Microbio 2 Flashcards
Rangs taxonomique de la classification des vivants
Daniel Réagit En Couchant avec Olaf et Finit avec une Grafigne Extrêmement Saignante
Domaine -> Règne -> embranchement -> Classe -> Famille -> Genre -> Espèce -> Souche
Quels sont les 3 principaux domaines
Bactérie
Archée
Eucaryote
Les procaryotes regroupes quels domaines et pourquoi
Les bactéries et les archées parce que se sont des cellules sont noyaux
Principale embranchement de bactéries
Protéobactérie (comme E.coli)
Gram +/-
ex de protéobactérie
E.coli
Dans quels domaines se trouve la plus grandes parties des pathogènes humaines
Bactérie
Archée
Domaine des procaryotes où l’on trouve des bactérie qui vivent dans des conditions extrême
Au niveau de la température: Thermophile
Au niveau du sel : halophile
Quels embranchement d’arquée retrouvons nous chez l’humain
Méthalogène
Les arquées peuvent ils être pathogène pour l’humain
No
À quel domaine appartient l’ancêtre des mitochondries
Bactérie
Dans quels règnes eucaryote y a t’il des agents pathogènes pour les humains
animal (helminth)
Mycète (Fungi)
Protozoaire
Pante (une seule algue peu infecté l’humain)
Qu’est-ce que regroupe les protozoaires
Entamibe
Mycétozoaires
Ciliés
Diplomonadine
Les protozoaires sont uni ou multicellulaire
Uni
Les procaryotes on t’il des regnes
non ils ont des embranchement
Classification des virus et des prions
Ils sont acellulaire, se ne sont donc pas des organismes vivants, mais sont souvent associé au vivant
Comment les virus font pour se reproduire et créer l’infection
les virus réplique de manière semi autonome grâce a leur acide nucléique. Ils doivent infecter les cellules de l’hôtes pour utiliser la machinerie de la cellule pour se faire répliqué. Une fois répliqué il quitte la cellule et vont en infecté un autre
Comment les prions fait pour causer une infection
Il ne se réplique pas et ne contient pas d’acide aminé
donc il entraine selon une cascade de transformation chez un prion sain, un changement de conformation au niveau de protéines semblable ce qui cause des dommages à la cellule
Qu’est ce qu’un microbe/ microorganisme
Organisme de petit taille (prend microscope pour l’observer),
comprend des eucaryotes et des procaryote (virus, bact, protozoaire, fungi)
Sont unicellulaire ou simple (le fungi peuvent être uni ou pluri et les virus sont acellulaire)
Sont capable d’activité métabolique et de reproduction (sauf pour les virus)
Quels facteurs est pris en compte dans l’identification des microrganimse
phénotype
génotype
donc on va identifier le M-O en fonction de
- Morphologie
- Biochimiqe (est-ce qu’il synthétise ou sécrète des subs)
- Physico chimie (qu’elles sont ces subs)
- sérologie (réaction du sérum humain)
- protéinurie (différencier les différent m-o en fonction de leur spectre de masse)
- génétique (séquence de leur génome)
Taille d’un eucaryote
environs 1 mm
Taille d’un procaryote (bact)
> 1 micro m
Taille d’un virus
< 1 micro m mais > 1 nanometre
Taille d’une protéine
environs 1 nm
Petites molécules et atomes
en bas de 1 nanomètre
Terminologie bactérienne
Genre (commence avec une majuscule) et espèce (commence avec une minuscule)
Bacillus
Petit batonnet
Lactobacillus
Petit bâtonnet de lait
Sarcina
En paquêt
Micrococcus
Petit grains
Clostridium
Fuselé
Corynebactérium
Batonnet en forme de massu
Pasteurella
Louis pasteur
Escherichia
Théodore Escherich
Nesseria
Albet Neisser
Nesseria gonorrhoea
Gonocoque
Neisseria meningitidis
Meningocoque
Streptococcus pneumoniae
Pneumocoque
Enterococcus faecalis
Enthérocoque
Les appellations bactérienne proviennent de (4)
appellation latine
appellation grecque
appellation du nom de la personne qui l’as décourvert
