Genetics Flashcards

1
Q

t(8;21) кой ген засяга?

A

RUNX1::RUNX1T1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Кой химерен онкопротеин при ОМЛ се среща предимно при новородени?

A

MLL

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Коя мутация в FLT3 при ОМЛ е свързана с по-висок риск от рецидив - FLT3-ITD (internal tandem duplication) или FLT3 - TKD (tyrosine kinase domain - обхващаща активационната примка)?

A

FLT3-ITD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Коя е мутацията при ОМЛ се среща при около 1/3 от пациентите, свързана е с благоприятна прогноза и неутрализира FLT3-ITD

A

NPM1 (nucleophosmin 1) гена

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Коя мутация при ОМЛ, когато е биалелна е свързана с благоприятна прогноза при липса на FLT3-ITD?

A

CEBPA (CCAAT/enhancer binding protein alfa) ген

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Коя мутация при ОМЛ, свързана с CBF благоприятните случай, но е свързана с повишен риск от рецидив, въпреки че остава чувствителна на химиотерапия

A

c-KIT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Коя мутация при ОМЛ се свързва с повишен риск от липса на отговор към терапия и е вторичен евент?

A

WT1 (Wilms tumour) гена

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

ASXL1, DNMT3A, RUNX1 и парциална тандемна дупликация на MLL (MLL-PTD) какво прогностично значение имат при ОМЛ?

A

Лошо

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

За кои подтипове ОМЛ с дефиниращи генетични аномалии все още важи правилото за 20% бласти в КМ?

A

ОМЛ с BCR/ABL1, ОМЛ с CEBPA мутация и ОМЛ-MR (myelodisplasia-related)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Кои са гените определящи ОМЛ-МС?

A

SRSF2, SF3B1, U2AF1, ZRSR2, ASXL1, EZH2, BCOR, STAG2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Кои са гените отговорни за спайсозомата и по-точно за инициирането на сплайсинга?

A

SF3B2, SRSF2, ZRSR2, U2AF1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

При кое заболяване най-често е мутирал SRSF2 и с какъв риск е свързан?

A

CMML
По-кратко време до трансформация в ОМЛ и по-ниска обща преживяемост

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Кой ген, свързан със спайсозомата, е мутирал при МДС и ОМЛ и е свързан с тежка тромбоцитопения, по-висок риск от трансформация в ОМЛ и по-ниска обща преживяемост?

A

ZRSR2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Мутации в гени, отговорни за спайсозомата с кой други мутации се срещат по-често?

A

С мутации в гени, отговорни за аберантното ДНК метилиране.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Кои са гените отговорни за ДНК метилиране?

A

DNMT3A, TET2, IDH1/2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Кои са гените отговорни за хистоновите модификации?

A

ASXL1, EZH2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Роля на TET2?

A

Конверсия на 5-метилцитозин в 5-хидроксиметилцитозин.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Роля на IDH1/2

A

катализират декарбоксилирането на изоцитрат в алфа-кетоглутарат. При мутация в тези гени нивото на алфа-кетоглутарат намалява, а той е необходим на TET2. Това води до промоторна хиперметилация.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

С какво се свързва RUNX1 мутацията?

A

С напреднало заболяване, тежка тромбоцитопения и лош клиничен изход.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Кой ген е засегнат при транслокации на 3та хромозома(t(3;3), inv 3), които водят до свръхекспресията му и е свързан с МДС и ОМЛ с абнормни мегакариоцити?

A

EVI-1 (zing-finger protein) - блокира еритроидната диференциация

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Роля на TP53 и p53

A

Протеин регулиращ клетъчния цикъл при G1/S стъпката, където може да активира апоптоза.
Тумор супресорен ген

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Коя мутация, свързана с лош отговор към леналидомид и увеличен риск от тртансформация в ОМЛ, се среща при МДС с del5q?

A

TP53

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Мутации е кой гени от RAS суперсемейството, свързани с интрацелуларната сигнална трансдукция, се срещат при МДС?

A

NRAS, KRAS, NF1, PTPN11, CB1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Коя соматична мутация се среща при 25-30% от пациентите с атипична ХМЛ и по-рядко при МДС и е свързана ДНК репликацията и свръхекспресията й води до висок възобновяем потенциал на миелоидните прогенитори?

A

SETBP1 (SET-binding protein 1)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Кой ген, свързан с разграждане на активни тирозин кинази, се среща при МДС и подобни и е свързан с лоша прогноза?

A

CBL гена

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Роля на GATA2 и при кой заболявания и синдроми се среща?

