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MCB2992- Bactériologie générale II > Cours 8- Initiation de la réplication > Flashcards

Cours 8- Initiation de la réplication Flashcards

1
Q

Comment se nomment les hélicases réplicatives chez les procaryotes?

A

DnaB

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Q

Comment se nomment les hélicases réplicative chez les eucaryotes et les Archées?

A

MCM

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3
Q

Comment se nomme l’élément en cis chez les bactéries lors de l’initiation de la réplication de leur chromosome?

A

OriC

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4
Q

Chez E.coli, de quelle longueur est la séquence d’ADN la plus coure portant un oriC actif?

A

245 nucléotides.

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5
Q

Comment se nomme la séquence consensus pour DnaA?

A

boite DnaA.

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6
Q

Nommez 3 boites DnaA de haute affinité.

A

R1, R2 et R4.

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7
Q

Vrai ou faux. La région OriC possède des sites d’interaction avec FIS et IHF.

A

Vrai.

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8
Q

Qu’est que la séquence DUE?

A

C’est une séquence A-T riche, où la séparation des brins est initiée à l’oriC.

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9
Q

Comment se nomme l’élément agissant en trans dans la réplication du chromosome bactérien?

A

DnaA

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10
Q

Quelle est la forme active de DnaA? Que permet-elle?

A

La forme active est DnaA-ATP, et elle permet l’ouverture des brins à OriC.

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11
Q

Concernant DnaA..
Elle est dans quelle famille de protéine?
Par quoi est régulée son activité?

A

Famille : AAA+

Régulation : Régulée par l’interaction avec le nucléotide adénine.

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12
Q

Comment l’ATP sur le DnaA est-il converti en ADP?

A

Par l’activité intrinsèque de DnaA.

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13
Q

Où est toujours présent DnaA-ADP?

De quel complexe fait-il partie?

A

Aux boites DnA de haute affinité à OriC. II fait partie du complexe de pré-réplication à OriC (pré-RC?

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14
Q

Vrai ou faux. Il faut un seul monomère de DnaA pour former un pré-RC.

A

Faux. Il en faut environ 20.

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15
Q

Quelle molécule détermine la masse d’initiation de la cellule?

A

DnaA.

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16
Q

Qu’est ce que la masse d’initiation ?

A

C’est la masse de la cellule qui déclenche l’initiation del a réplication à OriC

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17
Q

Qu’est ce qui détermine la richesse d’un milieu?

A

La quantité d’ATP

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18
Q

Dans la cellule, y a-t-il plus d’ATP ou d’ADP?

A

ATP, surtout dans un milieu riche.

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19
Q

Quel est le rôle de DnaC?

A

Charger l’hélicase réplicative DnaB pour l’établissement des fourches de réplication.

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20
Q

Quel est le rôle de DnaG?

A

Synthèse des amorces ARN

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21
Q

Quels sont les rôles de IHF et HIS dans l’initiation de la réplication?

A

Ce sont des protéines de type histone. Elles vont donc participer à la formation du méga-complexe avec DnaA, en facilitant la formation d’une courbure dans l’ADN.

22
Q

Quel est le rôle de la gyrase?

A

Introduction de surenroulement négatif dans l’ADN à OriC, pour faciliter son ouverture par DnaA.

23
Q

Qu’est ce que la transcription divergente?

A

C’est une génération de surenroulement négatif qui va faciliter l’ouverture des brins d’ADN

24
Q

Quel est le phénotype, à T non permissive, d’un mutant dnaA(TS)?

A

Phénotype d’arrêt retardé

25
Q

Quel est le phénotype, à T non permissive, d’un mutant dnaB(TS)?

A

Phénotype d’arrêt immédiat.

26
Q

À quoi s’attache la protéine SeqA?

A

Aux séquences GATC hémi-méthylées. Elle intéragit aussi avec la membrane cytoplasmique.

27
Q

Combien y a-t-il de séquences GATC dans la région OriC?

A

11

28
Q

Qu’arrive-t-il si la méthylase Dam est surproduite?

