Écosystème digestif (exam 1) Flashcards
ensemble
dynamique de micro-organismes organisés en communautés
complexes. Ces micro-organismes interagissent entre eux et avec
l’environnement dans lequel ils vivent (corps humain, sol, eau,
matrice alimentaire, etc.).
Microbiote / écosystème microbien
Nommer des exemples de micro-organismes.
- Bactéries commensales et pathogènes (procaryote)
- Champignons unicellulaires (levures, eucaryote)
- Archaea (procaryote)
- Protozoaires (parasites unicellulaires, eucaryote)
- Virus / bactériophages (acaryote)
Nommer le microbiote le plus vaste du corps.
Microbiote intestinal: le plus peuplé de l’organisme (des milliards) principalement localisé dans l’intestin grêle et le côlon, réparti entre la lumière et le biofilm protecteur formé par le mucus
Nommer plusieurs microbiotes du corps.
- Intestinal
- Cutané
- Buccal
- Respiratoire
- Vaginal
Il y a un gradient … de bactéries qui est en stricte relation avec des paramètres physicochimiques de la physiologie digestive comme la teneur en O2, le pH ou encore la vitesse de transit.
oro-anal (voir image p.8)
Quel type de bactérie retrouve-t-on dans l’intestin grêle?
Bactérie à croissance rapide à cause des sucres simples. Anaérobes facultatives (autant O2 que CO2,N2)
Quel type de bactérie retrouve-t-on dans le côlon?
Bactéries à croissance lente et exigeante en nutriments. Fermentation bactérienne: consomme des nutriments non-digérables (occasionne le CO2)
Comment la couche de mucus se différencie dans le tractus GI? (différenciation transversale du microbiote)
Dans l’intestin grêle, la couche de mucus est fine et des micro-organismes la pénètre facilement.
Dans le côlon, il y a une bi-couche de mucus:
* Une couche externe semi liquide/solide, facilement pénétrable par les micro-organismes;
* Une couche interne, presque impénétrable par les micro-organismes. (voir image p.10)
À la naissance, d’où viennent les micro-organismes dans le tube digestif du nourrisson?
De la maman: dépend du mode d’accouchement, type d’allaitement. Les 1000 premiers jours de vies sont très importants pour maturation du SI. À 3 ans= stable
Voir page 12 évolution du microbiote.
unique à chaque personne
V ou F: À l’âge adulte, la composition du microbiote reste relativement stable jusqu’à la vieillesse
vrai
V ou F: Certains individus peuvent avoir le même microbiote.
Faux
Tout au long de notre vie, le microbiote détient une
certaine … (antibiothérapie, toxi-infection alimentaire, gastroentérite, etc.) qui n’est pas infaillible. En cas de résilience (perturbation), le microbiote peut malgré tout revenir à son état initial sous une période plus ou moins longue selon le statut immunitaire de l’hôte (immunocompétent / immunodéprimé).
capacité de résistance aux perturbations
écologiques
Voir page 15 pour les facteurs influençant le microbiote
médicaments, alimentation, génétique, etc
Quelles sont les 4 principales fonctions du microbiote intestinal et expliquer chacune.
- Métabolique: synthèse/dégradation/transformation
- Barrière/défense: modulation défenses innées, exclusion compétitive pathogènes, immunomodulation
- effets trophiques: sur cellules SI et épithéliales
- neuromodulation: sensibilité viscérale, transit, affections neuropsychiatriques
Qu’est-ce que la fermentation intestinale?
Réaction d’oxydo-réduction en anaérobiose, dégage peu d’énergie, dégradation pour libérer substrat. transformation des bactéries, nutriments, en métabolites secondaires
Quelles sont les fonctions des produits de la fermentation?
✓ Provision d’énergie pour l’organisme,
✓ Réduire la charge osmotique colique (et donc le
risque de diarrhée),
✓ Nourrit les colonocytes
(fonctions métaboliques)
V ou F: Un microbiote intestinal déséquilibré peut entrainer certains troubles. (voir page 18/19)
Vrai:
Perturbations gastro-intestinales (dysbiose)
(diarrhée voyageur, maladies chroniques, etc)
Perturbations extra-intestinales
(obésité, allergies, infections vaginales/urinaires, etc)
Quelles sont les 4 types de modulations thérapeutiques?
Antibiotiques (infections Tx)
Prébiotiques (substrat pour microorganismes)
Probiotiques (microorganismes vivants)
Psychobiotiques (pro et prébiotiques)
Il s’agit de la transplantation de microbiote fécal qui consiste à insérer les selles d’un donneur sain dans un receveur afin de rétablir un microbiote non sain.
Fécothérapie
V ou F: Les médicaments peuvent modifier la composition du
microbiote et les bactéries intestinales peuvent
influencer l’efficacité et la dynamique d’absorption de
ces médicaments.
Vrai, page 23
discipline
émergente regroupant les domaines de la
génomique microbienne, de la pharmacologie et de
la microbiologie cherche à comprendre comment
les variations inter-individuelles dans le microbiote
façonnent l’efficacité de réponses aux médicaments
et leurs possibles effets secondaires.
Pharmacomicrobiomique
ex de Médicaments avec interactions: antidiabétiques, IPP
Les modèles ….
* sont une alternative intéressante…
* peuvent être utilisés en complémentarité…
… à l’expérimentation animale et/ou aux études
cliniques humaines, à condition que la pertinence de
ces outils soit du niveau de celle des expériences faites
chez l’Homme ou l’animal.
in-vitro
2 avantages des modèles in-vitro?
Se rapprocher de la physiologie digestive humaine
Validation scientifiques corrélant avec résultats in vivo
Quels sont les 3 champs de recherches in vitro en microbiologie-santé?
microbiologie, pharmacologie et toxicologie, nutrition
Modèle qui reproduit les principaux paramètres
physicochimiques de la partie haute
du tractus digestif de l’Homme
Température, pH, Temps de transit, Péristaltisme
Absorption, passive, Sécrétions digestives
Le TIM-1
Modèle qui reproduit de façon successive
l’estomac, l’intestin grêle en une
seule partie ainsi que les trois
régions du côlon.
Le SHIME (« Simulator of the Human Intestinal
Microbial Ecosystem”)
Permet de distinguer les bactéries qui colonisent , couche de mucus, celles qui restent dans le lumen
