Génétique - Chapitre 3 Flashcards
Combien existe-t-il de type de chromatine?
2:
- hétérochromatine
- euchromatine
Qu’est-ce que l’euchromatine?
- chromatine contenant les gènes
- forme les bandes G et R
- euchromatine inactive est plus condensée que l’euchromatine active
Que sont les bandes R?
euchromatine active contenant les gènes actifs de la cellule
Que sont les bandes G?
euchromatine inactive contenant:
- les gènes inactifs de la cellule
- les gènes actifs à certains moment du développement, dans certains tissus ou à certains moments du cycle cellulaire
Qu’est-ce que l’hétérochromatine?
- chromatine contenant de l’ADN non codant, éventuellement quelques gènes
- forme les bandes C
Quel est l’état de la chromatine au niveau du centromère?
très condensé = bande C
Est-ce que l’ADN est condensé uniformément le long du chromosome?
non, les chromosomes sont organisés en domaines actifs et inactifs au moment de la réplication et la transcription
Dans quel ordre les bandes C, R et G sont-elles répliquées?
- bandes R: séquences ADN répliquées très précocement lors de la phase S, structure peu condensée
- Bandes G: répliquées plus tardivement
- Bandes C: répliquées le plus tardivement, chromatine extrêmement condensée, inactivation transcriptionnelle
Quand sont répliquées les zones d’hétérochromatines?
en dernier, lors de la phase S
Est-il possible de passer de hétérochromatine à euchromatine?
oui, on appelle cela l’hétérochromatine facultative.
elle est différente de celle qui reste constamment dense, soit l’hétérochromatine constitutive, toujours présente au niveau des centromères
Y a-t-il des zones riches en G et C dans l’hétérochromatine constitutive?
oui, au niveau des centromères
Comment sont les boucles à l’échafaudage dans les bandes G vs R?
attachées de façon plus compacte en G, et relâchées en R
Quelle coloration permet de révéler une différence de composition en protéines chromatiniennes? À quoi cela pourrait-il correspondre?
- coloration Giemsa
- pourrait correspondre à des variations à grande échelle de la composition en paires de bases (bandes G environ 3,2% plus riches en A:T que les bandes R)
Quelle est la structure des chromosomes métaphasiques?
- 2 chromatides, chacune représentant une des 2 molécules d’ADN identiques issues de la réplication en S
- chromatides sont associées au niveau du centromère
- la position du centromère définit les bras longs (q) et courts (p)
- les extrémités distales = télomères
Comment sont classés les chromosomes?
selon la taille des bras longs et courts
Quels sont les 3 types de chromosomes selon la taille de leurs bras?
- métacentriques: 2 bras de la même longueur
- submétacentriques: bras courts franchement plus courts que les longs
- acrocentrique: bras courts peu ou pas visibles
Quelle est la particularité des chromosomes se classant dans le groupe acrocentrique?
ils hébergent les mêmes gènes sur leurs bras courts, qui ont tous une structure identique
ce sont les gènes responsables de la synthèse des ARN ribosomiques, présents en plusieurs centaines d’exemplaires dans la cellule
Que sont les télomères?
- structure nucléoprotéiques localisées à l’extrémité des chromosomes
- ne contiennent pas d’information génétique
- courtes séquences d’ADN répétées riche en G (TTAGGG répétée 150-2000x)
Quels sont les rôles des télomères?
- préserver l’intégrité des chromosomes
- protéger de la dégradation par des nucléases
- empêcher les recombinaisons aberrantes
Que sont les régions subtélomériques?
régions juste avant les télomères, riches en gènes
Quel est le système de nomenclature des chromosomes?
p+q = 1
aussi
(#chromosome)(p ou q)(localisation internationale)
ex: 17p13.1
En combien de groupes sont classés les chromosomes en fonction de leur taille et de la position du centromère? Quel indice permet le classement?
7 groupes, selon l’indice centromérique (un rapport entre la taille des bras)
Comment se nomme la classification des chromosomes?
caryotype
De quoi est composé le caryotype humain?
46 chromosomes, dont 44 autosomes et 2 gonosomes. C’est un caryotype euploïde
Peut-on classer les caryotypes selon les patrons de bande?
oui
Sous quelle forme doivent se trouver les chromosomes pour les analyser?
ils doivent être en cours de division, donc en métaphase
Quels sont les 3 types de cellules en cours de division?