A

Il y a une méthylation rapide à OriC, et par le fait même une compétition avec l’attachement de SeqA. Ceci entraîne une sur-initiation de la réplication à OriC, créant ainsi une dérégulation du cycle cellulaire et une augmentation de la quantité d’ADN dans la cellule.

29
Q

Où sont situées les séquences GATC dans l’OriC?

A

Dans les boites DnaA de faible affinité et dans la région DUE.

30
Q

Combien de temps dure la période de séquestration?

A

Environ 1/3 du cycle cellulaire.

31
Q

Le mouvement des fourches joue un rôle important dans la régulation de DnaA de 3 manières différentes. Quelles sont-elles?

A

1) DnaA-ATP attaché au chromosome est inactivé par un mécanisme appelé RIDA.
2) La duplication de séquences génomiques interagissant avec DnaA, incluant le site de haute capacité datA, va titrer les protéines DnaA libres pour ainsi réduire sa disponibilité
3) La duplication (réplication) de régions chromosomiques spécialisées appelées DARS stimulent la transformation de DnaA-ADP en DnaA-ATP.

32
Q

Comment l’hydrolyse de l’ATP de DnaA est-elle accélérée?

A

Par l’interaction avec la protéine Hda lorsque cette dernière intéragit avec la bétaclamp du réplisome.

33
Q

Quel gène produit la béta-clamp?

A

DnaN

34
Q

Vrai ou faux. LA forme de béta-clamp en solution peut favoriser l’hydrolyse de DnaA-ATP.

A

Faux. Il faut absolument que la béta-clamp soit chargée sur l’ADN.

35
Q

Vrai ou faux. DARS est un mécanisme pour promouvoir la dégradation de DnaA-ATP.

A

Faux. C’est pour promouvoir son accumulation.

36
Q

Concernant les séquences DARS…

Combien y en a-t-il? Quel est leur emplacement par rapport à OriC? Quel est leur emplacement entre elles?

A

Il y en a 2.

Elles sont éloignées de l’OriC, et éloignées entre elles.

37
Q

Que peut causer la perte de DARS?

A

Un délai dans l’initiation de la réplication durant le cycle cellulaire.

38
Q

Combien y a-t-il de boites DnaA sur le chromosome d’E.coli?

A

Plus de 300

39
Q

Vrai ou faux. Le locus datA a une haute capacité pour DnaA.

A

Vrai.

40
Q

Vrai ou faux. Chez E.coli et B.subtilis, la protéine DnaB a exactement la même fonction.

A

Faux.

41
Q

Nommez les protéines de réplication de l’initiation chez E.coli et B.subtilis

A

E.coli : DnaA

B.subtilis : DnaA

42
Q

Nommez les hélicases réplicatives chez E.coli et B.subtilis.

A

E.coli : DnaB

B. subtilis : DnaC

43
Q

Nommez les hélicases loader chez E.coli et B.subtilis

A

E.coli ; DnaC

B. subtilis : DnaI

44
Q

Nommez les protéines accessoires ou de remodelage chez E.coli et B.subtilis

A

E.coli : -

B.subtilis : DnaB et DnaD

45
Q

Vrai ou faux. Toutes les bactéries ont leur gène dnaA dans la région OriC.

A

Faux. Pas chez E.coli, qui semble être une exception.

46
Q

Vrai ou faux. Le fonctionnement de l’OriC de B.subtilis et E.coli est très similaire.

A

Vrai.

47
Q

Qu’est ce qui est différent entre l’oriC de B.subtilis et E.coli?

A

Chez B.subtilis, la région est beaucoup plus longue et dnaA est inclus.

48
Q

quel est le rôle du système PriA?

A

Il permet le réassemblage des fourches de réplication lorsqu’une fourche ne peut pas redémarrer.

49
Q

Quel sera le phénotype d’un mutant PriA sur un milieu riche?

A

Formation de cellules filamenteuses et d’un ADN mal distribué dans la cellule. C’est le phénotype typique d’une cellule qui a de la difficulté à compléter la réplication de son chromosome.

50
Q

Quelles mutations vont rendre la mutation PriA non viable, même à température permissive?

A

DnaB(Ts) et gyrB(Ts)

MCB2992- Bactériologie générale II (12 decks)

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