Farmacogenómica Flashcards
… 50s
-Genes candidatos
-Relación simple
-Limitaciones tecnologicas
-Variación en secuencias (ADN)
… 90s
- Expresión- Proteómica
-Mayor precisión de toxicidad (efectos pleiotópicos)
-Avances tecnológicos sin precsedentes
-Relación compleja
-Farmacogenética
-Farmacogenómica
Los DNA-RNA-Proteínas, expresión proteómica y transcriptómica y técnicas de análisis genómica son conceptos de…
Farmacogenómica
…
El genoma es complejo y con frecuencia son múltiples factores involucrados. Ej. El 5FU está involucrado aprox 40 enzimas.
Limitación
Análisis de expresión de muchos genes simultáneos.
estudio antiguo, pero se sigue usando, aborda características poligénicas
Microarreglos
Estudios de asociación,comparan; se toma una POBLACIÓN y se identifican variantes genéticas que expliquen posibles características.
GWAS
Estudio de gran escala de las proteínas
Proteómica
Grados de medicina personalizada
Población –> Subpoblación (más específico) –> individuo (fármacos huérfanos, casi nadie lo toma, 1 en cada millón, esta la idea pero no se completa, no llegan a producción)
Fármacos que se usan en toda la población, ejemplo aspirina
Población Blockbuster
DNA
Genoma
Información genética común de todas las células.
Todas las células tienen el mismo genoma
Ej. Hepatocito y osteocito tienen MISMO genoma
RNA
Transcriptoma
Información de EXPRESIÓN de RNA en una célula en determinado momento de su desarrollo.
-Ej. hepatocito y osteocito tiene muy DISTINTO transcriptoma
-Muchos RNA no se traducen a proteínas (no traducible) solo el ARNm
Proteínas
Proteoma
Estudio de todas las proteínas en determinado momento en determinada célula
-Células madre tienen un proteoma muy AMPLIO pero eventualmente se diferencia a una célula con proteoma ESPECIALIZADO.
Estudios de fácil a difícil
-Genoma
-Transcriptoma
-Proteomica
-Metabolómica
-Fenomica
Estudios de Genómica
-Halotipos
-Secuenciación
-Polimorfismos
-GWAS
-PCR tradicional
Conocer estudios de genómica NO es suficiente para establecer diagnóstico. V o F
V
Perfiles de expresión (estudios de transcriptoma)
-Perfiles de RNA total
-Microarreglo
-Niveles de transcritos específicos
-PCR tiempo real (usa RNA polimerasa)
-Estímulo y control (que aumenta y que reduce la cantidad de proteína, ej. inhibidores e inductores.)
Estudios de proteómica
-Perfil proteico
- Marcadores específicos
-Electroforesis
-Western blot (inmunoensayo)
-ELISA (inmnoensayo)
-electroforesis de proteínas
-cantidad de proteína, modificaciones postraduccionales
Análisis genómicos
Son dos que son indepedendientes de conocimiento previo (generan conocimiento nuevo)
- SAGE: segmento corto procedente de mRNA es suficiente para identificar un gen completo
-RNASeq: secuenciación de siguiente generación NGS de transcritos
Análisis genómicos
1 dependiente de conocimiento previo
-Microarreglos: qPCR (confirmatorio)
… utilizan fluorescencia, se ve diferencia de expresión en cada bolita (PCR), da mucha información. El tono dice que tan expresado esta. Como es estudio de expresión es de RNA. Pueden haber en cDNA que viene de RNA.
Microarreglos
Ley de … , tendencia de reducción de costo de la tecnología.