- divisions spontanées et fréquentes (ex: c. hématopoïétiques, germinales, embryonnaires, tumorales)
- divisions spontanées mais lentes (c. TC, embryonnaires, tumorales)
- ne se divisent pas (lymphocytes circulants)
Quand sont obtenus les chromosomes des 3 possibilités de divisions pour analyse?
- division spontanées fréquentes: tout de suite après cultures in vitro de 24-72h
- divisions spontanées lentes: après cultures in vitro de quelques jours à 2-3 semaines
- ne se divise pas: on ajoute des agents stimulants, puis culture de 48-72h
Quelles sont les étapes d’obtention des chromosomes pour analyse?
- Culture cellulaire dans un milieu nutritif, avec ajout de colcémide (bloque les c. en métaphase 1)
- centrifugation du culot cellulaire
- solution hypotonique pour faire éclater les cellules
- centrifugation
- fixatif
- centrifugation
- prélèvement et dépôt sur une lame
- chauffage
- trempage de la lame dans une cuve de coloration
- pose d’une lamelle sur la lame
- observation au microscope et photographie/découpage
Que permettent de révéler les méthodes de marquage des chromosomes?
alternance de bandes transversales faiblement ou fortement colorées dont la séquence est spécifique à chaque paire de X
Quels sont les marquages chromosomiques les plus fréquents?
- marquage en bandes G: GTG, obtenues par traitement à la trypsine et coloration de Giemsa
- marquage en bandes R: RGH, obtenues par traitement à la chaleur et coloration Giemsa
- marquage en bande C: CBG, obtenues par traitement au sulfate de Baryum et coloration Giemsa
Que permet d’observer seule la coloration Giemsa? Quel aspect a le chromosome en présence d’une telle coloration?
- permet de rechercher des cassures chromosomiques
- aspect rose violacé à peu près homogène sur toute leur longueur
- on ne peut pas distinguer les X que par taille et forme, insuffisant pour détecter anomalies
Quel est l’aspect des X lors d’un marquage GTG?
- alternance de bandes claires et sombres
- les bandes sombres sont les bandes G
Ou sont plus fréquemment utilisés les marquages GTG vs RHG? Si on place ces deux marquages côte à côte, qu’observe-t-on?
- GTG = Amérique, RHG = Europe
- les chromosomes GTG sont plus foncés que les RHG
Que permet de mettre en évidence le marquage CBG?
hétérochromatine constitutive, soit les régions non codantes du génome (régions centromériques)
Que mettent en évidence les bandes C?
- régions juxtacentromériques
- constrictions secondaires
- bras courts des X acrocentriques
- extrémité distale du q de Y
Pour quoi sont utiles les marquages en bande C?
étude des:
- X dicentriques
- Y courts
- asymétries des p des X acrocentriques
Quelles sont les étapes pour établir un caryotype de patient?
- comptage des X
- découpage des X par ordi
- classement des X selon taille (+ grand au + petit), forme (position centromère) et bandes
- appariement des X homologues
Quel impact a la résolution caryotypique?
une haute résolution permet d’avoir une meilleure précision sur la caractérisation d’une anomalie chromosomique
- caryotype standard = 300-550 bandes par X
- haute résolution augmente le nb de bandes en bloquant les X au debut de leur condensation. On peut avoir 800-1000 bandes par X
= permet mise en évidence d’anomalies de taille beaucoup plus réduite
Combien de cellules sont analysées au microscope photonique lors de l’analyse caryotypique?
10 cellules, voir 30-100 si doute
Que doit-on faire pour chaque cellule analysée lors de l’analyse caryotypique?
compter les X pour identifier les anomalies de nombre, et analyser la forme pour identifier les anomalies de structure
Combien de caryotypes complets sont effectuées lors de l’analyse caryotypique?
2-3, voir 5 si doute
Comment fonctionne la nomenclature internationale pour définir la constitution chromosomique d’un sujet?
nombre de X par cellule, liste des X sexuels ±, liste des anomalies trouvées
ex: 46, XY (normal) ou 47, XY, +21 (trisomie 21 chez un garçon)
Comment exprimer un caryotype comprenant une translocation?
