Diagnóstico Molecular para Microorganismos Flashcards
Representación de alelos en forma de picos después de una separación por electroforesis. Constituye al primer paso del análisis de las secuencias.
A. Isoelectroenfoque.
B. Electroferograma.
C. PCR.
D. Electroforesis capilar.
Electroferograma
En un electroferograma la letra w a qué nucleótidos representa.
W (AA)
W (AT)
W (CT)
W (UT)
W (AT)
En presencia de alguna indeterminación de nucléotidos. ¿Qué representa la letra y?.
Y (Purinas)
Y(Pirimidinas)
Y (Timinas)
Y (Adeninas)
Y(Pirimidinas)
Base de datos que te permite conocer el porcentaje de homología de diferentes organismos con tú secuencia.
KEGG
Blast
BRENDA
EXPASY
Blast
Según las guías de Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), ¿qué porcentaje de homología es adecuado para poder definir género?
<90%
>90% a <95%
<99%
≥95% al 98.49%
≥95% al 98.49%
Gen más adecuado para la definición y discriminación filogenética a nivel de especies y subespecies.
RNAr 16s
RNAr 23s
rpoB
rpoA
rpoB
En la identificación de microorganismos por medio del gen rpoB, ¿Cuál es el porcentaje de similitud para definir especie?
<95%
100%
90%
>97.7%
> 97.7%
Algoritmos utilizados para realizar dendogramas genéticos.
NJ(neighborjoining), KEGG
NJ(neighborjoining), UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic averages)
UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic averages), BRENDA.
BRENDA, KEGG, CLUSTAL W
NJ(neighborjoining), UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic averages)
Número de pares de bases adecuado para analizar ARNr 16s
1000 pb
2000 pb
>2500 pb
1.300 a 1.500 pb
1.300 a 1.500 pb
Secuencias que representan <1% de indeterminaciones, ¿Se consideran para el análisis?
Si
Si
Es la identificación bacteriana más certera, sólida y reproducible proporcionada por un análisis, con una resolución aproximada del 90% en las identificaciones:
ARNr 16S
ARNr 16S
Recientemente la aparición de esta técnica identifica de forma temprana a algunos agentes etiológicos bacterianos y fúngicos de la sepsis a partir de la muestra directa:
PCR multiplex acoplada a un analisis de la temperatura de melting
PCR multiplex acoplada a un analisis de la temperatura de melting
La Pirosecuenciación ó la espectrofotometría de masas son plataformas de identificación de patógenos que modifican o sustituyen la secuenciación tradicional?
Cierto
Cierto
Plataformas de amplificación-pirosecuenciación realizan la identificación bacteriana o fúngica mediante PCR de:
3 regiones variables del ARNr 16S y del ARNr 18S, respectivamente en hemocultivos
3 regiones variables del ARNr 16S y del ARNr 18S, respectivamente en hemocultivos
Cuál de las siguientes opciones no representa una ventaja para los métodos moleculares de identificación bacteriana basados en PCR-ESI/MS:
Requiere conocer con anticipación el producto analizado
Requiere conocer con anticipación el producto analizado