à partir de la pathologie
Cocobacille
Batonnet légèrement arrondi
Cocci
Sphère
Vibrio
Virgule
Spirochète
Tire-bouchon
Diplo
paire
Strepto
chainette
pneumo
Encapsulé
staphylocoque
groupement désorganisé
Palisade
chaine de bacille
Qu’elles sont les 6 choses qu’on observe sur une colonie
- forme
- élévation
- bordure
- couleur
- transparence
- surface
Enveloppe deff + nommé les 3
différente structure qui entoure la bactérie
- Matérielle extracell (capsule, glycocalix, couche -S)
- Paroi cellulaire
- Membrane plasmique
Capsule/glycocalixe fonction
Pouvoir pathogène en empêchant la phagocytose
capsule/glycocalix chez tout les bact
non
De quoi son constitué les capsule/glycoxalix
polysaccaride
est-ce que les capsule/glycocalix sont tous identique
non plusieurs sorte différente que forme les différent sérotype de pneumocoque
Capsule/glycocalix se nomme antigène ?
K
Glycocalix particularité
fait de matériaux agglutinant qui permet l’addésion au matériaux
Ex d’accumulation de bactérie dû a leur capsule/glycocalix
Sur les protèse: leur capsule les empêche de se faire phagocyter par le syst immun
carie dentaire
Role de la paroi cellulaire
Elle donne la forme (cocci, bacille, spirochète) à la bact
Apparence de la capsule
Muqueuse
est-ce qu’il est possible de voir les capsules au microscope
pour la voir il faut mettre un colorant (charbon de bois) et puisque la capsule ne prend pas les colorant ca formera une halo claire
Qu’elles sont les deux types de paroi cellulaire
Gram +: fait d’une couche épaisse de peptidoglycan
Gram - : fait d’une couche mince de peptidoglycan + une couche de lipopolysaccaride, contient de porine, plus difficile a franchir
Qu’elle autre nom donne t’on a la couche de lipopolisscaride
antigene O ou endotoxine
Effet de la lipopolisacaride/endotoxine/ AG O chez l’humain
Provoque la fièvre
Qu’elle paroi contient des porcines gram + ou -
gram -
Membrane cytoplasmique est fait de quoi
Bicouche de phospholipide + protéine de transport
Fonction de la memebrane
Transport d’Ion, de nutriment et de déchet + métabolisme grâce a la prod d’énergie
Qu’elles sont les constituants internes
Cytoplasme
Appareil nucléaire
Plasmide
Cytoplasme
contient l’appareil nucléaire + ribosome
Appareil nucléaire
ADN nucléaire, ne se situe pas dans un noyau
Plasmide
ADN extra-chromosomique circulaire, réplication autonome ces gènes codes pour de propriété facilitant la survie comme la résistance
Flagelle fonction
Permet la mobilité
flagelle = antigène
H
Type de flagelle
Monotriche: 1 seule flagelle
Lophotriche: plusieurs flagelles à la même extrémité
péritriche: plusieurs flagelles tout le tour
ampitriche: flagelle au extrémité
Comment la flagelle est encrée dans la paroi
par un système de rotor qui fonctionne avec le mouvement de proton dans la membrane
2 type d’appendice externe
fili
fimbriae
Fili/fimbriae fonction
permet de se fixer au cellules
pilus sexuel: permettre le transmission de plasmide d’une cell a un autre, pour lui donner le gène de résistance c’est ce qu’on appel le phénomène de conjugaison
Phénomène de conjugaison
Transport de matériel génétique (plasmide) par les piliers sexuel, permet de transmettre le gène de la resistance
Genre des spores
bacilles ou clostridium
fonction des spores
survivre dans des conditions difficiles
Comment se forme les spores
lorsqu’il n’y a plus assez de nutriments ou d’humidité, la bact empacte son matériel génétique et forme plusieurs couche autour, si les conditions deviennent trop difficile, la cell meurt et libère son spore (très difficile a éliminer, résistant produit ménager normal, etc), peu persister plusieurs années dans l’environnement, lorsque présence d’humidité et de nutriment, le spore germe et devient bact
