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MCB2992- Bactériologie générale II > Cours 7- La réplication de l'ADN > Flashcards

Cours 7- La réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Comment se nomme la première étape du cycle cellulaire chez la bactérie?

A

La réplication du chromosome bactérien.

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Q

Nommez les 3 étapes de la réplication du chromosome

A

1- initiation
2- élongation
3- terminaison

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Q

Nommez les 8 étapes du cycle cellulaire bactérien

A 
1- Croissance
2- Masse d'initiation
3- Réplication- initiation
4- Réplication-élongation
5- Réplication- terminaison
6- Décaténation
7- Ségrégation/septum
8- Division
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4
Q

De quel côté tourne la double hélice?

A

Du côté droit.

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5
Q

Comment se nomment les carbones du sucre de l’ADN?

A

Prime

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6
Q

Où est attaché la base sur le désoxyribose?

A

Sur le carbone 1’

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7
Q

Où sont attachés le ou les P sur le désoxyribose?

A

En carbone 3’ ou carbone 5’.

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8
Q

Expliquez la biosynthèse des dNTP.

A

1- La ribonucléotide réductase réduit (enlève l’O’) en position 2’ du ribose dans un NDP, pour faire un dNDP
2- La kinase ajoute un phosphate pour faire un dNTP

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9
Q

Expliquez la biosynthèse du dTTP.

A

1- La dUDP phosphatase donne le dUMP.

2- Le 5-méthyl est ajouté au d-UMP par la thymidylate synthétase via le tétrahydrofolate.

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10
Q

D’où provient le tétrahydrofolate?

A

Il provient du dihydrofolate, via la dihydrofolate réductase

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11
Q

Qu’est ce que la réplication semi-conservative?

A

Chacune des branches qui sort du complexe de réplication possède un vieux brin conservé et un nouveau brin.

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12
Q

Comment se nomme la structure où survient la réplication?

A

La fourche de réplication

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13
Q

Comment se nomme l’enzyme qui effectue la polymérisation de l’ADN?

A

La polymérase ADN

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14
Q

Quelle est l’action de la polymérase ADN?

A

Elle attache le premier phosphate du dNTP au carbone 3’ du nt suivant, ce qui mène également au relâchement des 2 derniers phosphates du 1er nucléotides pour fournir l’énergie nécessaire à la polymérisation

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15
Q

Vrai ou faux. Sur le brin matrice, l’ADN polymérase se déplace dans le sens 5’-3’.

A

Faux. Elle se déplace dans le sens 3’-5’, ce qui permet de lier les dNTP du nouveau brin dans le sens 5’-3’.

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16
Q

Comment se nomment les polymérases qui participent à la synthèse normale de l’ADN?

A

Polymérase I et Polymérase III

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17
Q

Quelle polymérase possède des rôles accessoires dans la réplication de l’ADN?

A

La polymérase I

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18
Q

Quelle polymérase fait partie d’un gros complexe de protéines?

A

La polymérase III

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19
Q

Comment la polymérase III est-elle ancrée à l’ADN, et quel est l’effet de cette liaison?

A

Par la sous unité DnaN (ou béta-clamp, sliding clamp). Cela lui permet de synthétiser l’ADN très efficacement, avec très peu d’interruptions .

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20
Q

Vrai ou faux. Les amorces sont faites d’ADN.

A

Faux. Ce sont des petits ARNs.

21
Q

Comment se nomme la primase qui synthétise les amorces lors de la réplication de l’ADN?

A

DnaG

22
Q

Quelle polymérase remplace les amorces d’ARN par de l’ADN?

A

La polymérase I

23
Q

Quelle activité enzymatique particulière possède la polymérase I, et que lui permet-elle de faire?

A

Une activité exonucléase 5’ vers 3’. Cette activité lui permet d’enlever les ribonucléotides ayant été incorporé pour faire l’amorce.

24
Q

Vrai ou faux. Les polymérases ADN et ARN sont capables de séparer les brins d’ADN.

A

Faux. Seulement les polymérases ARN peuvent le faire.

25
Q

Quel est le rôle et DnaB, et comment fait-elle ce rôle?

A

DnaB est une ADN hélicase, donc elle sépare les brins d’ADN en avant de la polymérase III. Pour ce faire, elle s’attache fortement au brin discontinu.

