3. FITOPATOLOGÍA (PLANTAS) Flashcards
Tipo de diagnóstico que consta del análisis de organismos patógenos de frutos, plantas y semillas utilizando protocolos apegados a normativas tanto nacionales como internacionales.
Diagnóstico normativo.
Tipo de diagnóstico que consta del análisis genético utilizando técnicas como PCR y secuenciación.
Diagnóstico absoluto.
Tipo de diagnóstico que consta de la identificación de cepas o subespecies de microorganismos fitopatógenos en frutos, plantas y semillas.
Diagnóstico específico.
Constan de ensayos de patogenicidad de microorganismos y ensayos de resistencia a patógenos en plantas
Bioensayos
Es el tipo de taxonomía que surge a partir de la identificación genética y fitogeografía de organismos patógenos y de su uso en la agricultura.
Taxonomía molecular.
Taxonomía que permite la identificación de todos los microorganismos presentes en una muestra compleja de suelo, planta o cultivo.
Taxonomía mediante metagenómica “barcoding”
Gen que permite la identificación de phytoplasma
Gen del factor de elongación tu (tuf)
Gen que permite la identificación de Xanthomonas, Pseudomonas yXylella
Factor de iniciación de replicación DnaA (RIF)
ITS que está entre el 5.8S y 26S rRNA en plantas
ITS2
ITS que se origina como producto de una inserción que interrumpió el gen 23S rRNA ancestral
ITS2
Cuáles son las características que hacen favorable el uso de las secuencias ITS?
- Son secuencias de pequeño tamaño
2. Son secuencias altamente conservadas
Cuál es el taxón usado para un marcador molecular 16S RNA
Bacteria y Archeas en general
El taxón de Buchnera se emplea en este tipo de marcadoress moleculares en plantas:
Chaperonina 60kDa (Cpn60), Chaperonina tipo II (ortólogo de Cpn60) y Gen gluconato-6-fosfato deshidrogenasa (gnd)
En los seres humanos que porcentaje comprenden las regiones intergénicas?
75% Genoma, 15% Bacterias y 30% Levaduras
Entre que genes se encuentra el ITS en bacterias y arqueas?
16s y 23s rRNA
Son los tipos de ITS en eucariotas:
ITS1 Y ITS2
Entre qué genes se encuentra situado el ITS2 en animales?
5.8s - 28s
Es la especialidad de los marcadores ITS:
Elucidar las relacioness filogenéticas entre algunos taxones
Secuencia de región ampliamente utilizada en taxonomía y filogenia molecular debido a sus propiedades favorables:
ITS
Es una ventaja de utilizar el diagnóstico molecular ITS:
Facil de detectar incluso a partir de pequeñas cantidades de ADN, debido al alto número de copias de los grupos de ARNr
El siguiente enunciado es cierto o falsos. Las secuencias de ITS se conservan independientemente de la evolución de la historia de vida en las plantas
Cierto
¿A qué se puede atribuir el alto grado de variación de las regiones ITS entre especies que están estrechamente relacionadas?
Debido a la presión evolutiva que actúa sobre las regiones separadoras no funcionales.
Menciona 5 grupos taxonómicos que han sido identificados utilizando los marcadores de ITS:
Compositae; Arceuthobium; Zea; Medicago; Diseae; Calopteryx; Plantago; Herbetus; Tsuga; Potamogeton.
Cuáles son los servicios de baja demanda para el diagnostico molecular de plantas?
PCR, qPCR, análisis genético y proteómico, técnicas de ingeniería genética DNA recombinante y diseño de m.o. para biocontrol
Pretendes identificar una bacteria fitopatógena del Phylum Actinobacteria, ¿Cómo debe de verse su tinción Gram?
a) positiva (azul)
b) negativa (azul)
c) positiva (rosa)
d) negativa (rosa)
a) positiva (azul)
Una vez conociendo la tinción de Gram para la identificación de una bacteria fitopatógena y pretendes diferenciarla mediante sus propiedades fisicoquímicas, ¿cuáles son esas propiedades a identificar?
La composición de la pared celular, la producción de enzimas y la utilización diferencial de sustratos.