Estructura y plegado de proteinas Flashcards
Cuales son las secuencias “unideminsionales”?
Secuencias de genes
RNAm
Secuencias de aminoacidos
Cual es el principal objetivo de la estructura tridimensional de las proteinas?
Favorecer sus actividades:
- CAtaliticas
- REgulagoras
- Estructurales
Cada secuencia de aminoacidos tendra su estado nativo estable unico y que se forma de manera espontanea? (VERDADERO o FALSO)
VERDADERO
Que proceso es la justificacion a la teoria de que las proteinas tienen un estado estable unico?
La desnaturalizacion reversible de las proteinas
- Si una proteina se calienta y llega a un estado no estable, se vera desordenada, hasta que la temperatura regrese a la normal, donde regresara a su estado estable unico
VERDADERO/FALSO
- La secuencia de DNA determina la secuencia de la proteina?
- La secuencia proteica determina la estructura proteica
- La estructura de la proteína determina la función de la proteína
Todas VERDADERAS
Que es el Motif?
Patron de plegado que involucra a dos o mas elementos de estructura secundaria y las regiones que les conectan
Solo proteinas Globulares
Que es un dominio de una proteina?
Parte de una cadena polipeptidica estable que es independiente del resto de la proteina
- Las proteinas de gran tamaño se pueden plegar en dos o mas dominios
Menciona las 5 reglas del plegado:
- Residuos hidrofobicos se van al centro de la proteina y necesitan dos estructuras secundarias para evitar contacto con agua
- Helice Alfa y Lamina Beta en un mismo dominio son de capas estructurales diferentes (NO pueden hacer puentes de hidrogeno entre ellas)
- Los segmentos de la cadena polipeptidica agrupados en la estructura secundaria se mantedran como estan despues del plegado
- Las conexiones entre elementos de estructura secundaria no pueden entrecruzarse ni formar nudos
- Lamina Beta es mas estable en sentido derecho que en izquierdo
De que se conforma el Barril TIM (alfa/beta)?
Repeticiones de un loop Beta-Alfa-Beta
Tiene 8 helices alfa y 8 laminas beta
Que tan comun es el Barril TIM?
El dominio que forma es uno de los más encontrado de las proteínas.
Estable y versatil, sitio activo para sustratos y cofactores
Que dicta La paradoja de Levinthal?
Cuánto tiempo tomaría para que una proteína se doblara correctamente si tuviera que mostrar todas sus posibles conformaciones en el espacio tridimensional
La siguiente parte del tema son cosas que ya se vieron en la intro a proteinas:
- Plegado de proteinas
- Proceso de plegado jerarquico
- Molten Globule
- Folding Funel
- Chaperonas
- Chaperoninas
Lo vimos en INTRO a proteinas :)
Cuales son las 4 clases estructurales de proteinas en la estructura terciaria??
Totalmente Alfa Helice
Totalmente Beta Plegadas
Alfa/Beta ó Intercaladas
Alfa + Beta ó Alfas de un lado y Beta del otro
Ver imagenes para entender como se venVer grabacion 25/10/2021, min 55**
Que significa CATH?
Class
Architecture
Topology
Homologous Super Family
Que es un Multimero y que es un Oligomero?
Multimero: Proteina con multiples subunidades
Oligomero: Multimero con pocas subunidades
Da un ejemplo de una proteina Oligomera
Hemoglobina
Como se obtuvo la estructura tridimensional de la hemoglobina, y cuales son sus componentes?
Se descubrio mediante difracción de rayos X
Contiene 4 cadenas polipeptídicas, y cuatro grupos prostéticos
La Globulina (porcion proteica) tiene dos cadenas a y dos b.
Cuales son las caracteristicas de las proteinas multimericas con subunidades iguales?
Se ordenan en formas simetricas
Se utilizan ejes de simetria
Cuales son los 2 tipos de simetria que pueden tener los oligómeros?
Rotacional
Helicoidal
Cuales son los 4 tipos de simetria rotacional y cuales son sus caracteristicas?
Simetria ciclica: (C)
- Rotacional y con solo un eje de simetria
Simetria diedrica: (D)
- Rotacional y con dos ejes de simetria divididos en dos niveles (eje Y y eje X)
Simetria Icosaédrica:
- 3 ejes de rotacion, 20 caras triangulares y 12 vertices
Simetria Octahedrica:
- 48 simetrias rotacionales totales
Cuales son las 2 simetrias más complejas y en donde las encontramos?
Simetria Icosaédricas
- En capsides de virus
Simetria Helicoidal
- En filamentos
IMPORTANTE saber identificar visualmente cuantos ejes y que tipo de simetria
Que es la desnaturalizacion?
Perdida de la estructura 3D y perdida de su funcionalidad
Cuales son las caracteristicas de la desnaturalizacion termica?
Afecta puentes de hidrogeno (interaccion debil)
Aumento leve de temperatura causa desnaturalizacion abrupta
Cooperativa (perdida de estructura en una region causa perdida en otras)
Cuales son las caracteristicas de la desnaturalizacion quimica?
Por PH’s extremos
Son solventes, solutos y detergentes
Como es que el PH afecta la estructura de una proteina? y como funcionan los solventes y detergentes?
El PH altera la carga neta de las proteinas y genera ruptura de los puentes de hidrogeno y repulsion de residuos
Solventes y Detergentes alteran interacciones hidrofobicas y desestabilizan la proteina
