Microbio Flashcards
Qu’est-ce qu’une infection?
Maladie causée par un déséquilibre entre les défenses naturelles de l’hôte et la capacité invasive des microorganismes
Quels sont les différents types de microorganismes?
- Virus
- Bactéries
- Champignons
- Protozoaires
- Helminthes
Quels sont les hôtes des microorganismes possibles?
- Microorganismes
- Insectes
- Plantes
- Animaux
- Humains
Que sont les 4 postulats de Koch?
→ Explication de l’étiologie de la tuberculose
1. Le microorganisme doit être associé à ceux qui souffrent de la maladie, mais absent des organismes sains.
2. Ce micro-organisme doit pouvoir être isolé et cultivé
3. Le micro-organisme cultivé doit déclencher la même maladie chez un animal de laboratoire sensible
4. Le micro-organisme doit être à nouveau isolé du nouvel organisme hôte rendu malade puis identifié comme étant identique à l’agent infectieux original
Qu’est-ce qu’une endémie vs épidémie vs pandéamie?
- Endémie : Continu dans une population, peut donner des épidémies, mais le taux d’infection/an reste constant
- Épidémie : Infection soudaine d’un grand nombre de personne dans un endroit donné
- Pandémie : Infection qui touche plusieurs continents/mondial
Quels sont les différents types d’infection?
- Transmission directe (contact, gouttelettes/voies aériennes, véhicule commun)
- Transmission vectorielle
- Nosocomiale
- Opportuniste
Qu’est-ce qu’une zoonose?
Groupe d’infections qui se transmettent de l’animal à l’homme
Vrai ou faux? Les infections des voies respiratoires causent plus de décès dans les pays en développement
Vrai
Vrai ou faux? Avec la COVID-19, la mortalité par infection des voies respiratoires se trouve au 3e rang au Canada
Vrai
Quel microorganisme est responsable de la peste?
Yersinia pestis (bactérie)
Quels ont été les impacts de la peste sur les connaissances actuelles?
- Déclin du sevrage : Mortalité → Pénurie main d’œuvre = Meilleures conditions
- Début santé publique (gestion cadavres, quarantaine, etc.)
Quel microorganisme est responsable de la variole?
Orthopoxvirus
Par rapport à la variole :
a. Quel est le taux de mortalité?
b. Quelle est la présentation clinique?
a. 30%
b. Syndrome grippal, éruptions cutanées et pustules
Quels ont été les impacts de la variole sur les connaissances actuelles?
- Perte des empires Aztèques et Incas → Reforestation = Baisse de CO2 → âge glacial et famine en Europe
- Variolisation (Inoculation avec le contenu des pustules)
- Vaccination (Inoculation avec l’équivalent du virus chez la vache)
- 1re maladie infectieuse éradiquée
Quel microorganisme est responsable du choléra?
Vibrio cholerae (bactérie)
Par rapport au choléra :
a. Quel est le mode de transmission
b. Quelle est la présentation clinique?
a. Fécale-rale (eau et aliments contaminés)
b. Déshydratation
Vrai ou faux? Le choléra est une maladie eradiquée
Faux : Encore active
Quels ont été les impacts du choléra sur les connaissances actuelles?
- Base de l’épidémiologie (source bactérienne = pompe)
- Quarantaine à Qc (Grosse-île)
Depuis le début du XXème siècle, le monde a été marqué par neuf pandémies de taille et de répercutions variables. Quelles sont-elles?
- Grippe espagnole (18-20)
- Grippe asiatique (57-78)
- Grippe de Hong-Kong (68-70)
- Grippe A H1N1(09-10)
- VIH (80- -)
- SRAS (02-03)
- MERS (2012)
- COVID-19 (2019)
- Ebola (14-16)
Par quel type de virus est causé l’influenza?
Virus à ARN de la famille des Orthomyxoviridés
Quels sont les 4 types d’influenza et lequel peut être pandémique?
A, B, C, D → A peut être pandémique
Par quoi sont définis les sous-types de l’influenza A?
2 protéines du virus :
- Hémagglutinine (H) →18
- Neuraminidase (N) → 11
Quel est le type de transmission de l’influenza?
Gouttelettes
Quels ont été les impacts du VIH/SIDA sur les connaissances actuelles?
- Diminution de la discrimination envers les minorités
- Implication des patients dans la recherche
- Maladie mortelle → Chronique
- La bi et trithérapie comme modèle pour d’autres maladies
Quelle est l’époque pasteurienne ?
