HC.6; Hoe werken kernreceptoren Flashcards
Kernreceptoren
Eiwitten die zich in de kern bevinden
Transcriptie factoren
Ligand afhankelijk
Ligand binding leidt tot conformatie verandering
Verschil tussen kernreceptor en transcriptie factor
Transcriptie factor: transcriptie activatie via cascade second messengers
Kernreceptor: ligand-afhankelijke transcriptie factor
Familie van kernreceptoren
Endocriene nucleaire receptoren
- Homo-dimeer
- RXR partner
Orphan nucleaire receptoren
- Dimeer
- Monomeer
Functionele domeinen kernreceptoren
A/B: AF1
- Ligand-onafhankelijke transactivatie
- Transactivatie functie 1
C: DBD
- DNA binding
- Dimerizatie
D: hinge
- Hinge regio
- Coregulator binding
E: LBD, AF2
- Ligand binding
- Coregulator binding
- Transactivatie functie 2
- Dimerizatie
- Kernlokalisatie
Eigenschappen van het ligand binding domeine
Hormoon-specifiek en hoge affiniteit
Structuur: dynamisch, conformatieveranderingen
Binding pocket bestaat uit specifieke aminozuren
Kooi van 12 helices, muizenvat, ca. 250 aminzuren
Eigenschappen van het DNA bindend domein
Receptor specifiek en hoge affiniteit voor DNA
Structuur dynamisch, conformatieverandering
DNA herkenning door 3 aminozuren
3D structuur: 3 a-helices met twee Zn clusters
Ca. 70 aminozuren, veel Arg en Lys
Dimerisatie motief
Eigenschappen hormoon respons elementen
Korte sequentie in/nabij promoter regio of enhancher regio van gen
Meestal 2 korte herhaalde DNA sequenties, gescheiden door variabele sequnetie van 3bp
Criteria waaraan co-activatoren voldoen
Interactie met de ligand-gebonden receptor
Versterken van de activatorfunctie van de receptor
Intrinsiek vermogen om transcriptie te activeren
Dissociatie van receptor na dissociatie van het hormoon
Criteria waaraan co-repressors voldoen
Interactie met de onbezette receptor
Versterken van de repressor functie van de receptor
Intrinsiek vermogen om transcriptie te onderdrukken
Dissociatie van de receptor na binding hormoon
Verschillen cortisol en T3
Cortisol
- Glucocorticoid receptor
- Diffusie
- Receptor translocatie naar kern na binding van ligand
- Receptor vormt meestal homo-dimeer
T3
- T3 receptor
- Membraan transporter
- Receptor dimeer op DNA
- Receptor vormt meestal hetero-dimeer