3. FITOPATOLOGÍA (PLANTAS) Flashcards
Tipo de diagnóstico que consta del análisis de organismos patógenos de frutos, plantas y semillas utilizando protocolos apegados a normativas tanto nacionales como internacionales.
Diagnóstico normativo.
Tipo de diagnóstico que consta del análisis genético utilizando técnicas como PCR y secuenciación.
Diagnóstico absoluto.
Tipo de diagnóstico que consta de la identificación de cepas o subespecies de microorganismos fitopatógenos en frutos, plantas y semillas.
Diagnóstico específico.
Constan de ensayos de patogenicidad de microorganismos y ensayos de resistencia a patógenos en plantas
Bioensayos
Es el tipo de taxonomía que surge a partir de la identificación genética y fitogeografía de organismos patógenos y de su uso en la agricultura.
Taxonomía molecular.
Taxonomía que permite la identificación de todos los microorganismos presentes en una muestra compleja de suelo, planta o cultivo.
Taxonomía mediante metagenómica “barcoding”
Gen que permite la identificación de phytoplasma
Gen del factor de elongación tu (tuf)
Gen que permite la identificación de Xanthomonas, Pseudomonas yXylella
Factor de iniciación de replicación DnaA (RIF)
ITS que está entre el 5.8S y 26S rRNA en plantas
ITS2
ITS que se origina como producto de una inserción que interrumpió el gen 23S rRNA ancestral
ITS2
Cuáles son las características que hacen favorable el uso de las secuencias ITS?
- Son secuencias de pequeño tamaño
2. Son secuencias altamente conservadas
Cuál es el taxón usado para un marcador molecular 16S RNA
Bacteria y Archeas en general
El taxón de Buchnera se emplea en este tipo de marcadoress moleculares en plantas:
Chaperonina 60kDa (Cpn60), Chaperonina tipo II (ortólogo de Cpn60) y Gen gluconato-6-fosfato deshidrogenasa (gnd)
En los seres humanos que porcentaje comprenden las regiones intergénicas?
75% Genoma, 15% Bacterias y 30% Levaduras
Entre que genes se encuentra el ITS en bacterias y arqueas?
16s y 23s rRNA
Son los tipos de ITS en eucariotas:
ITS1 Y ITS2
Entre qué genes se encuentra situado el ITS2 en animales?
5.8s - 28s
Es la especialidad de los marcadores ITS:
Elucidar las relacioness filogenéticas entre algunos taxones
Secuencia de región ampliamente utilizada en taxonomía y filogenia molecular debido a sus propiedades favorables:
ITS
Es una ventaja de utilizar el diagnóstico molecular ITS:
Facil de detectar incluso a partir de pequeñas cantidades de ADN, debido al alto número de copias de los grupos de ARNr
El siguiente enunciado es cierto o falsos. Las secuencias de ITS se conservan independientemente de la evolución de la historia de vida en las plantas
Cierto
¿A qué se puede atribuir el alto grado de variación de las regiones ITS entre especies que están estrechamente relacionadas?
Debido a la presión evolutiva que actúa sobre las regiones separadoras no funcionales.
Menciona 5 grupos taxonómicos que han sido identificados utilizando los marcadores de ITS:
Compositae; Arceuthobium; Zea; Medicago; Diseae; Calopteryx; Plantago; Herbetus; Tsuga; Potamogeton.
Cuáles son los servicios de baja demanda para el diagnostico molecular de plantas?
PCR, qPCR, análisis genético y proteómico, técnicas de ingeniería genética DNA recombinante y diseño de m.o. para biocontrol
Pretendes identificar una bacteria fitopatógena del Phylum Actinobacteria, ¿Cómo debe de verse su tinción Gram?
a) positiva (azul)
b) negativa (azul)
c) positiva (rosa)
d) negativa (rosa)
a) positiva (azul)
Una vez conociendo la tinción de Gram para la identificación de una bacteria fitopatógena y pretendes diferenciarla mediante sus propiedades fisicoquímicas, ¿cuáles son esas propiedades a identificar?
La composición de la pared celular, la producción de enzimas y la utilización diferencial de sustratos.
Están codificados por una fragmento del cromosoma bacteriano altamente conservada y representa sólo una pequeña parte del genoma:
a) Ribosomas
b) RNA 16s
c) secuencias ITS
A) Ribosomas
Motivo por el cual es más difícil el aislamiento de patógenos de plantas
Los patógenos vegetales generalmente crecen más lentamente que las bacterias no patógenas aisladas de plantas
Tipos de medios de cultivo que pueden ser utilizados para aislar organismos patógenos
a) simple
b) diferencial
c) complejo
d) específico
e) pruebas bioquímicas
a y c: simple y complejo
Métodos indirectos con los que se puede identificar mi.o patógenos en plantas
Por pigmentos bacterianos en las semillas y por el olor producido durante el cultivo bacteriano.
