Métabolomique

Question 1

c’est quoi le métabolome

Answer 1

ensemble des métabolites présents dans une cellule/organe/organisme spécifique

Question 2

3 types d’échantillons pour les analyses métabolomiques

Answer 2

1) biopsie du tissu pathlogique
2) culture cellulaire
3) biofluide

Question 3

4 exemples de biofluides

Answer 3

plasma, salive, urine, sérum

Question 4

c’est quoi les 8 techniques utilisées pour le métabolomique

Answer 4

1) RMN
2) LC
3) RPLC
4) HILIC (chromatographie à interaction hydrophile)
5) GC
6) MS
7)LC-MS
8)GC-MS

Question 5

c’est quoi l’analyse par RMN

Answer 5

analyse non destructive sensible qui utilise le champ magnétique pour exciter les noyaux des molécules

Question 6

comment interpreter les résultats de la RMN

Answer 6

en comparant avec une base de données

Question 7

c’est quoi la GC

Answer 7

technique qui sépare et analyse les métabolites volatiles

Question 8

utilité du GC-MS

Answer 8

permet d’analyser les échantillons volatiles et séparer des mélanges complexes en composantes uniques

Question 9

avantages de LC-MS

Answer 9

bonne sensibilité et séparation

Question 10

limites de LC-MS

Answer 10

phase mobile doit être configuré d’avance et certaines phases mobiles peuvent être nocives

Question 11

avantages de GC-MS

Answer 11

bonne sensibilité, séparation et répétabilité. Peut detecter les substances volatiles apolaires

Question 12

limites du GC-MS

Answer 12

peut seulement détecter les substances volatiles et apolaires, besoin d’un pré-traitement de dérivatisation

Question 13

avantages de la RMN

Answer 13

-non destructive
-préparation simple pour les échantillons
-peut analyser le même échantillon plusieurs fois
-permet analyse in vivo

Question 14

limites de la RMN

Answer 14

mauvaise sensibilité

Question 15

2 techniques pour générer des ions à partir des molécules

Answer 15

ESI (electrospray ionization) et MALDI (matrix laser assisted desorption ionization)

Question 16

c’est quoi l’ESI (electrospray ionization)

Answer 16

technique pour generer des ions par une haute tension électrique qui crée des gouttelettes chargées qui vont ensuite faire passage à un MS
utilisé en LC-MS

Question 17

c’est quoi la technique MALDI

Answer 17

technique pour generer des ions avec un laser. Elle utilise la matrice organique pour absorber l’énergie du laser. Les ions sont utilisés pour la MS

Question 18

ESI vs MALDI, c’est quoi la différence majeure

Answer 18

MALDI n’a pas besoin d’être couplé à une chromatographie

Question 19

2 types d’analyseurs pour MS

Answer 19

quadrupole et TOF (time of flight)

Question 20

c’est quoi l’analyseur TOF

Answer 20

analyseur pour les ions. les ions sont déviés en fonction de la longueur et du voltage oscillant appliqué. Permet le passage aux ions qui possèdent une ratio m/z spécifique

Question 21

3 sites web pour l’analyse et identification des métabolites

Answer 21

-metaboanalyst
-human metabolome database
-BiKEGG

Question 22

3 différents types d’analyse en métabolomique

Answer 22

1) ciblé
2) non-ciblé
3) flux métabolique

Question 23

c’est quoi l’analyse métabolomique non-ciblée

Answer 23

analyse semi-quantitative qui identifie les voies métaboliques affectées pour determiner une hypothèse. utilise la chromatographie et MS

Question 24

c’est quoi le fingerprinting vs footprinting

Answer 24

les deux sont relié à l’analyse non ciblée
Fingerprinting=utilisé pour les métabolites intracellulaires (sang, sérum, plasma)
Foot printing=analyse globale du métabolome extracellulaire (urine, salive, sueur)

Question 25

c’est quoi l’analyse m.tabolomique ciblée

Answer 25

analyse quantitative des métabolites qui ont été identifiés par l’analyse NON-CIBLÉE. valide les hypothèses et détecte les biomarqueurs. utilise RMN, MS et chromatographie

Question 26

pourquoi le couplage de l’analyse non ciblée et ciblée est nécessaire

Answer 26

pour assurer une bonne identification ET quantification des métabolites

Question 27

est que l’analyse ciblée a besoin d’un standard?

Answer 27

oui

Question 28

c’est quoi les analyses du flux métabolique (MFA)

Answer 28

analyse en temps réel pour des métabolites spécifiques en utilisant des traceurs stables d’isotopes pour mesurer le niveau des métabolites

Question 29

2 types d’analyses dy flux métabolique (MFA)

Answer 29

1) steady-state MFA
2) pseudo-steady state MFA

Question 30

c’est quoi la lipidomique

Answer 30

branche de métabolomique qui étudie les lipides exclusivement

Question 31

techniques utilisées lipidomique vs métabolomique

Answer 31

lipidomique=RPLC-MS/MS
métabolomique=HILIC-MS/MS, GC-MS