MIC - Auto-Apprentissage Flashcards
MIC-011 Caractéristiques entre les deux grands groupes de microorganismes : les procaryotes
Procaryotes
Noyau : sans membrane nucléaire Chromosome : 1 ADN extrachromosomal : plasmides Mitose et stérols dans membrane : Non Paroi : peptidoglycan Ribosome : 70s Organelles : non
MIC-011 Caractéristiques entre les deux grands groupes de microorganismes : les Eucaryotes
Noyau : vrai noyau Chromosome : >1 ADN extrachromosomal : dans organelles Mitose et stérols dans membrane : Oui Paroi : sans peptidoglycan Ribosome : 80s Organelles : mitochondries
4 types de micro-organismes?
- virus
- bactéries (procaryotes)
- mycètes (eucaryotes)
- protozoaires (eucaryotes)
MIC-014 Comparer les différentes caractéristiques entre les virus, les bactéries, les mycètes et les protozoaires.
VIRUS acide nucléiques : métabolisme : croissance : dimensions : multiplication : drogues (traitement) :
VIRUS
acide nucléiques : ADN ou ARN métabolisme : aucun croissance : dans vivants dimensions : 20-250 nm multiplication : assemblage dans cellule hôte drogues (traitement) : antiviraux
MIC-014 Comparer les différentes caractéristiques entre les virus, les bactéries, les mycètes et les protozoaires.
BACTÉRIES acide nucléiques : métabolisme : croissance : dimensions : multiplication : drogues (traitement) :
BACTÉRIES
acide nucléiques : ADN ET ARN métabolisme : autonome croissance : synthétiques dimensions : 0,5-5 micromètres multiplication : fission binaire drogues (traitement) : antibactériens
MIC-014 Comparer les différentes caractéristiques entre les virus, les bactéries, les mycètes et les protozoaires.
MYCETES acide nucléiques : métabolisme : croissance : dimensions : multiplication : drogues (traitement) :
MYCÈTES
acide nucléiques : ADN ET ARN métabolisme : autonome croissance : synthétiques dimensions : 0,5 micromètre - 0,5 mm multiplication : exospores et bourgeonnement drogues (traitement) : antifungiques
MIC-014 Comparer les différentes caractéristiques entre les virus, les bactéries, les mycètes et les protozoaires.
PROTOZOAIRES acide nucléiques : métabolisme : croissance : dimensions : multiplication : drogues (traitement) :
PROTOZOAIRES
acide nucléiques : ADN ET ARN métabolisme : complexe croissance : difficile, synthétique dimensions : 10 micromètre - mm multiplication : complexe, cycles vitaux dans hôtes intermédiaires drogues (traitement) : antiparasitaires
MIC-012 Concevoir la taille et l’omniprésence des microorganismes.
- La taille des plus gros microorganismes ne dépasse pas quelques centaines de micromètres.
- taille procaryotes < eucaryotes
- masse micro-organisme > masse tous les autres êtes vivants
Dimensions des virus?
20-250 nm
Dimensions bactéries?
0,5-5 micromètre à mm
Dimensions mycètes?
0,5 micromètre à mm
Dimensions protozoaires?
10 micromètres à mm
Sur quels milieux peuvent croitre les bactéries pouvant se développer de façon indépendante?
milieux artificiels
Sur quels milieux doivent croitre les bactéries n’ayant pas la capacité de produire des métabolites importants (parasites intracellulaire obligatoire)?
culture de cellule
Définition : parasites intracellulaire obligatoire
incapables de croître à l’extérieur des cellules de l’hôte
Quel type de micro-organisme n’est composé que d’un seul type d’acide nucléique, soit ARN ou ADN et jamais les deux?
virus!
tous les autres sont composés à la fois d’ADN et ARN.
Quel type n’est pas visible au microscope optique?
virus (nm)
les autres sont en micromètres à mm
Deux groupes de mycètes?
levures et moisissures
Définition levures
les levures sont des champignons unicellulaires qui se reproduisent par bourgeonnement.
Utilité levures?
- industrie alimentaires (bière, cidre, vin, fromages)
- revalorisation des déchets agricoles et industriels
- la production de protéines.
