Cours 6 - Fin Intra Flashcards

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1
Q

Compagnie la plus reconnue pour la distribution d’enzymes de restriction?

A

New england biolabs

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2
Q

Site sur les meilleures conditions possible pour la digestion d’adn avc 2 enzymes simultanément?

A

Double digest finder

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Q

Comment s’assurer de l’efficacité des digestions?

A

Contrôle de digestion simples avec chaque enzyme sur le vecteur de clonage

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4
Q

Quel est l’effet de cette digestion?

A

la linéarisation qui entraîne la perte des structures enroulées de l’adn

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Q

Comment analyser les résultats?

A

un adn linéaire aun plus faible poids moléculaire qu l’adn circulaire en gel d’agarose (prof pas d’accord anyway)

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6
Q

Étape entre la digestion et la ligation du fragment?

A

Purification du fragment

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7
Q

Quelle est l’enzyme ligase la plus utilisée en bio mol?

A

ADN ligase du bactériophage T4

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8
Q

Caractéristiques de l’adn ligase T4?

A

1- lie de façon covalente 5’P et 3’OH
2- Besoin d’atp
3- Inactivable par la chaleur
4- liason chm entre un insert et un vecteur digéré

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9
Q

Pourquoi l’efficacité de ligation est meilleure avec un bout cohésif?

A

Les bouts cohésifs forment déjà des ponts H, les séq à lier sont maintenues ensemble.
Avec les bouts francs, l’efficacité est dépendante de la probabilité de contact moléculaire selon le mvt brownien et la concentration d’adn

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10
Q

Quelle est l’étape la moins efficace d’un processus de clonage moléculaire?

A

La ligation

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11
Q

Ration insert:vecteur idéal?

A

3:1

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12
Q

Quel est l’effet d’une ligation?

A

Circularisation du vecteur -> structures enroulées -> poids moléc plus élevé -> le vecteur est maintenu dans les cellules après transformation

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13
Q

Comment réduire la probabilité de sélectionner le vecteur parental suite à la transformation? (3)

A

1) purification du vecteur digéré
2) digestion dans l’insert parental
3) déphosphorylaton du vecteur

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14
Q

Quelle est l’enzyme déphosphorylante des vcteur parentaux?

A

la shrimp alcaline phosphatase

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15
Q

Vrai ou faux. La majorité des espèces bactériennes doivent être traîtée pour devenir compétente?

A

Vrai, elles doivent être traîtée chimiquement et physiquement.

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16
Q

Avec quoi traite t on chimiquement et physiquement les bactéries afin qu’elles deviennent compétente? Pourquoi?

A

1) Cholrure de Ca, rubidium: perméabilité et neutralisation des charges
2) incubation sur glace: perméabilisation
3) éléctroporation (2kv): pores dans la membranes

17
Q

En quoi consiste l’incubation sur glace (compétence par traitement thermique), temps, températures?

A

30 min sur glace
2 min à 42C
2 min sur glace

18
Q

Lorsqu’on fait de l’électroporation, quel soluté nous ne voulons pas avoir?

A

sels

19
Q

Mesure de compétence bactérienne?

A

1 ug d’adn surenroulé / 1 ml de cellules compétentes

20
Q

Avec quoi peut on confirmer une construction ? (2)

A
  1. PCR (vect parental comme contrôle nég, insert original comme contrôle pos)
  2. digestion dx (vect parental comme contrôle comparatif, devrait pas avoir la même taille)