Microbio Flashcards
Qu’est-ce qu’une infection?
Maladie causée par un déséquilibre entre les défenses naturelles de l’hôte et la capacité invasive des microorganismes
Quels sont les différents types de microorganismes?
- Virus
- Bactéries
- Champignons
- Protozoaires
- Helminthes
Quels sont les hôtes des microorganismes possibles?
- Microorganismes
- Insectes
- Plantes
- Animaux
- Humains
Que sont les 4 postulats de Koch?
→ Explication de l’étiologie de la tuberculose
1. Le microorganisme doit être associé à ceux qui souffrent de la maladie, mais absent des organismes sains.
2. Ce micro-organisme doit pouvoir être isolé et cultivé
3. Le micro-organisme cultivé doit déclencher la même maladie chez un animal de laboratoire sensible
4. Le micro-organisme doit être à nouveau isolé du nouvel organisme hôte rendu malade puis identifié comme étant identique à l’agent infectieux original
Qu’est-ce qu’une endémie vs épidémie vs pandéamie?
- Endémie : Continu dans une population, peut donner des épidémies, mais le taux d’infection/an reste constant
- Épidémie : Infection soudaine d’un grand nombre de personne dans un endroit donné
- Pandémie : Infection qui touche plusieurs continents/mondial
Quels sont les différents types d’infection?
- Transmission directe (contact, gouttelettes/voies aériennes, véhicule commun)
- Transmission vectorielle
- Nosocomiale
- Opportuniste
Qu’est-ce qu’une zoonose?
Groupe d’infections qui se transmettent de l’animal à l’homme
Vrai ou faux? Les infections des voies respiratoires causent plus de décès dans les pays en développement
Vrai
Vrai ou faux? Avec la COVID-19, la mortalité par infection des voies respiratoires se trouve au 3e rang au Canada
Vrai
Quel microorganisme est responsable de la peste?
Yersinia pestis (bactérie)
Quels ont été les impacts de la peste sur les connaissances actuelles?
- Déclin du sevrage : Mortalité → Pénurie main d’œuvre = Meilleures conditions
- Début santé publique (gestion cadavres, quarantaine, etc.)
Quel microorganisme est responsable de la variole?
Orthopoxvirus
Par rapport à la variole :
a. Quel est le taux de mortalité?
b. Quelle est la présentation clinique?
a. 30%
b. Syndrome grippal, éruptions cutanées et pustules
Quels ont été les impacts de la variole sur les connaissances actuelles?
- Perte des empires Aztèques et Incas → Reforestation = Baisse de CO2 → âge glacial et famine en Europe
- Variolisation (Inoculation avec le contenu des pustules)
- Vaccination (Inoculation avec l’équivalent du virus chez la vache)
- 1re maladie infectieuse éradiquée
Quel microorganisme est responsable du choléra?
Vibrio cholerae (bactérie)
Par rapport au choléra :
a. Quel est le mode de transmission
b. Quelle est la présentation clinique?
a. Fécale-rale (eau et aliments contaminés)
b. Déshydratation
Vrai ou faux? Le choléra est une maladie eradiquée
Faux : Encore active
Quels ont été les impacts du choléra sur les connaissances actuelles?
- Base de l’épidémiologie (source bactérienne = pompe)
- Quarantaine à Qc (Grosse-île)
Depuis le début du XXème siècle, le monde a été marqué par neuf pandémies de taille et de répercutions variables. Quelles sont-elles?
- Grippe espagnole (18-20)
- Grippe asiatique (57-78)
- Grippe de Hong-Kong (68-70)
- Grippe A H1N1(09-10)
- VIH (80- -)
- SRAS (02-03)
- MERS (2012)
- COVID-19 (2019)
- Ebola (14-16)
Par quel type de virus est causé l’influenza?
Virus à ARN de la famille des Orthomyxoviridés
Quels sont les 4 types d’influenza et lequel peut être pandémique?
A, B, C, D → A peut être pandémique
Par quoi sont définis les sous-types de l’influenza A?
2 protéines du virus :
- Hémagglutinine (H) →18
- Neuraminidase (N) → 11
Quel est le type de transmission de l’influenza?
Gouttelettes
Quels ont été les impacts du VIH/SIDA sur les connaissances actuelles?
- Diminution de la discrimination envers les minorités
- Implication des patients dans la recherche
- Maladie mortelle → Chronique
- La bi et trithérapie comme modèle pour d’autres maladies
Quelle est l’époque pasteurienne ?
1885-1935
Quelle est la période thérapeutique classique des agents antimicrobiens?
1935-1980
Les antibiotiques visent 3 processus cellulaires bactériens. Quels sont-ils?
- Synthèse de membrane
- Synthèse d’acides nucléiques
- Synthèse de protéines
De quelle maladie est responsable Borrelia burgdorferi?
Maladie de Lyme
Quel champignon est généralement résistant aux azolés et peut être pan-résistant aux antifongiques?
Candida auris
Qu’est-ce que le microbiome?
Ensemble des gènes du microbiote
Quels sont les rôles du microbiote pour l’humain?
- Digestion des aliments
- Production de nutriments et métabolites
- Éducation de notre SI
- Protection
Quels sont les différents microbiotes humains?
- Poumons
- Tractus urinaire
- Buccal
- Peau
- Intestin
- Vagin
Que comprend la science de la taxonomie?
- Identification
- Classification
- Nomenclature
Qu’est-ce que la systématique?
Synonyme de taxonomie
Du plus large au plus spécifique, quels sont les rangs taxonomiques?
- Domaine
- Règne
- Embranchement
- Classe
- Ordre
- Famille
- Genre
- Espèce
(souche)
À quel rang taxonomique font référence ces suffixes :
a. aceae
b. ales
3. ota
a. Famille
b. Ordre
c. Embranchement
Quels sont les 3 domaines du vivant?
