Intra 3 - Biosynthèse des acides aminés Flashcards
Quels sont les rôles des acides aminées (3)?
Éléments de construction pour les protéines qui se renouvellent sans cesse
Éléments de construction pour d’autres molécules contenant de l’azote
Source énergétique
Quels sont les 3 grands processus du catabolisme des acides aminés?
La désamination
Le cycle de l’urée
Le catabolisme du squelette carboné en intermédiaires du métabolisme central
Quel processus utilisent l’énergie produite par la formation d’intermédiaires métaboliques (2) ?
La gluconéogénèse et la formation d’acétyl-CoA
Vrai ou Faux? Les acides aminés sont uniquement glucoformateurs ou cétogènes.
Faux, les acides aminés sont cétogènes, bivalents ou glucoformateurs.
Quels acides aminés forment le pyruvate?
Alanine, Cystéine, Glycine, Sérine, Thréonine, Tryptophane
Comment les corps cétoniques contribuent au cerveau?
Jusqu’à 60% de l’apport énergétique
Expliquer la dégradation de l’alanine en pyruvate?
Simple transmination
Enzyme: Alanine aminotransférase
Expliquer la dégradation de la sérine en pyruvate?
Simple déamination avec la pyridoxine comme cofacteur
Enzyme: Sérine déshydratase
Expliquer la dégradation de la cystéine en pyruvate?
Voie plus complexe libérant du souffre
Puis azote libéré par déamination
Expliquer la dégradation de la glycine en pyruvate?
Deux voies de dégradation:
Transformé en sérine
Dégradé en CO2, avec transfert d’un CH3 au THF
Expliquer la dégradation de la thréonine en pyruvate?
Acide aminé bivalent
Dégradé en glycine et acétyl-CoA
Quel est le cofacteur de la sérine déshydratase?
Le pyridoxal phosphate (PLP), un dérivé de la pyridoxine
Comment fonctionne le pyridoxal phosphate?
Le PLP est un puit d’électron qui sert de receveur et de donneur de groupe aminé.
Il est temporairement transformé en pyridoxamine phosphate (PMP).
Quelle est la base de Schiff?
Un groupe fonctionnel imine (C=N), auquel l’azote est lié a un groupement aryl ou alkyl.
Quelle rupture est facilitée par la base de Schiff?
La rupture de différentes liaisons au C alpha, dans différentes enzymes
Vrai ou Faux? La liason à rompre par la base de Schiff se trouve dans le plan parralèle à celui du cycle PLP.
Faux, c’est le plan perpendiculaire
Décrivez le mécanisme de la sérine déshydratase (4)?
- Formation de la base de Schiff sérine-PLP
- Départ de l’atome H du carbone alpha de la sérine (H recouvre les orbitales pi du PLP)
- Élimination du groupement OH du carbone beta
- Hydrolyse de la base de Schiff pour regénérer le PLP-enzyme
Combien de réactions sont nécessaires pour dégrader la phénylalanine et la tyrosine?
6 réactions enzymatiques
Enzyme: phénylalanine hydroxylase, ayant comme cofacteur la bioptérine
Dans combien de réactions sont impliquée la bioptérine?
6 réactions d’oxydation enzymatiques
Vrai ou Faux? La bioptérine est une vitamine.
Faux, on peut la synthétiser
Quels sont les intermédiaires du métabolisme de la sérine et de la méthionine (2)?
Tétrahydrofolate
S-adénosylméthionine
Comment est produit la S-adénosylméthionine?
Uniquement par la dégradation de la méthionine
Quel produit est recyclé pour regénérer la méthionine?
L’homocystéine
Comment est utilisé le Tétrahydrofolate?
Source de carbone
Combien d’acides aminés sont considérées comme essentiels?
10, la moitié
Comment sont synthétisés les acides aminés essentiels?
Par les plantes et les microorganismes, et sont présents dans les protéines végétales et animales
Comment sont synthétisés les acides aminés non essentiels?
Par notre organisme
Quelles sont les acides aminés essentiels?
Arginine
Histidine
Isoleucine
Leucine
Lysine
Méthionine
Phénylalanine
Thréonine
Tryptophane
Valine
Quels sont les intermédiaires métaboliques permettant la synthèse des acides aminés non essentiels (4)?
Oxaloacétate
a-cétoglutarate
Pyruvate
3-Phosphoglycérate
Quelle est la sources d’azote permettant la synthèse des acides aminés non essentiels (2)?
De l’échange du groupement azoté d’un autre acide aminé (transamination)
De l’ajout de l’azote venant de l’ammoniac
Quels acides aminés sont synthétisés par des réactions d’amination à une seule étape (transamination ou amidation) (5)?
Alanine, Asparagine, Aspartate, Glutamate, Glutamine
Expliquer la synthèse de l’alanine?
Simple transamination
Enzyme: Alanine aminotransférase
Expliquer la synthèse de l’aspartate?
Simple transamination
Enzyme: Aspartate aminotransférase
Expliquer la synthèse du glutamate?
Plein d’aminotransférase
Enzymes: Alanine aminotransférase et Aspartate aminotransférase
Expliquer la synthèse de l’asparagine?
Transfert d’azote via un mécanisme différent
Enzyme: Asparagine synthétase (avec ATP)
Expliquer la synthèse de la glutamine?
Transfert direct d’un groupement ammoniac libre
Point de contrôle dans le métabolisme de l’ammoniac
Enzyme: Glutamine synthétase (avec ATP)
Quelles enzymes sont impliquées dans la synthèse de la sérine?
- 3-phospohoglycérate déshydrogénase
- Phosphosérine aminotransférase
- Phosphosérine phosphatase
Quel est le substrat de la synthèse de la sérine?
3-phospohoglycérate
Intermédiaire de la voie de dégradation du glucose