ex de pathogène humain causer par des spores
Tétanos
Gangrène
Botulisme
anthrax
les ag K,O et H permettre quoi
de reconnaitre la bact
qu’elles sont les composantes obligatoires pour une bactéries
paroi cell membrane plasmique cytoplasme ribosome chromosome
qu’elles sont les composantes facultative pour une bact
capsule / AG K endotoxine/ag O/ lipopolysaccaride Flagelle / ag H Fili/fibriae spore
Est-il possible de voir la flagelle au microscope
oui en ajoutant argent pour les rendre plus épaisse
Les fili sont plus fréquent chez les gram - ou +
gram -
Les spores sont plus fréquent chez gram + ou -
gram +
Les spores peuvent elles permettre d’identifier une bact si oui comment
oui selon leur emplacement dans la bactérie
Coloration de gram
chauffer la lame pour faire coller le contenue mettre cristale violet ajouter iode rincer avec alcool ajoute sapharine rincer avec l'alcool
les gram + auront garder le colorant mauve tandis que le mauve ne sera pas rester dans les gram - et ceux-ci seront coloré en rouge acs de la saharien
les spores sont t’ils visibles au microscope
oui avec coloration spéciale
les spores sont t’ils visibles au microscope
oui avec coloration spéciale (verre de la malachite)
qu’est ce qu’un champ clair au microscope
observation regulière
qu’est-ce qu’un champ de contraste
facon de faire passer la lumière pour mettre les levure par exemple plus en évidence sans avoir besoin de coloration, permet de voir les épaisseur varié
Dans quel situaiton un champ noire est utiliser
si les cellules ne prennent pas les coloration et ne sont pas vue en champ clair ou en champ de contraste, on utilise champ noire
qu’est ce que le colorant simple fait ressortir
toutes les cellules présentent (sauf si ne prennent pas facilement le colorant)
qu’est ce qu’on utilise pour creer un fond noire
un condenseur
Microscopie a fluorescence
un AC coupler a un fluorophore reconnait sont ag et si fixe, on existe le fluorophore a partir d’un laser et on peut voire l’âge devenir fluorescent
Dans quel situaiton on utiliserait la microscopie électronique plutot que optique
pour voir les virus qui sont bcp plus petit que les bact
2 type de microscope électronique
à transmission = 2D
a balayage = 3D
Identification des bactéries par test biochimique: les technologie phénotype (décrire l’utilisation dans le temps)
- on faisait de bouillon dans lequel ont mettait des réactif, par la suite on y ajoutait les bactéries qu’on avait cultiver et on regarde la réaction (chagenemtn de couleur, prod de gaz, etc) permettait d’identifier a la bact
- par la suite on a commencer a utilise des cupules, même principes mais on utilisait moins de produit et augemnter la vitesse
- les tests on été informatiser = plaque a 96 puits, en compilant toute les réactions on identifie bact = plaque microscan
nom de la plaque a 96 puits
plaque microscan
qu’est ce qui a été ajouté dans la microscan qu’on avait pas avec les technique d’avant
des puits qui mesure la résistance au antibio
on met dans 2 puits une faible concentration et une plus forte, si aucune croissance dans les deux la bact est sensible, si croissance dans l’un des deux la abct est intermédiaire et si aucune croissance la bact est résistante
Test ELISA
Peu être utiliser pour trouver un ag dans un sérum ou un ac dans un sérum (savoir si la personne a déja eu la maladie), on fixe dans le fond des puis des AC ou AG, puis on étant le sérum si l’AG ou Ac sont présent il se fixeront dans les puits, on passe ensuite un deuxième AC ou AG fixer avec molécule fluo, ou on ajoute un enzyme qui cause changement de couleur, et on peut avoir un résultat quantitatif ou qualitatif