- Bactéries → Unicellulaire sans noyau = Procaryote
- Archées → Unicellulaire sans noyau = Procaryote
- Eucaryotes = Avec noyau
Vrai ou faux? Un eucaryote peut être un microbe
Vrai
Quels sont les 4 organismes regroupés sous le terme de microbes?
- Bactéries
- Virus
- Mycètes
- Protozoaire
Quelles sont les caractéristiques communes des microbes?
- Très petite taille (< 1mm)
- Omniprésence et abondance dans la nature
- Unicellulaire (sauf certains mycètes)
- Niveau d’organisation simple
- Procaryote ou eucaryote
- Potentiel métabolique (sauf virus)
- Capable de se reproduire (sauf virus)
Qu’est-ce qui distingue les archées des bactéries?
- Composition ribosomes
- Lipides membranaires
- Composition chimique paroi
Vrai ou faux? La majorité des espèces de bactéries ne sont pas pathogènes
Vrai
Vrai ou faux? On connait de nombreux archées pathogènes pour l’humain
Faux
Quels types d’eucaryotes peuvent être pathogènes pour l’humain?
- Mycètes
- Protozoaires
- Helminthes
a. De quoi est composée la membrane cytoplasmique des :
i. bactéries?
ii. archées?
b. De quoi est composée la paroi des :
iii. bactéries
iv. archées?
a.
i. Phospholipides
ii. Étherlipides
b.
iii. Peptidoglycane
iv. Pseudopeptidyglycane
Quels sont les règnes qui sous-divisent le domaine des eucaryotes?
- Protistes
- Mycètes
- Plantes
- Animaux
Vrai ou faux? Les bactéries et les archées n’ont pas de règne défini
Vrai
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux bactéries :
a. Les bactéries possèdent des organites complexes
b. Elles peuvent vivre à l’extérieur ou à l’intérieur des cellules de l’hôte qu’elles infectent
c. Elles ne possèdent que de l’ADN
d. Leurs ribosomes sont très semblables à ceux des humains
e. Leur membrane est composée d’une monocouche de phospholipides
a. faux
b. vrai
c. faux : ARN aussi
d. Faux : Exploité en antibiothérapie
e. Faux : Bicouche
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux virus :
a. Les virus sont visibles en microscopie optique
b. Ce sont des parasites obligatoires
c. Leur génome peut être composé d’ARN et d’ADN à la fois
a. Faux
b. Vrai
c. Faux : 1 des 2
Les mycètes sont des saprophytes environnementaux. Qu’est-ce que cela signifie?
Ils tirent les substances qui leur sont nécessaires de matières organiques en décomposition
Quelle est la différence entre une levure et une moissisure?
Levure → Unicellulaire
Moisissure → Pluricellulaire
Quelle est la différence entre une infestation et une infection?
- Infestation : Parasites macroscopiques non microbiens (ecto ou endo)
- Infection : Envahissement de l’intérieur par un microorganisme
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport aux protozoaires :
a. Les protozoaires sont des microorganismes eucaryotes unicellulaires
b. Ils causent des infestations
a. Vrai
b. Faux : Infections
Qu’est-ce qui donne aux bactéries leur forme?
Leur paroi
Vrai ou faux? Les bactéries Gram+ et Gram- ont une paroi constituée de peptidoglycane
Vrai
Quel est le mode d’action de la pénicilline?
Empêche la synthèse du peptidoglycane = De la paroi
Vrai ou faux? Les Gram+ ont une paroi très mince
Faux : Peptidoglycane épaus
Qu’est-ce qui caractérise une bactérie Gram-?
Paroi de peptidoglycane mince, mais recouverte d’une membrane externe de phospholipides et de lipopolysaccharides (LPS) = Endotoxines
Qu’est-ce que l’antigène O ?
LPS
Qu’est-ce qui caractérise la paroi des Gram+?
Épais peptidoglycane composé d’acide téichoïque
Qu’est-ce que l’antigène K?
Capsule = Sérotype
Dire si les énoncés suivants sont vrais ou faux par rapport à la capsule bactérienne :
a. Elle n’est pas visible en microscopie optique par les techniques de coloration usuelles
b. Elle est indispensable aux bactéries qui la possèdent
c. Elle procure une virulence et un pouvoir pathogène accrus
a. Vrai
b. Faux
c. Vrai
Vrai ou faux? La matrice extracellulaire autosécrétée permettant la formation d’un biofilm peut être une capsule, un glycocalyx ou une couche S
Vrai
Qu’est-ce qu’un couche-S?
Protéines extracellulaires organisées en réseau répétitif régulier
Par rapport aux flagelles :
a. Quelle est leur fonction?
b. De quelles protéines sont-elles composées?
c. Qu’est-ce qu’une flagelle :
i. Monotriche?
ii. Lophotriche?
iii. Amphitriche?
iv. Péritriche?
a. Mobilité
b. Flagellines
c.
i. 1 seule flagelle à 1 extrémité
ii. Plusieurs flagelles à 1 extrémité
iii. 1 ou plusieurs flagelles à 2 extrémités
iv. Plusieurs flagelles réparties
Qu’est-ce que l’antigène H?
Les flagelles
Par rapport aux pili :
a. Quelle est leur fonction?
b. De quelles protéines sont-elles composées?
c. Qu’est-ce qu’un pilus conjugatif?
a. Attache à des surfaces
b. Pilines
c. Permet la conjugaison = Transfert de matériel génétique
Vrai ou faux? Les flagelles sont plus courts que les pili
Faux : Pili plus courts
Comment s’appelle le processus de :
a. Bactérie → Spore
b. Spore → Bactérie
a. Sporulation
b. Germination
Vrai ou faux? Une bactérie sous forme de spore peut être pathogène
Faux
Vrai ou faux? La dissémination d’une bactérie dans la nature est souvent sous la forme de spores
Vrai
Vrai ou faux? Le volume, la forme, la localisation de la spore bactérienne à l’intérieur de la bactérie sont des caractéristiques constantes pour une espèce donnée et peuvent donc servir dans l’identification des espèces
Vrai
Quelle est l’utilité des spores?
