daugiaveiksnis paveldimumas ir poligeninis paveldimumas Flashcards
9 paskaita
Francis Galton
daugiaveiksmio paveldėjimo teorijų pradininkas
RA Fisher, statistikas ir genetikas
įrodė, kad daugelio nepriklausomų Mendelio būdais paveldėtų veiksnių sąveiką apsprendžia kiekybines paveldimas žmogaus savybes bei šeimines korealiacijas
arba kitaip
Mendelio būdais paveldėtų nepriklausomų veiksnių sąveika sudaro kiekybinius žmogaus požymius
DS Falconer
poligeninę paveldėjimo teoriją pritaikė daugiaveiksniams dichotominiams požymiams, apibrėždamas slenkstinę teoriją
slenkstinė teorija - koki yra požymiai?
dichotominis kokybinis požymis - liga yra arba nėra, slenkstis “peržengtas” arba ne 100%
kiekybiniai požymiai - polinkis ligai, pozymiai, kuriu skaitine reiksme gali buti isdestyta tam tikrove kreiveje pvz. ūgis, odos spalva ir kt.
kiekybiniai požymiai
jie yra paveldimi, pvz. IQ, ūgis, odos spalva ir pnš.
Paaiškink polinkį ligai
jis gali būti mažas arba didelis: polinkis ligai yra naudojamas iki tol, kol nėra peržengiama slenkstinė vertė, t.y. iki susirgimo trūksta tam tikrų veiksnių, pvz. aplinkos veiksnių, kurie padėtų peržengti slenktinę vertę ir asmuo būtų sergantis
daugiaveiksnės ligos - kokybinis požymis, o pvz. esantis genas bus ….?
liga yra kokybinis požymis, o ligą sudarančių veiksnių sąrašas bus nebūtini ir nepakankami požymiai.
kaip populiacijoje pasiskirsto kiekybiniai pozymiai?
jo skaitines reiksmes galima isdestyti kokioje nors skaleje
monogeninis požymis/liga
genetinio veiksnio poveikis fenotipui didelis (butinas ir pakankamas)
daugiaveiksnis požymis/liga
genetinio veiksnio poveikis fenotipui mazas (nebutinas ir nepakankamas)
fenilketonurija (FKU)
tai monogeninė liga (PHA geno bialelinė mutacija), paveldima autosominiu recesyviniu budu
simptomai gali skirtis, nes jie yra daugiaveiksniai požymiai (IQ, mikrocefalija ir pnš.)
koronarinė širdies liga
daugiaveiksnė liga, kuria sukelti gali įvairus įvairus genetiniai ir aplinkos veiksniai.
šeiminė hipercholesterolemija yra monogeninė, AD būdu paveldima liga dėl LDLR geno mutacijos - didelis chol. kiekis. Ligos požymiai - koronarinė širdies liga ir didelis chol. kiekis serume
slenkstinė teorija taikoma:
poligeninės teorijos taikymas dichotominiams požymiams
paveldimumas
tai pozymio ivairoves dalis, priklausoma nuo genetiniu veiksniu.
Dvynių konkordantiškumo tyrimas
MZ dvyniai įrodo, kad genetiniai veiksniai turi įtakos ligai vystytis, nes jeigu neturetu, tai MZ ir DZ dvyniu konkordantiskumas butu vienodas.
migrantu tyrimai
Jei migrantų tarpe laikui bėgant ligos dažnis pasikeičia, tai rodo didesnę aplinkos veiksnių svarbą, jei nepasikeičia – didesnę genetinių veiksnių svarbą.
daugiaveiksniu ligu grupes
letines infekcines ligos (koronarine sirdies liga) ir izoliuotos raidos ydos (igimtos sirdies ligos)
kaip nustatyti, kad tai daugiaveiksne liga?
- Ligos perdavimas šeimoje neatitinka jokių monogeninių paveldėjimo būdų.
- Ligos dažnis giminaičių tarpe didesnis, nei bendroje populiacijoje.
- Rizika ryškiai sumažėja, tolstant giminystės laipsniui: didžiausia rizika sergančiojo pirmos eilės giminaičiams (sibsams ir tėvams/vaikams), kiek padidėjusi – antros eilės giminaičiams, o trečios eilės giminaičiams rizika beveik tokia pati, kaip ir bendroje populiacijoje.
- Kuo daugiau sergančiųjų šeimoje, tuo didesnė rizika.
- Kuo sunkesnė liga, tuo didesnė rizika.
- Jei ligos dažnis lytims nevienodas, rizika didesnė tos lyties sergančiojo giminaičiams, kurioje ligos dažnis mažesnis.
- Rizika sibsams ir tėvams/vaikams panaši, rizika numatoma pirmos eilės giminaičiams.
- Rizikos dydis priklauso nuo rizikos bendroje populiacijoje: kuo didesnė bendrapopuliacinė rizika, tuo didesnė rizika giminaičių tarpe.
- Rizika didesnė giminingose santuokose ir populiacijose su dideliu inbrydingo koeficientu.
asociaciniai tyrimai
tiriamas tik alelio dažnis tarp sergančių ir sveikų ir tuomet “spėjamai” manoma, kad alelis yra patogeninis arba ne.
Viso genomo asociaciniai tyrimai
tyrimu nustatomi tik dažni genetiniai veiksniai - tie, kurių retesniojo alelio dažnis MAF yra > 5%
genetinės architektūros ir paveldimumo skirtumai
genetinė architektūra siekia paaiškinti viso genetinio ligos komponento struktūrą ir funkcijas, tuo tarpu paveldimumas tik nurodo, kokia dalis veiksnių galėtų būti genetiniai.
Viso egzomo sekoskaitos tyrimas
galima nustatyti ir mažo, ir didelio poveikio retus alelius, tačiau VES tyrimu tiriama tik koduojanti genomo dalis (ypac tinka monogeniniu ligu priezasciu nustatymui)
Viso genomo sekoskaitos tyrimas
išsamiausias genetinis tyrimas, tiriama visa genomo seka, ir koduojanti, ir nekoduojanti, tačiau mes dar labai mažai žinome apie nekoduojančios genomo dalies įvairovę
manoma, kad net iki 85% genetinės įvairovės daugiaveiksnių ligų atveju lemia nekoduojančios sekos