46, XX, t(1;18)
on ajoute le t, et on mentionne la translocation se produit entre quels X
Quelles sont les principales abréviations utilisées dans la nomenclature du caryotype anormal?
del (délétion)
dmin (double minute)
dup (duplication)
ins (insertion)
inv (inversion)
t (translocation)
Que permet d’étudier la cytogénétique moléculaire?
le génome humain d’une façon plus fine que le caryotype standard
Quelles sont les 2 principales technique en cytogénétique moléculaire?
- Hybridation in situ en fluorescence (FISH)
- hybridation génomique comparative sur micropuce
Quel est le colorant le plus fréquemment utilisé? En quoi consiste-t-il?
Giemsa, une association de 3 colorants de base qui donne une coloration rose violacée à la chromatine à la lumière visible
Quels sont les principaux colorants fluorescents? quelle est leur couleur respective?
- moutarde de quinacrine : jaune-vert
- DAPI: bleu
- iodure de Propidium: orange/rouge
Que permettent de visualiser les colorants fluorescents?
visualiser spécifiquement l’ADN car ils s’intercalent entre les bases de la double hélice
Quels colorants sont surtout utilisés en cytogénétique moléculaire?
les colorants fluorescents, lors de l’hybridation in situ de sondes d’ADN sur une préparation chromosomique
Sur quels principes se base l’hybridation?
- la structure en double hélice de l’ADN, dont chacun des brins est composé d’un polymère de désoxyribose phosphate lié à une base, liée par une liaison hydrogène à une base complémentaire
- dénaturation et renaturation en alternance
Qu’est-ce que la dénaturation lors du processus d’hybridation?
processus dans lequel les liaisons hydrogènes sont rompues entre les bases des 2 brins complémentaires de l’ADN, ce qui rend l’ADN simple brin
Qu’est-ce que la renaturation lors du processus d’hybridation?
processus dans lequel des segments d’ADN simple brin complémentaires vont s’apparier. il y a aussi formation de liaisons hydrogènes entre les bases complémentaires
Qu’est-ce que le FISH?
appariement d’une séquence marquée connue d’acides nucléiques (la sonde) à une ou plusieurs séquences complémentaires sur une préparation chromosomique ou des cellules fixées
Que peut-on utiliser comme sonde dans le FISH?
une petite séquence d’ADN simple brin, ou de l’ARN, dont l’emplacement normal est connu dans le génome, et qui est marquée chimiquement de façon à pouvoir être repérée par la suite
Avec quoi est mise en contact la sonde du FISH? Que fait ensuite la sonde?
avec les X d’une mitose, ou des noyaux interphasiques
elle va ensuite s’hybrider/se fixer spécifiquement au niveau de sa séquence complémentaire
Quelles sont les étapes de FISH?
- dénaturation de la sonde et de l’ADN génomique à étudier
- hybridation des ADN simple brin et renaturation
- visualisation au microscope à fluorescence
Quelle est la résolution de FISH?
100kb, ce qui permet une détection d’anomalies chromosomiques inframicroscopiques
Quels sont les 4 types de sondes d’ADN simple brin?
- sondes de peinture chromosomique
- Sondes télomériques
- sondes centromériques
- sondes à séquence unique
Que font les sondes de peinture chromosomiques?
- des sondes qui couvrent une paire spécifique de chromosome
- constitué d’un ensemble de sondes de petite taille qui couvre l’ensemble du chromosome
- séquence d’ADN spécifique de chaque chromosome
- pour interpréter certaines translocations complexes, des échanges de petite taille, identifier l’origine d’un fragment non identifié…
Que sont les sondes télomériques?
- sondes de séquences répétées TTAGGG, pour prouver l’intégrité des bras chromosomiques
- utile pour dénombrer les chromosomes, en métaphase et interphase
Que sont les sondes centromériques?
- séquences répétitives, pour trouver des anomalies de structure
- hybridation au niveau des centromères
- utile pour dénombrer les chromosomes en métaphase et interphase
Que détectent les sondes à séquence unique?
- diagnostics de syndromes de microdélétions, microduplications…
- sonde de petite taille permettant d’identifier une région très précise du génome
Les sondes FISH peuvent-elles être utilisées avec d’autres?
oui, elles peuvent être combinées pour obtenir un marquage multi couleur
Quelles sont les 3 principales application FISH?