Survivre aux conditions défavorables (sécheresse, température, nourriture, UV, pH)
Qu’est-ce qui module la germination des spores?
Changement de potentiel électrochimique (sortie des ions K+)
Dire si les structures suivantes sont obligatoires (O) ou facultatives (F) :
a. Paroi
b. Pili
c. Chromosome
d. Plasmide
e. Flagelle
f. Ribosomes
g. Corps d’inclusion/granules
h. Spore
i. Cytoplasme
j. Endotoxine
k. Membrane plasmique
l. Capsule
a. O
b. F
c. O
d. F
e. F
f. O
g. F
h. F
i. O
j. F
k. O
l. F
Quels sont les différents outils de classification et d’identification?
- Morphologie
- Biochimie
- Physico-chimie
- Sérologie
- Protéomique
- Génétique
a. Quelles sont les 2 types de caractéristiques morphologiques?
b. Quelles caractéristiques sont inclues dans chacune?
a. Cellulaire bactérienne et coloniale
b.
- Cellulaire bactérienne : Forme, taille, arrangement spatial, composants structurales
- Coloniale : Forme, élévation, bordure, surface, opacité, pigmentation
Quelle forme ou arrangement spatiale des bactéries est décrit par ce mot :
a. Bacilles
b. Strepto-
c. Cocci ou -coque
d. Diplo
e. Coccobacille
f. Vibrio
g. Spirochète
h. Pléimorphe
a. Bâtonnets
b. Arrangement en chainettes
c. Sphère
d. Arrangement en pair
e. Petit bâtonnet arrondi
f. Spirale en virgule
g. Spirale en tire-bouchon
h. Difforme
Qu’est-ce qu’une coloration simple?
1 seul colorant de base qui fait ressortir toutes les cellules
Quelles sont les étapes de la coloration de Gram?
- Fixation à la chaleur
- Crystal violet → Colore les Gram + et Gram-
- Iode → Entre dans les bactéries et se complexe avec le Crystal violet, ce qui le fait grossir
- Décoloration : Le Crystal violet complexé avec l’iode ne peut pas sortir des Gram+
- Safranine → Contre colorant qui colore seulement les bactéries qui ont été décolorées = Gram-
Quelle structure spécifique ces colorations permettent de mettre en évidence :
a. Encre de Chine
b. Vert de malachite + safranine
c. Molécules d’argent
a. Capsule
b. Endospore
c. Flagelles
En quoi consiste les tests biochimiques d’identification de bactéries?
Vérification de la capacité de la bactérie à :
- faire certaines réactions/à produire certains réactifs
- Croitre dans des conditions spécifiques
- Résister à des antibiotiques
À quoi correspond le nombre final sur une plaque MicroScan?
1 genre et espèce de bactérie
a. Quel type de test d’identification est le MALDI-TOF?
b. Quel en est le principe
a. Physico-chimique
b. Comparaison de spectres de MS à des bases de données
a. Que permet de déterminer un test de détection d’Ac spécifiques?
b. Quel est l’autre nom pour ce test?
a. S’IL y a eu une infection depuis au moins un certain temps
b. Test sérologique
a. Que permet de déterminer un test de détection d’Ag microbiens?
b. Quel est l’autre nom pour ce test?
a. S’il y a une infection actuelle (prélèvement) ou quel type de microbe est en culture)
b. Test antigénique
a. Que permet de déterminer le test d’agglutination sur lame?
b. En quoi consiste ce test?
a. Distinguer différentes souches d’une même espèce
b. Ajout d’un Ac à une culture : si l’Ac correspond, il y a agglutination
Que permet de déterminer un ELISA?
- Rechercher un Ag microbien dans un échantillon clinique donné OU
- Rechercher des Ac qui ont été formés contre cet antigène
→ Permet de détecter 1 antigène dans plusieurs échantillons en même temps
Qu’a-t-on besoin d’avoir préalablement déterminé avant de pouvoir identifier un microbe par TAAN?
Séquence génétique signature = Propre au microbe (pour l’oligo)
Pour une identification complète, les méthodes phénotypiques requièrent une a. ____________ des bactéries (18-48h) suivie d’une batterie de tests b. _____________ et c. _____________
a. culture pure
b. biochimiques
c. microbiologiques
Sur quelles caractéristiques les virus sont-ils classés?
- Nature du génome (ADN/ARN)
- Configuration du génome (ss/ds)
- Taille du génome
- Présence ou absence d’enveloppe
- Morphologie (héliocoïdale ou icosaédrique)
- Taille du virion
- Hôte
a. Qu’est-ce qu’une capside?
b. Qu’est-ce qu’une nucléocapside?
c. De quoi est composée l’enveloppe?
d. Comment les virus acquièrent-ils leur enveloppe?
a. Assemblage de capsomères protéiques
b. Capside + Acide nucléique d’un virus
c. Bicouche lipidique
d. Lors de la sortie des cellules hôtes par bourgeonnement
Qu’est-ce qu’un virus nu?
Virus sans enveloppe
Quelles sont 3 enzymes nécessaires aux rétrovirus et quel sont leur fonction?
- Transcriptase inverse (RT ARN en ADNc)
- Intégrase : Intègre l’ADN viral au génome de l’hôte
- Protéase : Favorise la maturation des protéines virales
À quoi sert la neuraminidase chez le virus de l’influenza?
Contribue au relargage des virus hors des cellules
Vrai ou faux? La future classification des virions est obligée de suivre la taxonomie selon les relations évolutives
Faux : Peut être une classification épidémiologiques ou selon des exigences réglementaires
Vrai ou faux? La taxonomie des virus doit refléter l’histoire évolutive des virus
Vrai
Quelle est la norme pour nommer les espèces de virus?
