gene functions Flashcards
Mutagenese
Physikalisch: Bestrahlung
Chemisch: basenverändernde Chemikalien
Biologisch: Insertionen durch Transposons („springende Gene“)
Genetische Screens
identifizieren Mutanten mit interessanten Phänotypen
Mutanten geben Aufschluss über die Genfunktion
Typen von Mutationen (Veränderung der DNA Sequenz):
Punktmutation (eine Base mutiert)
Deletion (mehrere zusammenhängende Basen deletiert)
Insertion (zusätzliche Base(n) integriert)
Inversion (Orientierung eines DNA Abschnitts invertiert)
Translokation (DNA Abschnitt in ein anderes Chromosom integriert)
Funktionsverlust (lossof function, LOF)
Amorph (Null-Mutante): kompletter Gen-Funktionsverlust
Hypomorph: teilweiser Gen-Funktionsverlust
Funktionsgewinn (gainof function, GOF)
Hypermorph: Gen-Funktion gesteigert
Antimorph (dominant negative): inhibieren eigentliche Genfunktion
Neomorph: Neue Gen-Funktion
Untersuchung von Gen-Funktion
1) Untersuchung von „gain of function“ und Transgenese
- Injektion (mRNA/DNA-Konstrukte)
- Transgene
2) Genom-Editierung
- Homologe Rekombination (Maus, Drosophila)
- CRISPR/Cas9-System (viele Organismen)
Untersuchung von Gen-Expression
1) Expressions-Muster bestimmen: Wholemount in situ hybridization Immunhistochemie / Antikörperfärbung Reportergene & EnhancerTrap Gene-Trap
2) Expressions-Höhe bestimmen: DNA-Arrays qPCR RNA-seq Nanostring