- cartographie génique
- diagnostic cytogénétique
- études des mécanismes de transformation maligne
En quoi FISH peut être utilisé pour la cartographie génique?
- permet une image directe de la localisation d’un gène sur un X
- pas nécessaire de connaître sa fonction ou qu’il soit exprimé
En quoi FISH permet un diagnostic cytogénétique?
détection d’anomalies:
- suspectées par le caryotype standard
- de très petite taille
- dans les noyaux en interphase
(microdélétions, remaniement complexe…)
l’hybridation in situ en interphase s’avère indispensable pour la détection d’anomalies de nombre ou de structure dans les cas ou: l’index mitotique est peu élevé, ou un résultat rapide est nécessaire
avantage: tout type de sondes utilisables, pas besoin de mitoses, beaucoup de cellules peuvent être analysées rapidement
Quel gène peut-on localiser grâce à la cartographie génique en FISH?
gène ATM, impliqué dans le contrôle du cycle cellulaire
Que peut-on diagnostiquer avec un FISH interphase?
des aneuploïdie fréquentes, avec des trousses qui ciblent les chromosomes X, Y , 13, 18 et 21
Concernant le cancer, qu’a permit de mettre en évidence FISH?
la translocation 9;22 impliquant la fusion des gènes BCR et ABL
- important facteur diagnostique et pronostique dans les leucémies myéloïdes chroniques et aigues lymphoblastiques
- parfois non visible au caryotype FISH sur noyaux interphasiques pour le diagnostic de la fusion des gènes BCR et ABL (sans translocation: 2 signaux séparés, avec: signaux fusionnés)
Qu’Est-ce que la technique CGH?
- méthode de cytogénétique moléculaire pour l’analyse fine des pertes et gains de matériel chromosomique
- souvent utilisée en cancérologie
Que compare la technique CGH?
- ADN d’un patient avec un ADN contrôle
- cette comparaison s’effectue grâce à l’hybridation de ces ADN marqués en fluorescence sur un support d’ADN
Est-ce que la technique CGH utilise les mêmes principes d’hybridation que FISH?
oui
Sur quoi place-t-on les fragments d’ADN génomique que l’on veut étudier avec la technique CGH?
une micropuce
De quelle couleur est un chromosome sur une lame cytogénétique lors de la technique CGH?
- vert s’il y a un gain de matériel génétique dans le génome
- rouge s’il y a perte de matériel génétique dans le génome
- orange si la quantité de matériel génétique est balancé
Quel est le principe de la technique CGH?
- hybridation sur des séquences d’ADN fractionnées (sondes) qui représentent tout le génome
- surplus de séquences vs ADN de référence: duplication de la séquence pour le patient
- pertes de séquences vs ADN de référence: délétion pour le patient
Quelles sont les étapes de la technique CGH?
- prélèvement
- extraction de l’ADN des patients
- marquage de l’ADN du patient et de son contrôle et mélange en proportions égales
- micropuce
- hybridation 48h sur la micropuce
- lavage
- scan
- traitement de l’image
Quels sont les types de micropuces utilisées dans la technique CGH?
- BACs: sondes de la taille d’une sonde FISH, résolution de l’analyse moins grande
- oligonucléotides: meilleure résolution vs BACs. Ce sont des fragments d’ADN d’environ 60pb, avec ou sans marqueurs SNPs. résultat plus fiable et technique plus rapide
Que sont les marqueurs SNP?
- single nucléotide polymorphism
- polymorphisme le plus commun du génome humain
- segment d’ADN ou les 2 chromosomes ne diffèrent que par 1 nucléotide ou une paire de base
- permet la détection des disomies uniparentales
Quels sont les avantages des puces de la technique CGH?
- permet de raffiner l’analyse chromosomique à une résolution de quelques dizaines de kb, donc diagnostic chez un plus grand nombre de sujets
- meilleure sensibilité pour la détection des duplications
- allie précision du FISH et approche d’évaluation globale du génome du caryotype (pas besoin de savoir ou cibler dans le génome)
- pas besoin de cellules en division
Chez qui l’utilisation de la technique CGH sans caryotype est-elle recommandée?
- retard intellectuel
- désordres du spectre de l’autisme
- malformations congénitales
Quel est le lien entre microdélétion et autisme?
pourrait être causé par une délétion d’environ 600kb
- surtout de novo
- quelques parents transmetteurs
Quels sont les 2 grands types d’anomalies chromosomiques?
