G4) Décarboxylation oxydative + Cycle de de Krebs + Bilan Glucose + Navette Flashcards

1
Q

Qu’est ce que la décarboxylation oxydative ?

A

C’est quand une molécule subit un catabolisme et pert un CO2.
C’est ce que subit le pyruvate pour se transformer en 2 AcétylCoA.

Cette réaction se produit grâce au complexe pyruvate déshydrogénase (3 enzymes, 5 co-enzymes).

Ensuite l’ActétylCoA pers ces deux derniers atomes de carbones, le glucose se trouve sur la forme la plus oxydé.

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2
Q

En quoi se transforme L’acétylCoA (2C) dans le cycle de krebs ?

A

il va se lier avec l’oxaloacétate (4C) pour devenir du citrate (6C), ensuite le citrate va perdre deux fois un atome de carbone et va donc redevenir du oxaloacétate (4C)

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3
Q

Quelle est le bilan global du cycle de krebs ?

A

C = 0
équivalent réducteur = 8
- 3 endroit ou on forme du NADH
- 1 endroit ou on forme du FADH
Formation d’un GTP qui pourra devenir de l’ATP.

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4
Q

Peut tu me donner le cycle de Krebs de façon silmplifié ?

A

Acétyl CoA (2C) + oxaloacétate (4) –> Citrate (6C)

Citrate (6C) –> Isocitrate (6C)

Isocitrate (6C) –> Ketoglutarate (5C)
*libération d’un CO2 et captation d’un ion H+ par le NADH

Ketoglutarate (5C) –> Succinyl-CoA (4C)
*libération d’un CO2 et captation d’un ion H+ par le NADH

Succinyl-CoA (4C) –> Succinate (4C)
*libération d’un GTP (qui peut ^tre transformer en ATP

Succinate (4C) –> Fumarate (4C)
captation d’un ion H+ par le FADH2

Fumarate (4C) –> Malate (4C)

Malate (4C) –> Oxaloacétate (4C)
captation d’un ion H+ par le NADH

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5
Q

Que deviennent les équivalent réducteurs au niveau de la mictochondrie (plus particulièrement de la membrane interne) ?

A

Tout d’abord la membrane interne est constitué de 4 complexes (protéines transmembranaires)

1) le NADH arrive au complexe 1 et perd ses deux équivalents réducteur
NADH -> NAD+

2) Le Complexe 1 réduit une co-enzymes Q avec les deux ER –> QH2
4 protons sont libérés dans l’espace intermembranaire par le complexe 1

3) La Co-enzyme QH2 va réduire le complexe 3 et transférer ces 2 Er sur une protéine –> Cyt
qui va être ensuite transférer sur le complexe 4.
4 protons sont libérés dans l’espace intermembranaire par le complexe 3

4) Les deux équivalents réducteurs de la protéines Cyt.C vont être déposés sur le complexe 4.
- Le complexe 4 va donner ses deux équivalents réducteurs à de l’oxygène (1/2 O2) et celui-ci
sera converti en H2O.
- 2 protons sont expulsés dans l’espace intermembranaire par le complexe 4

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6
Q

Que fait-on de tous ces protons libérées dans l’espace intermembranaire ?

A

10 protons sont libérées dans l’espace intermembranaire (C1 : 4 ; C3 : 4 ; C4 : 2)

Cela génère un gradient de concentration et un gradient électrochimique.

Pour rerentrer dans la mitochondrie le proton passe par un canal particulier L’ATP SYNTHETASE
–> Supprime variant électrochimique et de concentration
+ phophorylation oxydative

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7
Q

Qu’est ce que la phosphorylation oxydative ?

A

C’est la transformation des protons en ATP par l’ATP SYNTHETASE
4 protons -> 1 ATP
Or avec un NADH on libère 10 protons
Un NADH produit 2,5 ATP

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8
Q

Quand est-il pour le FADH2 ?