Nomenclature binomiale standard en 2 parties
Le mot virus peut désigner 2 choses. Quelles sont-elles?
- Ensemble du cycle viral
- Particule virale extracellulaire (virion)
Vrai ou faux? Dans un texte ou une présentation, l’espèce virale n’est généralement mentionnée qu’une seule fois
Vrai : À côté du nom du virus lorsqu’il est présenté pour la première fois
Quelle est la différence entre le nom d’un virus et le nom de son espèce virale ?
- Nom du virus = Nom commun
- Nom de l’espèce virale = Catégorie taxonomique
Vrai ou faux? Le nom des virus doit être mis en italique
Faux
Vrai ou faux? La façon dont les virologues nomment les virus est affectée par les récents changements dans les noms d’espèces virales
Faux
Qui suis-je? Reproduction par bourgeonnement en produisant des pseudohypes
Levure
Qui suis-je? Se reproduisent le plus souvent par spores asexuées volatiles
Moisissures
Que sont les protozoaires?
Protistes unicellulaires ayant des cycles de vie complexes pouvant affecter plusieurs espèces d’hôtes différents dans leur développement
Vrai ou faux? La toxoplasmose, la giardiase et la malaria sont causées par des protozoaires
Vrai
Vrai ou faux? La notion de croissance microbienne se rapporte à leur augmentation en taille
Faux : À leur multiplication
Partout où il y a de a. _____ sous forme liquide et une source de b. _____, on retrouve des microbes
a. l’eau
b. carbone
Qu’est-ce qu’une bactérie :
a. phototrophe?
b. chimiotrophe?
c. autotrophe?
d. hétérotrophe?
e. lithotrophe?
f. organotrophe?
a. Utilisent la lumière comme source d’énergie
b. Utilisent des composés chimiques comme source d’énergie
c. Utilisent le CO2 comme source de carbone
d. Utilisent des composés organiques plus complexes comme source de carbone
e. Utilisent une source inorganique d’électrons
f. Utilisent une source organique d’électrons
Comment sont appelés les milieux de culture :
a. liquides?
b. solides?
a. Bouillons de culture
b. Géloses
Vrai ou faux? La caractérisation des bactéries pour des fins d’identification phénotypique nécessite une culture pure
Vrai
Qu’est-ce qu’un milieu sélectif vs un milieu différentiel?
- Sélectif : Contient des inhibiteurs de croissance → Inhibe la croissance de bactéries indésirables et stimuler celle de microbes spécifiques (ex : Chapman)
- Différentiel : Ajout d’éléments pour distinguer des souches (ex : Gélose sang permet de distinguer les souches de streptocoque qui sécrètent ou non de l’hémolysine)
Quel type de bactérie pousse sur une gélose MacConkey?
Gram-
Vrai ou faux? Une gélose peut donc à la fois être enrichie, sélective et différentielle
Vrai
Quel est le but d’un milieu de culture
a. défini ?
b. complexe?
a. Étudier le rôle d’un composé sur la croissance
b. Favoriser la croissance de tout organisme pouvant être présent dans un échantillon ou encore ayant des exigences nutritionnelles spécifiques
La culture sur gélose permet l’obtention de colonies a. _______ et de cultures b. _______
a. isolées
b. pures
Comment la gélose Chapman est sélective et différentielle?
- Sélective grâce au sel : Sélectionne staphylocoque en inhibant les autres qui ne tolèrent pas le sel
- Différentielle grâce au mannitol : Permet d’identifier si la souche est capable de le fermenter grâce à un indicateur de pH
Quelle souche de streptocoque est :
a. non hémolytique?
b. partiellement hémolytique
c. hémolytique?
a. γ
b. α
c. β (Streptocoque A)
Comment la gélose MacConkey est sélective et différentielle?
- Sélective : Inhibe les Gram+ = favorise les Gram-
- Différentielle : Selon la capacité de fermentation du lactose (visible grâce à un indicateur de pH)
Quelle gélose permet de favoriser la croissance et d’identifier la famille des Enterobacteriaceae?
Gélose éosine-bleu de méthylène
Quelle est l’utilité des milieux de transport?
Suffisamment pauvre pour limiter la croissance, mais capable de préserver les microorganismes
À quelle T° croît une bactérie :
a. Psychrophile?
b. Mésophile?
c. Thermophile?
a. -10 à 25°C
b. 20 à 50°C
c. 50 à 100°C
a. À quel catégorie de T° les pathogènes humains appartiennent-ils?
b. Qu’est-ce qu’une bactérie thermotolérante?
c. Vrai ou faux? La pasteurisation permet de détruire toutes les bactéries thermotolérantes?
a. Mésophile (20-50°C, surtout 37°C)
b. Tolère la chaleur, n’en meure pas, mais ne croît pas non plus
c. Faux : Pas toutes
Par rapport aux bactéries aérobies strictes :
a. Quel est l’effet de l’O2 sur leur croissance
b. Qu’est-ce qui explique a.?
a. O2 essentielle : Croissance aérobie seulement
b. Présence de la catalase et de la SOD
Par rapport aux bactéries anaérobies facultatives :
a. Quel est l’effet de l’O2 sur leur croissance
b. Qu’est-ce qui explique a.?
a. Croissance aérobie ou anaérobie, mais optimale en présence d’O2
b. Présence de la catalase et de la SOD
Par rapport aux bactéries anaérobies strictes :
a. Quel est l’effet de l’O2 sur leur croissance
b. Qu’est-ce qui explique a.?
a. Aucune croissance en présence d’O2 : Anaérobie seulement
b. Pas d’enzymes permettant la neutralisation des ROS
Par rapport aux bactéries anaérobies aérotolérantes :
a. Quel est l’effet de l’O2 sur leur croissance
b. Qu’est-ce qui explique a.?
a. Croissance aérobie ou anaérobie, l’O2 n’a aucun effet et est toléré
b. Présence de la SOD
Par rapport aux bactéries microaérophiles :
a. Quel est l’effet de l’O2 sur leur croissance
b. Qu’est-ce qui explique a.?
a. Croissance aérobie, O2 essentielle, mais en faible concentration (< air)
b. Trop de ROS si trop d’O2
Quelles sont les différentes conditions physiques de croissance bactérienne à prendre en compte?