En condiciones naturales, la transferencia horizontal de material genetico es considerada responsable de mucha de la variación genética entre cepas de una especie
Verdadero
Falso
Verdadero
Químico utilizado para provocar la lisis celular
Conmitomicina C.
La podredumbre blanda bacteriana del melón es causada por
Erwinia carotovora
El marchitamiento bacteriano del melón es causado por
Erwinia tracheiphila
Las pruebas fisiológicas y/o moleculares no son base para el diagnostico de las enfermedades causadas por bacterias no fastidiosas
Verdadero
Falso
Falso
Es un género de bacterias acuáticas que forman un polimero extracelular que permite la agregación
Zooglea
Concentración de bacterias en lesiones de plantas muy infectadas
10^8 o 10^9 UFC/gr
Forma simple de determinar si la enfermedad de la planta es causada por una bacteria
Cortar la lesión típica o zona decolorada cerca de tejido sano y suspenderla en una gota de agua en el portaobjetos
Reacción que la mayoría de los patógenos vegetales pueden inducir en plantas no hospedantes
Reacción de hipersensibilidad
La HR es un mecanismo de defensa de plantas no hospedentes en respuesta a la presencia de un patógeno
Verdadero
Falso
Verdadero
La HR no limita efectivamente la dispersión de la infección
Verdadero
Falso
Falso
¿Cómo se realiza una prueba de sensibilidad?
Se introduce en una suspensión acuosa del cultivo puro con 10^8 UFC/ml en una hoja de planta no hospedante
¿Para que son utilizada las pruebas de hipersensibilidad?
Para determinar si una colonia asilada de un tejido vegetal infectado de es un patógeno
Que es provocado por la sensibilidad del tejido a un patógeno
La muerte rápida de las células vegetales atrapando al patógeno
La prueba de microscopio en la que se ve fluir la corriente bacteriana puede ser utlizada para todas las infecciones bacterianas
Verdadero
Falso
Falso
Ciencia que ayuda a comprender la gran diversidad de organismos existentes es preciso agruparlos y organizar los grupos generales en una estructura jerárquica sin superposiciones.
Taxonomía
Partes en las que se descompone la taxonomía:
Clasificación, nomenclatura e identificación.
Parte de la taxonomía que se encarga de la estructuración de los organismos en grupos o taxones en función a sus semejanza o parentesco evolutivo.
Clasificación
Rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos.
Nomenclatura
Parte de la taxonomía que consiste en establecer que un organismo determinado pertenece a un taxón reconocido
Identificación
Polisacárido producido por la bacteria Xanthomonas campestris , utilizado para la producción de alimentos, agricultura, cosméticos y farmacia:
Goma de Xantán
- Diversas bacterias asociadas a plantas producen este tipo de enzimas, que pueden ser utilizadas en el área de la investigación científica para cortar ADN de forma específica.
Endonucleasas de restricción
Bacteria capaz de infectar plantas introduciéndoles un plásmido que las modifica genéticamente provocando el crecimiento de tumores.
Agrobacterium tumefaciens
¿Actualmente existen pruebas fisiológicas y serológicas ligadas a enzimas que están disponibles comercialmente para pocas bacterias comunes?
Verdadero
La mayoría de las bacterias fitopatógenas son anaeróbicas:
Falso
Razón por la cual es utilizado el tabaco para pruebas de hipersensibilidad
Las hojas tienen espacios internervales grandes que se pueden infiltrar fácilmente
El colapso dentro de las primeras _______ del tejido vegetal indica que la bacteria sea un patógeno de otro hospedante
48hrs
Bacteria de la cual es derivada la goma xantán
Xanthomonas campestris
Principales funciones de la goma xantán
espesante y gelificante
La utilización de vectores de Agrobacterium tumefaciens es la peor forma de realizar la transformación de las plantas
Falso
Bacterias que no se pueden cultivar
Fastidious Vascular
Colonizing Bacteria
La toxicidad anual de raigrás es el envenenamiento del ganado por la toxina contenida en..
el Lolium rigidum infectado
El diagnóstico de las enfermedades causadas por bacterias no fastidiosas se basa en
La presencia de síntomas característicos
El aislamiento del presunto agente infeccioso
Pruebas fisiológicas y/o moleculares
Hongo que causo la pudrición blanca o clara en el corazón de los troncos, ramas y raíces de los enzinos
Phellinus robustus
Este microorganismo causa el amarillamiento , marchitamineto y caída de las hojas, muerte descendente y finalmente muerte del árbol
hypoxylon thouarsianum
