Genetische Schalter Flashcards
16. und 17. Vorlesung
Woraus besteht ein Gen?
Aus basalem Promotorbereich mit Regulatorelementen und einem codierenden Bereich.
Wodurch wird die Transkription initiiert?
- TATA-Box mit TATA-Box-Faktoren gebunden
- Bindung weiterer zahlreicher TFII-Proteine
- Bindung der DNA-Polymerase II
- Phosphorylierung der DNA-Polymerase II
Wie ist das Helix-turn-Helix-Motiv aufgebaut?
- alpha-Helix + geradlinige Bindung + entgegengesetzte alpha-Helix
- Helices stehen in spezifischem Winkel
- Helix passt exakt in die große Furche der DNA
- bestm. AS können über H-Brücken mit Purin interagieren
Wie sind Homodomänen aufgebaut?
(Spezielle Klasse des Helix-turn-Helix-Motivs)
- 3 Helices: 1 zur Bindung und 2 zur Stabilisierung
- Spezifität durch Zielsequenz
Wie ist das Zink-Finger-Motiv aufgebaut?
(lys-cys-his-his)
- Erkennung von nur 3 bp -> Spezifität durch viele aufeinanderfolgende
- ca. 6 AS sind bindungsrelevant
Wie können Leucin-Zipper inhibiert werden?
Wenn sie mit nicht-funktionalen Molekülen heterodimerisieren.
Wie kann das Helix-Loop-Helix-Motiv reguliert werden?
Inhibitorische Regulation durch verkürzte HLH-Proteine.
Wodurch wird die Aktivität von Genregulatorproteinen gesteuert?
- Synthese von aktiven Transkriptionsfaktoren
- Bindung von Liganden an TF
- Aktivierung durch Protein-Phosphorylierung
- Regulation über den Dpp-Aktivitäts-Gradienten
- Regulation durch Inhibitoren
- Aktivierung durch eine DNA-bindende Untereinheit
- juxtarine Signaltransduktion
Was versteht man unter transkriptionellen Synergie?
Durch die Kooperation zw. Transkriptionsfaktoren steigt die Transkription bei mehr TF exponentiell.
Was für Repressionsmechanismen (bei Translation und Transkription) gibt es?
- überlappende DNA-Sequenz-Bindungsstellen
- Repressor verdeckt aktivierende Stelle
- Repressor verhindert Transkription durch Kontakt mit generellem Transkriptionsfaktor
Wie können Histone geöffnet werden?
- Histon-Acetylierung (Änderung der chem. Eigenschaften)
- Komplexe setzten sich auf die verpackte Chromatin-Struktur und schieben sie auseinander
Was für Schutz-Mechanismen gibt es?
- Locus-Kontroll-Regionen
- Isolator-Sequenzen