DNA Profil Flashcards
hva er viktige punkter man må ha med seg for å lykkes i en PCR?
• Primerdesign er viktig for PCR • Sammensetning av basene – Unngå at primerne har komplementære sekvenser (primerdimere) – Unngå indre homologi (”loop”-dannelse) • Magnesium må tilpasses hver PCR reaksjon
hvorfor er magnesium viktig i en PCR?
• Magnesium viktig for bl.a. aktiviteten av
DNA-polymerasen
• Magnesium stabiliserer primer-templat
binding
hva skjer hvis man har for høy konsentrasjon av magnesium?
• Jo høyere kons. av
magnesium, jo større
sjanse for uspesifikke
PCR-produkter
• For mye magnesium kan også binde opp nukleotidene, så da blir det for lite nukleotider for å danne dna tråder
hva kan skje hvis man har for lav eller for høy temperatur i en PCR?
- For lav temperatur kan føre til flere uspesifikke PCR-produkter siden primerne da for sjansen til å binde seg til flere gener i dna tråden
- Ved for høy temperatur vil ikke primerne kunne binde seg til noen del av dna tråden og det vil ikke kunne skje noen PCR
hva er forskjellen multiplex PCR og andre typer PCR?
i Multiplex PCR har man flere primerpar i samme rør. man kan derfor kopiere flere dna sekvenser i samme rør
hva står STR for? og hvorfor er det viktig i dna profilering?
STR = Short Tandem Repeats
I noen områder varierer antallet av den repeterte enheten i et bestemt locus fraperson til person. Denne genetiske forskjellen benyttes
til å lage DNA profile
hvordan kan man vha elektroforese om et gen er fra en kvinne eller mann?
det finnes visse gener som er kortere hos det ene kjønne sammenlignet med det andre.
eks: amelogenin ; gen som koder for et protein som er viktig i utviklingen av tannemalje.
Kan benyttes i kjønnsbestemmelse da exon 1 i dette genet er 6 nt kortere på X-kromosomet i forhold til Y-kromosomet. det vil si at om man får to bånd på ved PCR av dette genet så har man en mann, er det et bånd er det en kvinne