- T°C
- O2
- pH
À quel pH croît une bactérie acidophile?
< 5,5
À quel pH croît une bactérie neutrophile?
5 - 8
À quel pH croît une bactérie alcalophile?
> 8,5
Vrai ou faux? Les bactéries peuvent synthétiser des facteurs de croissance
Faux : Essentiel, mais doit être apporté par les aliments
Vrai ou faux? Un facteur de croissance bactérien est une petite molécule qui peut être un acide aminé, une base nucléique, une vitamine, l’hème ou encore un ion
Vrai
Combien de colonies doit-il y avoir sur une gélose pour être dénombrables?
20-200
Quelles sont les 6 phases de la courbe de croissance bactérienne (indiquez les essentielles avec un*)
- Latence*
- Accélération
- Exponentielle*
- Ralentissement
- Stationnaire*
- Décroissance*
Qu’est-ce qui explique la phase de latence dans la courbe de croissance bactérienne?
Délai nécessaire pour la synthèse d’enzymes qui doivent être élaborées avant que les bactéries puissent métaboliser les nutriments
Qu’est-ce qui explique la phase de exponentielle dans la courbe de croissance bactérienne?
Production d’énergie maximale, temps de division minimale + sécrétions d’exotoxines (déchets métaboliques potentiellement toxiques pour les humains)
Qu’est-ce qui explique la phase de ralentissement dans la courbe de croissance bactérienne?
↓ éléments nutritifs ; ↑ des déchets = Vitesse non maximale
Qu’est-ce qui explique la phase stationnaire dans la courbe de croissance bactérienne?
- Densité maximale atteinte
- Nombre de nouvelles bactéries = Nombre de bactéries qui meurent
- Sporulation car milieu toxique
Qu’est-ce qui explique la phase de décroissance dans la courbe de croissance bactérienne?
↓ des cellules viables = Libération d’endotoxines, puis mort cellulaire de toute la culture
Vrai ou faux? Les bactéries n’ont pas de mitochondries
Vrai : Production d’ATP et transport d’électrons le long des membranes cytoplasmiques
Vrai ou faux? La respiration anaérobie produit autant d’énergie que l’aérobie
Faux : les anaérobies croissent généralement moins vite que les aérobies
Il existe un mode de respiration anaérobie chez certains microbes, qui utilisent des composés inorganiques simples comme accepteurs finaux de H+ et d’électrons pour procéder à la respiration. Quels sont ces composés?
- Ion nitrate (NO3-)
- Ion sulfate
- Ion carbonate
1 et 2 → Essentiels au cycle de l’azote et du soufre de l’environnement
Vrai ou faux? Le cycle de Krebs et la chaîne de transport des électrons faisant usage de cytochromes ne sont pas utilisées lors de la fermentation
Vrai
Quel est l’accepteur final d’électrons dans la fermentation?
Molécule organique synthétisée dans la cellule
Qu’advient-il du pyruvate pendant la fermentation?
Dérivé en produits intermédiaires excrétés = Produits de fermentation
De quoi dépend la nature du produit final de la fermentation?
- Le microorganisme
- Le substrat
- Les enzymes du microorganismes
Quelle est l’utilité de la fermentation en lab?
Cette propriété est mise à profit dans les tests diagnostiques d’identification biochimique en laboratoire
Par rapport à la fermentation :
a. Quel est son avantage (vs la respiration aérobique)
b. Quel est son désavantage?
a. Produit des composés biologiques
b. Produit «< d’ATP/glucose (2)
À partir de quoi a été élaborée la microbiologie industrielle?
Les technologies de production d’antibiotiques durant la 2e guerre mondiale
Qu’est-ce que la fermentation industrielle?
La culture de grandes quantités de microorganismes ou d’autres cellules isolées en vue de produire une substance d’intérêt commercial
Quel(s) est(sont) le(s) produit(s) final(finaux) de la fermentation :
a. alcoolique
b. homolactique
c. hétérolactique
d. propionique
e. acides mixtes
f. acétonobutylique
g. butyrique
a. Alcool éthylique
b. Acide lactique
c. Produits // à l’acide lactique
d. Acide propionique
e. Multiples acides
f. Acétone et butanol
g. Acide butyrique
a. Qu’est-ce qu’un bioréacteur?
b. Quels sont les facteurs pris en compte dans sa conception/utilisation?
a. Cuve pour la fermentation industrielle
b.
- aération (O2)
- pH
- T°
Qu’est-ce qu’un métabolite :
a. primaire?
b. secondaire?
a. Produit dans la phase de croissance (ex : alcool)
b. Produit dans la phase stationnaire (ex : pénicilline)
Nommer des produits pharmaceutiques issus de la microbiologie industrielle
- Éthanol et acide lactique
- Produits chimiques
- Acide acétique
- AA
- Acide citrique
- Enzymes
- Vitamines
- Gomme de canthane
- Antibiotiques
- Vaccins
- Hormones
Un humain en santé est en équilibre avec les microbes de l’environnement ou de son corps (homéostasie). Qu’est-ce qui peut briser cet équilibre et ainsi le rendre malade?
- Faiblesse dans les défenses de l’hôte
- Présence d’éléments toxiques chez le microbe
Qu’est-ce que le processus infectieux? (étapes essentielles *)
Ensemble des étapes par lesquelles un microbe en arrive à induire une maladie, en 6 étapes :
1.* Pénétration
2. Adhésion
3. Compétition avec la flore normale
4.* Résistance aux défenses immunitaires
5.* Envahissement des tissus cibles
6.* Induction de dysfonctions physiologiques
Qu’est-ce qui rend une bactérie pathogène?