1885-1935
Quelle est la période thérapeutique classique des agents antimicrobiens?
1935-1980
Les antibiotiques visent 3 processus cellulaires bactériens. Quels sont-ils?
- Synthèse de membrane
- Synthèse d’acides nucléiques
- Synthèse de protéines
De quelle maladie est responsable Borrelia burgdorferi?
Maladie de Lyme
Quel champignon est généralement résistant aux azolés et peut être pan-résistant aux antifongiques?
Candida auris
Qu’est-ce que le microbiome?
Ensemble des gènes du microbiote
Quels sont les rôles du microbiote pour l’humain?
- Digestion des aliments
- Production de nutriments et métabolites
- Éducation de notre SI
- Protection
Quels sont les différents microbiotes humains?
- Poumons
- Tractus urinaire
- Buccal
- Peau
- Intestin
- Vagin
Que comprend la science de la taxonomie?
- Identification
- Classification
- Nomenclature
Qu’est-ce que la systématique?
Synonyme de taxonomie
Du plus large au plus spécifique, quels sont les rangs taxonomiques?
- Domaine
- Règne
- Embranchement
- Classe
- Ordre
- Famille
- Genre
- Espèce
(souche)
À quel rang taxonomique font référence ces suffixes :
a. aceae
b. ales
3. ota
a. Famille
b. Ordre
c. Embranchement
Quels sont les 3 domaines du vivant?
- Bactéries → Unicellulaire sans noyau = Procaryote
- Archées → Unicellulaire sans noyau = Procaryote
- Eucaryotes = Avec noyau
Vrai ou faux? Un eucaryote peut être un microbe
Vrai
Quels sont les 4 organismes regroupés sous le terme de microbes?
- Bactéries
- Virus
- Mycètes
- Protozoaire
Quelles sont les caractéristiques communes des microbes?
- Très petite taille (< 1mm)
- Omniprésence et abondance dans la nature
- Unicellulaire (sauf certains mycètes)
- Niveau d’organisation simple
- Procaryote ou eucaryote
- Potentiel métabolique (sauf virus)
- Capable de se reproduire (sauf virus)
Qu’est-ce qui distingue les archées des bactéries?
- Composition ribosomes
- Lipides membranaires
- Composition chimique paroi
Vrai ou faux? La majorité des espèces de bactéries ne sont pas pathogènes
Vrai
Vrai ou faux? On connait de nombreux archées pathogènes pour l’humain
Faux
Quels types d’eucaryotes peuvent être pathogènes pour l’humain?
- Mycètes
- Protozoaires
- Helminthes
a. De quoi est composée la membrane cytoplasmique des :
i. bactéries?
ii. archées?
b. De quoi est composée la paroi des :
iii. bactéries
iv. archées?
a.
i. Phospholipides
ii. Étherlipides
b.
iii. Peptidoglycane
iv. Pseudopeptidyglycane
Quels sont les règnes qui sous-divisent le domaine des eucaryotes?
- Protistes
- Mycètes
- Plantes
- Animaux
Vrai ou faux? Les bactéries et les archées n’ont pas de règne défini
Vrai
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux bactéries :
a. Les bactéries possèdent des organites complexes
b. Elles peuvent vivre à l’extérieur ou à l’intérieur des cellules de l’hôte qu’elles infectent
c. Elles ne possèdent que de l’ADN
d. Leurs ribosomes sont très semblables à ceux des humains
e. Leur membrane est composée d’une monocouche de phospholipides
a. faux
b. vrai
c. faux : ARN aussi
d. Faux : Exploité en antibiothérapie
e. Faux : Bicouche
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux virus :
a. Les virus sont visibles en microscopie optique
b. Ce sont des parasites obligatoires
c. Leur génome peut être composé d’ARN et d’ADN à la fois
a. Faux
b. Vrai
c. Faux : 1 des 2
Les mycètes sont des saprophytes environnementaux. Qu’est-ce que cela signifie?
Ils tirent les substances qui leur sont nécessaires de matières organiques en décomposition
Quelle est la différence entre une levure et une moissisure?
Levure → Unicellulaire
Moisissure → Pluricellulaire
Quelle est la différence entre une infestation et une infection?
