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MCB2992- Bactériologie générale II > Cours 6 : Régulation globale chez les bactéries > Flashcards

Cours 6 : Régulation globale chez les bactéries Flashcards

1
Q

Vrai ou faux. B.subtilis et E.coli utilisent le même facteur sigma pour répondre au heat shock.

A

Faux. B. subtilis utilise un facteur sigma normal.

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2
Q

Comment se nomme le répresseur de la réponse heat shock chez B.subtilis?

A

HrcA

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3
Q

Sur quelle séquence opérateur se lie HrcA, et quelle est sa particularité?

A

La séquence CIRCE, qui est hautement conservée chez des bactéries comme B.subtilis et les cyanobactéries, ce qui indique que c’est un système de régulation très ancien.

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4
Q

Est-ce que HrcA agit à haute ou basse température?

A

HrcA réprime les gènes heat shock à basse température

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5
Q

Quelle chaperonne est utilisée comme thermomètre cellulaire dans le cas de la réponse aux gènes heat shock chez b.subtilis?

A

GroEL

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6
Q

Comment se nomme la chaperonne qui replie HrcA pour l’activer?

A

GroEL

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7
Q

Comment se nomme le facteur sigma utilisé pour la réponse générale au stress chez les Gram-?

A

Sigma S

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8
Q

Comment se nomme le facteur sigma utilisé pour la réponse générale au stress chez les Gram+?

A

Sigma B

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9
Q

De quoi dépend la réponse au stress chez les bactéries gram+?

A

De l’inactivation d’un facteur anti-sigma, qui autrement interagit avec sigma B pour inhiber son interaction avec la polymérase

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10
Q

Comment se nomme le système qui compose la voie de signalisation qui active sigma B, et que contient-elle?

A

C’est un système phosphorelais, qui contient des kinases et des phosphatases sérine/thréonine

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11
Q

Vrai ou faux. Les bactéries Gram+ ont une voie spécifique pour détecter le manque d’énergie dans la cellule quand elle est en pénurie de sources de carbone et d’énergie, ainsi qu’une autre voie pour détecter un stress environnemental.

A

Vrai.

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12
Q

Comment se nomment les protéines qui induisent la réponse au stress chez les bactéries gram+?

A

Ce sont 5 protéines périplasmiques nommées Rsb

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13
Q

Nommez les 4 protéines Rsb de pleine longueur, et la plus courte protéine Rsb.
Parlez ensuite de leur rôle.

A

Rsb pleine longueur: RsbRA (RsbT) , RsbRB, RsbRC, RsbRD. Ces Rsb répondent à un stress externe particulier.
Rsb la plus courte : RsbS

Les Rsb de pleine longueur phosphorylent la plus petite Rsb en réponse à leur stress particulier.

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14
Q

Vrai ou faux. Les Rsb sont des sérines ou des thréonines kinases.

A

Vrai

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15
Q

La régulation par les sRNA sont très importantes. Donnez un autre nom pour ce système de régulation.

A

Riborégulation

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16
Q

Comment fonctionnent la majorité des sRNA identifiés?

A

En formant des paires de bases avec l’ARN qu’ils régulent.

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17
Q

Les sRNA qui agissent en cis ont-ils besoin d’une Hfq?

A

Non, car leur séquence est 100% complémentaire à l’ARN cible.

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18
Q

La majorité des sRNA agissent-ils en trans ou en cis?

A

En trans.

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19
Q

Vrai ou faux. Les sRNA qui agissent en trans ont une seule cible.

A

Faux, elles en ont plusieurs différentes (plusieurs ARN différents)

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20
Q

Nommez 3 sRNA qui agissent en trans et le gène qu’ils régulent

A

DsrA régule rpoS
MicF régule ompF
RyhB régule les gènes pour les protéines contenant du fer

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21
Q

Comment est-ce que les sRNA peuvent réguler l’expression génique en interagissant avec leur ARNcible? Il y a deux façons, nommez un exemple pour chacun.

A

1- En inhibant la traduction en interagissant avec TIR pour bloquer l’accès aux ribosomes (MicF sur ompF)
2- En stimulant la traduction en défaisant une structure secondaire qui emprisonne le TIR (DsrA et rpoS)

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22
Q

Où Hfq a-t-elle été découverte pour la première fois, et quel était son rôle?

A

Dans la réplicase du phage QB, qui est requise pour répliquer l’ARN génomique de ce petit phage.

23
Q

Hfq ressemble beaucoup à une autre protéine. Quelle est cette protéine, et quel est son rôle?

A

La protéine Sm, qui est impliquée dans l’épissage de l’ARN chez les eurcaryotes

24
Q

Décrivez la structure de Hfq

A

C’est une protéine hexamérique (6 sous unités) qui forme un anneau

25
Q

Avec quoi interagissent les sRNA de la famille CsrB?

A

Avec des protéines cibles dont ils modulent l’activité.