- anomalie du nombre
- anomalie de structure
Comment peut-on classer les anomalies chromosomiques lorsque l’on considère les cellules? À quel moment du développement se trouve le problème?
- homogène: présente dans toutes les cellules d’un individu.
- mosaïque: présente dans une sous-population cellulaire.
Qu’Est-ce que l’aneuploïdie?
perte ou addition d’un ou plusieurs chromosomes d’une même paire d’homologues
- monosomie: perte d’un X entier
- trisomie: addition d’un chromosome
- tétrasomie, pentasomie…
De quoi résultent généralement les aneuploïdies?
d’une erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire: non disjonction ou malségrégation des chromosomes
Quand se produit la non disjonction dans une aneuploïdie homogène vs mosaïque?
- homogène: au cours de la méiose d’un des parents
- mosaïque: au cours du développement du zygote
Qu’Est-ce que la polyploïdie?
addition d’un ou plusieurs compléments haploïdes (n)
- triploïdie= 69 X
- tétraploïdie = 92X
Quels gamètes sont produits lors d’une non-disjonction dans la deuxième division méiotique?
1 gamète ayant 2 chromosomes
2 gamète ayant 1 chromosome
1 gamète vide
Quels gamètes sont produits lors de la non-disjonction dans la première division méiotique?
2 gamètes ayant 2 chromosomes
2 gamètes vide
Les monosomies sont-elles viables?
les monosomies des autosomes ne sont pas viables, et provoque des fusses-couches au 1er trimestre
Donner un exemple de monosomie
Syndrome de Turner: X
Qu’est-ce que le syndrome du triple X?
- XXX
- Dx difficile sans caryotype
- taille légèrement supérieure à la normale
- QI légèrement abaissé
- pas d’anomalies morpho évidentes
- chromatine buccale double (2 corpuscules de Barr)
- léger hypogonadisme (diminution fréquence menstru)
- peuvent avoir des enfants
Qu’est-ce que le syndrome de Klinefelter?
XXY
Quel est le syndrome de Jacobs?
- XYY
- phénotype masculin souvent normal
- très grande taille
- peuvent présenter atrophie des testicules et stérilité
- calvitie précoce
- peut être associé à un facteur d’agressivité
Qu’est-ce que le syndrome de Patau?
- trisomie 13
- anomalies SN/visage/reins/coeur/abdominales
- plus de 95% des foetus atteints décèdent in utero
- 50% des enfants aboutissant à terme décède 3 mois après la naissance
- 90% décède avant 1 an de complication
Qu’est-ce que le syndrome d’Edwards?
- trisomie 18
- anomalies coeur/squelette/muscle
- déformation de la main
- profond retard mental
- 95%+ mort in utero
- 90% des enfants décèdent avant 1 an de complication
- Quelques cas décrits jusqu’à 5 ans
Quel signe de la trisomie 18 est observable à l’échographie?
poings fermés
Qu’Est-ce que le syndrome de Down?
- trisomie 21
- DI variable
- hypotonie musculaire
- malformation cardiaque et digestive
- vieillissement précoce et alzheimer
Comment évolue le risque de trisomie 21 en fonction de l’âge maternel?
il augmente avec l’âge, passant de 1 à 38 ans, et à 3,5 à 44 ans
Quels sont les symptômes d’une tétrasomie XXXX?
- retard de langage, trouble d’apprentissage
- grande taille
- dysmorphie faciale
- anomalies dentaires, hypotonie avec laxité articulaire
- léger hypogonadisme (irrégularité menstruelle)
- peuvent avoir des enfants
Est-ce que les polyploïdies sont viables?
seulement chez les chromosomes sexuels
Quelle est la principale cause des polyploïdies?
accidents au cours de la fécondation
Les polyploïdies de type 69, XXX ou encore 69, XYY sont-elles viables?
rare à la naissance, mais fréquentes dans les avortements spontanés
Quels sont les 2 mécanismes pouvant mener à la triploïdie?
- digynie
- diandrie
Qu’Est-ce que la digynie?