A

Транскрипционен фактор, отговорен за хемопоетичната диференциация и формирането на лимфоцитната система. Има роля в поддържане на пролифарецията и оцеляването на ранните ХСК и преференциална диференциация към еритроидна или мегакариоцитна линия.
При МДС, а при герминативна мутация - МоноМАС синдром.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Кои гени се срещат при герминативни мутации при МДС и ОМЛ?

A

DDX 41(хеликаза), GATA2, RUNX1, ANKRD 26, ETV6

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Кои цитогенетични нарушения се приемат от някои автори, че могат да се наблюдават при АА?

A

+8, del13q

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Кои гени често са засегнати при ХММЛ?

A

ASXL1, TET2, SRSF2, RUNX1, NRAS, CBL

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

роля на DDX41?

A

в биогенезата на рибозомите.
Биалелна мутация води до нарушения с РНК синтеза и клетъчна смърт.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Кои гени са най-често мутирали при МДС/МПН с неутрофилия и са част от критериите за поставяне на диагноза?

A

ASXL1 и SETBP1 (ICC) и ASXL1 и ETNK1 (WHO 2022)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Мутация в кой ген се свързва с Хронична неутрофилна левкемия

A

В CSF3R

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

С коя мутация се свързва t(3;3), inv (3) и каква прогноза има

A

MECOM(EVI1 i MDS1) rearrangement или GATA2 - GATA2::MECOM (EVI1);
води до свръхекспресия на MECOM поради промяна на позицията на GATA2 enhancer
Анемия, тромбоцитоза и мултилинейна дисплазия
лоша прогноза

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

роля на EVI1

A

Транскрипционен регулатор, участващ в пролиферацията, диференциацията и апоптозата на клетките; Сврухекспресиран е в ХСК и нивото му намалява при миелоидна диференциация

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Кои гени са включени в CPSS mol и кои цитогенетични аномалии?

A

ASXL1, NRAS, RUNX1, SETBP1
нисък риск (-Y и нормален), Лош риск ( +8, абнормален 7 и комплексен кариотип), интермедиерен - всичко останало

35
Q

Кои сигнални пътища са засегнати при BCR/ABL1?

A

RAS, JAK-STAT, phosphatidylinositol 2 PI3 kinase pathway, SYP, FES, CBL

36
Q

Кои са допълнителните клонални хромозомни аномалии при ХМЛ?

A

+8, изохромозома 17q, +19, аномалии в 3, комплексен кариотип

37
Q

Кои соматични мутации при ПВ са свързани с повишен риск?

A

ASXL1, IDH1/2, SRSF2

38
Q

Коя мутация при ЕТ в свързана с по-нисък риск от тромбози?

A

CALR и потенциално се свързва с по-висок риск от прогресия в МФ

39
Q

Кои соматични мутации при ЕТ са свързани с повишен риск?

A

SH2B3, SF3B1, U2AF1, TP53, IDH2, EZH2

40
Q

Кои цитогенетични аномалии са неблагоприятни спрямо DIPSS plus

A

комплексен кариотип, 1 или 2 аномалии включващи +8, -7/-7q, i17q, -5/-5q, 12p-, inv3, 11q23 rearrangement

41
Q

Кои цитогенетични аномалии са неблагоприятни спрямо MIPSS70plus

A

всеки абнормален кариотип с изключение на единични аномалии на 20q-,13q-, +9, translocation/duplication 1, -Y или други аномалии на половите хромозоми

42
Q

Кои мутации са с висок риск в MYPSS и MYPSSplus

A

ASXL1, IDH1/2, EZH2, SRSF2, TP53, U2AF1

43
Q

Роля на JAK2 V617F в патогенезата на МПН?

A

Валин 617 нормално действа като репресор на тирозин киназната активност. Заместването му с фенилаланин води до увеличена киназна активност, цитокинова независимост и води до еритроцитоза. При нормални обстоятелства Епо се свързва с неговия рецептор EPOR и това води до фосфорилиране на JAK2 и води до фосфорилиране на други таргети като най важен е STAT5 (signal transducer and activator of transcription), което води до стимулиране на еритропоезата?

44
Q

Какво се наблюдава по-често при мутации JAK2 exon 12 и какво се случва при тях?

A

Мутации в JAK2 exon12 водят до засягане на псевдокиназния домейн, което води до постоянна активност на JAK2 киназата.
По-често при по-млади хора и по-изолирана еритроцитоза, по-висок Хб, по-рядко тромбоцитоза и левкоцитоза.

