Analisis genomicos proteicos: Parte 3 (Interacciones proteina-proteina)

Question 1

VERDADERO O FALSO

La expresion de proteinas es un proceso dinamico

Answer 1

VERDADERO

Question 2

VERDADERO O FALSO

Las proteinas pueden o no activarse o expresarse

Answer 2

VERDADERO

Question 3

VERDADERO O FALSO

El tipo de celula es un factor importante para saber como se expresa una proteina

Answer 3

VERDADERO

Question 4

Cuales son los 6 aspectos importantes para entender la funcion de una proteina?

Answer 4

1. • Secuencia y estructura de la proteina
2. • Historial evolutivo y secuencias conservadas
3. • Perfil de expresion
4. • Modificaciones postraduccionales
5. • Interacciones entre otras proteinas
6. • Localizacion intracelular

Question 5

Cuales son los 2 tipos de interacciones entre proteinas?

Answer 5

Estables
Transitorias
Son interacciones fuerte o debiles

Question 6

Las interacciones estables entre proteinas estan asociadas a….

Answer 6

Estan asociadas a:

- Complejos de multiples subunidades identicas o diferentes

Question 7

Da 2 ejemplos de proteinas con interacciones estables?

Answer 7

Hemoglobina

RNA polimerasa central

Question 8

Que otros enlaces se encargan de unir a las proteinas?

Answer 8

Enlaces hidrofobos
Fuerzas de Van der Waals
Puentes Salinos

Question 9

Que 5 efectos biologicos tendremos por las interacciones proteina-proteina?

Answer 9

1. • Alteracion de propiedades cineticas de enzimas
2. • Canalizacion de sustratos
3. • Creacion de nuevos sitios de union
4. • Inactivacion o destruccion de una proteina
5. • Cambio en la especificidad de una proteina

Question 10

Cuales son los 4 metodos para analizar los tipos de interacciones entre proteinas?

Answer 10

• Co-inmunoprecipitación (co-IP)
• Ensayos pull-down
• Análisis de interacción por crosslinking de proteínas.
• Análisis far-western blot

Question 11

Para que sirve el ensayo de Co-inmunoprecipitación, cual es el cebo y cual es la presa? y para que tipo de interacciones se usa? y que otro componente usa?

Answer 11

• Inmunoprecipitacion de una proteina unica
• Cebo (anticuerpo): Proteina inmunoprecipitada
• Presa (Proteina que se esta buscando): Complejo asociado de union a proteina
• Tambien se usa una molecula magnetica
• En interacciones Estables (fuertes)

Question 12

Cuales son las caracteristicas de los Ensayos Pull-down, y cual es el cebo? y para que interacciones se usa?

Answer 12

• Uso de una Matriz de soporte
• Cebo: Proteina para purificar
• En interacciones Estables
• NO usa anticuerpos

Question 13

Cuales son las caracteristicas del ensayo de Análisis de interacción por crosslinking de proteínas? y para que interacciones se usa?

Answer 13

• Generar o marcar el entrecruzmiento de proteinas y poder unirlas de manera permanente
• Para interacciones debiles (transitorias)
• Se usan pasos extra (lisis celular, purificacion por afinidad, electroforesis o espectrometria)

Question 14

Cuales son las caracteristicas para el ensayo Análisis far-western blot? y para que interacciones se usa?

Answer 14

• NO usa anticuerpo
• Usa proteinas marcadas, cebo y purificada
• Deteccion por incubacion con electroforesis
• Interacciones moderadas

Question 15

Cuales son las caracteristicas del Gel de Poliacrilamida?

Answer 15

• Gel de soporte
• Polimerizacion de Acrilamida + Bisacrilamida
• Mucha poliacrilamida, tamaño del poro disminuido

Question 16

Cuales son los 5 tipos de Cromatografia de proteínas?

Answer 16

Filtracion por gel (tamaño de moleculas)
Filtracion por interaccion hidrofobica
Filtracion por intercambio ionico
Filtracion por afinidad
Filtracion por fase reversa (polaridad)

Question 17

Como funciona Maldi-TOF?

Answer 17

• Analisis de expectrometria de masas
• Ionizacion laser asistida por matriz de absorcion de energia
• Creacion de iones
• El tiempo que tardan en llegar al final es como se analizan