Épigénomique Flashcards
comment méthylation
- transfert covalent grp méthyl de donneur SAM sur C5 de cytosine
- type de novo(DNMT3a/b), maintenance (DNMT1)
qu’est ce que désamination
suit méthylation, transforme 5mc–>T
comment méthylation CpG inhibe transcription
- interfère liaison facteur transcription
- inhibe transcription médié par prot
- structure chromatine inactive
Empreinte parentale
responsable différence fonctionnelle entre génome dans tissus somatiques–> exp limité à une allèle parentale (ICR centre empreinte)
Rôle ARNnc dans empreinte
- miARN lie 3-UTR
-ARNnc action en cis ou en trans (ARN xist)
quelle chromosome ont régions soumises à l’empreinte
6, 7, 11, 14, 15, 20
maladie lié à l’empreinte
1 allèle active selon patron empreinte–> si allèle active est absente ou mutée–> autre peut pas prendre la relève–> maladie
altérations moléculaire dans maladie empreinte
- UDP
- épimutation: 1–> marque aberrante DMR, 2–> mt prod gène nécessaire pour établir/maintenir ADNmet (DNMT)
- mt ponctuelle gène empreinte
–> altère expression génique gène empreinte
-CNV
UDP: recombinaison mitotique
iUDP segmentaire
UDP: recombinaison méiotique
iUDP et hUDP segmentaire
quels gènes subit empreinte
- Ctrl: croissance, différenciation, dev neural et survie
- gènes organisé en cluster
analyse méthylation
- conversion bisulfite
- enzyme restriction sensible méthylation
- Méthylome
- MS-PCR ou MS-MLPA
PWS/AS
- PWS: mat UDP
-AS: pat UDP - 70% délétion (CGH)–> 30% UDP (test méthylation)
Épisignature
-mt dans fct met–> impact pangénomique
- >90 maladie en lien avec machinerie épigénétique (writer,eraser, reader, remodeler)
limites épisignature
- seulement sur sang mais méthylation tissu-dep
- certaines signature ont sensibilité et spécificité réduite
- nouveau-né–>hypométhylation