- Dispose d’éléments de virulence
- Capable de franchir les étapes du processus infectieux
Qu’est-ce qu’une infection opportuniste?
Infection causée par des microbes généralement inoffensifs dans un hôte immuno-compromis
Quels sont les origines et types de réservoirs d’agents pathogènes?
- Humain (porteurs sains, porteurs latents ou porteurs malades)
- Animal (zoonose)
- Inanimé (sol, eau, aliments, objets)
Qu’est-ce qu’un porteur latent vs un porteur sain?
- Sain : Porteur d’un microbe qui ne lui infligera pas de Sx (mais peut potentiellement causer des Sx à une personne immunocompromise)
- Latent : Porteur qui n’a pas de Sx actuellement, mais peut potentiellement en avoir si le microbe sort de sa latence
Quels sont les différents types de transmission des microbes?
- Contact étroit (direct, indirect ou gouttelettes)
- Vecteur vivant (arthropodes, notamment moustiques)
- Véhicule inanimé (objets souillés)
Qu’est-ce que la colonisation vs l’infection vs la contamination?
- Colonisation : Présence d’un microbe sans maladie (jamais ou éventuellement)
- Infection : Envahissement par un microbe pathogène capable de causer des maladies (inclut latence et phase pré Sx)
- Contamination : Microbe sur une surface du corps ou objet (fomite)
Qu’est-ce qu’un pathogène primaire?
Pathogène qui cause une maladie chez les sujets sains
Qu’est-ce que la :
a. Pathogénicité?
b. Virulence?
c. Comment est mesurée la virulence?
a. Capacité d’un microbe à causer une infection (qualitatif)
b. Degré de pathogénicité (quantitatif)
c. Taux de morbidité, de mortalité, DL50
Vrai ou faux? La virulence est un facteur constant pour une souche
Faux : Peut varier en fonction de divers critères
Qu’est-ce qui peut faire varier la virulence :
a. à la hausse?
b. à la baisse?
a. Transferts successifs, mutation
b. Facteurs physico-chimiques ou génétiques (mutations, congélation)
Quels sont les différents facteurs de risque/prédisposants à certaines infections spécifiques?
- Génétique/sexe
- Âge
- Habitudes de vie
- Maladies chroniques
- Prise de Rx
- Environnement
Quelles sont les portes d’entrée principales des microbes?
- Muqueuses
- Peau (follicules pileux, glandes sudoripares, plaies)
Qu’est-ce qu’une infection acquise par voie parentérale?
PAS acquise par la voie TGI
Qu’est-ce qui permet aux bactéries d’adhérer aux cellules de l’hôte?
- Adhésine (microbe) : Glycoprotéines ou lipoprotéines, pili, glycocalyx
- Récepteur (hôte) : Glucides ou protéines de surface
Quels sont les obstacles d’implantation des bactéries à la surface des tissus en contact avec l’extérieur?
- Sécrétion de substances chimiques (sébum, lysozyme, HCL, Ac)
- Desquamation des épithéliums
- Péristaltisme
- Réflexe des voies respiratoires
Qu’est-ce qui détermine quelle partie du corps une bactérie peut infecter spécifiquement?
Présence des récepteurs reconnus par les adhésines de la bactérie
Vrai ou faux? La présence d’une bactérie peut favoriser la présence d’une autre
Vrai : Exemple de la gingivite
Qu’est-ce que la flore :
a. endogène?
b. exogène?
c. Qu’est-ce que le microbiote?
a. Microbes habituels permanent ou transitoire sur un site anatomique normal
b. Microbe habituellement de l’environnement, mais rencontrés dans des échantillons corporels d’individus sains
c. Flore normale = Flore endogène + exogène
Qu’est-ce que le microbiome?
Microbes + génome + liens avec leur environnement
Quels sont les rôles du microbiote/flore normale?
- Protection : Contre les autres bactéries en occupant l’espace, les nutriments et sécrétion d’éléments toxiques
- Métabolisme : digestion et production de certaines vitamines
- Stimulation du SI (local) : Production d’IgA et phagocytes empêche le passage des microbes vers la lymphe ou sang
- Infection (opportuniste) : Si se retrouvent à des sites inhabituels ou blessés
Vrai ou faux? Bien que les bactéries constituent la majorité de la flore normale, on y retrouve aussi des virus, des champignons et des protozoaires
Vrai
Qu’est-ce qu’un holobionte?
Hôte + Tous ses microbes
La densité de la population microbienne varie selon les a. _______ du revêtement cutané et est influencée par la b. ________ des follicules pileux, des glandes sébacées et des glandes sudoripares
a. régions
b. densité
Vrai ou faux? La flore de la peau n’est que transitoire
Faux : Résidante et transitoire
Les Staphylocoques sont des bactéries a. _________ à Gram b. __________ qui s’assemblent en c. __________ de forme irrégulière. On les divise en 2 catégories selon qu’ils produisent ou non de la d. _________
a. sphériques
b. +
c. grappes
d. coagulase
Par rapport aux staphylocoques :
a. Quelles souches sont fréquemment présentes dans le microbiote de la peau?
b. À quel moment ces bactéries deviennent pathogènes?
c. Quelle est l’espèce la plus prévalente sur la peau?
d. Quelle est l’espèce la plus pathogène?
a. Staphylocoque à coagulase négative
b. Barrière cutanée endommagée
c. S. epidermidis
d. S. aureus (coagulase +)
Qu’est-ce qu’une folliculite?
Infection des follicules pileux (souvent par S. aureus)
Qu’est-ce qu’un orgelet?