Rôle négatif levures?
contamination et dégradation aliments
certaines sont pathogènes pour l’homme et animaux
Définition moisissures
les moisissures sont des champignons filamenteux multicellulaires, mais la notion de cellule est assez floue car leur structure est souvent mycélienne ou coenocytique (cellules fusionnées à plusieurs noyaux)
Intervention moisissures alimentation?
- champignons à activité phytopathogène
- mycotoxines dangereuses
- utilisées en agriculture ou dans l’industrie alimentaire
L’infection chez l’humain est-elle nécessaire au cycle de survie des mycètes?
non, existent dans la nature en tant que saprophytes environnementaux
Définition parasite?
variété protozoaires + organismes eucaryotes multicellulaires capables d’induire maladie
MIC-015 Décrire les principes de la classification bactérienne.
Nomenclature binomiale en italique/souligné.
Genre : nom lettre majuscule
Espèce : adjectif lettre minuscule
MIC-016 Définir la notion de souche.
On utilise alors le terme de souche pour désigner chaque groupe, une souche étant un ensemble de cellules bactériennes descendant toute d’une même cellule mère.
Comment définir une espèce procaryote?
population de cellules bactériennes ayant des caractéristiques semblables.
Les cultures pures d’une même espèce sont-elle tout à fait identiques?
Pas tout à fait. C’est pourquoi on utilise le terme de souche.
Définition : taxonomie
classification des bactéries
MIC-017 Décrire les caractères phénotypiques de la classification bactérienne.
morphologiques
- forme
- taille
- arrangement spaciaux
Types de forme de bactéries?
- coques (bactéries sphériques)
- bacilles (bactéries cylindriques)
- spiralées
Types d’arrangement spatiaux
- en amas (seules)
- en paires
- en chaîne
Chaque espèce bactérienne a une morphologie propre reconnaissable à l’aide de quels critères?
- taille
- couleur
- forme
- aspect
- texture
Les cultures pures sont plus facilement identifiables par leur apparence en milieu ___
milieu solide
coloration de Gram : on peut diviser les bactéries en 2 grands groupes selon leur réaction
- Gram + = violet
2. Gram - = rose
Quelles caractéristiques des flagelles peuvent permettre d’identifier/classifier?
- nature (sérotype H)
- nombre
- disposition
Définition endospores?
présence de structures intracellulaires particulières
MIC-017 Décrire les caractères génotypiques de la classification bactérienne.
étude des protéines et acides nucléiques qui sont des produits directs des gènes ou les gènes eux-mêmes = infos considérables sur les parentés véritables.
- comparaison protéines
- composition en bases des acides nucléiques
- hybridation des acides nucléiques
- séquençage d’un ADN
Comparaison des protéines?
séquence AA protéines reflètent séquences ARNm –> gènes encodant.
- Séquence en acides aminés des protéines
- Mobilité électrophorétique (électrophorèse) des protéines
- Techniques immunologiques: anticorps
- Propriétés physiques, cinétiques et régulatrices
Composition en bases des acides nucléiques?
déterminer la composition des bases de l’ADN sous la forme du % de guanine et cytosine (GC%)
LE contenu en bases puriques et pyrimidiques de l’ADN __ d’un organisme à l’autre, mais est __ dans une espèce donnée.
varie
constant
Le coefficient CG% varie de __ à __ chez les bactéries.
25 à 75%
Hybridation des acides nucléiques?
Comparaison directe de la similitude entre génomes.
Hybridation : s’unir par appariement des bases complémentaires entre 2 brins d’ADN de deux organismes distincts.
L’hybridation des acides nucléiques se base sur quelle hypothèse?
Si deux espèces sont similaires/apparentées, une bonne partie des séquences des nucléotides sera semblable.
Le degré de similitude est __ à l’hybridation stable détectable. Il S’exprime en __
proportionnel
%
Séquençage d’un ADN
Seule technique permettant de comparer directement les structures génomiques d’ADN et ARN.
Quelle est la seule technique qui permet de comparer directement les structures génomiques?
séquençage d’ADN et d’ARN
MIC-018 Dissocier l’identification de la classification bactérienne.
Classification : liste de caractéristiques/méthode de comparaison facilitant l’identification
Les techniques d’identification des de classification des microorgnismes sont-elles les mêmes?
pas nécessairement
Raison d’identifier un microorganisme?
