Analisis genomicos proteicos: Parte 1 (Recoleccion de muestras y Microarrays) Flashcards

1
Q

Cual es el Nombre del lugar donde se da La recolección, el procesamiento y el almacenamiento de muestras biológicas?

A

Centros de recursos biologicos o muestras biologicas

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Q

Que cosas (9) son importantes conocer antes de hacer una recoleccion de muestras?

A
Objetivos
Analisis de laboratorio para las muestras
Tipo de muestras y cuantas muestras
Volumen de cada muestra
Validacion de todos los procesos
Almacenamiento de las muestras
Logistica de la toma de muestras
Etica del proyecto
Fondos y recursos necesarios
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Q

Cuales son los pasos que se llevan a cabo en un Centro de recursos biologicos?

A

Recoleccion:
- Consentimiento, protocolo, recoleccion y anotacion
Almacenamiento:
- Etiquetado y almacenamitento de datos y muestras
Procesamiento:
- Identificacion y Shiping

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4
Q

Cuales son las muestras mas utilizadas en investigaciones?

A
Sangre y fracciones de sangre
Tejido
Saliva/celulas bucales
Tejdio placentario
Medula osea
Leche materna
Lineas celulares
Cabello 
Uñas
Semen
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Q

Quienes son los especialistas en la recoleccion de sangre? y que instrumento se usa para recolectar la sangre?

A

Flebotomistas

Sistema Becton-Dickenson Vacutainer para su recoleccion

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6
Q

Porque es importante la sincronizacion?

A

Para minimizar el tiempo entre recoleccion, estabilizacion y el procesamiento de la muestra

Como en especimenes provenientes de autopsia

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7
Q

Cuales son las caracteristicas de la recoleccion de saliva o celulas salivales?

A

Celulas Bucales exfoliadas son Excelente fuente de DNA para estudios
La auto-recoleccion es seguro y barato
Enjuague bucal produce mucho DNA y de buena calidad

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8
Q

Como se procesa la Sangre (separacion de fragmentos)?

A

Crioconservacion

  • Preservar linfocitos
  • Usa DMSO (dimetilsulfóxido) como crioprotector
  • Creacion de lineas celulares por la transformacion de Virus de Epstein Barr
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9
Q

Como se porcesan las muestras del enjuague bucal (saliva)?

A

Centrifugacion de suspension celular
Resuspension con tampon
Congelacion para su uso posterior
PCR para identificar DNA humano y bacterial

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10
Q

Como se hace la extraccion de DNA para, sangre, celulas bucales, tejidos frescos y bloques de tejido?

A

Extracción con fenolcloroformo

Se pueden usar otros metodos mejores y mas baratos

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11
Q

Que técnicas se usan para medir la calidad y cantidad de DNA?

A

Absorbancia 260nm y 280nm
Fluorescencia
PCR tiempo real (25 picogramos de DNA)
Electroforesis en Gel

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12
Q

Para que se usa la relacion A260 / A280?

A

Medida aproximada de la pureza del DNA y contaminacion de proteinas

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13
Q

(VERDADERO O FALSO)

EL RNA es mucho mas estable y facil de extraer que el DNA?

A

FALSO

El RNA es mas dificl de extraer y menos estable que el DNA

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14
Q

Que significa Microarrays? y para que sirven?

A

Micro arreglos o Micro matrices

Permiten el deposito de miles de genes o partes de genes en un portaobjetos
Funcionan como detectores moleculares

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15
Q

El uso de Microarrays nos permite…..

A

Tener una vision instantanea de actividad de genomas completos o grupo selectos de genes

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16
Q

Que tecnicas se emplean en los estudios de microarrays?

A

Hibridizacion de acidos nucleicos y deteccion por fluorescencia

Solo los puntos donde se dio la hibridizacion habra fluorescencia
Tambien se usan Northern Blot y RT-PCR

17
Q

Que es un Target y que es un Probe?

A

Target (blanco): Molecula libre

Probe (Sonda): Molecula inmovilizada

18
Q

Cuales son los 4 tipos de Microarrays?

A

Microarray de cDNA
Microarray de Oligonucleotidos
Microarray de Proteinas
Microarray de tejido (TMA)

19
Q

Cuales son las caracteristicas del Microarray de cDNA? y cual es su proceso?

A

Se usa cDNA (complemento para DNA)

    • Purificacion y verificacion de Amplicones
    • Se depositan por capilaridad en portaobjetos por robots
20
Q

Cuales son las caracteristicas de los Microarray de oligonucleotidos?

A

Las sondas dan porciones de DNA sintetico simple y corto

Son presinteizados y depositados en Ink-Jet o DNA chips

21
Q

Cuales son las caracteristicas de Microarray de proteinas? (sondas y blancos)

A

Sondas son anticuerpos fijados en portaobjetos
Blancos son muestras de suero o tejido
Dificil de inmovilizar y crear proteinas 3D

22
Q

Cuales son las caracteristicas de Microarray de tejido?

A

Uso de muestras microscopicas para hacer pruebas de DNA, RNA, proteinas

Resuelve el problema del tamaño de la muestra