- fécondation d’un ovule diploïde et d’un spz
- type 1: non disjonction en méiose 1
- type 2: non disjonction en méiose 2
Qu’est-ce que la diandrie?
comprend 2 mécanismes différents:
- dispermie: fécondation d’un ovule normal avec 2 spermatozoïde normaux
- diplospermie: fécondation d’un ovule normal avec un spz diploïde (type 1 ou 2 selon la non-disjonction en méiose 1 ou 2)
Quelle est l’aberration chromosomique la plus fréquente dans les avortements spontanés?
- triploïdie
- important retard de croissance
- mortalité foetale précoce
- parfois nouveau-né vivant mais malformations sévères
Quelle est la cause la plus fréquente de la triploïdie?
dispermie
À quoi sont presque toujours dues les anomalies de structure?
à des cassures chromosomiques
Peut-il y avoir plusieurs site de cassure transversale sur un chromosome?
oui
Est-ce possible que plusieurs chromosomes subissent des cassures en même temps?
oui, homologues ou non
Les points de cassures des chromosomes ont-ils tendance à se recoller?
oui
les fragments chromosomiques non recollés persistent dans les cellules filles au cours des divisions cellulaires seulement s’il contient un centromère: c’est une délétion terminale
Qu’est-ce qu’un fragment acentrique?
un fragment qui ne contient pas de centromère et qui ne se recolle pas. il sera perdu au cours des divisions cellulaires
Que peut faire un fragment après une cassure?
- se perdre
- se recoller exactement comme il était avant (on ne verra plus la cassure)
- se recoller différemment (au même endroit ou ailleurs)
Que sont les anomalies équilibrées?
n’entraînent pas de déséquilibre du matériel chromosomique et n’ont habituellement pas d’effet phénotypique
Quels gamètes peuvent résulter des anomalies équilibrées?
gamètes déséquilibrés donnant des zygotes anormaux, ce qui se traduira par la survenue d’avortements ou par la naissance d’enfants porteurs d’anomalies congénitales
De quoi résultent les anomalies non équilibrées?
peuvent survenir de novo (délétions, translocations non équilibrées de novo) ou la conséquence d’un remaniement parental équilibré
Qu’est-ce qu’une délétion terminale?
anomalie portant sur 1 chromosome avec 1 seule cassure, avec perte du segment acrocentrique entrainant une monosomie partielle
Comment restituer la stabilité d’un chromosome après une délétion terminale?
il faut un mécanisme de restitution d’un télomère
Quels sont les symptômes d’une délétion terminale du chromosome 18? Comment peut s’appeler ce syndrome?
- retard dév/mental
- oreilles larges et décollées
- bouche large
- anomalies dentaire
= syndrome du cri du chat
Qu’est-ce qu’un isochromosome?
- chromosome anormal formé des 2 bras longs ou des 2 bras courts d’un même chromosome avec perte de l’autre bras
= 1 chromosome avec 1 cassure
Que peut engendrer un isochromosome?
2 chromosomes anormaux, toujours métacentriques et différents:
1 constitué des 2 chromatides du bras court
1 constitué des 2 chromatides du bras long
Est-ce qu’un isochromosome peut remplacer un chromosome normal?
oui, ou encore coexister avec les 2 chromosomes normaux de la même paire réalisant alors une tétrasomie pour le bras dupliqué
En quelle quantité sont présent les gènes des bras courts et longs d’un isochromosome?
double exemplaire du bras qui reste et des gènes portées par ce bras, perte des gènes par le bras manquant
Qu’est-ce qu’une délétion intercalaire ou interstitielle?
- 2 cassures sur un chromosome, ne touchant pas le centromère
- après les cassures, il y a perte du segment entre les 2 cassures et recollement des 2 portions
- la cassure affecte le même bras
- on perd le segment
Par quel type d’anomalie chromosomique est caractérisé le syndrome de Prader-Willi?
délétion intercalaire
Qu’est-ce que l’inversion? Quels sont les 2 types?
- 1 chromosome, 2 cassures
- inversion paracentrique: ne touche pas le centromère (affecte le même bras)
- inversion péricentrique: touche le centromère (affecte les 2 bras)
- pas de perte de segment
Les inversions sont-elles des anomalies équilibrées?
oui, elles sont sans conséquence phénotypique pour le porteur, mais risque de produire des gamètes anormaux au cours de la méiose
Quelle sont les conséquences des inversions sur les recombinaisons?
une recombinaison dans le segment inversé entraîne la formation de gamète anormaux par duplication/déficience
Que sont les microdélétions?