Moor
Análisis proteómicos
1- Variación de proteínas de tipo celular y ambiente
2- Rangos dinámicos de concentración de proteínas varía desde 106-107
3- 50% de las proteínas son de baja abundancia
4- No hay mandera de amplificar proteínas (como en PCR)
5- Reguladas postraduccionalmente
Eslectroforesis 2D
-1D (o tradicional)
-Separa ADN
-Hay unos que separan proteínas por tamaño (punto isoeléctrico), se pone un anticuerpo contra proteína de interés y se hace el arreglo (western blot)
-Es por tamaño, por carga y pH
-Estudio PROTEÓMICO especializado
Microarreglo
Marcas tejidos con colorantes, haces un merch, en base a la cantidad de color
Medicina traslacional
-Interacción entre investigación básica, clínica y epidemiológica para reducir la incidencia y morbilidad d3e enfermedades humanas.
Trabajo en el laboratorio, proyectos de alto costo y resultados a largo plazo como respuesta a una pregunta experimental, muy pocos casos tienen aplicabilidad clínica a corto plazo
Investigador básico
Trabajo sobre paciente, técnicas prácticas y resultados a corto plazo En muchas ocasiones si requiere manejar cuestiones de laboratorio básico contacta a estos grupos
Investigador clínico
Centra su trabajo en grupos de población, analizando solo aspectos clínicos si contacto en laboratorio, plazo de estudio es a largo plazo
Investigador epidemiológico
Marcadores derivados de un sistema biológico que oriente un estado de salud/enfermedad.
Biomarcadores
Estudios procuran idntificar biomarcadores
Los biomarcadores son detectables y aveces cuantificables
-Genómicos
-Transcriptómicos
-Proteómicos
-Derivados d eanteriores (epigenética o metabolómica)
Biomarcadores pueden ser sustancias TÓXICAS biotransformadas por el cuerpo, presencia de enzimas, proteínas, metabolitos o incluso signos y síntomas. V o F
V
Cuantificar fármacos/toxinas en el organismo
–> El daño es dependiente de una substancia –> Estudiar el efecto del fármaco o sustancia tóxica –> Detectar y analizar el mismo en el organismo–> Muestreo biológico y uso de biomarcadores. ¿Que son cada uno?
-Muestreo biológico: Determinación cuantitativa de la concentración del fármaco/tóxcico o sus metabolitos en uno o más medios corporales del organismo expuesto. Orina, sangre y cabello.
-Biomarcador: cambios medibles, bioquímicos fisiológicos o morfológicos, asocian a exposición a sustancia.
Biomarcadores
-Detectar la presencia de una exposición
-Determinar las consecuencias biológicas de la exposición
-Detectar estados iniciales e intermedios de un proceso patológico
-Identificar a los individuos sensibles de una población
-Fundamentar la decisión de intervenir, tanto a nivel individual como ambiental.
Proporcionan infromación cuantitativa sobre la EXPOSICIÓN y corroboran el ingreso de fármacos/tóxicos al organismo.
Son los resulatdos de la dosimetría interna o sea la concentración de los xenobióticos y sus METABOLITOS.
Biomarcador de exposición
Respuesta biológica por exposición crónica, cuantificable y detonan un xenobiótico o sustanciua efectora. Son compuestos de adición estables que forman el fármaco/tóxico o sus productos de bioactivación con ácidos nucleicos y proteínas.
Son más persistentes y preesentan ALTERACIONES GENÉTICAS.
Marcadores de efecto
Ejemplo de marcadores de efecto
Mutaciones de ciertos oncogenes y alteraciones a nivel de la cromatina.
Los PÓLIPOS en colón son un … de enfermedad ya que la continuación de exposición puede conducir a un cáncer.
-marcador
Todas la variantes, se utilizan para idnetificar a individuos más SUCEPTIBLES al desarrollo de una enfermedad por exposición a un xenobiótico en una población.
Algunos tienen PROBABILIDADES más altas que otros de recorrer completo el camino exposición-enfermedad
Marcadores de suceptibilidad
Marcadores de suceptibilidad
Se puede deber a que tienen más activos los procesos de … o que tienen disminuidas sus capacidades de … , de excretar y reparar daños.
Ej. Individuos con alta actividad NAT tienen más riesgo si son expuestos a los compuestos que son bioactivados por NAT.
-BIOACTIVACIÓN
-destoxificar