A

1) le FADH2 arrive au complexe 2 et se fait oxydé en FADH, il réduit le complexe 2 avec 2ER qui vont aller réduire la co-enzyme Q

2) La Co-enzyme QH2 va réduire le complexe 3 et transférer ces 2 Er sur une protéine –> Cyt
qui va être ensuite transférer sur le complexe 4.
4 protons sont libérés dans l’espace intermembranaire par le complexe 3

3) Les deux équivalents réducteurs de la protéines Cyt.C vont être déposés sur le complexe 4.
- Le complexe 4 va donner ses deux équivalents réducteurs à de l’oxygène (1/2 O2) et celui-ci
sera converti en H2O.
- 2 protons sont expulsés dans l’espace intermembranaire par le complexe 4

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9
Q

Bilan FADH2

A

6 protons expulsé : on peut donc faire 1,5 ATP grâce à l’ATP SYNTHETASE

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10
Q

BILAN GLOBALE ATP PRODUIT POUR 1 GLUCOSE

A

CYTOSOL

  • GLYCOLYSE
    2ATP / 2NADH / 2 PYRUVATE

MITOCHONDRIE

  • 2 PYRUVATE –> AcetylCoA 2
    2 NADH (1 par pyruvate)
  • CYCLE DE KREBS
    2* (3NADH / 1FADH2 / 1ATP (GTP))

BILAN GLOBAL
10 NADH = 100 protons libérés
4 protons = 1 ATP
25 ATP produit
2FADH = 12 protons libérés
3 ATP produit
+3 ATP
25 + 6 = 31

1 glucose = 31 ATP produit

Ce bilan peut être plus élevé car un NADH produit entre 2,5 et 3 ATP
et un FADH2 entre 1,5 et 2

Le bilan se situerait donc plus entre 32 et 38 ATP pour un glucose.

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11
Q

Rappel que se passe t’il dans la mitochondrie lors de la gluconéogèse ?

A

Le pyruvate est transformé en oxaloacétate mais celui ci ne peut pas passé la membrane interne de la mitochondrie pour atteindre le cytosol.
Il va alors se lier à un NADH et devenir un malate qui lui peut franchir la membrane,
Ensuite dans le cytosol le malate va libérer ce NADH et redevenir de l’oxaloacétate.

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12
Q

Quelles sont les molécules qui ne peuvent pas passe la membrane interne de la mitochondrie ?

A
  • Oxaloacétate
  • NADH
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13
Q

Qu’est ce qu’une oxydo-réduction, exemple du NADH + oxyloacétate ?

A

Le NADH va venir réduire le oxyloacétate (anabolsime) mais celui-ci va être oxydé (catabolsime) et devenir du NAD+

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14
Q

Comment faire pour refaire passer l’oxaloacétate de l’autre côté ?

A

On va transformer l’oxaloacétate en aspartate grâce à un groupement amine qu’on va mettre sur le 2ème C

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15
Q

D’ou provient ce groupe amine ?

A

Du glutamate qui va alors être oxydé en alpha-cétoglutarate par l’aspartate aminotransférase
et inversement dans la mitochondrie

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16
Q

Quel est l’objectif de la navette Glycérol 3 P ?

A

Faire rentrer des équibvalents réducteur dans la mitochondrie sous forme de NADH pour le lier ensuite à la chaine de transport des électrons afin de produire de l’ATP

17
Q

Comment fonctionne la nevette Glycérol 3 P ?

A

1) Le dihydroxyacétone phosphate va capter 2 ER provenant d’un NADH et devenir du Glycérol 3P, L’enzyme qui permet cette réaction est la G-3-P déshydrogénase cytosolique.

2) Ce G3P va passer dans l’espace intermembranaire de la mitochondrie et la G3P déshydrogénase mitochondriale.
A cette endroit la G3P va être reoxydé en dihydroxyacétone phosphate en libérant ces 2 ER sur du FAD qui devient du FADH2

3) puis on repart dans la chaine de transport d’électrons pour le FADH2 (vu précédemment)

18
Q

Oû est présente la navette Malate-Aspartate et la navette Glycérol 3P ?

A

Malate - Aspartate : foie/rein/coeur
+ fibre musculaire de type 1

G3P : cerveau / muscle squelettique

19
Q

Quel est est le rôle des réactions anaplérotiques ? et quelles sont les 2 principales enzymes qui y contribue ?

A

Le rôle de des réactions anaplérotiques est de reformer le stock des molécules présentes dans le cycle de Krebs permettant son bon fonctionnement.

Les deux principales enzymes sont :

  • l’enzyme malique (pyruvate-malate)
    Mitochondrie et cytosol
  • pyruvate carboxylase (pyruvate-oxaloacétate)
    enzyme mitochondriale