- Infestation : Parasites macroscopiques non microbiens (ecto ou endo)
- Infection : Envahissement de l’intérieur par un microorganisme
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux protozoaires :
a. Les protozoaires sont des microorganismes eucaryotes unicellulaires
b. Ils causent des infestations
a. Vrai
b. Faux : Infections
Qu’est-ce qui donne aux bactéries leur forme?
Leur paroi
Vrai ou faux? Les bactéries Gram+ et Gram- ont une paroi constituée de peptidoglycane
Vrai
Quel est le mode d’action de la pénicilline?
Empêche la synthèse du peptidoglycane = De la paroi
Vrai ou faux? Les Gram+ ont une paroi très mince
Faux : Peptidoglycane épaus
Qu’est-ce qui caractérise une bactérie Gram-?
Paroi de peptidoglycane mince, mais recouverte d’une membrane externe de phospholipides et de lipopolysaccharides (LPS) = Endotoxines
Qu’est-ce que l’antigène O ?
LPS
Qu’est-ce qui caractérise la paroi des Gram+?
Épais peptidoglycane composé d’acide téichoïque
Qu’est-ce que l’antigène K?
Capsule = Sérotype
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport à la capsule bactérienne :
a. Elle n’est pas visible en microscopie optique par les techniques de coloration usuelles
b. Elle est indispensable aux bactéries qui la possèdent
c. Elle procure une virulence et un pouvoir pathogène accrus
a. Vrai
b. Faux
c. Vrai
Vrai ou faux? La matrice extracellulaire autosécrétée permettant la formation d’un biofilm peut être une capsule, un glycocalyx ou une couche S
Vrai
Qu’est-ce qu’un couche-S?
Protéines extracellulaires organisées en réseau répétitif régulier
Par rapport aux flagelles :
a. Quelle est leur fonction?
b. De quelles protéines sont-elles composées?
c. Qu’est-ce qu’une flagelle :
i. Monotriche?
ii. Lophotriche?
iii. Amphitriche?
iv. Péritriche?
a. Mobilité
b. Flagellines
c.
i. 1 seule flagelle à 1 extrémité
ii. Plusieurs flagelles à 1 extrémité
iii. 1 ou plusieurs flagelles à 2 extrémités
iv. Plusieurs flagelles réparties
Qu’est-ce que l’antigène H?
Les flagelles
Par rapport aux pili :
a. Quelle est leur fonction?
b. De quelles protéines sont-elles composées?
c. Qu’est-ce qu’un pilus conjugatif?
a. Attache à des surfaces
b. Pilines
c. Permet la conjugaison = Transfert de matériel génétique
Vrai ou faux? Les flagelles sont plus courts que les pili
Faux : Pili plus courts
Comment s’appelle le processus de :
a. Bactérie → Spore
b. Spore → Bactérie
a. Sporulation
b. Germination
Vrai ou faux? Une bactérie sous forme de spore peut être pathogène
Faux
Vrai ou faux? La dissémination d’une bactérie dans la nature est souvent sous la forme de spores
Vrai
Vrai ou faux? Le volume, la forme, la localisation de la spore bactérienne à l’intérieur de la bactérie sont des caractéristiques constantes pour une espèce donnée et peuvent donc servir dans l’identification des espèces
Vrai
Quelle est l’utilité des spores?
Survivre aux conditions défavorables (sécheresse, température, nourriture, UV, pH)
Qu’est-ce qui module la germination des spores?
Changement de potentiel électrochimique (sortie des ions K+)
Dire si les structures suivantes sont obligatoires (O) ou facultatives (F) :
a. Paroi
b. Pili
c. Chromosome
d. Plasmide
e. Flagelle
f. Ribosomes
g. Corps d’inclusion/granules
h. Spore
i. Cytoplasme
j. Endotoxine
k. Membrane plasmique
l. Capsule
a. O
b. F
c. O
d. F
e. F
f. O
g. F
h. F
i. O
j. F
k. O
l. F
Quels sont les différents outils de classification et d’identification?
- Morphologie
- Biochimie
- Physico-chimie
- Sérologie
- Protéomique
- Génétique
a. Quelles sont les 2 types de caractéristiques morphologiques?
b. Quelles caractéristiques sont inclues dans chacune?
a. Cellulaire bactérienne et coloniale
b.