Infection d’un follicule pileux d’un cil (souvent S. aureus)
Quel pathogène cause souvent des infections nosocomiales, le SARM, des folliculites, des furoncles et l’impétigo du nouveau0né?
Staphylocoque aureus
Quels sont les 3 genres de bactéries le plus souvent retrouvés dans la flore de la peau?
- Staphylocoque
- Corynébactéries
- Propionibactérie (acné)
Vrai ou faux? La présence d’une éruption ou d’une lésion cutanée est toujours le signe d’une infection
Faux : Peut aussi constituer un signe ou symptôme d’une maladie sous-jacente
Qu’est-ce qu’une :
a. macule?
b. papule?
c. plaque?
d. vésicule?
e. bulle?
f. pustule?
g. croûte?
h. ulcère?
a. tache rouge plane
b. lésion avec relief < 1 cm, sans pus
c. lésion avec relief > 1 cm, sans pus
d. Cloque <1 cm (séreux)
e. Cloque > 1 cm (séreux)
f. Ampoule avec pus
g. sérosité, sang et pus séché
h. cavité par perte de l’épiderme
Quels sont les 2 écosystèmes de la bouche et le microorganisme le plus abondant?
- Muqueuse buccale : Streptococcus salivarus
- Dents et plaque dentaire : Streptococcus mutans
Qu’est-ce qui module la flore buccale?
SI et alimentation
Vrai ou faux? La densité bactérienne est la plus élevée dans le duodénum
Faux : Augmente à mesure qu’on descend dans le TGI et l’alcalinisation du pH
a. Quelle partie du corps a le plus forte concentration microbienne?
b. Quelles bactéries y sont prédominantes?
a. Colon
b. Anaérobies
Quelles vitamines sont synthétisées par la flore du colon?
- B1
- B2
- B6
- B12
- K
Vrai ou faux? La flore normale du colon représente 30% de son contenu
Vrai
Vrai ou faux? L’urètre et la vessie sont colonisés par une flore, tandis que les reins sont stériles
Faux : Vessie stérile aussi
Quelle bactérie maintient le pH du vagin acide?
Lactobacilles : Fermentent le glycogène en acide lactique (pendant le vie fertile, autrement pas de glycogène, donc pH neutre)
Vrai ou faux? Candida albicans fait partie de la flore vaginale normale
Vrai
3 facteurs maternels facilement modifiables ont un impact sur la structure et la fonction du microbiome du nouveau-né, du nourrisson et/ou de la petite enfance. Quels sont-ils?
- Allaitement
- Alimentation de la mère
- Contrôle des comorbidités maternelles et des maladies chronique
Quels sont les mécanismes de résistance au SI utilisés par les bactéries?
- Masquage des composantes vulnérables (enveloppe virale, capsule bactérienne)
- Protection contre la phagocytose (capsule bactérienne)
- Survie dans les leucocytes (VIH)
- Sécréter des enzymes qui détruisent les leucocytes (leucocidines bactériennes)
- Interférer avec les Ac et le complément (enzymes)
Les microbes qui réussissent à éviter l’élimination par le système immunitaire peuvent ensuite envahir les tissus cibles en s’implantant plus profondément dans les structures corporelles de l’hôte. Quelles sont les 4 catégories d’enzymes sécrétées dont l’action entraine des bris ou dysfonctions cellulaires et leur mode d’action?
- Cytolysine → Brise composants cellulaires (collagène, phospholipides)
- Hémolysine → Détruit GR
- Coagulase et fibrinolysine → Formation de caillot et empêche la coagulation
- Leucocidine → Perfore les leucocytes (pores)
a. Quelles sont les 2 grandes catégories de toxines bactériennes?
b. Quel est l’effet physiologique des tozines?
a.
1. Endotoxine (composante structurale du microbe)
2. Exotoxine (sécrétée par la bactérie)
b. Stimule des réactions inflammatoire = Dysfonction physiologique
a. Que sont les endotoxines?
b. Chez quel type de bactérie les retrouve-t-on?
c. De quoi est-ce composé et quel composant est toxique?
d. Que provoquent-elles chez l’humain?
a. Lipopolysaccharides (LPS) de la paroi
b. Gram -
c. Chaine de polysaccharide (antigène O + Lipide-A = toxique
d. Fièvre, jusqu’à choc septique (car LPS provoque une réponse inflammatoire +++)
Qu’est-ce qu’un choc septique?
Effondrement de la pression : Septicémie → Endotoxine → Cytokines inflammatoires → Fièvre et frissons + → PG qui dilatent et perméabilisent les capillaires sanguins → Œdème dans les organe et hypotension sévère
Vrai ou faux? Bien que l’antibiothérapie soit nécessaire pour stopper une prolifération bactérienne mortelle, elle contribue tout de même à la libération d’endotoxines
Vrai
Les infections par des bactéries sécrétant des exotoxines causent plus de risque de mourir par empoisonnement. Pourquoi?
Puisque ce n’est pas la prolifération microbienne qui tue mais bien le haut degré de toxicité de l’exotoxine
a. Qu’est-ce qu’une anatoxine?
b. Comment sont-elles utilisées?
a. Toxine inactivée, mais encore immunogène
b. Production de vaccin
Comment peut-on inactiver une toxique
Thermosensible → Par la chaleur
Aussi par des moyens chimiques ou biologiques
Quelles sont les cytokines très proinflammatoires responsables de la majorité des effets de l’endotoxine et comment?
TNFα et IL-1 → En générant la libération d’acide arachidonique → PG → vasodilatation
Quelles sont les 3 catégories d’exotoxines?
- Cytotoxines : tuent/altèrent les cellules
- Entérotoxines : s’attaquent du TGI
- Neurotoxines : Perturbent les influx nerveux
La résistance aux antibiotiques est causée principalement par 4 mécanismes. Quels sont-ils?
