Cours 7- La réplication de l'ADN Flashcards
Comment se nomme la première étape du cycle cellulaire chez la bactérie?
La réplication du chromosome bactérien.
Nommez les 3 étapes de la réplication du chromosome
1- initiation
2- élongation
3- terminaison
Nommez les 8 étapes du cycle cellulaire bactérien
1- Croissance 2- Masse d'initiation 3- Réplication- initiation 4- Réplication-élongation 5- Réplication- terminaison 6- Décaténation 7- Ségrégation/septum 8- Division
De quel côté tourne la double hélice?
Du côté droit.
Comment se nomment les carbones du sucre de l’ADN?
Prime
Où est attaché la base sur le désoxyribose?
Sur le carbone 1’
Où sont attachés le ou les P sur le désoxyribose?
En carbone 3’ ou carbone 5’.
Expliquez la biosynthèse des dNTP.
1- La ribonucléotide réductase réduit (enlève l’O’) en position 2’ du ribose dans un NDP, pour faire un dNDP
2- La kinase ajoute un phosphate pour faire un dNTP
Expliquez la biosynthèse du dTTP.
1- La dUDP phosphatase donne le dUMP.
2- Le 5-méthyl est ajouté au d-UMP par la thymidylate synthétase via le tétrahydrofolate.
D’où provient le tétrahydrofolate?
Il provient du dihydrofolate, via la dihydrofolate réductase
Qu’est ce que la réplication semi-conservative?
Chacune des branches qui sort du complexe de réplication possède un vieux brin conservé et un nouveau brin.
Comment se nomme la structure où survient la réplication?
La fourche de réplication
Comment se nomme l’enzyme qui effectue la polymérisation de l’ADN?
La polymérase ADN
Quelle est l’action de la polymérase ADN?
Elle attache le premier phosphate du dNTP au carbone 3’ du nt suivant, ce qui mène également au relâchement des 2 derniers phosphates du 1er nucléotides pour fournir l’énergie nécessaire à la polymérisation
Vrai ou faux. Sur le brin matrice, l’ADN polymérase se déplace dans le sens 5’-3’.
Faux. Elle se déplace dans le sens 3’-5’, ce qui permet de lier les dNTP du nouveau brin dans le sens 5’-3’.
Comment se nomment les polymérases qui participent à la synthèse normale de l’ADN?
Polymérase I et Polymérase III
Quelle polymérase possède des rôles accessoires dans la réplication de l’ADN?
La polymérase I
Quelle polymérase fait partie d’un gros complexe de protéines?
La polymérase III
Comment la polymérase III est-elle ancrée à l’ADN, et quel est l’effet de cette liaison?
Par la sous unité DnaN (ou béta-clamp, sliding clamp). Cela lui permet de synthétiser l’ADN très efficacement, avec très peu d’interruptions .
Vrai ou faux. Les amorces sont faites d’ADN.
Faux. Ce sont des petits ARNs.
Comment se nomme la primase qui synthétise les amorces lors de la réplication de l’ADN?
DnaG
Quelle polymérase remplace les amorces d’ARN par de l’ADN?
La polymérase I
Quelle activité enzymatique particulière possède la polymérase I, et que lui permet-elle de faire?
Une activité exonucléase 5’ vers 3’. Cette activité lui permet d’enlever les ribonucléotides ayant été incorporé pour faire l’amorce.
Vrai ou faux. Les polymérases ADN et ARN sont capables de séparer les brins d’ADN.
Faux. Seulement les polymérases ARN peuvent le faire.
Quel est le rôle et DnaB, et comment fait-elle ce rôle?
DnaB est une ADN hélicase, donc elle sépare les brins d’ADN en avant de la polymérase III. Pour ce faire, elle s’attache fortement au brin discontinu.
Comment sont reliées entre-elles 2 polymérases?
Via la clamp loader
Nommez 2 rôles des protéine SSB.
1- Interaction avec l’ADNsb pour empêcher la refermeture des brins séparés par DnaB
2- Maintient de l’intégrité de l’ADNsb (protection)
Quel est le rôle de l’ADN gyrase?
C’est une ADN topoisomérase, qui enlève le surenroulement positif généré en avant de la fourche de réplication.
Qu’arrive-t-il si le surenroulement positif n’est pas retiré dans l’ADN?
La progression de la fourche sera empêchée.
Qu’est ce que la fonction editing de la polymérase?
C’est une activité exonucléase 3’ vers 5’, qui permet à la polymérase de reculer et d’enlever les nucléotides incorporés par erreurs, donc de corriger les erreurs de réplication.
Quelles polymérases possèdent la fonction editing?
Pol I et III (DnaQ)
Quelles polymérases sont des error prone polymérases? Qu’est ce que cela veut-dire?
Pol IV et pol V. Ces polymérases n’ont pas d’activité de correction, et vont augmenter le nombre de mutations.
Nommez 4 obstacles à la réplication de l’ADN
1- Protéines attachées à l’ADN
2- Surenroulement positif en excès
3- Dommages encombrants à l’ADN
4- Cassures
La polymérase III gère différemment les différents obstacles s’ils se trouvent sur le brin continu ou discontinu. Quelles sont les différences?
Brin discontinu : La pol III peut sauter par dessus les obstacles
Brin continu : On a besoin d’une nouvelle polymérase III
Qu’est ce qui voyage plus vite? La transcription ou la réplication?
La réplication voyage 20x plus vite.
Quelles collisions sont les plus dommageables? Les collisions face à face ou les collisions co-directionnelles?
Les collisions face à face
Qu’est ce que le surenroulement négatif?
L’énergie emmagasinée dans l’ASDN tend à dérouler la double hélice et compacter l’ADN. Cela facilite l’ouverture des brins pour initier la réplication et la transcription.
Qu’est ce que le surenroulement positif?
La tension dans l’ADN tend à enrouler davantage la double hélice, et les brins d’ADN sont plus difficile à séparer. Le surenroulement positif est généré par la réplication.
Quelle est l’activité de l’enzyme topoisomérase?
Activité de cassure de brins, passage de brins et refermeture (ligation).
Vrai ou faux. La topoisomérase participe à toutes les étapes de la réplication.
Vrai.
Par quoi est régulé le surenroulement du chromosome bactérien?
Par les activités opposées de la gyrase et de la topoisomérase I
Qu’est ce qui est absolument essentiel lors de l’initiation de la réplication (en lien avec la topologie de l’ADN) ?
Le surenroulement négatif de l’ADN par la gyrase est nécessaire, avec DnaA, pour séparer les brins d’ADN à OriC, afin d’initier la réplication.
Par quel enzyme sont enlevées les pré caténanes?
Topoisomérase IV
Quel est le problème au niveau de la terminaison de la réplication, en ce qui concerne la topologie de l’ADN?
Les 2 fourches convergentes à la région ter entraînent une très forte accumulation de supertours positifs qui ne peuvent pas être enlevés par la gyrase, car l’espace est trop restreint.
Le surenroulement négatif favorise-t-il la caténation ou la décaténation?
La décaténation
À quel moment est-ce que la réplication du chromosome se termine?
Lorsque les 2 fourches initiées à OriC se rencontrent dans la région Ter
Comment la terminaison est-elle restreinte aux séquences ter?
Grâce au système Tus/ter, qui bloque les fourches d’une manière unidirectionnelle.
Quel est l’avantage d’avoir la terminaison aux séquences ter?
Facilite le couplage avec la ségrégation des chromosomes.
