Farmacogenómica Flashcards
… 50s
-Genes candidatos
-Relación simple
-Limitaciones tecnologicas
-Variación en secuencias (ADN)
… 90s
- Expresión- Proteómica
-Mayor precisión de toxicidad (efectos pleiotópicos)
-Avances tecnológicos sin precsedentes
-Relación compleja
-Farmacogenética
-Farmacogenómica
Los DNA-RNA-Proteínas, expresión proteómica y transcriptómica y técnicas de análisis genómica son conceptos de…
Farmacogenómica
…
El genoma es complejo y con frecuencia son múltiples factores involucrados. Ej. El 5FU está involucrado aprox 40 enzimas.
Limitación
Análisis de expresión de muchos genes simultáneos.
estudio antiguo, pero se sigue usando, aborda características poligénicas
Microarreglos
Estudios de asociación,comparan; se toma una POBLACIÓN y se identifican variantes genéticas que expliquen posibles características.
GWAS
Estudio de gran escala de las proteínas
Proteómica
Grados de medicina personalizada
Población –> Subpoblación (más específico) –> individuo (fármacos huérfanos, casi nadie lo toma, 1 en cada millón, esta la idea pero no se completa, no llegan a producción)
Fármacos que se usan en toda la población, ejemplo aspirina
Población Blockbuster
DNA
Genoma
Información genética común de todas las células.
Todas las células tienen el mismo genoma
Ej. Hepatocito y osteocito tienen MISMO genoma
RNA
Transcriptoma
Información de EXPRESIÓN de RNA en una célula en determinado momento de su desarrollo.
-Ej. hepatocito y osteocito tiene muy DISTINTO transcriptoma
-Muchos RNA no se traducen a proteínas (no traducible) solo el ARNm
Proteínas
Proteoma
Estudio de todas las proteínas en determinado momento en determinada célula
-Células madre tienen un proteoma muy AMPLIO pero eventualmente se diferencia a una célula con proteoma ESPECIALIZADO.
Estudios de fácil a difícil
-Genoma
-Transcriptoma
-Proteomica
-Metabolómica
-Fenomica
Estudios de Genómica
-Halotipos
-Secuenciación
-Polimorfismos
-GWAS
-PCR tradicional
Conocer estudios de genómica NO es suficiente para establecer diagnóstico. V o F
V
Perfiles de expresión (estudios de transcriptoma)
-Perfiles de RNA total
-Microarreglo
-Niveles de transcritos específicos
-PCR tiempo real (usa RNA polimerasa)
-Estímulo y control (que aumenta y que reduce la cantidad de proteína, ej. inhibidores e inductores.)
Estudios de proteómica
-Perfil proteico
- Marcadores específicos
-Electroforesis
-Western blot (inmunoensayo)
-ELISA (inmnoensayo)
-electroforesis de proteínas
-cantidad de proteína, modificaciones postraduccionales
Análisis genómicos
Son dos que son indepedendientes de conocimiento previo (generan conocimiento nuevo)
- SAGE: segmento corto procedente de mRNA es suficiente para identificar un gen completo
-RNASeq: secuenciación de siguiente generación NGS de transcritos
Análisis genómicos
1 dependiente de conocimiento previo
-Microarreglos: qPCR (confirmatorio)
… utilizan fluorescencia, se ve diferencia de expresión en cada bolita (PCR), da mucha información. El tono dice que tan expresado esta. Como es estudio de expresión es de RNA. Pueden haber en cDNA que viene de RNA.
Microarreglos
Ley de … , tendencia de reducción de costo de la tecnología.
Moor
Análisis proteómicos
1- Variación de proteínas de tipo celular y ambiente
2- Rangos dinámicos de concentración de proteínas varía desde 106-107
3- 50% de las proteínas son de baja abundancia
4- No hay mandera de amplificar proteínas (como en PCR)
5- Reguladas postraduccionalmente
Eslectroforesis 2D
-1D (o tradicional)
-Separa ADN
-Hay unos que separan proteínas por tamaño (punto isoeléctrico), se pone un anticuerpo contra proteína de interés y se hace el arreglo (western blot)
-Es por tamaño, por carga y pH
-Estudio PROTEÓMICO especializado
Microarreglo
Marcas tejidos con colorantes, haces un merch, en base a la cantidad de color
Medicina traslacional
-Interacción entre investigación básica, clínica y epidemiológica para reducir la incidencia y morbilidad d3e enfermedades humanas.