Les procaryotes ont peu de traits morpho distinctifs permettant de les classifer. Il faut réactions métaboliques/caractéristiques pour les distinguer.
raisons pratiques –> définir traitement approprié contre infection
Comment se font les processus d’identification?
majorité –> facilement en laboratoire
plus petit nombre possible d’épreuve
doit être rapide et efficace
MIC-019 Décrire les critères et méthodes taxonomiques de la classification et d’identification bactérienne.
I : identification
C : classification
- caractères morphologiques (I)
- coloration différentielle (I+C)
- épreuves biochimiques (I)
- sérologie (I)
techniques d’analyse des acides nucléiques
- composition bases ADN (C)
- hybridation moléculaire (I+C)
- séquençage de l’ADN (C)
MIC-023 Identifier la principale structure de la paroi bactérienne.
ENVELOPPES : structures entourant cellules bactériennes
- capsule
- glycocalyx
- paroi
- membrane cytoplasmique
Définition capsule
- PAS indispensable à la survie
- seulement chez certaines bactéries
- favorise virulence
- enveloppe visqueuse composée souvent de polysaccarides
Comment la capsule peut être jouer un rôle essentiel dans la virulence?
- empêche la phagocytose
- favorise l’adhérence des bactéries aux cellules épithéliales
Comment visualiser la capsule?
- invisible en microscopie optique par technique coloration usuelle
- visible en mélangeant la suspension bactérienne avec encre de chine (capsule forme halo clair autour bactérie)
Les cellules bactériennes présentent 3 principales structures antigéniques importantes, lesquelles?
antigène H, K et O
Définition glycocalyx?
feutrage de fibres polysaccharidiques (exopolymère) présent à la surface des bactéries dans leur milieu naturel.
Rôle glycocalyx?
- favorise adhésion de la bactérie
- formation plaque dentaire –> carie (Streptococcus mutans)
Définition et rôle paroi
- enveloppe rigide assure forme bactérie
- point d’ancrage flagelles
Quelles rares espèces bactériennes sont dépourvues de paroi?
mycoplasmes
Quel est le constituant commun des parois différentes des bactéries à Gram+ vs Gram-
peptidoglycan (mucopeptide ou muréine)
Définition peptidoglycan (muréine)
polymère macromoléculaire composé de chaînes polysaccharidiques reliées par de courts peptides (structure réticulée) entourant bactérie
Comment agit la pénicilline?
inhibe la formation des ponts inter-peptidiques.
Décrire la paroi des bactéries à Gram positif?
- épaisse
- majorité de peptidoglycan
- autres constituants superficiels : acides teichoïques
Décrire paroi bactéries Gram-
- couche peptidoglycan mince
- enveloppe/membrane externe supplémentaire
Quels antigènes se trouvent sur la membrane externe des bactéries Gram-?
antigènes O utilisés pour la classification antigénique (sérotype) de certaines espèces bactériennes.
Comment se nomme l’espace entre la membrane externe et la membrane cytoplasmique?
Espace périplasmique –> rempli de périplasme –>
- concentration élevée d’enzyme de dégradation et de transporteurs protéiques
- abrite couche peptidoglycan
La membrane externe protège les bactéries gram - contre quoi?
- pénicilline (antibiotiques)
- enzymes digestives
- lysozyme
- désinfectants
- métaux lours
- sels biliaires
La membrane externe s’oppose-t-elle au passage de toutes les substances de l’environnement?
NON
doit laisser passer les nutriments pour métabolisme
protéines membranaires (porines –> canaux) = perméabilité
Qu’est-ce qui explique la réaction à la coloration de Gram des bactéries à gram - (rose)
la grande quantité de lipides dans leur paroi.
MIC-022 Comparer la paroi des bactéries à Gram positif et à Gram négatif.
Structure et composition chimique de la paroi des bactéries gram positives
Structure Gram+
- épaisse 15-80 nm
- une seule couche (peptidoglycan)
MIC-022 Comparer la paroi des bactéries à Gram positif et à Gram négatif.
Structure et composition chimique de la paroi des bactéries gram négatives
Structure Gram-
- mince 10-15 nm
- trois couches (lipoprotéines, lipopolysaccharides, peptidoglycan)
MIC-024 Décrire les différences physiques et chimiques de la paroi bactérienne.
