quelles sont les composantes facultatives des bactéries?
Capsule Endotoxine Plasmide Flagelle Pili spore
quelle caractéristiques morphologiques peut on exploiter pour l’identification des bactéries?
morphologie bactérienne: taille, forme (bacille, cocci, coccobacilles, vibrio/virgule, spirale/spirochètes, pléiomorphes), arrangement spatiale (isolée, diplocoques, streptocoques/chainette, amas organisé ou désorganisée/staphylocoque) ou présence de composantes
morphologie coloniale: forme, élévation, bordure, xsurface, xopacité, xpigmentation
quels sont les différents types de coloration?
simple:solution d’un seul colorant basique pour faire ressortir la cellule en entier ex: bleu de méthylène, fuschine basique…
différentielle: GRAM
spécifiques: visant à colorer une composante (capsule/encre de chine, endospore/vert de malachite, flagelle/fuschine)
comment fonctionne la coloration de gram?
Cette technique permet de diviser les bactéries en deux grands groupes : les bactéries à Gram positif et les bactéries à Gram négatif. On fait une coloration primaire d’un frottis avec du cristal-violet, que toutes les bactéries absorbent, surtout en y ajoutant de l’iode comme mordant. Toutes les bactéries apparaissent alors violettes. On lave ensuite avec une solution d’éthanol ou d’acétone, ce qui
11
décolore certaines espèces seulement, alors que d’autres conservent le cristal-violet. Les bactéries ayant perdu le cristal violet deviennent transparentes. On soumet ensuite le frottis à un second colorant (dit ‘contre-colorant’) qui est la safranine, de couleur rosée. Seules les bactéries qui s’étaient décolorées à l’éthanol absorbent le contre-colorant. Le résultat final est la visualisation de bactéries violettes (Gram +) ou de bactéries roses (Gram -). En fait, les bactéries réagissent différemment pour des raisons liées à la structure de leur paroi cellulaire. Selon sa composition, cette dernière retient ou laisse échapper le mélange de cristal-violet et d’iode
quelle est l’utilité de la coloration de GRram?
sélection des antibiotiques à administrer, car dépend de la composition de la paroi
quelles sont les différents types de microscopie optique?
- à fond clair
- à fond noir (microbe qui ne peuvent être colorés)
- à contraste de phase (intensité lumineuse en fn des indices de réfraction)
- à inversion (objectifs en dessous)
- à fluorescence (capacité de substances à absorber la lumière ou en émettre) ou immunofluorescence
qu’est ce que la microscopie confocale?
La microscopie confocale fait usage de fluorochromes ainsi que de lasers qui traversent par plans successifs très étroits les échantillons à observer, procurant des images d’une clarté 40% supérieure à tout autre type de microscope optique.
-couplé à un ordinateur qui reconstitue en 3d
quelles propriétés des bactéries peuvent exploités les tests biochimiques?
Elles exploitent une panoplie de propriétés bactériennes, incluant la capacité pour certaines de croître en absence d’oxygène, ou en présence d’antibiotiques ou de fortes concentrations de sel, ou encore de métaboliser par voie de fermentation une vaste gamme de glucides.
qu’est ce que la tachnologie micro scan?
maintenant la technologie Micro-Scan qui effectue les tests dans des microplaques de 96 puits contenant divers réactifs colorimétriques dont l’analyse automatisée est accomplie par ordinateur. Pour chaque rangée de tests, un pointage est attribué selon que la réponse est positive ou négative. Le cumul du pointage donne un résultat final à 8 chiffres qui correspond à une seule espèce bactérienne possible.
quel est le principe des tests d’agglutination sur lame avec serum?
Le test d’agglutination sur lame avec antisérum est une procédure simple qui consiste à incorporer des échantillons d’une bactérie inconnue dans des gouttes de solution saline placées sur différentes lames. On ajoute ensuite un antisérum différent à chaque lame. Les bactéries s’agglutinent et forment des grumeaux lorsqu’elles correspondent aux anticorps d’un antisérum particulier.
qu’est ce que la méthode ELISA?
La méthode ELISA (pour ‘enzyme-linked immunosorbent assay’) est également une technique d’identification faisant usage d’anticorps spécifiques (dits monoclonaux), placés dans des plaques de 96 puits. Un ELISA permet soit de rechercher un antigène microbien dans un échantillon clinique donné (ex. le virus VIH dans le sang) ou de rechercher des anticorps qui ont été formés contre cet antigène (ex. anticorps anti-VIH dans le sang d’un patient). L’idée consiste à fixer, dans le fond d’une plaque, un anticorps (ou un antigène) qui réagira spécifiquement avec l’antigène (ou l’anticorps) recherché dans le spécimen clinique qu’on répand ensuite dans la plaque. Si l’antigène (ou l’anticorps) recherché est présent, il se fixera à son tour à l’anticorps (ou l’antigène) déjà adhéré. Il s’agira d’ajouter un élément révélateur pour visualiser cette combinaison antigène-anticorps qui vient d’être formée dans la plaque. Cet agent révélateur peut fort bien être un second anticorps (ou antigène) à notre disposition, préalablement marqué avec une substance fluorescente ou une enzyme provoquant une réaction colorimétrique.
quel est le but du séquencage d’ADN?
est d’identifier, pour chaque espèce, des sections d’ADN qui lui sont propres, afin de développer des sondes capables de reconnaître précisément ces sections et d’ainsi détecter la présence d’un microbe particulier dans un échantillon.
que fait on si on réussit à identifier une séquence génétique particulière?
Lorsqu’une séquence génétique particulière a été identifiée dans une espèce bactérienne, il devient possible de construire les outils génétiques capables de détecter cette espèce dans un échantillon. On utilise alors des sondes génétiques, qui sont de courts segments d’ADN complémentaires à la séquence présente chez le microbe
quels sont les 5 différentes trousses de dx moléculaires disponibles?
- Streptocoques du groupe B chez la femme enceinte et l’enfant à la naissance;
- Staphylocoques résistants ou non à la méticilline;
- Clostridium difficile donnant des diarrhées difficiles à traiter;
- Entérocoques résistants à la vancomycine.
que permet l’appareil revogene de GenePOC?
Détection simultanée potentielle de
plusieurs espèces de microbes