45
Q

Роля на CALR и видове мутации

A

Ендоплазмен ретикулинов шаперон.
Обикновено мутации настъпват в екзон 9 (30% при ЕТ) и биват два типа:
тип I при 52-bp делеция (по-висока обща преживяемост при ПМФ)
тип II при 5-bp инсерция

(при CALR мутация при ЕТ - по-често има по-нисък Хб, по-високи Тр, по-нисък риск от тромбоза и по-висок риск от трансформация в миелофиброза)

46
Q

Роля на MPL?

A

Тромбопоетинов рецептор; 5% мутации при ЕТ,

(при ЕТ - по-изолирана тромбоцитоза и по-малко хиперцелуларен КМ, по-висок риск от трансформация във фиброза,
при ПМФ - по-нисък Хб и по-висок риск от трансфузионна зависимост)

47
Q

според СЗО 2022 кои допълнителни молекулярни мутации могат да докажат клоналност при ПМФ, тройно негативен?

A

ASXL1, EZH2, TET2, IDH1/2, SRSF2, SF3B1

48
Q

Какви цитогенетични аномалии се наблюдават при всички видове маргиналнозонов лимфом?

A

Тризомия на хромозоми 3 и 18.

49
Q

Какви цитогенетични аномалии са характерни за нодалния маргиналнозонов лимфом (NMZL)?

A

Придобивки на 2p и 6p.
Загуба на 1p и 6q.

50
Q

Какви цитогенетични аномалии се срещат при екстранодалния маргиналнозонов лимфом на MALT тип (EMZL) в орбиталната област?

A

Придобивка на 6p.
Загуба на 6q.

51
Q

Каква е характерната транслокация при гастрален и пулмонален екстранодален маргиналнозонов лимфом (EMZL)?

A

Транслокация t(11;18)(q21;q21), водеща до сливане на BIRC3::MALT1.

52
Q

Какви мутационни профили са характерни за екстранодалния маргиналнозонов лимфом (EMZL) в орбиталната област?

A

Мутация/делеция на TNFAIP3.

53
Q

Какви мутации се срещат при екстранодалния маргиналнозонов лимфом (EMZL) в слюнчените жлези?

A

Мутация на GPR34.

54
Q

Какви мутации са често срещани при щитовидния екстранодален маргиналнозонов лимфом (EMZL)?

A

Мутации на CD274, TNFRSF14 и/или TET2.

55
Q

Какви генетични аномалии са характерни за нодалния маргиналнозонов лимфом (NMZL)?

A

Чести соматични варианти на KMT2D, PTPRD, NOTCH2, KLF2 и други.

56
Q

Какви генетични аномалии са характерни за първичен кожен MZL

A

FAS мутации

57
Q

Какви генетични аномалии са характерни за класически ФЛ?

A

t(14;18) IGH::BCL2 fusion

58
Q

Какво е характерно за нетипичния ФЛ (uFL) с предимно дифузен растеж?

A

голям Ту в ингвинална област със CD23 експресия, липса на IGH::BCL2 fusion, чести STAT6 мутации заедно с 1p36 делеции или TNFRSF14 мутации

59
Q

Характерни генетични аномалии за MCL?

A

IGH::CCND1 - t(11;14)
по-рядко вместо IGH - IGK ili IGL
при малкото случаи на cyclin D1 негативни MCL - може CCND2, CCND3 ili CCNE

60
Q

Кои генетични аномалии са характерни за фоликуларен лимфом?

A

t(14;18), води до свръхекспресия на антиапоптоичния ген BCL2

61
Q

Кои генетични аномалии са характерни за мантелноклетъчен лимфом?

A

t(11;14), което води до свръхекспресия на Циклин D1

62
Q

Кои генетични аномалии са характерни за лимфом на Бъркит?

A

t(8;14), t(2;8), t(8;22), което свързва генния промотър на имуноглобулиновите тежки или леки вериги за транскрипционния фактор cMYC
Допълнителни мутации в транскрипционния фактор, който контролира пролиферацията на клетките в герминативни център - TCF3 и неговия инхибитор ID3; те кооперират с cMYC за стимулиране на пролиферацията

63
Q

Кои генетични аномалии са характерни за DLBCL?

A

BCL6 - транскрипционен фактор на хр3

64
Q

Кои генетични аномалии са характерни за ALK+ ALCL?

A

t (2;5), което свързва ALKс нуклеофосмин

65
Q

Коя мутация се открива в част от ALK- ALCL и е свързана с добра прогноза?

A

DUSP22 транслокация

66
Q

Коя мутация е характерна за косматоклетъчна левкемия?

A

BRAFV600E

67
Q

Коя мутация е характерна за WM и коя друго мутация може да се среща?