Composition chimique paroi bactéries Gram+
peptidoglycan : acides teichoïques et lipotechoïques : lipoprotéines : lipopolysaccharides (LPS) : phospholipides : porines :
peptidoglycan : ++++ (50% poids sec) acides teichoïques et lipotechoïques : + lipoprotéines : - lipopolysaccharides (LPS) : - phospholipides : - porines : -
MIC-024 Décrire les différences physiques et chimiques de la paroi bactérienne.
Composition chimique paroi bactéries Gram-
peptidoglycan : acides teichoïques et lipotechoïques : lipoprotéines : lipopolysaccharides (LPS) : phospholipides : porines :
peptidoglycan : + (10% poids sec) acides teichoïques et lipotechoïques : - lipoprotéines : + lipopolysaccharides (LPS) : + phospholipides : + porines : +
Qu’est-ce que la coloration de Gram?
Coloration différentielle basée sur les différences structurales entre les parois cellulaires des bactéries à Gram positif et à Gram négatif et sur les effets que produisent sur elles les divers réactifs utilisés dans la coloration.
Qu’est-ce qui explique la coloration violette des bactéries Gram+?
- Violet de cristal colore les deux types de bactéries, car il pénètre jusqu’au cytoplasme.
- L’iode (le mordant) ajouté forme des cristaux avec le colorant trop gros pour s’échapper de la paroi cellulaire.
- La solution d’isopropanol et d’acétone (ou éthanol 95%) déshydrate l’épaisse couche de peptidoglycan des Gram+ = paroi ++ imperméable = conservation couleur violette
Qu’est-ce qui explique la coloration rosée des bactéries Gram-? (grande qté lipides)
- Violet de cristal colore les deux types de bactéries, car il pénètre jusqu’au cytoplasme.
- L’iode (le mordant) ajouté forme des cristaux avec le colorant trop gros pour s’échapper de la paroi cellulaire.
- L’alcool dissout la membrane externe et rend la couche de peptidoglycan perméable = diffusion complexe violet-iode = bactéries incolores après traitement isopropanol-acétone
- Contre-coloration avec ajout de safranine = apparition en rose
MIC-025 Décrire les différentes structures et fonctions des constituants internes des bactéries.
Rôle paroi dans l’antigénicité
On trouve a/n de la paroi :
- déterminants antigéniques responsables de l’antigénicité somatique (antigène O des entérobactéries)
- ++ récepteurs que reconnaissent les bactériophages (virus des bactéries)
Rôle des antibiotiques avec la paroi?
beta-lactamines empêchent assemblage convenable paroi = éclatement bactéries
agit a/n synthèse des bactéries : bacitracine, vancomycine, fosfomycine.
Composition membrane cytoplasmique
- structure mince, souple et résistante de la paroi cellulaire et enveloppant le cytoplasme.
- protéines et bicouche phospholipides
Fonctions de la membrane cytoplasmique
- Barrière osmotique
- Système de transport
- Enzymes
- Division cellulaire (fission biaire)
- Membrane cytoplasmique et antibiotiques
La membrane cytoplasmique joue le même rôle que __ dans les cellules eucaryotes.
mitochondrie = métabolisme énergétique
Comment s’effectue la division cellulaire?
Fission binaire
- invagination membrane cytoplasmique
- Tapissement progressif membrane par la paroi
- Cloison (septum) entre les 2 cellules filles
- Septum se clive (séparation)
*division du chromosome précède la division de la cellule
Quelles substances anti-bactériennes ont la membrane cytoplasmique comme cible?
- phénols
- antiseptiques cationiques
- antibiotiques polypeptidiques
Quels sont les constituants internes?
- cytoplasme
- appareil nucléaire
- ADN extra-chromosomique appelé “plasmide”
Cytoplasme
- nb ribosomes + machinerie synthèse protéines
- parfois granulation stockage
Constitution ribosome?
- prots + ARN
- 2 sous-unités (50s et 30s chez bactéries)
ADN ou appareil nucléaire
chromosome bactérien = filament ADN bicaténaire, circulaire nu
- 1000x plus long que la bactérie
- forme pelotonnée
Plasmide (ADN extra-chromosomique)
- ## molécules ADN cytoplasmiques douées de réplication autonome
Implications médicales des plasmides?