- Destruction/modification de l’antibiotique
- Modification de la cible
- Diminution de la perméabilité cellulaire et production de pompes à efflux
Quelles sont les principales différences entre les eucaryotes et les bactéries exploitées pour les antibiotiques?
- Ribosomes
- Nucléoïde (empaquetage de l’ADN)
- Paroi cellulaire
Vrai ou faux? Un parasite obligatoire a un plus petit génome
Vrai : Capacités limitées, donc dépend d’un hôte
La plupart des bactéries ont a. ______ chromosome et en général celui-ci est b. ______
a. 1 seul
b. circulaire
Quels genres de gènes sont contenus sur un plasmide?
Gènes qui procurent un avantage :
- Résistance
- Virulence
Qu’est-ce que le pangénome bactérien?
Ensemble des gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne = Génome de base + génome accessoire
Qu’est-ce que le génome bactérien :
a. de base?
b. accessoire?
a. Gènes communs à toutes les souches d’une même espèce
b. Gènes retrouvés dans certaines souches seulement
Vrai ou faux? Plus le pangénome est grand, plus le potentiel de résistance est petit
Faux : Plus il est grand
Pangénome = Réservoir de résistances potentielles
Vrai ou faux? Chez E. Coli, que la taille du pangénome augmente tandis que celle du génome de base continue de diminuer
Vrai
Les bactéries se divisent par fission binaire.
a. Combien de temps prend la formation d’une nouvelle génération?
b. Vrai ou faux? Les chromosomes et les plasmides sont répartis de façon égale entre les 2 cellules filles
a. 20 minutes
b. Faux : Répartition plasmide pas nécessairement égale
Afin de minimiser ses dépenses énergétiques, la bactérie n’active un système (gène) que si elle en a besoin. Quel mécanisme de régulation de l’expression est le plus utilisé chez les bactéries?
Régulation transcriptionnelle = Changement dans le nombre de transcrits
Par quoi est reconnue la séquence :
a. promotrice?
b. opératrice?
a. ARN pol
b. Protéine régulatrice (activateur ou répresseur)
Vrai ou faux? Les protéines régulatrices sont elles mêmes contrôlées
Vrai : Sont inductibles et répressibles
Vrai ou faux? La régulation des gènes est plus rapide durant la phase de croissance exponentielle des bactéries que durant les phases de latence et de plateau ou de décroissance.
Vrai : Processus actif qui exige que la cellule soit dans un état métabolique actif
Outre les protéines régulatrices, quels sont d’autres moyens de régulation transcriptionnelle?
- Regroupement de gènes dans un opéron
- Contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un régulon = Même protéine stimulatrice
- Contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un stimulon = Même stimulus
Vrai ou faux? Les mutations spontanées sont plus fréquentes que les mutations induites
Faux : Induites (par des mutagènes)»_space;> Spontanées (erreurs aléatoires)
Vrai ou faux? La fenêtre de sélection de bactéries résistantes se trouvent entre la concentration minimale inhibitrice des bactéries susceptibles et la concentration minimale inhibitrice des bactéries résistantes
Vrai
Lors du traitement contre des infections bactériennes, il est important de traiter a. rapidement et b. efficacement. Pourquoi?
a. Éviter la formation d’une trop grande population ou d’un biofilm
b. Éviter les bactéries résistantes
a. Quels sont les systèmes de réparation de l’ADN chez les bactéries?
b. Lequel peut stimuler le transfert horizontal?
c. Lequel peut entrainer des mutations?
a.
1. Directe
2. Par excision
3. Par recombinaison
4. Réponse SOS
5. Sujette à erreur
b. Réponse SOS
c. Sujette à erreur
Vrai ou faux? L’action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation de l’ADH des bactéries
Vrai
a. Quels sont les mécanismes de transfert horizontal chez les bactéries?
b. Lequel est prédominant?
a.
1. Transformation → Absorption d’ADN libre (souvent de bactéries mortes)
2. Conjugaison → Pili conjugatifs
3. Transduction → Introduction d’ADN à partir d’un bactériophage
b. Conjugaison
Vrai ou faux? La transformation est beaucoup plus efficace entre bactéries d’une même espèce qu’entre bactéries d’espèces différentes
Vrai
Quel mécanisme est responsable de la résistance de la bactérie Streptococcus pneumoniae aux antibiotiques de la classe des bêta-lactamines (pénicillines et céphalosporines)?
Transformation (absorption de l’ADN de streptocoque de la bouche)
Par rapport à la transformation :
a. Quelle bactérie important est naturellement compétente?
b. Quelle cellule contrôle l’acquisition de l’ADN?
a. Streptococcus pneumoniae (pneumococoque)
b. Bactérie réceptrice
Les antibiotiques peuvent favoriser la transformation de 3 façons. Nommez-les.
- Pression sélective aux bactéries transformées par des gènes de résistance
- Stimulus externe induisant ou augmentant la compétence
- Lyse de cellules, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation.
a. Qu’est-ce qu’un plasmide conjugatif?
b. Qu’est-ce qu’un plasmide conjugatif de type R?
a. Gros plasmide qui contient les gènes nécessaires à la conjugaison
b. Plasmide conjugatif qui contient des gènes de résistance
Qu’est-ce que la mobilisation?
Transfert d’un ou d’autres plasmides en même temps que le plasmide conjugatif
Vrai ou faux? Les bactéries à Gram positif utilisent un mécanisme distinct du pili conjugatif pour la conjugaison
Vrai
Qu’est-ce qu’un phage :
a. virulent?
b. tempéré?
c. chronique?
a. Phage avec un cycle de croissance strictement lytique
b. Intègre son génome dans la cellule sans la détruire
c. Se réplique et sort de la cellule sans la lyser
Qu’est-ce que la transposition?
Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule
Quelles sont les 3 classes de transposons?
- Séquence d’insertion (IS)
- Transposons complexes (IS + autres gènes)
- Phages transposables
Que sont les intégrons?
Éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément