Diagnóstico molecular en cancer Flashcards
¿Cuántos genes de cáncer se conocen?
400
¿Cuáles son los tipos de mutaciones qué existen?
Cromosómica, Epigenetica y Molecular
Son los cambios reversibles del DNA que conllevan modulaciones en la expresión de los genes
Mutaciones epigenéticas
¿Qué sucede cuando el cambio de un nucleótido no conlleva a un cambio de aa?
Se da un polimorfismo, la proteina resultante no sufre ningún cambio
Poseen las secuencias consenso responsables de la maduración del mRNA
Intrones
¿Por qué una mutación intrónica afecta al mRNA?
Porque un cambio de nucleotido daria un mal splicing, afectando al mRNA
¿Qué usaría para detectar una mutación (De forma económica) que se encuentra en la diana de una endonucleasa?
Digestion del producto de PCR, posterior electroforesis
¿Cómo se denomina al estudio del conjunto de mutaciones que puede tener un gen?
Screening de mutaciones
¿Qué es indispensable para poder realizar el screening de un gen?
Conocer la estructura exon-intrón del mismo
¿Qué técnica puede ser empleada para el análisis de mutaciones en un gen desconocido?
El polimorfismo de conformacion de cadena individual de ADN (SSCP)
¿Cómo se puede abordar el estudio de un gen de gran tamaño además de secuenciación?
Mediante análisis de heterodúplex utilizando técnicas como SSCS o DHPLC.
¿En qué se basa el método del SSCP?
Se basa en que bajo condiciones no desnaturalizantes una hebra individual de ADN adopta una conformación espacial específica.
¿Qué ocurre posterior a la amplificación de PCR en el método SSCP?
Se realiza una desnaturalización de dichos fragmentos una renaturalización de las hebras de ADN progresiva y lenta.
Verdadero o Falso. Los heterodúplex, son térmicamente igual de estables que su correspondiente homodúplex.
Falso
¿Cuántas secuencias pueden ser amplificadas simultáneamente en el método de MLPA?
Hasta 40
¿Qué se requiere para llevar a cabo la técnica de MLPA?
Un termociclador y un sistema de electroforesis capilar
¿En que consisten las MLPA probes?
En la sonda oligonucleotido izquierda(LPO) y la sonda oligonucleotido derecha(RPO)
Verdadero o Falso. La amplificación es de las sondas de MLPA, no de las muestra de ADN.
Verdadero
¿Cuál de las siguientes opciones es uno de los portales donde encontramos secuencias de cDNA únicas para cada gen es la base de datos mutaciones genéticas humanas?
The Human Gene Mutation Database
¿En cuales casos se requiere utilizar RT-PCR para analizar la mutacion de un gen conocido?
Cuando se trata de una mutación que afecta a una secuencia consenso para el splicing de un intrón concreto.
¿Cómo se pueden detectar las mutaciones en genes desconocidos?
Utilizando microarreglos o secuenciación masiva
Herramienta estándar para la identificación de la huella genética de las diversas formas de cáncer
Los análisis de expresión mediante microarrays de expresión
¿En que esta basada la secuenciación masiva?
En secuenciación por clusters: pirosecuenciación o ligación
¿Cuál es la mayor limitación de la secuenciación masiva?
Precio del equipamiento y de la reacción
Verdadero o Falso. Los diferentes tipos de cáncer representan un grupo homogéneo de tumores, tanto en su comportamiento clínico como pronóstico.
Falso
¿A qué se refiere la clasificación intrínseca?
Correspondencia entre patrones de expresión genética creados por microarreglos de DNA y patrones fenotípicos/biológicos que provee un sistema de taxonomía molecular.
¿Cuándo se dice que el cáncer de mama es positivo para ER/EP?
Son positivos cuando se expresan con tinción nuclear +1%.
¿Que reactivo transforma las citosinas no metiladas en uracilos en la técnica MSP?
bisulfito sódico
¿Cuál técnica combina la conversión del ADN por el bisulfito y la digestión con enzimas de restricción que reconoce las secuencias modificadas?
Cobra
Técnica en la que se utilizan un set de sondas para la detección de metilación que contienen un sitio de restricción de la enzima endonucleasa HhaI, sensible a la metilación.
MS-MLPA
