Cours 12 : Dommages et réparation de l'ADN Flashcards
Que vont reconnaître les systèmes de réparation spécifiques?
Ils reconnaissent des dommages spécifiques dans l’ADN (comme une base en particulier)
Que vont reconnaître les systèmes de réparation non-spécifiques?
Ils vont reconnaître des distorsions dans la doubles hélice, qui sont souvent causées par des mauvais appariements des bases.
Qu’est ce que la désamination?
C’est la perte du groupement amine des bases nucléotidiques
Quels sont les dommages induits suite à une désamination sur l’ADN?
Changement de l’appariement entre les nucléotides, et causent des mutations ponctuelles de type transition.
Vrai ou faux. Seuls les agents désaminants peuvent induire la désamination des bases nucléotidiques.
Faux! La désamination peut arriver aussi de manière spontannée, spécialement lorsque la température de croissance est élevée.
Nommez 3 agents désaminants qui peuvent induire la désamination des bases nucléotidiques.
Hydroxylamine, Bisulfite et Acide nitreux
Quelle molécule deviens l’adénine au contact de l’acide nitreux, et avec quelle base va-t-elle s’associer?
Elle deviens de l’hypoxanthine, et se lie à la cytosine. Transition de base
Quelle molécule deviens la cytosine au contact de l’acide nitreux, et avec quelle base va-t-elle s’associer?
Elle deviens de l’uracile, et va se lier à l’Adénine.
Transition de base
Quelle molécule deviens la guanine au contact de l’acide nitreux, et avec quelle base va-t-elle s’associer?
Elle deviens de la xanthine, et se lie à la cytosine.
Transition de base.
Quelle molécule deviens le 5-méthylcytosine lors d’une désamination spontanée?
Thymine.
Lors de la réparation des bases désaminées, quel enzyme va couper le lien glycosyl entre la base endommagée et le sucre dans le nucléotide?
Les glycosylases ADN (il y en a une pour chaque base désaminée)
Expliquez en détail la réparation des bases désaminées (4 enzymes impliqués)
1- Action spécifique d’une glycosylase ADN propre à la base désaminée, qui va couper le lien glycosyl entre la base endommagée et le sucre dans le nucléotide
2- Une AP endonucléase apurinique ou apyrimidique va couper le lien phosphodiester du côté 5’ du dommage, introduisant un nick dans l’ADN
3- L’ADN polymérase I va ajouter les bons nucléotides
4- Le tout est scellé par la ligase.
Vrai ou faux. Il n’est pas normal d’avoir des 5-méthylcytosines dans l’ADN, et ces bases doivent être réparées.
Faux! La majorité des organismes possèdent quelques 5-méthylcytosines dans leur ADN au lieu de la cytosine.
Quel est le risque d’avoir des 5-méthylcytosine dans l’ADN?
S’ils sont désaminés, il y aura formation de thymine, qui est une base normale de l’ADN. Les mécanismes de réparations ne vont pas la reconnaître, et il y aura un mauvais appariement des bases et une mutation instaurée à cet endroit.
Dans quelle séquence ADN se retrouvent habituellement les 5-méthylcytosines? Quel enzyme est impliqué dans ce processus?
Séquence 5’CCWGG3’/3’GGWCC5’. La cytosine ADN méthylase (Dcm) méthyle le deuxième C de cette séquence.
Quel enzyme est spécifique aux appariement T-G causées par la désamination de la 5-méthyl-cytosine?
Vsr endonucléase
Nommez les enzymes possédées par la cellules pour contrer l’accumulation de produits nocifs dérivés de l’oxygène moléculaire.
- Superoxyde dismutase
- Catalase
- Peroxydase
Nommez les moyens utilisés par la cellule pour prévenir les effets néfastes du 8-oxoG dans l’ADN.
1- Le produit du gène mutT code pour une phosphatase, qui va convertir le 8-oxoG-dGTP en 8-oxoG-dGMP, pour prévenir l’incorporation du 8-oxoG dans l’ADN.
2- Le produit du gène mutY, une glycosylase spécifique, va enlever une adénine située en face du 8-oxoG
3- Le produit du gène mutM, une glycosylase spécifique, va enlever le 8-oxoG incorporé dans l’ADN