A

MYD88,
CXCR4 в около 30%,

68
Q

Коя мутация е характерна за GCB-like DLBCL?

A

EZH2

69
Q

Коя мутация е характерна за ABL-like DLBCL?

A

MYD88 и CD79B

70
Q

Коя транслокация се среща при маргиналнозонов лимфом, при кои видове и с какво се свързва?

A

t(11;18) - 20-30%, свързва се с резистентност към ерадикация на H. pylori,
не се среща при нодалния вариант?

71
Q

Кои транслокации се наблюдават при МЗЛ?

A

-t(1;14); t(14;18); t(3:14); t(11;18);
-При нодален MZL- t(11;18); t(3:14); t(14:18); del(13q). del(17q)
- При спленален маргиналнозонов del(7q)

72
Q

Какво допълнително може да се изследва при В-лимфопролиферативно заболяване с фенотип на косматоклетъчна левкемия, но негативно за BRAF V600E и какво значение има?

A

10-20% може да се наблюдава IGHV4-34 пренареждане и заболяването протича повече като косматоклетъчна левкемия, вариант или по СЗО 2022, спленална В-клетъчна лимфом/левкемия с проминентни нуклеоли;
не отговаря добре на лечение с пуринови аналози и има по-лоша прогноза;
често има мутации в MAP2K1

73
Q

Кои генетични мутации могат да подпомагнат поставянета на диагноза спленален MZL?

A

NOTCH2 и KLF2

74
Q

Кой ИХХ маркер може да подпомогне диагнозата на ХЛЛ от MCL?

A

Lymphoid Enhancer-Binding Factor 1 (LEF1) - много рядко може да се среща при MCL, типичен за ХЛЛ

75
Q

Койи маркери могат да подпомогнат диагнозата индолентен MCL?

A

SOX11- и мутирал IGHV;
типично за индолентния MCL е и левкемизация, без нодално ангажиране, със спленомегалия и ki67 <10 %

76
Q

Кои хромозомни аберации и генетични мутации са характерни за ХЛЛ?

A

разпределени по риск за прогресия:
del17p13 (TP53) > del11q22.3 (ATM) > trisomy 12 > del 13q14 (miR 15A и miR16-1 - инхибитори на BCL2)
Освен мутации в TP53 и ATM,
рекурентни мутации при около 10% на NOTCH1 (по-агресивно заболявне и увеличен риск за трансформация в DLBCL) и SF3B1 (по-кратък отговор към терапия и намалена OS)

77
Q

Кои са рекурентните транслокации при ММ и кои гени засягат?

A

t(11;14) - CCND1,
t(4;14) - FGFR/MMSET (fibroblast growth factor receptor/ multiple myeloma SET domain)
t(14;16) - MAF;
t(6;14) - CCND3
t(14;20) - MAFB

78
Q

Какви са бройните хромозомни нарушения при ММ?

A
  • Хипердиплоидия - добра прогноза
  • Нехипердиплоидни ( хидиплоидни, псевдодиплоидни, почти тетрадиплоидни (повече от 74))
  • -13 - най-честата монозомия
  • del 17p - 5-10%, но по-висока честота при напреднал стадий и екстрамедуларна болест
  • лезии на Хр 1 - най-честата аномалия при ММ - 1q gains и 1p loses
79
Q

Късни мутации при ММ, свързани с прогресия на заболяването?

A
  • MYC
  • активиращи RAS мутации - KRAS, NRAS
  • TP53 инактивиращи мутации
  • метилиране на тумор супресорни гени - CDKN2B и CDKN2A
80
Q

Кои миркоРНКи повлияват p53 при ММ?

A

миР-192, миР-194, миР-215 водят до деградация на MDM2 с последващо стимулиране на p53 и инхибиране на клетъчния разтеж

81
Q

Коя транслокация и съответно фузионен протеин са характерни за ALK+ ALCL?

A

t(2;5), NPM-ALK, кодиращ химерен протеин с тирозин киназна активност

82
Q

Добър риск мутации при В-ОЛЛ?

A

Хипердиплоидия, t(12;21) ETV6:RUNX1
+4, +10, +17
t1;19 TCF3 :PBX1
Dux4
PAX5
BCR/ABL1 без IKZF1 plus

83
Q

Лош риск мутации при В-ОЛЛ?

A

Хиподиплоидия. t(9;22), t(4;11) KMT2A rearrangement, комплексен кариотип, IKZF1, IKZF1 plus, CRLF2 rearrangements, IGH translocations

84
Q

Мутации при Т-ОЛЛ?

A

NOTCH1/FBXW7 - добра прогноза, ако липсват долните
RAS/PTEN - лоша прогноза