26
Q

Comment sont reliées entre-elles 2 polymérases?

A

Via la clamp loader

27
Q

Nommez 2 rôles des protéine SSB.

A

1- Interaction avec l’ADNsb pour empêcher la refermeture des brins séparés par DnaB
2- Maintient de l’intégrité de l’ADNsb (protection)

28
Q

Quel est le rôle de l’ADN gyrase?

A

C’est une ADN topoisomérase, qui enlève le surenroulement positif généré en avant de la fourche de réplication.

29
Q

Qu’arrive-t-il si le surenroulement positif n’est pas retiré dans l’ADN?

A

La progression de la fourche sera empêchée.

30
Q

Qu’est ce que la fonction editing de la polymérase?

A

C’est une activité exonucléase 3’ vers 5’, qui permet à la polymérase de reculer et d’enlever les nucléotides incorporés par erreurs, donc de corriger les erreurs de réplication.

31
Q

Quelles polymérases possèdent la fonction editing?

A

Pol I et III (DnaQ)

32
Q

Quelles polymérases sont des error prone polymérases? Qu’est ce que cela veut-dire?

A

Pol IV et pol V. Ces polymérases n’ont pas d’activité de correction, et vont augmenter le nombre de mutations.

33
Q

Nommez 4 obstacles à la réplication de l’ADN

A

1- Protéines attachées à l’ADN
2- Surenroulement positif en excès
3- Dommages encombrants à l’ADN
4- Cassures

34
Q

La polymérase III gère différemment les différents obstacles s’ils se trouvent sur le brin continu ou discontinu. Quelles sont les différences?

A

Brin discontinu : La pol III peut sauter par dessus les obstacles
Brin continu : On a besoin d’une nouvelle polymérase III

35
Q

Qu’est ce qui voyage plus vite? La transcription ou la réplication?

A

La réplication voyage 20x plus vite.

36
Q

Quelles collisions sont les plus dommageables? Les collisions face à face ou les collisions co-directionnelles?

A

Les collisions face à face

37
Q

Qu’est ce que le surenroulement négatif?

A

L’énergie emmagasinée dans l’ASDN tend à dérouler la double hélice et compacter l’ADN. Cela facilite l’ouverture des brins pour initier la réplication et la transcription.

38
Q

Qu’est ce que le surenroulement positif?

A

La tension dans l’ADN tend à enrouler davantage la double hélice, et les brins d’ADN sont plus difficile à séparer. Le surenroulement positif est généré par la réplication.

39
Q

Quelle est l’activité de l’enzyme topoisomérase?

A

Activité de cassure de brins, passage de brins et refermeture (ligation).

40
Q

Vrai ou faux. La topoisomérase participe à toutes les étapes de la réplication.

A

Vrai.

41
Q

Par quoi est régulé le surenroulement du chromosome bactérien?

A

Par les activités opposées de la gyrase et de la topoisomérase I

42
Q

Qu’est ce qui est absolument essentiel lors de l’initiation de la réplication (en lien avec la topologie de l’ADN) ?

A

Le surenroulement négatif de l’ADN par la gyrase est nécessaire, avec DnaA, pour séparer les brins d’ADN à OriC, afin d’initier la réplication.

43
Q

Par quel enzyme sont enlevées les pré caténanes?

A

Topoisomérase IV

44
Q

Quel est le problème au niveau de la terminaison de la réplication, en ce qui concerne la topologie de l’ADN?

A

Les 2 fourches convergentes à la région ter entraînent une très forte accumulation de supertours positifs qui ne peuvent pas être enlevés par la gyrase, car l’espace est trop restreint.

45
Q

Le surenroulement négatif favorise-t-il la caténation ou la décaténation?

A

La décaténation

46
Q

À quel moment est-ce que la réplication du chromosome se termine?

A

Lorsque les 2 fourches initiées à OriC se rencontrent dans la région Ter

47
Q

Comment la terminaison est-elle restreinte aux séquences ter?

A

Grâce au système Tus/ter, qui bloque les fourches d’une manière unidirectionnelle.

48
Q

Quel est l’avantage d’avoir la terminaison aux séquences ter?

A

Facilite le couplage avec la ségrégation des chromosomes.

MCB2992- Bactériologie générale II (12 decks)

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