- Cellulaire bactérienne : Forme, taille, arrangement spatial, composants structurales
- Coloniale : Forme, élévation, bordure, surface, opacité, pigmentation
Quelle forme ou arrangement spatiale des bactéries est décrit par ce mot :
a. Bacilles
b. Strepto-
c. Cocci ou -coque
d. Diplo
e. Coccobacille
f. Vibrio
g. Spirochète
h. Pléimorphe
a. Bâtonnets
b. Arrangement en chainettes
c. Sphère
d. Arrangement en pair
e. Petit bâtonnet arrondi
f. Spirale en virgule
g. Spirale en tire-bouchon
h. Difforme
Qu’est-ce qu’une coloration simple?
1 seul colorant de base qui fait ressortir toutes les cellules
Quelles sont les étapes de la coloration de Gram?
- Fixation à la chaleur
- Crystal violet → Colore les Gram + et Gram-
- Iode → Entre dans les bactéries et se complexe avec le Crystal violet, ce qui le fait grossir
- Décoloration : Le Crystal violet complexé avec l’iode ne peut pas sortir des Gram+
- Safranine → Contre colorant qui colore seulement les bactéries qui ont été décolorées = Gram-
Quelle structure spécifique ces colorations permettent de mettre en évidence :
a. Encre de Chine
b. Vert de malachite + safranine
c. Molécules d’argent
a. Capsule
b. Endospore
c. Flagelles
En quoi consiste les tests biochimiques d’identification de bactéries?
Vérification de la capacité de la bactérie à :
- faire certaines réactions/à produire certains réactifs
- Croitre dans des conditions spécifiques
- Résister à des antibiotiques
À quoi correspond le nombre final sur une plaque MicroScan?
1 genre et espèce de bactérie
a. Quel type de test d’identification est le MALDI-TOF?
b. Quel en est le principe
a. Physico-chimique
b. Comparaison de spectres de MS à des bases de données
a. Que permet de déterminer un test de détection d’Ac spécifiques?
b. Quel est l’autre nom pour ce test?
a. S’IL y a eu une infection depuis au moins un certain temps
b. Test sérologique
a. Que permet de déterminer un test de détection d’Ag microbiens?
b. Quel est l’autre nom pour ce test?
a. S’il y a une infection actuelle (prélèvement) ou quel type de microbe est en culture)
b. Test antigénique
a. Que permet de déterminer le test d’agglutination sur lame?
b. En quoi consiste ce test?
a. Distinguer différentes souches d’une même espèce
b. Ajout d’un Ac à une culture : si l’Ac correspond, il y a agglutination
Que permet de déterminer un ELISA?
- Rechercher un Ag microbien dans un échantillon clinique donné OU
- Rechercher des Ac qui ont été formés contre cet antigène
→ Permet de détecter 1 antigène dans plusieurs échantillons en même temps
Qu’a-t-on besoin d’avoir préalablement déterminé avant de pouvoir identifier un microbe par TAAN?
Séquence génétique signature = Propre au microbe (pour l’oligo)
Pour une identification complète, les méthodes phénotypiques requièrent une a. ____________ des bactéries (18-48h) suivie d’une batterie de tests b. _____________ et c. _____________
a. culture pure
b. biochimiques
c. microbiologiques
Sur quelles caractéristiques les virus sont-ils classés?
- Nature du génome (ADN/ARN)
- Configuration du génome (ss/ds)
- Taille du génome
- Présence ou absence d’enveloppe
- Morphologie (héliocoïdale ou icosaédrique)
- Taille du virion
- Hôte
a. Qu’est-ce qu’une capside?
b. Qu’est-ce qu’une nucléocapside?
c. De quoi est composée l’enveloppe?
d. Comment les virus acquièrent-ils leur enveloppe?
a. Assemblage de capsomères protéiques
b. Capside + Acide nucléique d’un virus
c. Bicouche lipidique
d. Lors de la sortie des cellules hôtes par bourgeonnement
Qu’est-ce qu’un virus nu?
Virus sans enveloppe
Quelles sont 3 enzymes nécessaires aux rétrovirus et quel sont leur fonction?
- Transcriptase inverse (RT ARN en ADNc)
- Intégrase : Intègre l’ADN viral au génome de l’hôte
- Protéase : Favorise la maturation des protéines virales
À quoi sert la neuraminidase chez le virus de l’influenza?
Contribue au relargage des virus hors des cellules
Vrai ou faux? La future classification des virions est obligée de suivre la taxonomie selon les relations évolutives
Faux : Peut être une classification épidémiologiques ou selon des exigences réglementaires
Vrai ou faux? La taxonomie des virus doit refléter l’histoire évolutive des virus
Vrai