Test immunochromatographique rapide
un peu meme principe que Élisa, tu met l’échantillon de salive sur un papier buvard, donc l’échantillon va avancer, elle va premièrement rencontrer dasn AC avec des molécule fluorescente pui elle va rencontre d’autre ac fixer en ligne, il s’agit de l’a ligne positive, l’autre ligne capte les ac restant qui on ou pas des ag
test microbien par détection d’ADN quels sont les 2 types + comment sa fonctionne
ceux qui chercher un microbe en particulier
ceux qui peuvent donner tous les microbe présente
on amplifie les gène qu’on recherche puis on les recherche
Pourquoi Élisa est plus performant que immunochomatographique
car on fait des lavages entre les étapes d’élisa
Ex de microbe rechercher
s. aeurus resistant a la méthiciline staphylocoque sensible et résistante entérocoque résistant a vancomycine clostridium diff strep B
3 facons d’identifier les microbe
par leur phénotype avec les plaque microscan, élisa
par leur génotype, amplification d’ADN
Maldi-tof = ratios masse charge
Qu’est ce qui est nécessaire dans tous les cas
des base de donnée: qu’est ce qui est supposer est + dans les puits pour quel bact, séquence de gènes, ration m/charge
elle doit être fiable et exhaustive
qu’est ce qui distincte les virus des autre microorganisme
- très petit
- structure simple = A.N (arn ou adn) + emballage
- ne produit pas sa propre énergie
- ne peu pas se reproduire sans la cell hote
- ne réagit pas au antibio
- réagit au antiviraux
pourquoi est t’il difficile de faire des antiviraux efficace
parce que très peu de cible puisque le virus est très simple, de plus utilise tout la machinera de l’hôte donc se cache du syst immun, ne se réplique pas rapidement
classification virale (7)
- Nature du génome (ADN ou ARN)
- Configuration du génome (double brin, simple brin)
- Taille d’un génome : long brin, court brin
- enveloppe: autre couche par dessus la capside
- Morphologie: forme de la capside
- taille du virions
- Hôte qu’il infecte
un virus peut il avoir de l’ADN et de l’ARN + qu’elles sont les formes possible
impossible le virus peut avoir: ADN simple brin (juste possible dans les virus) ou ADN double brin ou ARN simple brin : brin neg ou pos(pos est celui qui code directement pour l'ARNm) ou ARN double brin
Comment les virus aquérise une enveloppe lipidique
En sortant de la cellule hote, il vole leur enveloppe lipidique et enjouée leur prot pour reconnaitre les cellules hote, ce sont les plus facile à éliminer par ce que l’alcool leur fait perde leur couche lipidique et donc leur prot, et ils ne sont plus capable de reconnaitre la cellule hote
quelle virus est le plus difficile a éliminer, celui avec un couche lipidique par dessus sa capside ou le virus nu
le virus nu
quels sont les deux formes possible des capsides
hélicoïdal ou icoséadrique ou mixte
quels forme de capside protège mieux c,est acide nucléique
icoséadique
capside mixte
tête icoséadrique et queue hélicoïdale, on injecte le matériel génétique de la tête par la queue
3 enzymes spécifiques au rétrovirus
transcriptase inverse: permet la rétro transcription de l’ARN viral en ADN
intégrase: intègre l’ADN virale au chromosome de l’hôte
Protéase: favorise la maturation des protéines virales
=cible de la trithérapie
enzyme du virus de l’influenza
neuraminidase: contribue au relargage du virus hors de la cellule
levure uni ou pluricellulaire
unicellulaire
diff entre levure et moissisure en colonie
levure= lisse moisissure = minou
Utilisation des levures?
Vin, bière, pain
Levure pathologique
muguet, vaginite
Utilisation des moisissure
fromage, pénicéline