26
Q

Décrivez la structure des sRNA de la famille CsrB

A

Ils ont une structure répétée avec plusieurs petits domaines en hélice qui miment le site d’interaction du répresseur CsrA (une protéine)

27
Q

Comment fonctionne le sRNA 6S?

A

Il forme une structure semblable à un complexe ouvert d’ADN et inhibe les molécules d’ARN pol liées à sigma70, mais pas cellules liées à sigmaS.

28
Q

Quel est l’effet de l’action de sRNA 6S?

A

Facilite la transition vers l’expression génique contrôlée par sigmaS pendant la phase stationnaire.

29
Q

Vrai ou faux. Les régions intergéniques conservées entre bactéries apparentées correspondent souvent à des sRNA

A

Vrai.

30
Q

Quelle est la première ligne de défense contre les stress de l’environnement chez les bactéries?

A

La membrane bactérienne.

31
Q

Vrai ou faux. Plusieurs réponses aux stress sont reliés à l’état des membranes.

A

Vrai

32
Q

La pression osmotique est-elle plus élevée dans la cellule où à l’extérieur?

A

À l’intérieur de la cellule.

33
Q

Vrai ou faux. Les bactéries peuvent induire leurs gènes de virulence grâce à la détection d’une baisse de pression osmotique.

A

Vrai

34
Q

Comment la cellule peut-elle réguler les différences de pression osmotique entre l’extérieur et l’intérieur?

A

En accumulant ou en excrétant des ions potassium (K) ou d’autres solutés comme la proline ou la glycine bétaine.

35
Q

Par quel mécanisme majeur les Gram- équilibrent la pression osmotique à travers la membrane externe?

A

En synthétisant des pores pour permettre l’entrée et la sortie de solutés dans l’espace périplasmique

36
Q

Comment se nomment les protéines qui forment les pores?

A

Porines

37
Q

Comment se nomment les deux porines principalement retrouvées chez E.coli?

A

ompC et ompF

38
Q

Un pore plus petit contiendra-t-il des porines ompC ou ompF?

A

OmpC

39
Q

Les cellules se multipliant dans un environnement de Posmotique élevée comme l’intestin humain ont-ils plus de OmpC ou de OmpF?

A

OmpC

40
Q

Vrai ou faux. Seulement l’osmolarité peut altérer le ratio OmpC/OmpF

A

Faux. D’autres facteurs environnementaux peuvent aussi altérer le ratio.

41
Q

Vrai ou faux. Les gènes OmpC et OmpF sont sous le contrôle du même régulon.

A

Faux. Ils sont sous le contrôle de différents régulons qui répondent à différents stress externes.

42
Q

Vrai ou faux. Seulement l’expression de ompF est requise pour la synthèse de OmpF.

A

Faux. Il faut aussi la synthèse de EnvZ et d’OmpR pour la transcription optimale de ompF

43
Q

EnvZ et OmpR font partie de quel locus?

A

ompB

44
Q

EnvZ et OmpR sont un système à deux composante. Quel est le rôle de chacun?

A

EnvZ: Senseur membranaire
OmpR: Régulateur transcriptionnel

45
Q

Expliquez comment fonctionne le système à deux composantes d’EnvZ et OmpR.

A

Le niveau de phosphorylation d’EnvZ est plus élevé en présence d’une osmolarité plus élevée, et ce phosphate peut alors être transféré à OmpR.
De hauts niveaux d’OmpR-P favorisent la transcription d’ompC, alors que de bas niveaux vont favoriser la transcription d’ompF

46
Q

Grâce à quelle molécule s’effectue la régulation de la synthèse des porines par les autres formes de stress que la pression osmotique?

A

sARN MicF

47
Q

Le sARN MicF a été découvert par chance car il est adjacent à quel gène?

A

ompC

48
Q

L’Activateur SoxS répond à quel signal de l’environnement?

A

Stress oxydatif

49
Q

L’activateur MarA répond à quel signal de l’environnement?

A

Acides faibles et certains antibiotiques

50
Q

L’activateur Rob répond à quel signal de l’environnement?

A

peptides antimicrobiens

51
Q

Dans le système CpxA-CpxR : quels sont les rôles de ces composantes?

A

CpxA: Senseur membrannaire

CpxR : Régulateur transcriptionnel

52
Q

Dans quelles circonstances est-ce que CpxA va s’autophosphoryler?

A

Lorsque des molécules devant être sécrétées, comme des pilis ou des curlis, vont s’accumuler dans l’espace périplasmique à cause d’un défaut de transport dû à des dommages à la membrane externe.

53
Q

Comment est-ce que le ratio OmpC/OmpF est affecté par le système CpxA-CpxR?

A

Le ratio augmente via l’action d’OmpR-P qui est stimulée par l’activation de CpxA par un mécanisme inconnu

MCB2992- Bactériologie générale II (12 decks)

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