- apparition brusque de souches multirésistantes aux antibiotiques
- permet résistance aux antiseptiques et sels de métaux toxiques
Exemples d’espèces bactériennes hébergeant des plasmides de résistance?
Nombre d’espèce important
- coques à Gram+ (staphylocoques streptocoques)
- bacilles à Gram- (entérobactéries, Pseudomonas)
MIC-026 Décrire les différentes structures et fonctions des appendices externes des bactéries.
- flagelles
2. pilis
Flagelles
- mobilité
- micromètres
- nombre et disposition varient selon espèces
- composée de flagelline
- antigène H (sérotype)
- 4 types arrangements (monotriche, lophotriche, amphitriche, péritriche)
Monotriche
Un seul flagelle polaire
Amphitriche
un ou plusieur flagelles aux deux extrémités de la cellule
Lophotriche
deux ou plusieurs flagelles à une extrémité de la cellule
Péritriche
des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule
définition pili bactérien.
- appendices filiformes plus courts, droits et minces que les flagelles
- fixer bactérie plutôt que mobiliser
- constituée de piline assemblée en hélice autour noyau central
MIC-027 Distinguer les deux types de pili bactérien.
- fimbriae (pili commun)
2. pilis sexuels
Fimbriae ou pili commun
- nombreux et courts
- fixation bactéries aux tissus
- s’adaptent à récepteurs spécifiques
- pouvoir pathogène bactéries
- fixation certains bactériophages
pilis sexuels
- peu nombreux, longs, creux, enflés à l’extrémité distale
- codés par plasmides
- conjugaison bactérienne (échange génétique unidirectionnel avec contact temporaire entre 2 bactéries)
MIC-028 Associer les déterminants antigéniques bactériens O, H et K à une structure bactérienne.
O : paroi bactérienne, membrane externe Gram-
H : flagelles
K :
DÉFINITION endospores
différenciation bactéries en “formes de survie”
Forme bactérie
- forme végétative métabolique active et potentiellement pathogène
ou - forme végétative métabolique inactive et non pathogène (forme porulée)
Quel type de bactérie à la capacité de former des endospores?
bacilles à Gram positif
- Bacillus
- clostridium
Différence entre spores bactériennes et spores des mycètes (champignons?)
bactériennes = formes résistances
champignons = cellules formées au cours de la reproduction asexuée
Quels sont des caractères morpholoiques d’identification des endospores intéressants, car stables?
- volume
- position dans la cellule bactérienne
Quelles propriétés donnent les endospores aux bactéries?
résistance à des conditions défavorables :
- température extrême (+/-)
- humidité trop basses
- éléments nutritifs faible ou absent
- insensibilité à composés chmiques actifs (ex : antibiotiques)
Résistance est causée par quelle substance composant principal de l’enveloppe de la spore bactérienne?
acide dipicolinique
- stabilisation des protéines cytoplasmiques
- empêche dénaturation par chaleur
- imperméabilité spore = résistance produits chmiques
L’endospore peut rester en état de __. Le retour d’une condition défavorable il se produit la __é
état de dormance
germination = naissance à une nouvelle bactérie active
Cycle de l’endospore
- bactérie végétative
- Formation préspore par invagination membrane cytoplasmique
- Fin de la formation préspore
- Synthèse de l’enveloppe sporale (devient comme une bulle dans la cellule)
- Libération de la spore
- Germinationd e la spore aux retours des conditions défavorables
Les endospores sont médicalement importantes dans la dissémination de quelques maladies telles que:
- la gangrène gazeuse (Clostridium perfringens)
- le tétanos (Clostridium tetani) (plaies souillées par la terre)
- le botulisme (Clostridium botulinum) (conserves familiales)
- l’anthrax (Bacillus anthracis)
Qu’entend-on par procaryote?
- elles n’ont pas de vrai membrane nucléaire. Le matériel génétique est donc présent sous la forme d’un nucléoïde, libre dans le cytoplasme.
- population de cellules bactériennes ayant des caractéristiques semblables.
Quelles sont les modalités de reproduction des virus, des bactéries et des protozoaires?
