Marcadores moleculares Flashcards
Microsatélites son…
Secuencias simples repetidas de 1 a 4 pares de bases tanto en regiones codificantes como no codificantes.
Los AFLPs no requieren ninguna información previa de la secuencia
Verdadero
La técnica de RFLPs se puede utilizar con Western blot y PCR.
Falso
Esta técnica utiliza un primer di o trinucleotido repetido. Se ha utilizado para variación poblacional.
ISSR
Se caracteriza esta técnica, debido a que genera bandas erróneas en los geles, dando por consecuencia que alelos raros no sean detectados como también una mala interpretación de los resultados.
RAPDs
La hibridización de un microarreglo no difiere significativamente de las condiciones que comúnmente se utilizan para un experimento tipo Southern blot o Norther blot.
Verdadero.
¿En qué técnica se utiliza un láser para excitar las moléculas fluorescentes unidas al cDNA y poder obtener la imagen de cada una de las muestras ?
Microarreglo.
Son unas de las características que deben reunir los marcadores moleculares
Alto grado de polimorfismo, herencia codominante, distribución frecuente y uniforme en todo el genoma.
Las ventajas de este técnica son su simplicidad y bajo costo, aunque tiene el inconveniente de ser un marcador de tipo dominante, es decir, no es posible discernir sobre la heterocigocidad de los loci observados.
RAPDs
El polimorfismo de los microsatélites se basa en la variación en el número de repeticiones en tándem de los alelos de un locus
Verdadero
Los microarreglos se colocan en ______________ para tener cuidado con la evaporación de los reactivos.
Cámara húmeda
En el sistema de marcadores dominantes, dado 2 alelos M y m para un locus particular, si M es el alelo amplificable «dominante» y m es el alelo nulo «no amplificable», los genotipos ___ y ___ mostrarían bandas, mientras que el genotipo ___ no se mostraría.
MM, Mm y mm.
Los ____ son variaciones en nucleótidos únicos que no cambian la longitud total de la secuencia de ADN en la región. Son muy abundantes en el genoma humano, a razón de un ___ por cada 1 000 pares de bases.
SNP
Al ser marcadores bialélicos, los SNP poseen un contenido de información bastante alto, y hay que usar muchos para llegar al nivel de información obtenido a partir de un panel estándar de 30 loci de microsatélites.
Falso
Son variantes de una misma enzima (son formas funcionalmente similares de enzimas), que comparten un sustrato en común pero difieren en su movilidad electroforética.
Isoenzimas
Son unas de las isoenzimas frecuentemente empleadas en la caracterización de plantas
Fosfoglucomutasa, glutamato oxaloacetato transmitasa, y peroxidasas
En la técnica de microarreglo, para realizar las sondas marcadas se debe utilizar ARN marcado fluorescentemente para indicar la hibridación de la secuencia.
Falso
Técnica que es esencialmente la combinación de una digestión con enzimas de restricción y de amplificación por PCR.
AFLPs
Para fijar el ADN en el soporte de un microarreglo se debe..
Poner los microarreglos a 80°C por cuatro horas o con un entrecruzador de luz ultravioleta.
Los SNPs, a diferencia de otro tipo de marcadores como los microsatelitales, presentan una tasa mayor de mutación por lo que no son de ayuda en estudios de genética de poblaciones.
Falso
Ocurre un cambio de color durante la prueba ELISA:
Cuando la proteína de interés o antígeno está presente en la muestra.
¿La prueba de ELISA es uno de los más sensibles inmunoensayos que existen?
Verdadero.
¿Cuántas variaciones de la prueba ELISA existen?
3, ELISA directa, ELISA indirecta y ELISA tipo sándwich.
Dos aplicaciones de los RFLP:
Filogenética y fingerprinting.
Ventajas de los RFLP:
Alta reproducibilidad, muestra de alelos codominantes, detecta la fase de acoplamiento del ADN, es un marcador confiable.
Desventajas de los RFLP:
Se requieren altas cantidades de ADN, es un proceso muy laborioso, costoso.
Los productos amplificados mediante está técnica se separan en gel de agarosa en presencia de EtBr y se observan bajo luz UV.
RAPD
Ventajas de los RAPD:
Barato, rápido y fácil de analizar, se requieren bajas cantidades de ADN molde.
Aplicaciones de los RAPD:
Mapas genéticos e identificación de individuos.
En está técnica los polimorfismos se detectan a partir de diferencias en la longitud de los fragmentos amplificados mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE):
AFLP
Esta técnica también es conocida como chips de ADN o Biochips:
Microarreglos.
Aplicaciones de los microarreglos:
Medicina, industria, medio ambiente, agricultura y comercio.
Algunas ventajas de los marcadores moleculares son:
Alta reproducibilidad, facilidad del intercambio de datos entre laboratorios, desarrollo a un costo razonable, fácil y rápido, detectan altos niveles de polimorfismos.
Tipos de células y organismos que se pueden observar bajo un microscopio electrónico:
Células cancerosas, virus y estructuras fúngicas completas.
Los síndromes se se puede identificar visualmente mediante la realización de un:
Cariotipo.
Desventajas de los AFLP:
Se requieren muchos pasos, se requiere de purificación .
¿Cuantas PCR se realizan en un AFLP?
2
¿Las isoenzimas son marcadores moleculares?
Verdadero.
¿Qué elemento debe llevar forzosamente un RFLP?
Enzimas de restricción .
¿Cuál es la principal razón a favor de utilizar marcadores moleculares?
Que son universales
El ____ es aquel que se encuentra empaquetado y asociado a proteínas histonas, conformando los cromosomas.
ADN nuclear
Es el ADN que existe solo en los organismos fotosintéticos. Típicamente
bacteriano circular, de 120 a 200 kb, con intrones y exones que se considera muy conservado.
ADN de cloroplasto (cLADN)
Son definidas como formas moleculares múltiples de las enzimas que tienen funciones idénticas o similares y están presentes en el mismo individuo.
Isoenzimas
Los _____ han tomado ventaja sobre otros marcadores genéticos debido a que tienen el más alto grado de polimorfismos y son codominantes.
Microsatélites
Marcador molecular conocido como secuencias repetidas intersimples.
ISSR
Los dos métodos que se utilizan en la electroforesis para ISSR son:
Gel gel de agarosa visualizado con bromuro de etidio, y geles de acrilamida teñidos con nitrato de plata.
Una de las ventajas de los ISSR es que:
Tienen un gran número de bandas polimórficas
Una desventaja de los ISSR es que:
Las bandas son leídas como marcadores dominantes, es decir cuando tenemos la presencia de la
banda no se sabe si el individuo es homocigoto dominante o herocigoto.
Fue el primer marcador de ADN utilizado por biólogos poblacionales
RFLP