- catégories particulières de délétions de toute petite taille dont la caractéristique principale est de ne pas être visible sur le caryotype standard
- ne sont dépistées qu’avec une technique de haute résolution ou FISH
Quels sont les 2 mécanismes d’apparition des microdélétions?
- à l’occasion d’un remaniement chromosomique: au cours du processus de cassure, réapparition des X, il peut y avoir perte d’un petit fragment responsable de l’apparition de signes cliniques malgré l’aspect équilibré du caryotype
- microdélétion isolée: certaines régions riches en séquences répétées sont des localisations préférentielles de survenue de ce type d’anomalie par un mécanisme de recombinaison inégale entre les 2 X homologues
Par quoi sont causés les syndromes de Prader-Willi et Angelman?
micro délétion du chromosome 15
Qu’est-ce que la duplication?
- 1 chromosome avec 2 cassures
- double exemplaire d’une région chromosomique
- anomalie toujours déséquilibrée
Qu’Est-ce qu’une duplication directe? Et inversée?
directe: si fragment dupliqué conserve la même orientation que le fragment d’origine
inversée: si le fragment dupliqué a une orientation inverse
Qu’est-ce qu’un chromosome en anneau?
- 1 chromosome, 2 cassures
- cassure à chaque extrémité d’un chromosome suivie par un recollement avec perte des segments distaux
- assimilables à une double délétion terminale, mais les échanges mitotiques entre chromatides soeurs engendrent des dérivés complexes avec duplication/déficiences, ce qui complique l’interprétation du phénotype
Qu’est-ce que la translocation?
- 2 cassures qui se produisent sur 2 chromosomes (1 par X)
- échange de matériel chromosomique
- recollage des segments
Quels sont les 2 types de translocation?
- translocation réciproque
- translocation Robertsonienne
les translocations peuvent être équilibrées ou déséquilibrées, survenir de novo ou être transmises
Les translocations réciproques équilibrée se font entre qui? Cela a-t-il un effet sur le phénotype?
- entre des bras de chromosomes non homologues
- pas de variation du nombre de chromosome, pas de perte de matériel, donc pas d’effet sur le phénotype
- risque de ségrégation non équilibrée et de malségrégation lors de la méiose, donc risque de phénotype anormal chez la descendance
Quels gamètes peuvent être formés par une translocation réciproque déséquilibrée?
soit:
- 2 X normaux
- 2 X transloqués, mais équilibrés comme le parent porteur
- 1 X normal et 1 transloqué = ségrégation non équilibrée, et zygote monosomique ou trisomique partielle
Quel facteur influence les conséquences cliniques d’une translocation réciproque?
varie selon le nombre et l’importance fonctionnelle des gènes impliqués dans le segment chromosomique en excès ou en défaut
En règle générale, quels déséquilibres sont plus compatibles avec la vie?
plus les déséquilibres en excès qu’en défaut
Pourquoi un déséquilibre dans le matériel génétique peut-il causer une fausse-couche?
si le déséquilibre est très important, la fausse couche peut survenir même avant un retard de règle
petit déséquilibre = compatible avec la survie, mais risque de retard mental et malformations
Qu’est-ce qu’une translocation Robertsonienne équilibrée?
- 2 chromosomes avec 2 cassures
- 2 cassures et recollement au niveau des centromères: uniquement les centromères des chromosomes acrocentrique ou fusion centrique des 2 chromosomes
- variation du nombre de X
- perte de matériel génétique: les petits bras des 2 X acrocentriques qui sont constitués d’hétérochromatine (pas d’Effet sur le phénotype du porteur)
- risque de ségrégation non équilibrée et de malségrégation lors de la méiose, risque de phénotype anormaux chez leurs enfants
Qu’est-ce qu’une insertion?
- 2 chromosomes, 3 cassures
- cas particulier de translocation ou un fragment de chromosome est inséré au sein d’un autre
Dans quelles situations la CGH n’est pas recommandée?
- rechercher des remaniements équilibrés
- rechercher des anomalies de ploïdies
- prénatal dans le contexte du risque d’aneuploïdie
- si phénotype clair d’anomalie chromosomique précise (comme trisomie 21)
