Estructura y plegado de proteinas

Question 1

Cuales son las secuencias “unideminsionales”?

Answer 1

Secuencias de genes
RNAm
Secuencias de aminoacidos

Question 2

Cual es el principal objetivo de la estructura tridimensional de las proteinas?

Answer 2

Favorecer sus actividades:

• CAtaliticas
• REgulagoras
• Estructurales

Question 3

Cada secuencia de aminoacidos tendra su estado nativo estable unico y que se forma de manera espontanea? (VERDADERO o FALSO)

Answer 3

VERDADERO

Question 4

Que proceso es la justificacion a la teoria de que las proteinas tienen un estado estable unico?

Answer 4

La desnaturalizacion reversible de las proteinas
- Si una proteina se calienta y llega a un estado no estable, se vera desordenada, hasta que la temperatura regrese a la normal, donde regresara a su estado estable unico

Question 5

VERDADERO/FALSO

1. • La secuencia de DNA determina la secuencia de la proteina?
2. • La secuencia proteica determina la estructura proteica
3. • La estructura de la proteína determina la función de la proteína

Answer 5

Todas VERDADERAS

Question 6

Que es el Motif?

Answer 6

Patron de plegado que involucra a dos o mas elementos de estructura secundaria y las regiones que les conectan
Solo proteinas Globulares

Question 7

Que es un dominio de una proteina?

Answer 7

Parte de una cadena polipeptidica estable que es independiente del resto de la proteina
- Las proteinas de gran tamaño se pueden plegar en dos o mas dominios

Question 8

Menciona las 5 reglas del plegado:

Answer 8

1. • Residuos hidrofobicos se van al centro de la proteina y necesitan dos estructuras secundarias para evitar contacto con agua
2. • Helice Alfa y Lamina Beta en un mismo dominio son de capas estructurales diferentes (NO pueden hacer puentes de hidrogeno entre ellas)
3. • Los segmentos de la cadena polipeptidica agrupados en la estructura secundaria se mantedran como estan despues del plegado
4. • Las conexiones entre elementos de estructura secundaria no pueden entrecruzarse ni formar nudos
5. • Lamina Beta es mas estable en sentido derecho que en izquierdo

Question 9

De que se conforma el Barril TIM (alfa/beta)?

Answer 9

Repeticiones de un loop Beta-Alfa-Beta

Tiene 8 helices alfa y 8 laminas beta

Question 10

Que tan comun es el Barril TIM?

Answer 10

El dominio que forma es uno de los más encontrado de las proteínas.
Estable y versatil, sitio activo para sustratos y cofactores

Question 11

Que dicta La paradoja de Levinthal?

Answer 11

Cuánto tiempo tomaría para que una proteína se doblara correctamente si tuviera que mostrar todas sus posibles conformaciones en el espacio tridimensional

Question 12

La siguiente parte del tema son cosas que ya se vieron en la intro a proteinas:

• Plegado de proteinas
• Proceso de plegado jerarquico
• Molten Globule
• Folding Funel
• Chaperonas
• Chaperoninas

Answer 12

Lo vimos en INTRO a proteinas :)

Question 13

Cuales son las 4 clases estructurales de proteinas en la estructura terciaria??

Answer 13

Totalmente Alfa Helice
Totalmente Beta Plegadas
Alfa/Beta ó Intercaladas
Alfa + Beta ó Alfas de un lado y Beta del otro
Ver imagenes para entender como se venVer grabacion 25/10/2021, min 55**

Question 14

Que significa CATH?

Answer 14

Class
Architecture
Topology
Homologous Super Family

Question 15

Que es un Multimero y que es un Oligomero?

Answer 15

Multimero: Proteina con multiples subunidades

Oligomero: Multimero con pocas subunidades

Question 16

Da un ejemplo de una proteina Oligomera

Answer 16

Hemoglobina

Question 17

Como se obtuvo la estructura tridimensional de la hemoglobina, y cuales son sus componentes?

Answer 17

Se descubrio mediante difracción de rayos X
Contiene 4 cadenas polipeptídicas, y cuatro grupos prostéticos
La Globulina (porcion proteica) tiene dos cadenas a y dos b.

Question 18

Cuales son las caracteristicas de las proteinas multimericas con subunidades iguales?

Answer 18

Se ordenan en formas simetricas

Se utilizan ejes de simetria

Question 19

Cuales son los 2 tipos de simetria que pueden tener los oligómeros?

Answer 19

Rotacional

Helicoidal

Question 20

Cuales son los 4 tipos de simetria rotacional y cuales son sus caracteristicas?

Answer 20

Simetria ciclica: (C)
- Rotacional y con solo un eje de simetria
Simetria diedrica: (D)
- Rotacional y con dos ejes de simetria divididos en dos niveles (eje Y y eje X)
Simetria Icosaédrica:
- 3 ejes de rotacion, 20 caras triangulares y 12 vertices
Simetria Octahedrica:
- 48 simetrias rotacionales totales

Question 21

Cuales son las 2 simetrias más complejas y en donde las encontramos?

Answer 21

Simetria Icosaédricas
- En capsides de virus
Simetria Helicoidal
- En filamentos

IMPORTANTE saber identificar visualmente cuantos ejes y que tipo de simetria

Question 22

Que es la desnaturalizacion?

Answer 22

Perdida de la estructura 3D y perdida de su funcionalidad

Question 23

Cuales son las caracteristicas de la desnaturalizacion termica?

Answer 23

Afecta puentes de hidrogeno (interaccion debil)
Aumento leve de temperatura causa desnaturalizacion abrupta
Cooperativa (perdida de estructura en una region causa perdida en otras)

Question 24

Cuales son las caracteristicas de la desnaturalizacion quimica?

Answer 24

Por PH’s extremos

Son solventes, solutos y detergentes

Question 25

Como es que el PH afecta la estructura de una proteina? y como funcionan los solventes y detergentes?

Answer 25

El PH altera la carga neta de las proteinas y genera ruptura de los puentes de hidrogeno y repulsion de residuos

Solventes y Detergentes alteran interacciones hidrofobicas y desestabilizan la proteina