Koppling Och Kartläggning Flashcards
Vad innebär det att två gener är kopplade, till skillnad från oberoende?
Oberoende gener sitter i regel på olika kromosomer. Kopplade gener har alleler placerade (nära varandra) på samma kromosom.
Mycket tät koppling = ingen rekombination mellan gener.
Vad är chiasmata?
Tydliga tecken på rekombination mellan kromosomer. (Under meiosen) Plats för korsning.
Vad blir resultatet om korsning sker mellan två kopplade loci?
Rekombinanta gameter.
Hur blir fördelningen mellan parentala och rekombinanta gameter om där är koppling mellan två gener placerade på X-kromosomen?
Ca 99% parentala och 1% rekombinanta
Vad är nollhypotesen i ett x^2-test?
Observerade värden överensstämmer med förväntade värden. “Oberoende nedärvning”. Om hypotesen kan avvisas har man påvisat att koppling förekommer.
T.ex. förväntas 25% av var gamet från dubbla heterozygoter.
Vad är formeln för x^2-test?
x^2 = (obs - förv.)^2 / förv.
Vilket värde ger det fysiska avståndet mellan två loci, och i vilken enhet mäts avståndet?
Rekombinationsfrekvensen. 1% rekombination = 1 RF = 1 map unit (m.u.) = 1 centiMorgan (cM)
På vilka två sätt kan man kartlägga geners placering med hjälp av deras rekombinationsavstånd?
Utgå från en gen och mäta dess avstånd till övriga, t.ex. a-b, a-c, a-d.
Eller mäta från var gen till nästa, t.ex. a-b, b-c, c-d
där mätning från var gen till nästa sannolikt ger närmast korrekt värde då man inte riskerar att gå miste om eventuella dubbelkorsningar i beräkningen.
Vilka korsningsmöjligheter finns i en trihybridkorsning?
Enkel rekombination:
Mellan lokus 1 och 2 / mellan lokus 2 och 3
Dubbel rekombination:
Både mellan lokus 1 och 2 och lokus 2 och 3.
Lägst sannolikhet.
Vad innebär kromosomal interferens?
Korsning kräver att kromosomer böjs och ett rekombinationskomplex av proteiner rekryteras. Därför innebär rekombination i en region hämmad korsning i närliggande regioner.
Vad anger interferens?
Om antalet dubbelkorsningar avviker från det förväntade.
I < 0 = fler, I > 0 = färre
Vad är formeln för interferens?
I = 1 - (obs. % dubbelkorsningar / förv. % dubbelkorsningar)
Vilken information anger en kopplingskarta?
Placering av flera kopplade gener på en kromosom.
Vad kallas flera kopplade gener/loci (oberoende av placering på kromosomen?
Kopplingsgrupp