Cours 5 Flashcards
Où sont les signaux qui contrôlent les expressions des gènes ?
Hors de la cellule (TOUJOURS)
Pourquoi la régulation se fait plutôt à l’initiation ?
Ça demande moins d’énergie de pas transcrire inutilement et c’est plus facile - un seul promoteur doit être régulé VS +++ d’ARNm transcrit à stopper.
Pourquoi on fait pas juste réguler à l’initiation si c’est si efficace ?
Pour réguler plus finement, efficacement et rapidement.
Vrai ou faux : l’ARN pol sans régulateur transcrit énormément.
Faux, niveau basal parce qu’elle se lie faiblement au promoteur ! = étape limitante.
Les régulateurs peuvent agir comment ? (4)
- Coopérativement (2+ régulateurs intéragissent entre eux ou avec l’ADN)
- Au promoteur ou à distance
- Par recrutement (positif) ou encombrement (négatif) = aide ou nuit la liaison de la pol
- En activant ou désactivant la pol déjà liée - étape limitante devient complexe ouvert - fermé (=allostérie sur ADN, ARN pol OU sur le régulateur direct).
Quel est le nom du site des répresseurs ? Des activateurs ?
L’opérateur ; site de liaison de l’activateur (nul)
Les régulateurs sont-ils tous proches du promoteur ?
Non ! Éloignés (+1000 parfois)
= Boucles pour rapprocher (des protéines peuvent plier l’ADN) ou passe par des médiateurs
Quelle est la source d’énergie chez les procaryotes ?
Des sucres, surtout le glucose = plus facile à absorber (monosaccharide) sinon il cherche autre chose (comme le lactose - galactose + glucose)
Qu’est-ce qu’un opéron ?
Plusieurs gènes pour un seul promoteur. Fait un seul ARNm (polycistronique) traduit en plusieurs protéines.
Quelles sont les protéines/gènes de l’opéron lac ?
LacZ, lacY et lacA (en ordre, le promoteur étant devant le lacZ)
À quoi servent les 3 protéines de l’opéron lac ?
LacZ = code bêta-galactosidase coupe lactose
LacY = code lactose perméase fait rentrer lactose (=transmembranaire)
LacA= code thiogalactoside transacétylase enlève thipgalactosides = toxique qui rentrent avec le lactose par lacY = perméase.
Quelles sont les protéines régulatrices de l’opéron lac ? Quels sont leurs rôles et quand sont-elles présentes ?
CAP = activateur, se lie quand pas de glucose. Quand pas lié = niveau basal d’opéron transcrit, quand lié, augmente beaucoup.
Répresseur lac = répresseur CODÉ par lacI = se lie quand pas de lactose, empêche transcription par encombrement !
Quand CAP n’est pas là, pourquoi il n’y a qu’un niveau basal de transcription ?
Car :
1. la région -35 n’est pas optimale pour la liaison de sigma (domaine 4 ! Vu au cours 4
2. Il n’y a pas d’élément UP ! (la plupart du temps c’est comme ça quand un activateur est impliqué dans la régulation d’un gène.)
La présence de CAP change quoi ?
Se lie 60 pb avant site initiation et recrute ARN pol = liaison coop !
La queue CTD de pol qui lie normalement UP (absent ici) va lire CAP et son site !!!! Yay (remplace en gros UP)
Qu’a CAP de spécial par rapport aux autres régulateurs ?
Il change la structure de l’ADN (=allostérie) : fait une torsion (permet à la queue de s’appuyer sur CAP)
De quel cofacteur CAP a besoin pour fonctionner ? Par quoi la concentration du cofacteur est-elle augmentée ?
AMPc, par la diminution du taux de glucose dans l’environnement et dans la cellule, donc.
Le répresseur lac a combien de sous-unités ? Elles font quoi ?
2 sous-unités (2x hélice-coude-hélice) qui reconnaissent chacun une moitié symétrique (demi-site) du site de liaison du répresseur (opérateur lac) de 21 pb.
Comment le répresseur lac inhibe ?
en recouvrant une partie du promoteur, il empêche pol de se lier physiquement (=encombrement)
À quoi servent chacune des hélices du répresseur lac ?
Une (=reconnaissance) s’insère grand sillon
L’autre travers grand sillon + interagit squelette ADN (pas mal tjrs comme ça) = stabilise + positionne 1re hélice.
Vrai ou faux : le répresseur lac agit toujours en dimère.
Faux : il va y avoir un dimère sur un opérateur primaire (empiète sur le promoteur, décalé un peu vers l’aval) et les deux monomères restants vont lier SOIT un opérateur 90 pb amont SOIT 400 pb aval de l’opérateur. Les répresseurs vont se lier ensemble et plier l’ADN, empêchant encore plus la pol de se lier.
Qu’est-ce qui fait que le répresseur lac n’agit pas en présence de lactose ?
Des changements allostériques, lactose induit un changement de conformation du répresseur = ne lie plus l’opérateur.
Vrai ou faux : CAP ne régule que l’opéron lac.
Faux, il contrôle (active) +100 gènes chez E. coli. Les autres régulateurs sont différents pour ces gènes (par exemple, le répresseur lac n’est présent que pour le lactose et ça sera galR pour le galactose).
On appelle ça le contrôle combinatoire = un régulateur pour +++ gènes !
Qu’est-ce que galR ? À quoi sert-il ?
Répresseur présent quand il n’y a pas de galactose, inhibe transcription de l’opéron gal.
N’encombre pas !!! Retient pol en complexe fermé (ne peut pas passer en complexe ouvert.)
Que va être la conséquence du remplacement de sigma 70 par un autre sigma dans une cellule bactérienne ?
(Sigma reconnait et se lie au promoteur pour que l’ARN pol commence la transcription là)
Ça va guider la transcription de ce pol vers d’autres promoteurs (sur des lieux spécifiques reliés à une situation précise, par exemple, lors de l’infection d’une cellule!)