Cours 5 Flashcards
qu’est-ce que le carrefour métabolique?
point final commun du catabolisme des glucides, lipides, protéines et acides aminés menant à la formation de l’acétyl-CoA
Où se produit le cycle de krebs?
dans la matrice mitochondriale
quel est le centre énergétique de la cellule?
mitochondrie
Quel est le but ultime du cycle de krebs?
Produire des intermédiaires riches en ATP dans la chaîne respiratoire
combien de réaction enzymatique le cycle de krebs comprend-il?
8
quels sont les 2 produits du cycle de krebs qui sont réoxyder dans la chaine respiratoire au cours des phosphorylation oxydatives?
NADH et FADH
quel est la principale conséquence d’un dysfonctionnement du cycle de krebs? pourquoi?
Une acidose lactique
si l’apport en oxygène est insuffisant, les mitochondries sont incapables de continuer la synthèse de l’ATP a un débit suffisant, alors que la glycolyse se fait normalement. Il y a donc un excès de pyruvate qui est alors convertit en lactate par la voie anaérobique.
de quoi est formé le CoA? (3) quelle est sa principale fonction?
groupe B-mercaptoéthylamine
acide pantothénique (vit B5)
3’5’ adenosine diphosphate.
Le CoA assure le transport du groupement acétyle
Comme le cycle de krebs se produit dans la mitochondrie, le pyruvate produit lors de la glycolyse doit s’y rendre. Par quel type de mécanisme?
système symport
transport actif
quels sont les 3 avantages d’avoir un complexe multi-enzymatique?
diminue la distance des sites actifs
permet de guider les intermédiaires d’une voie a l’autre
régulation coordonnée
le complexe PDH comprend 3 enzymes, lesquelles?
Pyruvate déshydrogenase (E1)
dihydrolipoamideS-acétyltransférase (E2)
dihydrolipoyl déshydrogénase (E3)
Quels sont les 5 enzymes retrouvées dans le complexe PDH?
TPP lipoamide/dihydrolipoamide CoA FAD NAD+
Chez les mammifères, le complexe PDG comprend environ 12 copies de E3. A quoi ca sert?
faciliter la liaison de E3 au coeur de E2
Combien d’ATP génère le NADH lorsqu’oxydé?
3 ATP
Comment fonctionne l’arsenic?
se lie au groupement sulfhydryle de E2 et l’inhibent.
conséquence: arrêt de la production d’Acétyl-CoA, arrêt de la respiration du cycle cellulaire
quelles sont les 3 étapes du cycle de krebs qui sont irréversibles?
1-3-4
Quels sont les 2 systèmes de régulation employés pour le cycle de krebs?
inhibition par les produits (NADH et Acétyl-CoA)
modification covalente par phosphorylation et déphosphorylation de E1
De quel type est l’inhibition par les produits?
compétitive
Que ce passe-t-il dans le mécanisme de synthèse de l’acétyl-CoA si les concentrations en NADH et en acétyl-CoA sont élevées?
Les réactions réversibles catalysées par E2 et E3 s’inversent
Quels sont les 2 enzymes régulant l’enzyme E1?
comment agissent-ils?
pyruvate déshydrogénase phosphatase. activent la E1 en la déphosphorylant
pyruvate déshydrogénase kinase. Désactivent la E1 en la phosphorylant
la première réaction du cycle de krebs est de quel type?
condensation
quelle réaction dans le cycle de krebs permet la première formation de NADH?
la réaction 3 catalysée par l’isocitrate déshydrogénase
thioesther riche en énergie produit a l’étape 4 du cycle de krebs
Succinyl-CoA
Quel enzyme permet de convertir le GTP en ATP en présence d’ADP?
nucléoside diphosphate kinase
quels sont les effets sur le malonate sur le cycle de krebs?
il inhibe la succinate déshydrogénase en s’installant dans son site catalytique
quel est l’accepteur d’électron de la réaction impliquant le succinate déshydrogénase? où le retrouve-t-on
le FAD
contenu directement dans l’enzyme
quel est le seul enzyme contenu dans la membrane des mitochondrie dans le cycle de krebs? pourquoi?
succinate déshydrogénase
sa réoxydation par le biais de la chaine respiratoire s’effectue dans la membrane
quelles sont les 3 enzymes qui font en sorte que le cycle de krebs est thermodynamiquement favorable?
citrate synthase
isocitrate déshydrogénase
a-cétoglutarate déshydrogénase
pourquoi le cycle de krebs a tout de même lieu, même si la malate déshydrogénase est très endergonique?
car l’oxaloacétate est continuellement utilisé, donc la citrate synthase n’est jamais saturé
Combien d’électrons représentent la transformation de 3 NAD+ en 3 NADH? et combien d’ATP peuvent former une molécule de NADH?
3 molécules de NADH = 3 paires d’és
1 NADH = 3 ATP
combien d’électrons représentent la transformation de 1 FAD+ en 1 FADH2? combien d’équivalent ATP pour une molécule de FADH2?
1 molécule de FADH2 = 1 paire d’és
1 FADH2 = 2 ATP
a la fin du cycle de krebs, combien y a t-il d’équivalent ATP par molécule de pyruvate?
1 pyruvate = 15 ATP
quels sont les régulateurs les plus stratégiques du site de l’acide citrique?
Oxaloacétate
Acétyl-CoA
NADH
Que ce passe-t-il lorsqu’un tissu passe d’une faible activité à une activation et respiration intense?
la concentration en NADH mitochondriale diminue
il y a augmentation de la concentration en oxaloacétate stimulant la citrate synthase
de quoi dépend la vitesse d’utilisation de la citrate synthase? comment se fait la régulation?
isocitrate déshydrogénase NAD+-dépendante
enzyme inhibée par le NADH
vrai ou faux
le NADH n’influence pas l’activité de la citrate synthase
Faux
la citrate synthase est fortement inhibée par la citrate synthase
quelles sont les 3 conséquences d’une diminution de concentration en citrate?
le citrate inhibe l’oxaloacétate (pas de citrate = pas d’inhibition)
l’activité de l’a-cétoglutarate est augmenté car la concentration en NADH diminue
inhibition compétitive par rétrocontrole du succinyl-CoA avec l’acétyl CoA
quels sont les effets de l’ADP et de l’ATP sur l’isocitrate déshydrogénase?
ADP = effecteur positif ATP = effecteur négatif
Quel est l’effet du CA2+ sur la pyruvate déshydrogénase?
active la pyruvate déshydrogénase phosphatase et inhibe la pyruvate déshydrogénase kinase
Quel est l’effet du Ca2+ sur l’isocitrate déshydrogénase? et l’a-cétoglutarate déshydrogénase?
Activation
Activation
Que veut dire, le cycle de krebs est amphiolique?
il est a la fois catabolique et anabolique car plusieurs voies de biosynthèse utilisent les intermédiaires
qu’est-ce qu’une réaction cataléprotique?
réaction qui utilisent/consomment les intermédiaires du cycle
quelles sont les utilités d’avoir des réactions cataléprotiques? (2)
synthétiser des produits importants
éviter l’accumulation des produits
comment appelle-t-on les réactions qui réapproviosinnent le cycle de krebs en intermédiaire? quel enzyme permet ce type de réaction?
réaction anaplérotique
pyruvate carboxylase