Virus : Assemblage dans la cellule hôte
Bactéries : Fission binaire
Mycètes : exospores et bourgeonnement
Protozoaires : Complexe, cycles vitaux dans des hôtes intermédiaires
En quels sous-groupes sont divisés les mycètes?
levures et moisissures
En quoi les capsules, flagelles, pili, plasmides sont-ils utiles aux bactéries?
- flagelles : mobilité
- pili commun : attacher aux cellules
- pilis sexuels : échange unidirectionnel ADN et ARN entre 2 bactéries par contact temporaire
- plasmides : résistances des bactéries + codent les pilis sexuels
Pourquoi appelle-t-on ‘sexuels’ certains pili?
Il permettent l’échange d’ADN et ARN entre 2 bactéries
A quoi sert le test de Gram?
Par coloration, il permet de classifier les bactéries en Gram- ou Gram+ selon leurs structures et leur réaction à certains agents.
Quelles sont les principales différences dans la paroi qui distinguent les Gram+ et les Gram-? De quelles couleurs seront-elles dans cette coloration?
Gram +
- mince
- 50% peptidoglycan
- violette
Gram -
- lipoprotéines
- membrane externe
- mince couche peptidoglycan
- rose Gram
Lesquelles sont porteuses d’endotoxine?
Les endotoxines font partie de la membrane externe de la paroi cell des Gram-.
Diffusent seulement à la mort de la cellule, quand la membrane éclate.
Partie lipidique du LPS (lipide A) est l’élément toxique.
Le génotype étant les gènes et le phénotype étant les caractéristiques qui en découlent (morphologie, métabolisme, etc), nommez quelques techniques/approches qui permettent d’étudier le génotype microbien?
- Comparaison des protéines : séquences en AA des protéines reflétant les ARNm (et donc gènes)
- Composition en bases des acides : pourcentage de guanine et cytosine (G+C) pour mettre en évidence les homologies moléculaires
- Hybridation des acides nucléiques : similitude génomes –> séquences nucléotides semblables chez deux espèces similaires/apprentées
- Séquençage d’un ADN
Caractéristiques du génotype et phénotype : Lesquelles apportent des informations sommaires/grossières ou le plus de précision pour établir le degré de parenté entre deux souches?
Précision : le terme souche est utilisé pour désigner la bactérie qu’on isole d’un spécimen clinique; exemple, on isole chez monsieur X du Streptococcus pneumoniae sérotype 3 et chez madame Y du Streptococcus pneumoniae sérotype 3; théoriquement c’est la même souche, mais elle pourrait malgré tout avoir de petites différences qu’on ne prendra pas le temps d’étudier en clinique, donc on dira la ‘souche’ isolée chez monsieur x et la ‘souche’ isolée chez madame y.
Les caractérisques phénotypiques apportent plus d’informations pour établir le degré de parenté entre 2 souches.
l’antigène O: A quelle structure se réfère-t-il ?
ENDOTOXINE : antigène fait partie de la membrane externe des gram-
PAROI des entérobactéries
l’antigène O : associé à quelle capacité chez la bactérie?
Immunogénicité (capacité d’induire la production d’anticorps
Antigène O : est-il toxique?
Très toxique
Antigène O : composition?
- La membrane externe des Gram- enveloppe la couche de petidoglycan de la paroi cellulaire.
- Partie lipide A du LPS (lipoprot, phospholipides et lipopolysaccharides) est l’élément toxique
DONC endotoxines = lipopolysaccharides
et exotoxines = protéines
Antigène O : effets sur l’hôte?
Non spécifique
- fièvre
- bradycardie
- hypotension
- choc septique
Effets des antibiotiques sur les endotoxines?
Antibiotiques contre Gram - peut entraîne lyse de la membrane = libération endotoxine = exacerbation symptômes dans l’immédiat
MAIS, l’EG du patient s’améliore au fur et à mesure que l’endotoxine se dégrade.
Antigène H : À quelle structure de la cellule se réfère-t-il?
Flagelle : entérobactéries mobiles
Antigène H : toxicité?
Non toxique
Antigène H : Anticorps produit?
Lors d’infection systémique à entérobactéries, production d’anticorps non neutralisants permettant le séro-diagnostique.
Antigène K : À quelle structure de la cellule se réfère-t-il
antigène d’enveloppe entoure paroi
Antigène K : Rôle?
masque l’antigène O (défense contre les barrières défensives de l’hôte)
